Белок цинковых пальцев 804А
| ЗНФ804А | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | ZNF804A , C2orf10, белок цинковых пальцев 804A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | ОМИМ : 612282 ; МГИ : 2442949 ; Гомологен : 18461 ; Генные карты : ZNF804A ; ОМА : ZNF804A – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок 804А «цинковых пальцев» — это белок , который у человека кодируется ZNF804A геном . [5] Ген человека картирован на хромосоме 2 q32.1 и состоит из 4 экзонов, кодирующих белок из 1210 аминокислот (137 кДа). [6]
Мало что известно о характеристиках и функциях кодируемого белка. Однако белковая последовательность кодирует домен, характерный для классического C 2 H 2 -типа цинкового пальца вблизи N- конца. [6] [7]
Взаимодействия
[ редактировать ]ZNF804A связывается с N-концом ATXN1 . [8]
Связывание ДНК
[ редактировать ]Третичная структура пальца C 2 H 2 состоит из бета-шпильки, сложенной напротив альфа-спирали . Складывание происходит с помощью иона цинка (II), который координирует два остатка цистеина (по одному на каждом бета-листе ) и два остатка гистидина (оба на α-спирали). [9] ZNF804A может использовать свой цинковый палец для связывания ДНК специфичным для последовательности образом. Например, Карл Пабо и его коллеги в 1991 году обнаружили, что мышиный фактор транскрипции Zif268 связывается с ДНК с помощью трех связанных цинковых пальцев C 2 H 2 . Аминокислотные остатки, торчащие из α-спиралей цинковых пальцев, взаимодействуют с богатым гуанином участком двойной спирали ДНК посредством водородных связей, а также электростатических и гидрофобных взаимодействий. Расстояние между остатками совпадает с расстоянием между парами оснований. Цинковые пальцы входят в большую бороздку и обвивают спираль ДНК почти на один оборот. [9]
Ассоциация с шизофренией
[ редактировать ]У людей ZNF804A широко экспрессируется по всему мозгу, особенно в развивающемся гиппокампе и коре головного мозга, а также во взрослом мозжечке . [10] Ожидается, что ZNF804A будет связываться с ДНК и, таким образом, регулировать экспрессию генов, как и другие белки цинковых пальцев. [6] Недавно сообщалось, что мышиный гомолог ZNF804A, zfp804a, является мишенью для HOXC8, что позволяет предположить, что ZNF804A может участвовать в регуляции раннего развития нервной системы. [7]
Полногеномное ассоциативное исследование (GWAS) идентифицировало ZNF804A как ген предрасположенности к шизофрении. [11] По данным исследований семьи, близнецов и усыновителей, шизофрении составляет ~ 80%. наследственность [7] и есть подозрение, что риск возникает из-за множественных генетических вариантов с небольшим эффектом. Однонуклеотидный полиморфизм (SNP) rs1344706 в интроне 2 ZNF804A был идентифицирован как вариант, наиболее тесно связанный с шизофренией. [11]
Сообщалось, что тот же SNP коррелирует со слегка нарушенной функциональной связью нескольких областей мозга у здоровых людей, что напоминает изменения, описанные при шизофрении . [12] [13] [14] Дальнейшее исследование показало, что SNP rs1344706 соответствует ассоциации с шизофренией у европейских пациентов, но не у ханьских пациентов. Более того, исследование показало, что SNP rs1021042 и rs359895 связаны с шизофренией у пациентов из Китая, а аллель rs359895 увеличивает активность промотора ZNF804A. [7] Результаты другого исследования свидетельствуют об отсутствии связи между вариантом rs1344706 и нарушением когнитивных функций у больных шизофренией. [6] а результаты еще одного исследования показывают, что ZNF804A также играет роль в том, как симптомы шизофрении реагируют на антипсихотики. [15]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000170396 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070866 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ген Энтрез: белок цинковых пальцев 804А» .
- ^ Перейти обратно: а б с д Уолтерс Дж.Т., Корвин А., Оуэн М.Дж., Уильямс Х., Драгович М., Куинн Э.М., Судья Р., Смит DJ, Нортон Н., Гиглинг И. и др. (июль 2010 г.). «Ген предрасположенности к психозу ZNF804A и когнитивные функции при шизофрении» . Арх. Общая психиатрия . 67 (7): 692–700. doi : 10.1001/archgenpsychiatry.2010.81 . ПМИД 20603450 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Ли М, Луо XJ, Сяо X, Ши Л, Лю XY, Инь ЛД, Дяо ХБ, Су Б (декабрь 2011 г.). «Аллельные различия между ханьскими китайцами и европейцами по функциональным вариантам ZNF804A и их связь с шизофренией». Am J Психиатрия . 168 (12): 1318–25. дои : 10.1176/appi.ajp.2011.11030381 . ПМИД 21890790 .
- ^ Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
- ^ Перейти обратно: а б Исалан М (2004). «Цинковые пальцы» . В Леннарц В.Дж., Лейн М.Д., Модрич П., Диксон Дж., Карафоли Э., Экстон Дж., Кливленд Д. (ред.). Энциклопедия биологической химии . Амстердам: Эльзевир. стр. 435–439. дои : 10.1016/B0-12-443710-9/00713-4 . ISBN 0-12-443710-9 .
- ^ Ленц Т., Сешко П.Р., ДеРосс П., Бердик К.Е., Бромет Э.Дж., Билдер Р.М., Малхотра А.К. (июль 2010 г.). «Ген риска шизофрении, ZNF804A, влияет на нейроанатомические и нейрокогнитивные фенотипы» . Нейропсихофармакология . 35 (11): 2284–2291. дои : 10.1038/нпп.2010.102 . ПМЦ 2939918 . ПМИД 20664580 .
- ^ Перейти обратно: а б О'Донован М.К., Крэддок Н., Нортон Н., Уильямс Х., Пирс Т., Москвина В., Николов И., Хэмшир М., Кэрролл Л. и др. (сентябрь 2008 г.). «Идентификация локусов, связанных с шизофренией, путем полногеномной ассоциации и последующего наблюдения». Нат. Жене . 40 (9): 1053–5. дои : 10.1038/ng.201 . ПМИД 18677311 . S2CID 205345009 .
- ^ Эсслингер С., Уолтер Х., Кирш П., Эрк С., Шнелл К., Арнольд С., Хаддад Л., Майер Д., Опиц фон Боберфельд С., Рааб К., Витт Ш., Ритшель М., Сичон С., Мейер-Линденберг А. (май 2009 г.). «Нейронные механизмы общегеномного варианта психоза». Наука . 324 (5927): 605. Бибкод : 2009Sci...324..605E . дои : 10.1126/science.1167768 . ПМИД 19407193 . S2CID 206517207 .
- Разместить резюме в: «Шизофрения и маниакально-депрессивное расстройство: генетический вариант нарушает связь внутри мозга» . ScienceDaily (пресс-релиз). 1 мая 2009 г.
- ^ «Связанный с шизофренией вариант гена ZNF804A влияет на связь мозга» . Форум по исследованию шизофрении. Архивировано из оригинала 15 февраля 2012 г. Проверено 6 мая 2009 г.
- ^ Хилл М.Дж., Джеффрис А.Р., Добсон Р.Дж., Прайс Дж., Брей, Нью-Джерси (март 2012 г.). «Нокдаун гена предрасположенности к психозу ZNF804A изменяет экспрессию генов, участвующих в клеточной адгезии» . Хм. Мол. Жене . 21 (5): 1018–24. дои : 10.1093/hmg/ddr532 . ПМИД 22080834 .
- ^ Месснер Р., Шумахер А., Вагнер М., Леннерц Л., Штайнбрехер А., Кведнов Б.Б., Руеску Д., Ритшель М., Майер В. (апрель 2012 г.). «Ген риска шизофрении ZNF804A влияет на антипсихотический ответ на положительные симптомы шизофрении» (PDF) . Европейская психиатрическая клиника Neurosci . 262 (3): 193–7. дои : 10.1007/s00406-011-0235-1 . ПМИД 21892778 . S2CID 5635120 .