СЕВПА

СЕВПА
Идентификаторы
Псевдонимы	CEBPA , C/EBP-альфа, CEBP, CCAAT/белок, связывающий энхансер альфа, белок, связывающий энхансер CCAAT альфа
Внешние идентификаторы	Опустить : 116897 ; МГИ : 99480 ; Гомологен : 3211 ; GeneCards : CEBPA ; ОМА : CEBPA – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	33,302,534 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	34,821,353 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	nipple; ; skin of arm; ; human penis; ; skin of thigh; ; skin of abdomen; ; right lobe of liver; ; monocyte; ; adipose tissue; ; subcutaneous adipose tissue; ; vulva;
	Top expressed in
	lactiferous gland; ; brown adipose tissue; ; subcutaneous adipose tissue; ; white adipose tissue; ; lip; ; tunica adventitia of aorta; ; skin of external ear; ; stroma of bone marrow; ; right lung; ; gallbladder;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; protein homodimerization activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity; transcription coactivator activity; transcription factor binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; kinase binding; protein binding; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	transcription regulator complex; RNA polymerase II transcription regulator complex; nucleolus; nucleus; nucleoplasm; intracellular membrane-bounded organelle;
Biological process	Notch signaling pathway; transcription by RNA polymerase I; myeloid cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; cellular response to lithium ion; glucose homeostasis; negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; lung development; cytokine-mediated signaling pathway; urea cycle; regulation of transcription by RNA polymerase II; cellular response to organic cyclic compound; mitochondrion organization; embryonic placenta development; cholesterol metabolic process; negative regulation of cell cycle; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; cell maturation; generation of precursor metabolites and energy; transcription, DNA-templated; macrophage differentiation; multicellular organism development; positive regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of osteoblast differentiation; granulocyte differentiation; regulation of cell population proliferation; brown fat cell differentiation; lipid homeostasis; white fat cell differentiation; inner ear development; liver development; viral process; negative regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of fat cell differentiation; positive regulation of transcription by RNA polymerase III; fat cell differentiation; positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of cell population proliferation; transcription by RNA polymerase II; cellular response to tumor necrosis factor; positive regulation of DNA-templated transcription, initiation; positive regulation of macrophage activation; positive regulation of inflammatory response; interleukin-6-mediated signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	1050
	12606
	ENSG00000245848
	ENSMUSG00000034957
	P49715
	P53566
	НМ_004364 ; НМ_001285829 ; НМ_001287424 ; НМ_001287435
	НМ_001287514 ; НМ_001287515 ; НМ_001287521 ; НМ_001287523 ; НМ_007678
	НП_001272758 ; НП_001274353 ; НП_001274364 ; НП_004355
	НП_001274443 ; НП_001274444 ; НП_001274450 ; НП_001274452 ; НП_031704
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

CCAAT/энхансер-связывающий белок альфа представляет собой белок, кодируемый CEBPA геном у человека. ^[5]^[6] CCAAT/энхансер-связывающий белок альфа представляет собой фактор транскрипции, участвующий в дифференцировке определенных клеток крови . ^[7] CCAAT Подробную информацию о структурном мотиве в генных энхансерах и о белках, связывающих CCAAT/энхансер, см. на конкретной странице .

Функция

Белок, кодируемый этим безинтронным геном, представляет собой bZIP транскрипционный фактор , который может связываться в виде гомодимера с определенными промоторами и энхансерами генов . Он также может образовывать гетеродимеры с родственными белками CEBP-beta и CEBP-gamma, а также с отдельными факторами транскрипции, такими как c-Jun . Кодируемый белок является ключевым регулятором адипогенеза (процесса образования новых жировых клеток) и накопления липидов в этих клетках, а также метаболизма глюкозы и липидов в печени. ^[8] Было показано, что белок связывается с промотором и модулирует экспрессию гена, кодирующего лептин , белок, который играет важную роль в гомеостазе массы тела. Кроме того, кодируемый белок может взаимодействовать с CDK2 и CDK4 , тем самым ингибируя эти киназы и заставляя культивируемые клетки прекращать деление. ^[9] Кроме того, CEBPA необходим для миелоидного коммитирования клона и, следовательно, необходим как для нормального образования зрелых гранулоцитов , так и для развития аномального острого миелолейкоза . ^[10]

Общие мутации

Существует две основные категории, на которые можно разделить мутации CEBPA. Одна категория мутаций предотвращает связывание CCAAT/белка альфа-связывающего энхансера с ДНК путем изменения его COOH-концевого основного домена лейциновой молнии. Другая категория мутаций нарушает трансляцию CCAAT/конца NH2 альфа-связывающего энхансера _белка . Мутации CEBPA, которые приводят к снижению активности CCAAT/альфа-связывающего белка, способствуют трансформации миелоидных предшественников. ^[11]

Взаимодействия

Было показано, что CEBPA взаимодействует с циклин-зависимой киназой 2. ^[12] и циклин-зависимая киназа 4 . ^[12]

Клиническое значение

Было показано, что мутация CEBPA связана с хорошим исходом как у взрослых, так и у детей с острым миелолейкозом . ^[13]

Значение при остром миелолейкозе

Острый миелолейкоз характеризуется генетическими аномалиями в кроветворных предшественниках. входит чрезмерная пролиферация бластов и блокировка кроветворения гранулоцитов Сюда . Показано, что подавление экспрессии CEBPA и блокирование CCAAT/энхансер-связывающего белка альфа останавливают дифференцировку миелоидных предшественников. По этой причине роль CCAAT/энхансер-связывающего белка альфа во время дифференцировки гранулоцитов и роль CEBPA как гена- супрессора опухоли критически важны в прогнозе острого миелолейкоза. ^[14]

Прогностическое значение мутаций CEBPA

CCAAT/энхансер-связывающий белок альфа, транскрипционный фактор , кодируемый CEBPA, очень важен для дифференцировки незрелых гранулоцитов. Было показано, что мутация гена CEBPA играет решающую роль в лейкемогенезе и прогнозе у пациентов с острым миелолейкозом. В недавних исследованиях мутации CEBPA были обнаружены у 7–15% пациентов с острым миелолейкозом. Три различных типа мутаций, наблюдаемых у этих пациентов с ОМЛ, включают N-концевую мутацию зародышевой линии, N-концевую мутацию сдвига рамки считывания и С-концевую мутацию. Эти мутации чаще всего обнаруживаются при остром миелолейкозе М1 или остром миелолейкозе М2. Многие сообщения связывают мутации CEBPA с благоприятным исходом острого миелолейкоза. Это связано с тем, что эти мутации, вероятно, вызывают остановку дифференцировки у этих пациентов. Пациенты с мутациями CEBPA имеют более длительную продолжительность ремиссии и выживаемость, чем пациенты без мутаций. ^[11] Следовательно, наличие мутаций CEBPA напрямую связано с более благоприятным течением прогрессирования заболевания. ^[15]

Значение при солидных опухолях

Недавно было показано, что эпигенетическая модификация дистальной промоторной области CEBPA приводит к снижению экспрессии CEBPA в клетках рака поджелудочной железы, рака легких и плоскоклеточного рака головы и шеи . ^[16]^[17]

Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с ОМЛ

Недавнее исследование показало, что более высокие уровни метилирования CEBPA прямо пропорциональны реакции на лечение. Частота полного ответа увеличивалась пропорционально уровню метилирования CEBPA. По этой причине было высказано предположение, что метилирование CEBPA может быть очень полезным биомаркером острого миелолейкоза в прогнозе . ^[18]

См. также

Белки, связывающие Ccaat-энхансер

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000245848 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034957 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Шпирер С., Ривьер М., Кортезе Р., Накамура Т., Ислам М.К., Леван Г., Шпирер Дж. (июль 1992 г.). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C/EBP, DBP и HNF1/LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1 соответственно) и фактора роста гепатоцитов». ген фактора рассеяния (HGF)». Геномика . 13 (2): 293–300. дои : 10.1016/0888-7543(92)90245-N . ПМИД 1535333 .
^ Цао З., Умек Р.М., Макнайт С.Л. (октябрь 1991 г.). «Регулируемая экспрессия трех изоформ C/EBP во время жировой конверсии клеток 3T3-L1» . Генс Дев . 5 (9): 1538–52. дои : 10.1101/gad.5.9.1538 . ПМИД 1840554 .
^ «СЕБПА» . Домашний справочник по генетике . 20 апреля 2016 года . Проверено 25 апреля 2016 г.
^ Олофссон Л.Е., Орхо-Меландер М., Уильям-Олссон Л., Сьёхольм К., Шёстрем Л., Груп Л., Карлссон Б., Карлссон Л.М., Олссон Б. (1 декабря 2009 г.). «CCAAT/белок, связывающий энхансер альфа (C/EBPalpha) в жировой ткани регулирует гены метаболизма липидов и глюкозы, а генетическая вариация C/EBPalpha связана с уровнями триглицеридов в сыворотке» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 93 (12): 4880–4886. дои : 10.1210/jc.2008-0574 . ПМИД 18765514 .
^ «Ген Энтрез: CEBPA CCAAT/белок, связывающий энхансер (C/EBP), альфа» .
^ Олссон Э., Шустер М.Б., Хаземанн М., Порс Б.Т. (апрель 2016 г.). «Многогранные функции C/EBPalpha в нормальном и злокачественном кроветворении». Лейкемия . 30 (4): 767–75. дои : 10.1038/leu.2015.324 . ПМИД 26601784 . S2CID 24767947 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Линь ЛИ, Чен С.И., Линь Д.Т., Цай В., Тан Дж.Л., Йе Ю.К. и др. (2005). « Характеристика мутаций CEBPA при остром миелолейкозе». Большинство пациентов с мутациями CEBPA имеют двуаллельные мутации и демонстрируют отчетливый иммунофенотип лейкозных клеток» . Клин Рак Рес . 11 (4): 1372–9. дои : 10.1158/1078-0432.ccr-04-1816 . ПМИД 15746035 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ван Х., Якова П., Уайлд М., Велм А., Гуд Т., Рослер В.Дж., Тимченко Н.А. (октябрь 2001 г.). «C/EBPalpha останавливает пролиферацию клеток посредством прямого ингибирования Cdk2 и Cdk4» . Мол. Клетка . 8 (4): 817–28. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00366-5 . ПМИД 11684017 .
^ Хо П.А., Алонсо Т.А., Гербинг Р.Б., Поллард Дж., Стирвалт Д.Л., Гурвиц С., Хирема Н.А., Хирш Б., Раймонди С.К., Ланге Б., Франклин Дж.Л., Радич Дж.П., Мешинчи С. (июнь 2009 г.). «Распространенность и прогностические последствия мутаций CEBPA при остром миелоидном лейкозе у детей (ОМЛ): отчет Детской онкологической группы» . Кровь . 113 (26): 6558–66. дои : 10.1182/кровь-2008-10-184747 . ПМЦ 2943755 . ПМИД 19304957 .
^ Линь Т.К., Хоу Х.А., Чжоу В.К., Оу Д.Л., Ю С.Л., Тьен Х.Ф. и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с de novo острым миелолейкозом » . Лейкемия . 25 (1): 32–40. дои : 10.1038/leu.2010.222 . ПМИД 20927134 .
^ Эль-Шарноуби Дж.А., Ахмед Л.М., Таха А.М., Камаль О. Прогностическое значение мутаций CEBPA и экспрессии BAALC у египетских пациентов с острым миелолейкозом с нормальным кариотипом. Египет Дж Иммунол. 2010;15:131–143.
^ Тада Ю., Брена Р.М., Хакансон Б., Моррисон С., Оттерсон Г.А., Пласс С. (2006). «Эпигенетическая модуляция активности опухолевого супрессора CCAAT/энхансера-связывающего белка альфа при раке легких» . J Национальный онкологический институт . 98 (6): 396–406. дои : 10.1093/jnci/djj093 . ПМИД 16537832 .
^ Беннетт К.Л., Хакансон Б., Смит Л.Т., Моррисон К.Д., Ланг Дж.К., Шуллер Д.Э. и др. (2007). «Супрессорная активность CCAAT/белка альфа, связывающего энхансер, эпигенетически снижается при плоскоклеточном раке головы и шеи» . Рак Рез . 67 (10): 4657–4664. дои : 10.1158/0008-5472.can-06-4793 . ПМИД 17510391 .
^ Линь Т.К., Хоу Х.А., Чжоу В.К., Оу Д.Л., Ю С.Л., Тьен Х.Ф. и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с острым миелоидным лейкозом de novo» . Лейкемия . 25 (1): 32–40. дои : 10.1038/leu.2010.222 . ПМИД 20927134 .

Дальнейшее чтение

Сладек Ф.М., Дарнелл Дж.Э. (1992). «Механизмы экспрессии генов, специфичных для печени». Курс. Мнение. Жене. Дев . 2 (2): 256–9. дои : 10.1016/S0959-437X(05)80282-5 . ПМИД 1638120 .
Маркуччи Г., Мрузек К., компакт-диск Bloomfield (2005). «Молекулярная гетерогенность и прогностические биомаркеры у взрослых с острым миелолейкозом и нормальной цитогенетикой». Курс. Мнение. Гематол . 12 (1): 68–75. дои : 10.1097/01.moh.0000149608.29685.d1 . ПМИД 15604894 . S2CID 6183391 .
Лерой Х., Румье С., Юиг П., Биджио В., Фено П., Прюдомм К. (март 2005 г.). «Точковые мутации CEBPA при гематологических злокачественных новообразованиях» . Лейкемия . 19 (3): 329–34. дои : 10.1038/sj.leu.2403614 . ПМИД 15674366 .

Внешние ссылки

человека CEBPA Расположение генома и страница сведений о гене CEBPA в браузере генома UCSC .
Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW о семейном остром миелолейкозе (ОМЛ) с мутацией CEBPA
CEBPA+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000245848 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034957 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1535333-5] Шпирер С., Ривьер М., Кортезе Р., Накамура Т., Ислам М.К., Леван Г., Шпирер Дж. (июль 1992 г.). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C/EBP, DBP и HNF1/LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1 соответственно) и фактора роста гепатоцитов». ген фактора рассеяния (HGF)». Геномика . 13 (2): 293–300. дои : 10.1016/0888-7543(92)90245-N . ПМИД 1535333 .

[pmid1840554-6] Цао З., Умек Р.М., Макнайт С.Л. (октябрь 1991 г.). «Регулируемая экспрессия трех изоформ C/EBP во время жировой конверсии клеток 3T3-L1» . Генс Дев . 5 (9): 1538–52. дои : 10.1101/gad.5.9.1538 . ПМИД 1840554 .

[7] «СЕБПА» . Домашний справочник по генетике . 20 апреля 2016 года . Проверено 25 апреля 2016 г.

[Olofsson2008-8] Олофссон Л.Е., Орхо-Меландер М., Уильям-Олссон Л., Сьёхольм К., Шёстрем Л., Груп Л., Карлссон Б., Карлссон Л.М., Олссон Б. (1 декабря 2009 г.). «CCAAT/белок, связывающий энхансер альфа (C/EBPalpha) в жировой ткани регулирует гены метаболизма липидов и глюкозы, а генетическая вариация C/EBPalpha связана с уровнями триглицеридов в сыворотке» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 93 (12): 4880–4886. дои : 10.1210/jc.2008-0574 . ПМИД 18765514 .

[9] «Ген Энтрез: CEBPA CCAAT/белок, связывающий энхансер (C/EBP), альфа» .

[10] Олссон Э., Шустер М.Б., Хаземанн М., Порс Б.Т. (апрель 2016 г.). «Многогранные функции C/EBPalpha в нормальном и злокачественном кроветворении». Лейкемия . 30 (4): 767–75. дои : 10.1038/leu.2015.324 . ПМИД 26601784 . S2CID 24767947 .

[:0-11] Перейти обратно: ^а ^б Линь ЛИ, Чен С.И., Линь Д.Т., Цай В., Тан Дж.Л., Йе Ю.К. и др. (2005). « Характеристика мутаций CEBPA при остром миелолейкозе». Большинство пациентов с мутациями CEBPA имеют двуаллельные мутации и демонстрируют отчетливый иммунофенотип лейкозных клеток» . Клин Рак Рес . 11 (4): 1372–9. дои : 10.1158/1078-0432.ccr-04-1816 . ПМИД 15746035 .

[pmid11684017-12] Перейти обратно: ^а ^б Ван Х., Якова П., Уайлд М., Велм А., Гуд Т., Рослер В.Дж., Тимченко Н.А. (октябрь 2001 г.). «C/EBPalpha останавливает пролиферацию клеток посредством прямого ингибирования Cdk2 и Cdk4» . Мол. Клетка . 8 (4): 817–28. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00366-5 . ПМИД 11684017 .

[pmid19304957-13] Хо П.А., Алонсо Т.А., Гербинг Р.Б., Поллард Дж., Стирвалт Д.Л., Гурвиц С., Хирема Н.А., Хирш Б., Раймонди С.К., Ланге Б., Франклин Дж.Л., Радич Дж.П., Мешинчи С. (июнь 2009 г.). «Распространенность и прогностические последствия мутаций CEBPA при остром миелоидном лейкозе у детей (ОМЛ): отчет Детской онкологической группы» . Кровь . 113 (26): 6558–66. дои : 10.1182/кровь-2008-10-184747 . ПМЦ 2943755 . ПМИД 19304957 .

[14] Линь Т.К., Хоу Х.А., Чжоу В.К., Оу Д.Л., Ю С.Л., Тьен Х.Ф. и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с de novo острым миелолейкозом » . Лейкемия . 25 (1): 32–40. дои : 10.1038/leu.2010.222 . ПМИД 20927134 .

[15] Эль-Шарноуби Дж.А., Ахмед Л.М., Таха А.М., Камаль О. Прогностическое значение мутаций CEBPA и экспрессии BAALC у египетских пациентов с острым миелолейкозом с нормальным кариотипом. Египет Дж Иммунол. 2010;15:131–143.

[16] Тада Ю., Брена Р.М., Хакансон Б., Моррисон С., Оттерсон Г.А., Пласс С. (2006). «Эпигенетическая модуляция активности опухолевого супрессора CCAAT/энхансера-связывающего белка альфа при раке легких» . J Национальный онкологический институт . 98 (6): 396–406. дои : 10.1093/jnci/djj093 . ПМИД 16537832 .

[17] Беннетт К.Л., Хакансон Б., Смит Л.Т., Моррисон К.Д., Ланг Дж.К., Шуллер Д.Э. и др. (2007). «Супрессорная активность CCAAT/белка альфа, связывающего энхансер, эпигенетически снижается при плоскоклеточном раке головы и шеи» . Рак Рез . 67 (10): 4657–4664. дои : 10.1158/0008-5472.can-06-4793 . ПМИД 17510391 .

[18] Линь Т.К., Хоу Х.А., Чжоу В.К., Оу Д.Л., Ю С.Л., Тьен Х.Ф. и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с острым миелоидным лейкозом de novo» . Лейкемия . 25 (1): 32–40. дои : 10.1038/leu.2010.222 . ПМИД 20927134 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]