Понижающая и повышающая регуляция
В биохимии , в биологическом контексте организмами регуляции экспрессии генов и производства генных продуктов , понижающая регуляция – это процесс, при котором клетка снижает выработку и количество своих клеточных компонентов , таких как РНК и белки , в ответ на внешний стимул. . Дополнительный процесс, который включает увеличение количества клеточных компонентов, называется активацией. [1]
Примером понижающей регуляции является клеточное снижение экспрессии определенного рецептора в ответ на его повышенную активацию молекулой, такой как гормон или нейротрансмиттер , что снижает чувствительность клетки к молекуле. Это пример механизма локального действия ( отрицательная обратная связь ).
Примером положительной регуляции является реакция клеток печени на воздействие таких ксенобиотиков, молекул как диоксин . В этой ситуации клетки увеличивают выработку ферментов цитохрома P450 , что, в свою очередь, увеличивает деградацию этих молекул диоксина.
Понижение или повышение уровня РНК или белка также может возникнуть в результате эпигенетических изменений. Такое эпигенетическое изменение может привести к тому, что экспрессия РНК или белка перестанет реагировать на внешний стимул. Это происходит, например, при наркотической зависимости или прогрессировании рака .
Понижение и повышение активности рецепторов
[ редактировать ]Этот раздел нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( февраль 2020 г. ) |
Все живые клетки обладают способностью получать и обрабатывать сигналы, исходящие за пределами их мембран, что они делают с помощью белков, называемых рецепторами , часто расположенных на поверхности клетки, встроенных в плазматическую мембрану. Когда такие сигналы взаимодействуют с рецептором, они эффективно направляют клетку на какое-то действие, например на деление, смерть или создание веществ, а также на вход или выход из клетки. Способность клетки реагировать на химическое сообщение зависит от наличия рецепторов, настроенных на это сообщение. Чем больше рецепторов в клетке настроено на это сообщение, тем больше клетка на него отреагирует.
Рецепторы создаются или экспрессируются на основе инструкций в ДНК клетки, и их активность может увеличиваться или активироваться, когда сигнал слабый, или уменьшаться или подавляться, когда он сильный. [ нужна ссылка ] Их уровень также можно регулировать вверх или вниз путем модуляции систем, которые разрушают рецепторы, когда они больше не нужны клетке.
Понижение регуляции рецепторов может также произойти, когда рецепторы хронически подвергаются воздействию чрезмерного количества лиганда либо со стороны эндогенных медиаторов, либо со стороны экзогенных лекарств. Это приводит к индуцированной лигандом десенсибилизации или интернализации этого рецептора. Обычно это наблюдается в рецепторах гормонов животных. С другой стороны, активация рецепторов может привести к сверхсенсибилизации клеток, особенно после многократного воздействия антагонистического препарата или длительного отсутствия лиганда.
Некоторые агонисты рецепторов могут вызывать подавление соответствующих рецепторов, тогда как большинство антагонистов рецепторов временно активируют соответствующие рецепторы. Нарушение равновесия, вызванное этими изменениями, часто приводит к синдрому отмены длительного приема препарата . при прекращении
Повышение и понижение регуляции также может происходить в ответ на токсины или гормоны . Примером усиления регуляции во время беременности являются гормоны, которые заставляют клетки матки становиться более чувствительными к окситоцину .
Пример: Снижение уровня регуляции инсулиновых рецепторов.
[ редактировать ]Повышенный уровень гормона инсулина в крови вызывает снижение активности связанных рецепторов. [2] Когда инсулин связывается со своими рецепторами на поверхности клетки, рецепторный комплекс гормона подвергается эндоцитозу и впоследствии подвергается атаке внутриклеточных лизосомальных ферментов . [3] Интернализация молекул инсулина обеспечивает путь деградации гормона, а также регуляции количества сайтов, доступных для связывания на поверхности клетки. [4] При высоких концентрациях в плазме количество поверхностных рецепторов инсулина постепенно снижается из-за ускоренной скорости интернализации и деградации рецепторов, вызванной усилением гормонального связывания. [5] [ нужна страница ] Скорость синтеза новых рецепторов внутри эндоплазматической сети и их внедрения в плазматическую мембрану не поспевает за скоростью их разрушения. Со временем эта самоиндуцированная потеря рецепторов клеток-мишеней для инсулина снижает чувствительность клеток-мишеней к повышенной концентрации гормона. [5]
Этот процесс иллюстрируется сайтами рецепторов инсулина на клетках-мишенях, например клетках печени, у человека с диабетом 2 типа . [6] Из-за повышенного уровня глюкозы в крови у человека β-клетки ( островки Лангерганса ) поджелудочной железы должны вырабатывать больше инсулина, чем обычно, чтобы удовлетворить потребность и вернуть кровь к гомеостатическому уровню. [7] Почти постоянное повышение уровня инсулина в крови является результатом попытки соответствовать увеличению уровня глюкозы в крови, что приводит к подавлению регуляции рецепторов на клетках печени и уменьшению количества рецепторов инсулина, увеличивая резистентность субъекта за счет снижения чувствительности к этому инсулину. гормон. [ нужна ссылка ] Также наблюдается снижение чувствительности печени к инсулину . Это можно увидеть по продолжающемуся глюконеогенезу в печени даже при повышенном уровне глюкозы в крови. Это более распространенный процесс резистентности к инсулину , который приводит к диабету у взрослых. [8]
Другой пример можно увидеть при несахарном диабете , при котором почки становятся нечувствительными к аргинин-вазопрессину .
Наркомания
[ редактировать ]Исследования, проведенные в семье, усыновлении и близнецах, показали, что существует сильный (50%) наследственный компонент уязвимости к зависимости от психоактивных веществ. [9]
Повторное употребление наркотиков в подростковом или взрослом возрасте, особенно среди генетически уязвимых лиц, вызывает зависимость, вызывая стабильное снижение или повышение экспрессии определенных генов и микроРНК посредством эпигенетических изменений . [10] Было показано, что такая понижающая или повышающая регуляция происходит в зонах вознаграждения мозга, таких как прилежащее ядро . [10]
Рак
[ редактировать ]Повреждение ДНК, по-видимому, является основной причиной рака. [11] Повреждение ДНК также может усилить эпигенетические изменения из-за ошибок во время восстановления ДНК. [12] [13] Такие мутации и эпигенетические изменения могут привести к раку (см. злокачественные новообразования ). [12] [13] [ нужна проверка ] Исследование эпигенетической понижающей или повышающей регуляции восстановленных генов ДНК, возможно, имеющей решающее значение для прогрессирования рака, регулярно проводится с 2000 года. [14]
Эпигенетическое подавление гена репарации ДНК MGMT встречается в 93% случаев рака мочевого пузыря. [15] 88% случаев рака желудка, 74% случаев рака щитовидной железы, 40–90% случаев колоректального рака и 50% случаев рака головного мозга. [ нужна ссылка ] Аналогичным образом, эпигенетическое подавление LIG4 происходит в 82% случаев колоректального рака, а эпигенетическое подавление NEIL1 происходит в 62% случаев рака головы и шеи и в 42% немелкоклеточного рака легких .
Эпигенетическая активация генов репарации ДНК PARP1 и FEN1 происходит при многих видах рака (см. «Регуляция транскрипции при раке »). PARP1 и FEN1 являются важными генами в подверженном ошибкам и мутагенном пути репарации ДНК, опосредованном микрогомологическим соединением концов . Если этот путь активируется, избыточные мутации, которые он вызывает, могут привести к раку. PARP1 сверхэкспрессируется при тирозинкиназно-активируемых лейкозах. [16] при нейробластоме, [17] при опухолях яичек и других герминогенных опухолях, [18] и при саркоме Юинга. [19] Уровень FEN1 повышается при большинстве случаев рака молочной железы, простаты, желудка, нейробластомы, поджелудочной железы и легких. [20] [ нужна ссылка ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Аткинсон, Тейлор Дж; Халфон, Марк С (1 января 2014 г.). «Регуляция экспрессии генов в геномном контексте» . Журнал вычислительной и структурной биотехнологии . 9 (13): e201401001. дои : 10.5936/csbj.201401001 . ISSN 2001-0370 . ПМЦ 3962188 . ПМИД 24688749 .
- ^ Крупп, М; Лейн, доктор медицины (25 февраля 1981 г.). «О механизме лиганд-индуцированного снижения уровня инсулиновых рецепторов в клетках печени» . Журнал биологической химии . 256 (4): 1689–94. дои : 10.1016/S0021-9258(19)69862-5 . ПМИД 7007369 .
- ^ Заляускене, Лолита; Кан, Сонхён; Бруйетт, Кристи Г.; Лебовиц, Джейкоб; Арани, Рамин Б.; Коллон, Джеймс Ф. (2016). «Понижающая регуляция рецепторов клеточной поверхности модулируется полярными остатками в трансмембранном домене» . Молекулярная биология клетки . 11 (8): 2643–2655. дои : 10.1091/mbc.11.8.2643 . ISSN 1059-1524 . ЧВК 14946 . ПМИД 10930460 .
- ^ Карпентье, Ж.-Л. (1994). «Интернализация рецепторов инсулина: молекулярные механизмы и физиопатологические последствия» . Диабетология . 37 (2): С117–С124. дои : 10.1007/BF00400835 . ISSN 0012-186X . ПМИД 7821727 .
- ^ Jump up to: а б Шервуд, Лорали; Кландорф, Хиллар; Янси, Пол (1 января 2012 г.). Физиология животных: от генов к организмам . Cengage Обучение. ISBN 978-1133709510 .
- ^ Фрейдё, Сара; Видаль, Юбер; Пирола, Лучано (01 февраля 2009 г.). «Изменения передачи сигналов инсулина при диабете 2 типа: обзор текущих данных, полученных от людей» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1792 (2): 83–92. дои : 10.1016/j.bbadis.2008.10.019 . ПМИД 19041393 .
- ^ Уилкокс, Гизела (20 ноября 2016 г.). «Инсулин и инсулинорезистентность» . Обзоры клинических биохимиков . 26 (2): 19–39. ISSN 0159-8090 . ПМК 1204764 . ПМИД 16278749 .
- ^ Франц, Мэрион Дж. (2000). «Протеиновые споры при диабете» . Диабетический спектр . 13 (3). Архивировано из оригинала 05 марта 2016 г. Проверено 20 ноября 2016 г.
- ^ Уокер, Дина М.; Нестлер, Эрик Дж. (2018). «Нейроэпигенетика и зависимость». Справочник по клинической неврологии . Том. 148. стр. 747–765. дои : 10.1016/B978-0-444-64076-5.00048-X . ISBN 9780444640765 . ПМЦ 5868351 . ПМИД 29478612 .
- ^ Jump up to: а б Нестлер, Эрик Дж. (январь 2014 г.). «Эпигенетические механизмы наркомании» . Нейрофармакология . 76 Часть Б: 259–68. doi : 10.1016/j.neuropharm.2013.04.004 . ПМЦ 3766384 . ПМИД 23643695 .
- ^ Бернштейн, К; Прасад, Арканзас; Нфонсам, В; Бернштейн, Х. (2013). «Глава 16: Повреждение ДНК, восстановление ДНК и рак». В Чен, Кларк (ред.). Новые направления исследований в области репарации ДНК . Совет директоров – Книги по запросу. п. 413. ИСБН 978-953-51-1114-6 .
- ^ Jump up to: а б О'Хаган, Хизер М.; Мохаммад, Хелай П.; Бэйлин, Стивен Б. (15 августа 2008 г.). «Двойные разрывы цепей могут инициировать молчание генов и SIRT1-зависимое начало метилирования ДНК на экзогенном промоторном CpG-островке» . ПЛОС Генетика . 4 (8): е1000155. дои : 10.1371/journal.pgen.1000155 . ПМЦ 2491723 . ПМИД 18704159 .
В совокупности наши данные показывают, что нормальное восстановление разрыва ДНК может иногда вызывать наследственное молчание промотора, содержащего CpG-островки, за счет рекрутирования белков, участвующих в молчании... Это открытие предполагает, что повреждение ДНК может напрямую способствовать большому количеству эпигенетически молчание генов в опухолях.
- ^ Jump up to: а б Куоццо, Кончетта; Порчеллини, Антонио; Ангризано, Тициана; Морано, Анналиса; Ли, Бонгён; Пардо, Альба Ди; Мессина, Саманта; Юлиано, Родольфо; Фуско, Альфредо; Сантильо, Мария Р; Мюллер, Марк Т; Кьяриотти, Лоренцо; Готтесман, Макс Э; Авведименто, Энрико V (6 июля 2007 г.). «Повреждение ДНК, репарация, направленная на гомологию, и метилирование ДНК» . ПЛОС Генетика . 3 (7): е110. дои : 10.1371/journal.pgen.0030110 . ЧВК 1913100 . ПМИД 17616978 .
...данные подтверждают механистическую связь между HR и метилированием ДНК и позволяют предположить, что метилирование ДНК у эукариот маркирует гомологичные рекомбинированные сегменты.
- ^ Бакстер, Ева; Виндлох, Каролина; Ганнон, Фрэнк; Ли, Джейсон С. (декабрь 2014 г.). «Эпигенетическая регуляция прогрессирования рака» . Клетка и биологические науки . 4 (1): 45. дои : 10.1186/2045-3701-4-45 . ПМЦ 4422217 . ПМИД 25949794 .
- ^ Билграми, Шумайла М; Куреши, Сохаил А; Первез, Шахид; Аббас, Фархат (декабрь 2014 г.). «Гиперметилирование промотора генов-супрессоров опухоли коррелирует со степенью злокачественности и инвазивностью опухоли у пациентов с уротелиальным раком мочевого пузыря» . СпрингерПлюс . 3 (1): 178. дои : 10.1186/2193-1801-3-178 . ПМК 4000596 . ПМИД 24790823 .
- ^ Муварак, Нидал; Келли, Шеннон; Роберт, Карин; Баер, Мария Р.; Перротти, Данило; Гамбакорти-Пассерини, Карло; Сивин, Курт; Шайбнер, Кара; Рассул, Фейруз В. (1 апреля 2015 г.). «c-MYC генерирует ошибки восстановления посредством повышенной транскрипции факторов альтернативного NHEJ, LIG3 и PARP1, при лейкозах, активированных тирозинкиназой» . Молекулярные исследования рака . 13 (4): 699–712. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-14-0422 . ПМЦ 4398615 . ПМИД 25828893 .
- ^ Ньюман, Эрика А.; Лу, Фудзия; Башлари, Даниэла; Ван, Ли; Опипари, Энтони В.; Касл, Валери П. (1 марта 2015 г.). «Компоненты альтернативного пути NHEJ являются терапевтическими мишенями при нейробластоме высокого риска» . Молекулярные исследования рака . 13 (3): 470–482. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-14-0337 . ПМИД 25563294 . S2CID 1830505 .
- ^ Мего, Михал; Чиерна, Сузана; Светловская, Даниэла; Мачак, Душан; Мачалекова, Катарина; Мисковска, Вера; Хованец, Михал; Усакова, Ванда; Обертова, Яна; Бабал, Павел; Мардиак, Йозеф (июль 2013 г.). «Экспрессия PARP в опухолях зародышевых клеток». Журнал клинической патологии . 66 (7): 607–612. doi : 10.1136/jclinpath-2012-201088 . ПМИД 23486608 . S2CID 535704 .
- ^ Ньюман, Роберт; Солдатенков Вячеслав; Дричило, Анатолий; Нотарио, Висенте (1 мая 2002 г.). «Изменения оборота поли(АДФ-рибозы)-полимеразы не способствуют сверхэкспрессии PARP в клетках саркомы Юинга». Отчеты онкологии . 9 (3): 529–532. дои : 10.3892/или.9.3.529 . ПМИД 11956622 .
- ^ Сюй, Х; Чжэн, Л; Дай, Х; Чжоу, М; Хуа, Ю; Шен, Б (2011). «Заболеваемость раком, вызванная химическими веществами, и основные механизмы у мышей с мутацией Fen1» . Онкоген . 30 (9): 1072–1081. дои : 10.1038/onc.2010.482 . ПМЦ 3832200 . ПМИД 20972458 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Понижающее регулирование в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)