Jump to content

ДНК-лигаза 4

(Перенаправлено с LIG4 )

LIG4
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы LIG4 , LIG4S, ДНК-лигаза 4
Внешние идентификаторы Опустить : 601837 ; МГИ : 1335098 ; Гомологен : 1736 ; Генные карты : LIG4 ; ОМА : LIG4 – ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_176953
НМ_001377042

RefSeq (белок)

НП_795927
НП_001363971

Местоположение (UCSC) Чр 13: 108,21 – 108,22 Мб Чр 8: 10.02 – 10.03 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

ДНК-лигаза 4, также ДНК-лигаза IV , представляет собой фермент , который у человека кодируется LIG4 геном . [ 5 ]

ДНК-лигаза 4 представляет собой АТФ -зависимую ДНК-лигазу , которая соединяет двухцепочечные разрывы во время негомологичного пути соединения концов репарации двухцепочечных разрывов. Это также важно для рекомбинации V(D)J . Lig4 образует комплекс с XRCC4 и далее взаимодействует с ДНК-зависимой протеинкиназой (DNA-PK) и XLF/Cernunnos , которые также необходимы для NHEJ. Кристаллическая структура комплекса Lig4/XRCC4 решена. [ 6 ] Дефекты этого гена являются причиной синдрома LIG4 . Дрожжевым гомологом Lig4 является Dnl4.

синдром LIG4

[ редактировать ]

У людей дефицит ДНК-лигазы 4 приводит к клиническому состоянию, известному как синдром LIG4 . Этот синдром характеризуется чувствительностью клеток к радиации, задержкой роста, задержкой развития, микроцефалией, дисморфизмом лица, повышенной предрасположенностью к лейкозам, различной степенью иммунодефицита и снижением количества клеток крови. [ 7 ] [ 8 ]

Старение гемопоэтических стволовых клеток

[ редактировать ]

Накопление повреждений ДНК, приводящее к истощению стволовых клеток, считается важным аспектом старения. [ 9 ] [ 10 ] Дефицит lig4 в плюрипотентных стволовых клетках нарушает негомологическое соединение концов (NHEJ) и приводит к накоплению двухцепочечных разрывов ДНК и усилению апоптоза. [ 8 ] Дефицит Lig4 у мышей вызывает прогрессирующую потерю гемопоэтических стволовых клеток и клеток костного мозга во время старения. [ 11 ] Чувствительность гемопоэтических стволовых клеток к дефициту lig4 позволяет предположить, что lig4-опосредованный NHEJ является ключевым фактором, определяющим способность стволовых клеток противостоять физиологическому стрессу с течением времени. [ 8 ] [ 11 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что LIG4 взаимодействует с XRCC4 через его домен BRCT . [ 12 ] [ 6 ] Это взаимодействие стабилизирует белок LIG4 в клетках; клетки с дефицитом XRCC4 , такие как клетки XR-1, имеют пониженные уровни LIG4. [ 13 ]

Механизм

[ редактировать ]

LIG4 представляет собой АТФ-зависимую ДНК-лигазу. LIG4 использует АТФ для аденилирования, а затем переносит группу AMP на 5'-фосфат одного конца ДНК. Нуклеофильная атака 3'-гидроксильной группы второго конца ДНК и высвобождение АМФ приводят к образованию продукта лигирования. Аденилирование LIG4 стимулируется XRCC4 и XLF . [ 14 ]

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000174405 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049717 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Энтрез: лигаза LIG4 IV, ДНК, АТФ-зависимая» .
  6. ^ Jump up to: а б Сибанда Б.Л., Кричлоу С.Е., Бегун Дж., Пей XY, Джексон С.П., Бланделл Т.Л., Пеллегрини Л. (декабрь 2001 г.). «Кристаллическая структура комплекса Xrcc4-ДНК-лигаза IV». Структурная биология природы . 8 (12): 1015–9. дои : 10.1038/nsb725 . ПМИД   11702069 . S2CID   21218268 .
  7. ^ Руччи Ф, Нотаранжело Л.Д., Фазели А., Патрици Л., Хикернелл Т., Паганини Т., Коакли К.М., Детре С., Кесей М., Уолтер Дж.Е., Фельдман Л., Ченг Х.Л., Полиани П.Л., Ван Дж.Х., Балтер Б.Б., Речер М., Андерссон Э.М. , Жа С., Джилиани С., Терхорст С., Альт Ф.В., Ян К.Т. (февраль 2010 г.). «Гомозиготная мутация ДНК-лигазы IV R278H у мышей приводит к синдрому утечки SCID и представляет собой модель человеческого синдрома LIG4» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (7): 3024–9. Бибкод : 2010PNAS..107.3024R . дои : 10.1073/pnas.0914865107 . ПМЦ   2840307 . ПМИД   20133615 .
  8. ^ Jump up to: а б с Тилгнер К., Неганова И., Морено-Химено И., Аль-Аама Дж.Ю., Беркс Д., Юнг С., Сингапол С., Сарецки Г., Эванс Дж., Горбунова В., Дженнери А., Пшиборски С., Стойкович М., Армстронг Л., Джегго П., Лако. М (август 2013 г.). «Модель iPSC человека с дефицитом лигазы IV показывает важную роль NHEJ-опосредованной репарации DSB в выживании и геномной стабильности индуцированных плюрипотентных стволовых клеток и возникающих гемопоэтических предшественников» . Смерть клеток и дифференцировка . 20 (8): 1089–100. дои : 10.1038/cdd.2013.44 . ПМК   3705601 . ПМИД   23722522 .
  9. ^ Росси DJ, Брайдер Д., Сейта Дж., Нуссенцвейг А., Хоймейкерс Дж., Вайсман И.Л. (июнь 2007 г.). «Недостаток восстановления повреждений ДНК ограничивает функцию гемопоэтических стволовых клеток с возрастом». Природа . 447 (7145): 725–9. Бибкод : 2007Natur.447..725R . дои : 10.1038/nature05862 . ПМИД   17554309 . S2CID   4416445 .
  10. ^ Бернштейн Х., Пейн С.М., Бернштейн С., Гаревал Х., Дворжак К. (2008). «Глава 1: Рак и старение как последствия невосстановленного повреждения ДНК» . Кимура Х, Сузуки А (ред.). Новое исследование повреждений ДНК . Нью-Йорк: Nova Science Publishers, Inc., стр. 1–47. ISBN  978-1-60456-581-2 . Архивировано из оригинала 25 октября 2014 г. Проверено 20 мая 2015 г.
  11. ^ Jump up to: а б Ниджник А., Вудбайн Л., Маркетти С., Доусон С., Ламбе Т., Лю С., Родригес Н.П., Крокфорд Т.Л., Кабуй Э., Виндигни А., Энвер Т., Белл Дж.И., Слижепчевич П., Гуднау CC, Джегго П.А., Корналл Р.Дж. (июнь 2007 г.) ). «Репарация ДНК ограничивает гемопоэтические стволовые клетки во время старения». Природа . 447 (7145): 686–90. Бибкод : 2007Natur.447..686N . дои : 10.1038/nature05875 . ПМИД   17554302 . S2CID   4332976 .
  12. ^ Дешпанде Р.А., Уилсон Т.Е. (октябрь 2007 г.). «Пути взаимодействия дрожжевых белков Nej1, Lif1 и Dnl4 и сравнение с человеческими XLF, XRCC4 и Lig4» . Восстановление ДНК . 6 (10): 1507–16. дои : 10.1016/j.dnarep.2007.04.014 . ПМК   2064958 . ПМИД   17567543 .
  13. ^ Брайанс М., Валенцано М.К., Стамато Т.Д. (январь 1999 г.). «Отсутствие белка ДНК-лигазы IV в клетках XR-1: свидетельства стабилизации с помощью XRCC4». Мутационные исследования . 433 (1): 53–8. дои : 10.1016/s0921-8777(98)00063-9 . ПМИД   10047779 .
  14. ^ Махани Б.Л., Хаммел М., Мик К., Тайнер Дж.А., Лис-Миллер С.П. (февраль 2013 г.). «XRCC4 и XLF образуют длинные спиральные белковые нити, подходящие для защиты концов ДНК и выравнивания, чтобы облегчить восстановление двухцепочечных разрывов ДНК» . Биохимия и клеточная биология . 91 (1): 31–41. дои : 10.1139/bcb-2012-0058 . ПМЦ   3725335 . ПМИД   23442139 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: b7c86b420024da6b3cdb5da5abcb94c1__1718073840
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/b7/c1/b7c86b420024da6b3cdb5da5abcb94c1.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
DNA ligase 4 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)