МYB (ген)

МИБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1GUU, 1GV2, 1GV5, 1GVD, 1H88, 1H89, 1IDY, 1IDZ, 1MBE, 1MBF, 1MBG, 1MBH, 1MBJ, 1MBK, 1MSE, 1MSF, 1SB0, 2AGH
Идентификаторы
Псевдонимы	MYB , Cmyb, c-myb, c-myb_CDS, efg, протоонкоген MYB, фактор транскрипции
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 189990 ; МГИ : 97249 ; Гомологен : 31311 ; GeneCards : MYB ; ОМА : MYB – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	135,219,173 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	21,036,883 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of sigmoid colon; ; bronchial epithelial cell; ; trabecular bone; ; bone marrow; ; thymus; ; rectum; ; buccal mucosa cell; ; bone marrow cells; ; mucosa of transverse colon; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	thymus; ; tibiofemoral joint; ; left colon; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; Paneth cell; ; hair follicle; ; femur; ; body of femur; ; granulocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nuclear matrix; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	positive regulation of transcription, DNA-templated; chromatin remodeling; negative regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of histone H3-K4 methylation; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of histone H3-K9 methylation; positive regulation of T-helper cell differentiation; transcription by RNA polymerase II; mitotic cell cycle; response to hypoxia; positive regulation of collagen biosynthetic process; positive regulation of neuron apoptotic process; positive regulation of smooth muscle cell proliferation; positive regulation of glial cell proliferation; cellular response to hydrogen peroxide; cellular response to retinoic acid; positive regulation of transforming growth factor beta production; positive regulation of neuron death; positive regulation of hepatic stellate cell proliferation; positive regulation of hepatic stellate cell activation; positive regulation of testosterone secretion; regulation of hematopoietic stem cell differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4602
	17863
	ENSG00000118513
	ENSMUSG00000019982
	P10242 ; Q708E1
	P06876
showНМ_001130172 ; НМ_001130173 ; НМ_001161656 ; НМ_001161657 ; НМ_001161658 ;
	NM_001161659; NM_001161660; NM_005375
	НМ_001198914 ; НМ_010848 ; НМ_033597
showНП_001123644 ; НП_001123645 ; НП_001155128 ; НП_001155129 ; НП_001155130 ;
	NP_001155131; NP_001155132; NP_005366
	НП_001185843 ; НП_034978
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Myb-подобный ДНК-связывающий домен
Myb-подобный ДНК-связывающий домен
Идентификаторы
Символ	Myb_DNA-связывание
Пфам	PF00249
ИнтерПро	IPR001005
PROSITE	PDOC00037
КАТ	1ирз
СКОП2	1ирз / СКОПе / СУПФАМ
CDD	cd00167
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Myb Гены являются частью большого семейства генов факторов транскрипции, обнаруженных у животных и растений. У людей он включает протоонкоген Myb, подобный 1 , и родственный Myb белок B в дополнение к собственно MYB . ^[5]^[6] Члены расширенного семейства SANT/Myb также включают домен SANT и другие подобные полностью спиральные гомеобокс- подобные домены.

Функция

Животные

Протоонкогенный белок Myb является членом семейства ( my eloblastosis MYB ) транскрипционных факторов . Белок содержит три домена: N-концевой ДНК-связывающий домен , центральный домен активации транскрипции и C-концевой домен, участвующий в репрессии транскрипции . Он может играть роль в регуляции клеточного цикла. Как и вирусная версия, этот ген является онкогеном , и его перестройки (часто связанные с делецией в С-концевом домене) вызывают рак. ^[8]

Растения

Факторы MYB представляют собой семейство белков, которые включают консервативный ДНК-связывающий домен MYB. Растения содержат подсемейство белков MYB, которое характеризуется доменом MYB типа R2R3. ^[9]

В кукурузе флабафены синтезируются по пути синтеза флавоноидов. ^[10] в результате полимеризации флаван-4-олов ^[11]^[12] который кодирует R2R3 myb-подобный активатор транскрипции ^[13] гена А1, кодирующего дигидрофлавонол-4-редуктазу (восстанавливающую дигидрофлавонолы во флаван-4-олы) ^[14] в то время как другой ген (супрессор пигментации перикарпа 1 или SPP1) действует как супрессор . ^[15] Ген P кукурузы кодирует гомолог Myb, который распознает последовательность CCWACC, что резко контрастирует с YAACGG, связанным с белками Myb позвоночных. ^[16]

У сорго соответствующий ген желтого семени 1 (y1) ^[17] также кодирует белок домена Myb типа R2R3, который регулирует экспрессию генов халконсинтазы , халконизомеразы и дигидрофлавонолредуктазы, необходимых для биосинтеза 3-дезоксифлавоноидов . ^[18]

Рубин является активатором транскрипции MYB генов, которые производят антоцианы в цитрусовых. В большинстве сортов цитрусовых Рубин нефункционален, но в красных апельсинах он усиливает выработку антоцианов, что придает плодам характерный красный цвет. ^[19]

См. также

ЭЖ1

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000118513 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019982 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Чэнь Ю, Сюй Х, Лю Дж, Чжан С, Лойц А, Мо Х (июль 2007 г.). «c-Myb действует как нижестоящая мишень PDGF-опосредованного сигнала выживания в гладкомышечных клетках сосудов». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 360 (2): 433–6. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.06.078 . ПМИД 17599807 .
^ «Ген Энтрез: гомолог вирусного онкогена миелобластоза v-myb (птичий)» .
^ Клемпнауэр К.Х., Саймондс Дж., Эван Г.И., Бишоп Дж.М. (июнь 1984 г.). «Субклеточная локализация белков, кодируемых онкогенами вируса птичьего миелобластоза и вируса птичьего лейкоза Е26 и куриным геном c-myb». Клетка . 37 (2): 537–47. дои : 10.1016/0092-8674(84)90384-2 . ПМИД 6327074 . S2CID 46196167 .
^ Jump up to: ^а ^б Джордж О.Л., Несс С.А. (октябрь 2014 г.). «Ситуационная осведомленность: регуляция транскрипционного фактора myb при дифференцировке, клеточном цикле и онкогенезе» . Раки . 6 (4): 2049–71. дои : 10.3390/cancers6042049 . ПМК 4276956 . ПМИД 25279451 .
^ Страке Р., Вербер М., Вайсхаар Б. (октябрь 2001 г.). «Семейство генов R2R3-MYB у Arabidopsis thaliana». Курс. Мнение. Растительная биол . 4 (5): 447–56. Бибкод : 2001COPB....4..447S . дои : 10.1016/s1369-5266(00)00199-0 . ПМИД 11597504 .
^ Хими Э, Марес DJ, Янагисава А, Нода К (июль 2002 г.). «Влияние гена цвета зерна (R) на покой зерна и чувствительность зародыша к абсцизовой кислоте (АБК) пшеницы» . Дж. Эксп. Бот . 53 (374): 1569–74. дои : 10.1093/jxb/erf005 . ПМИД 12096095 .
^ Винкель-Ширли Б. (июнь 2001 г.). «Биосинтез флавоноидов. Красочная модель для генетики, биохимии, клеточной биологии и биотехнологии» . Физиол растений . 126 (2): 485–93. дои : 10.1104/стр.126.2.485 . ПМК 1540115 . ПМИД 11402179 .
^ Чопра С., Коччиолоне С.М., Бушман С., Сангар В., Макмаллен, доктор медицинских наук, Петерсон Т. (март 2003 г.). «Фактор нестабильности кукурузы для оранжевого цвета1 является доминантным эпигенетическим модификатором тканевого специфически молчащего аллеля цвета околоплодника1» . Генетика . 163 (3): 1135–46. дои : 10.1093/генетика/163.3.1135 . ПМЦ 1462483 . ПМИД 12663550 .
^ Структурный и транскрипционный анализ сложного кластера P1-wr в кукурузе. Вольфганг Геттель, Йоахим Мессинг. XVI конференция «Геномы растений и животных». Архивировано 18 февраля 2012 г. в Wayback Machine.
^ Донг X, Браун Э.Л., Гротеволд Э. (сентябрь 2001 г.). «Функциональная консервативность вторичных метаболических ферментов растений, выявленная путем комплементации мутантов флавоноидов Arabidopsis генами кукурузы» (PDF) . Физиол растений . 127 (1): 46–57. дои : 10.1104/стр.127.1.46 . hdl : 1811/48809 . ПМК 117961 . ПМИД 11553733 .
^ Ли Э.А., Харпер В. (2002). «Супрессор пигментации перикарпа 1 (SPP1), новый ген, участвующий в накоплении флобафена в околоплодниках кукурузы (Zea mays L.)». Майдика . 47 (1): 51–58. ИНИСТ 13772300
^ Гротеволд Э., Драммонд Б.Дж., Боуэн Б., Петерсон Т. (1994). «Гомологичный myb ген P контролирует пигментацию флобафена в цветочных органах кукурузы путем прямой активации подмножества генов биосинтеза флавоноидов». Клетка . 76 (3): 543–554. дои : 10.1016/0092-8674(94)90117-1 . ПМИД 8313474 . S2CID 42197232 .
^ Бодду Дж., Свабек С., Ибрагим Ф., Джонс А.Д., Чопра С. (2005). «Характеристика делеционной аллели желтого семени гена Myb сорго, показывающая потерю 3-дезоксифлавоноидов». Наука о растениях . 169 (3): 542–552. doi : 10.1016/j.plantsci.2005.05.007 . ИНИСТ 16983977
^ Бодду Дж., Цзян С., Сангар В., Олсон Т., Петерсон Т., Чопра С. (январь 2006 г.). «Сравнительная структурная и функциональная характеристика дупликаций сорго и кукурузы, содержащих ортологичные регуляторы транскрипции myb биосинтеза 3-дезоксифлавоноидов». Завод Мол. Биол . 60 (2): 185–99. дои : 10.1007/s11103-005-3568-1 . ПМИД 16429259 . S2CID 23841582 .
^ Бутелли Э., Личчарделло С., Чжан Ю., Лю Дж., Маккей С., Бэйли П., Рефоргиато-Рекуперо Г., Мартин С. (2012). «Ретротранспозоны контролируют специфическое для фруктов холодозависимое накопление антоцианов в красных апельсинах» . Растительная клетка . 24 (3): 1242–55. дои : 10.1105/tpc.111.095232 . ПМЦ 3336134 . ПМИД 22427337 .

Дальнейшее чтение

О, IH, Reddy EP (1999). «Семейство генов myb в росте, дифференцировке и апоптозе клеток» . Онкоген . 18 (19): 3017–33. дои : 10.1038/sj.onc.1202839 . ПМИД 10378697 .
Николаидес Н.К., Гуальди Р., Касадевалл С., Манцелла Л., Калабретта Б. (1991). «Положительная ауторегуляция экспрессии c-myb через сайты связывания Myb в 5'-фланкирующей области человеческого гена c-myb» . Мол. Клетка. Биол . 11 (12): 6166–76. дои : 10.1128/mcb.11.12.6166-6176.1991 . ПМК 361795 . ПМИД 1944282 .
Калькбреннер Ф., Гуманн С., Мёллинг К. (1990). «Активация транскрипции генами c-myb и v-myb человека». Онкоген . 5 (5): 657–61. ПМИД 2189102 .
Вестин Э.Х., Горс К.М., Кларк М.Ф. (1990). «Альтернативный сплайсинг гена c-myb человека». Онкоген . 5 (8): 1117–24. ПМИД 2202948 .
Дасгупта П., Редди EP (1990). «Идентификация альтернативно сплайсированных транскриптов c-myb человека: молекулярное клонирование и анализ последовательностей последовательностей экзона 9A c-myb человека». Онкоген . 4 (12): 1419–23. ПМИД 2687764 .
Янссен Дж.В., Верноле П., де Бур П.А., Остерхейс Дж.В., Коллард Дж.Г. (1986). «Сублокализация c-myb в 6q21----q23 путем гибридизации in situ и экспрессии c-myb при тератокарциноме человека с перестройками 6q». Цитогенет. Клеточная генетика . 41 (3): 129–35. дои : 10.1159/000132217 . ПМИД 3007038 .
Slamon DJ, Boone TC, Murdock DC, Кейт DE, Press MF, Ларсон RA, Соуза LM (1986). «Исследование человеческого гена c-myb и его продукта при острых лейкозах человека». Наука . 233 (4761): 347–51. Бибкод : 1986Sci...233..347S . дои : 10.1126/science.3014652 . ПМИД 3014652 .
Маджелло Б., Кеньон Л.К., Далла-Фавера Р. (1987). «Протоонкоген c-myb человека: нуклеотидная последовательность кДНК и организация геномного локуса» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 83 (24): 9636–40. дои : 10.1073/pnas.83.24.9636 . ПМК 387195 . ПМИД 3540945 .
Щилик С, Скорски Т, Ку Д.Х., Николаидес Н.К., Вэнь С.К., Рудницка Л., Бонати А., Малагуарнера Л., Калабретта Б (1993). «Регуляция пролиферации и экспрессии цитокинов фибробластов костного мозга: роль c-myb» . Дж. Эксп. Мед . 178 (3): 997–1005. дои : 10.1084/jem.178.3.997 . ПМК 2191153 . ПМИД 7688794 .
Криг Дж., Эльгешлегер М., Янкнехт Р., Люшер Б. (1995). «Высокоаффинное связывание ДНК нативного полноразмерного c-Myb и дифференциальная протеолитическая чувствительность его N- и C-концевых доменов». Онкоген . 10 (11): 2221–8. ПМИД 7784067 .
Джейкобс С.М., Горс К.М., Вестин Э.Х. (1994). «Идентификация второго промотора в протоонкогене c-myb человека». Онкоген . 9 (1): 227–35. ПМИД 8302584 .
Фавье Д., Гонда Т.Дж. (1994). «Обнаружение белков, которые связываются с мотивом лейциновой молнии c-Myb». Онкоген . 9 (1): 305–11. ПМИД 8302594 .
Глейзер Р., Лафьюз В.П., Бонно Р.Х., Аткинсон С., Киколт-Глейзер Дж.К. (1993). «Стресс-ассоциированная модуляция экспрессии протоонкогенов в лейкоцитах периферической крови человека». Поведение. Нейроски . 107 (3): 525–9. дои : 10.1037/0735-7044.107.3.525 . ПМИД 8329139 .
Дэш АБ, Оррико ФК, Несс С.А. (1996). «Мотив EVES опосредует как межмолекулярную, так и внутримолекулярную регуляцию c-Myb» . Генс Дев . 10 (15): 1858–69. дои : 10.1101/гад.15.10.1858 . ПМИД 8756344 .
Форбрюгген Г., Ловрич Дж., Мёллинг К. (1997). «Функциональный анализ фосфорилирования серина 532 c-Myb человека с помощью киназы MAP». Биол. Хим . 377 (11): 721–30. дои : 10.1515/bchm3.1996.377.11.721 . ПМИД 8960373 .
Тавнер Ф.Дж., Симпсон Р., Таширо С., Фавье Д., Дженкинс Н.А., Гилберт Д.Д., Коупленд Н.Г., Макмиллан Э.М., Лютвич Дж., Кио Р.А., Исии С., Гонда Т.Дж. (1998). «Молекулярное клонирование показывает, что Myb-связывающий белок p160 представляет собой новый, преимущественно ядрышковый белок, который может играть роль в трансактивации Myb» . Мол. Клетка. Биол . 18 (2): 989–1002. дои : 10.1128/MCB.18.2.989 . ПМЦ 108811 . ПМИД 9447996 .
Хедж С.П., Кумар А., Куршнер С., Шапиро Л.Х. (1998). «c-Maf взаимодействует с c-Myb, регулируя транскрипцию раннего миелоидного гена во время дифференцировки» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2729–37. дои : 10.1128/mcb.18.5.2729 . ПМК 110652 . ПМИД 9566892 .
Леверсон Дж.Д., Коскинен П.Дж., Оррико ФК, Райнио Э.М., Ялканен К.Дж., Дэш А.Б., Эйзенман Р.Н., Несс С.А. (1998). «Киназа Pim-1 и p100 взаимодействуют, усиливая активность c-Myb» . Мол. Клетка . 2 (4): 417–25. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80141-0 . ПМИД 9809063 .
Томпсон М.А., Розенталь М.А., Эллис С.Л., Френд А.Дж., Зорбас М.И., Уайтхед Р.Х., Рамзи Р.Г. (1998). «Снижение уровня регуляции c-Myb связано с дифференцировкой клеток толстой кишки человека, апоптозом и снижением экспрессии Bcl-2». Рак Рез . 58 (22): 5168–75. ПМИД 9823328 .
Вербек В., Гомбарт А.Ф., Чумаков А.М., Мюллер С., Фридман А.Д., Кеффлер Х.П. (1999). «C/EBPepsilon напрямую взаимодействует с ДНК-связывающим доменом c-myb и совместно активирует транскрипцию миелоидных промоторов» . Кровь . 93 (10): 3327–37. дои : 10.1182/blood.V93.10.3327 . ПМИД 10233885 .