КЛФ3

КЛФ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1P7A, 1U85, 1U86
Идентификаторы
Псевдонимы	KLF3 , BKLF, Круппель-подобный фактор 3 (основной), Круппель-подобный фактор 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 609392 ; МГИ : 1342773 ; Гомологен : 7396 ; Генные карты : KLF3 ; ОМА : KLF3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	38,701,517 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	64,990,244 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of thigh; ; human penis; ; mucosa of paranasal sinus; ; jejunal mucosa; ; mucosa of sigmoid colon; ; trabecular bone; ; mucosa of pharynx; ; oral cavity; ; gums; ; vulva;
	Top expressed in
	left colon; ; epithelium of stomach; ; skin of external ear; ; genital tubercle; ; conjunctival fornix; ; Paneth cell; ; left lung lobe; ; blood; ; gastrula; ; mesenteric lymph nodes;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; protein binding; metal ion binding; nucleic acid binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm;
Biological process	multicellular organism development; cellular response to peptide; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51274
	16599
	ENSG00000109787
	ENSMUSG00000029178
	P57682
	Q60980
	НМ_016531
	НМ_008453
	НП_057615
	НП_032479
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Круппелеподобный фактор 3 — это белок , который у человека кодируется KLF3 геном .

Структура

KLF3, первоначально названный «Основной фактор, подобный фактору Круппеля» (BKLF), был третьим факторов, подобных факторам Круппеля членом семейства «цинковых пальцев» . , транскрипционных факторов открытым ^[5] Факторы транскрипции этого семейства связывают ДНК посредством трех характерных трех _{C 2} H ₂ цинковых пальцев на их С-концах . Поскольку их ДНК-связывающие домены высококонсервативны внутри семейства, все белки KLF распознают CACCC или CGCCC-боксы общей формы NCR CRC CCN (где N — любое основание, а R — пурин ).

Функция

Хотя С-концы у разных KLF одинаковы, N-концы различаются, и, соответственно, разные KLF могут либо активировать, либо подавлять транскрипцию, либо и то, и другое. KLF3, по-видимому, действует преимущественно как репрессор транскрипции. Это выключает гены. Он делает это путем привлечения ко-репрессоров С-концевого связывающего белка CTBP1 и CTBP2 . ^[6]^[7] CtBP стыкуется с коротким мотивом (остатки 61-65) на N-конце KLF3 общей формы Пролин – Изолейцин – Аспартат – Лейцин – Серин (мотив PIDLS). ^[6]^[7] CtBP, в свою очередь, привлекает ферменты, модифицирующие гистоны, для изменения хроматина и подавления экспрессии генов.

KLF3 высоко экспрессируется в эритроцитах или эритроцитах. Здесь он управляется другим KLF, эритроидным KLF или KLF1 , и его экспрессия увеличивается по мере созревания эритроидных клеток. Исследования на нокаутных мышах выявили легкую анемию в отсутствие функционального KLF3 и дерепрессию нескольких генов-мишеней, которые содержат CACCC-боксы в своих регуляторных областях. ^[8] Многие из этих генов активируются KLF1, следовательно, очевидно, что KLF3 действует по принципу отрицательной обратной связи , чтобы сбалансировать активирующий потенциал KLF1. KLF3 также регулирует другой репрессивный KLF, KLF8 . ^[9] Таким образом, KLF1, KLF3 и KLF8 работают в тесной регулирующей сети. KLF3 и KLF8 могут иметь избыточные функции, поскольку у мышей, лишенных как KLF3, так и KLF8, наблюдаются более серьезные дефекты, чем при любом одиночном нокауте. Они умирают внутриутробно примерно на 14-й день беременности. ^[10]

KLF3 не только экспрессируется в эритроидных клетках, но и в других типах клеток, и анализ нокаутных мышей выявил дефекты, влияющие на жировую ткань. ^[11] и В-клетки . ^[12] Мыши с дефицитом KLF3 имеют меньше жировой ткани и признаки метаболического здоровья, что может быть связано с дерепрессией гена адипокинового гормона адиполина . ^[13] Роль KLF3 в B-лимфоцитах сложна, но, по-видимому, он действует в сети с KLF2 и KLF4, влияя на переключение между селезенки маргинальной зоной и фолликулярными B-клетками . ^[14]

Взаимодействия

Было показано, что KLF3 взаимодействует с:

CTBP2 ^[6]^[7] и
ФХЛ3 . ^[6]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109787 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029178 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кроссли М. (апрель 1996 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей BKLF/TEF-2, основной белок, связывающий CACCC-бокс, в эритроидных клетках и некоторых других клетках» . Мол. Клетка. Биол . 16 (4): 1695–705. дои : 10.1128/mcb.16.4.1695 . ПМК 231156 . ПМИД 8657145 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Тернер Дж., Николас Х., Бишоп Д., Мэтьюз Дж. М., Кроссли М. (2003). «Белок LIM FHL3 связывает основной Krüppel-подобный фактор/Krüppel-подобный фактор 3 и его ко-репрессорный C-концевой связывающий белок 2» . Ж. Биол. Хим . 278 (15): 12786–95. дои : 10.1074/jbc.M300587200 . ПМИД 12556451 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Тернер Дж., Кроссли М. (1998). «Клонирование и характеристика mCtBP2, ко-репрессора, который связывается с основным фактором Круппеля и другими регуляторами транскрипции млекопитающих» . ЭМБО Дж . 17 (17): 5129–40. дои : 10.1093/emboj/17.17.5129 . ПМК 1170841 . ПМИД 9724649 .
^ Funnell AP, Norton LJ, Mak KS, Burdach J, Artuz CM, Twine NA, Wilkins MR, Power CA, Hung TT, Perdomo J, Koh P, Bell-Anderson KS, Orkin SH, Fraser ST, Perkins AC, Pearson RC, Кроссли М. (август 2012 г.). «CACCC-связывающий белок KLF3/BKLF репрессирует подмножество генов-мишеней KLF1/EKLF и необходим для правильного созревания эритроидов in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 32 (16): 3281–92. дои : 10.1128/MCB.00173-12 . ПМЦ 3434552 . ПМИД 22711990 .
^ Итон С.А., Funnell AP, Сью Н., Николас Х., Пирсон Р.К., Кроссли М. (август 2008 г.). «Сеть факторов, подобных Круппелю (Klfs). Klf8 подавляется Klf3 и активируется Klf1 in vivo» . Ж. Биол. Хим . 283 (40): 26937–47. дои : 10.1074/jbc.M804831200 . ПМК 2556010 . ПМИД 18687676 .
^ Funnell AP, Mak KS, Twine NA, Pelka GJ, Norton LJ, Radziewic T, Power M, Wilkins MR, Bell-Anderson KS, Fraser ST, Perkins AC, Tam PP, Pearson RC, Crossley M (август 2013 г.). «Поколение мышей с дефицитом KLF3/BKLF и KLF8 показывает генетическое взаимодействие и роль этих факторов в подавлении эмбрионального глобинового гена» . Мол. Клетка. Биол . 33 (15): 2976–87. дои : 10.1128/MCB.00074-13 . ПМЦ 3719677 . ПМИД 23716600 .
^ Сью Н., Джек Б.Х., Итон С.А., Пирсон Р.К., Фаннелл А.П., Тернер Дж., Чолидж Р., Деньер Г., Бао С., Молеро-Навахас Дж.К., Перкинс А., Фудзивара Ю., Оркин Ш., Белл-Андерсон К., Кроссли М. (июнь 2008). «Направленное разрушение основного гена круппелеподобного фактора (Klf3) раскрывает роль в адипогенезе» . Мол Клеточная Биол . 28 (12): 3967–78. дои : 10.1128/MCB.01942-07 . ПМЦ 2423134 . ПМИД 18391014 .
^ Ву Т., Гатто Д., Тернер В., Фаннелл А.П., Мак К.С., Нортон Л.Дж., Каплан В., Коули М.Дж., Аженес Ф., Кирберг Дж., Бринк Р., Пирсон Р.К., Кроссли М. (ноябрь 2011 г.). «Нарушение развития В-клеток в отсутствие Круппелеподобного фактора 3» . Дж. Иммунол . 187 (10): 5032–42. doi : 10.4049/jimmunol.1101450 . ПМИД 22003205 .
^ Белл-Андерсон К.С., Фаннелл А.П., Уильямс Х., Мэт Джусо Х., Скалли Т., Лим В.Ф., Бурдах Дж.Г., Мак К.С., Найтс А.Дж., Хой Эй.Дж., Николас Х.Р., Сэйнсбери А., Тернер Н., Пирсон Р.К., Кроссли М. (апрель 2013 г.) ). «Потеря Круппелеподобного фактора 3 (KLF3/BKLF) приводит к усилению регуляции инсулино-сенсибилизирующего фактора адиполина (FAM132A/CTRP12/C1qdc2)» . Диабет . 62 (8): 2728–37. дои : 10.2337/db12-1745 . ПМЦ 3717849 . ПМИД 23633521 .
^ Пирсон Р.К., Funnell AP, Кроссли М. (февраль 2011 г.). «Фактор транскрипции цинковых пальцев млекопитающих, подобный Круппелю фактор 3 (KLF3/BKLF)» . ИУБМБ Жизнь . 63 (2): 86–93. дои : 10.1002/iub.422 . ПМИД 21360637 . S2CID 38842040 .

Дальнейшее чтение

Тернер Дж., Кроссли М. (2000). «Основной фактор, подобный Круппелю, функционирует в сети взаимодействующих гематопоэтических факторов транскрипции». Межд. Дж. Биохим. Клеточная Биол . 31 (10): 1169–74. дои : 10.1016/S1357-2725(99)00067-9 . ПМИД 10582345 .
Ван MJ, Цюй XH, Ван Л.С., Чжай Ю, Ву С.Л., Хэ ФК (2003). «Клонирование кДНК, субклеточная локализация и тканевая экспрессия нового человеческого фактора транскрипции, подобного круппелю: основного человеческого фактора, подобного круппелю (hBKLF)». И Чуань Сюэ Бао . 30 (1): 1–9. ПМИД 12812068 .
Пердомо Дж., Вергер А., Тернер Дж., Кроссли М. (2005). «Роль модификации SUMO в облегчении репрессии транскрипции с помощью BKLF» . Мол. Клетка. Биол . 25 (4): 1549–59. дои : 10.1128/MCB.25.4.1549-1559.2005 . ПМК 548027 . ПМИД 15684403 .
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (2006) / Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» Genome Res . 16 (1): 55–65. : 10.1101 gr.4039406 . PMID . . « 16344560 doi
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Внешние ссылки

Белок KLF3, человеческий, в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109787 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029178 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Кроссли М. (апрель 1996 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей BKLF/TEF-2, основной белок, связывающий CACCC-бокс, в эритроидных клетках и некоторых других клетках» . Мол. Клетка. Биол . 16 (4): 1695–705. дои : 10.1128/mcb.16.4.1695 . ПМК 231156 . ПМИД 8657145 .

[pmid12556451-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Тернер Дж., Николас Х., Бишоп Д., Мэтьюз Дж. М., Кроссли М. (2003). «Белок LIM FHL3 связывает основной Krüppel-подобный фактор/Krüppel-подобный фактор 3 и его ко-репрессорный C-концевой связывающий белок 2» . Ж. Биол. Хим . 278 (15): 12786–95. дои : 10.1074/jbc.M300587200 . ПМИД 12556451 .

[pmid9724649-7] Jump up to: ^а ^б ^с Тернер Дж., Кроссли М. (1998). «Клонирование и характеристика mCtBP2, ко-репрессора, который связывается с основным фактором Круппеля и другими регуляторами транскрипции млекопитающих» . ЭМБО Дж . 17 (17): 5129–40. дои : 10.1093/emboj/17.17.5129 . ПМК 1170841 . ПМИД 9724649 .

[pmid22711990-8] Funnell AP, Norton LJ, Mak KS, Burdach J, Artuz CM, Twine NA, Wilkins MR, Power CA, Hung TT, Perdomo J, Koh P, Bell-Anderson KS, Orkin SH, Fraser ST, Perkins AC, Pearson RC, Кроссли М. (август 2012 г.). «CACCC-связывающий белок KLF3/BKLF репрессирует подмножество генов-мишеней KLF1/EKLF и необходим для правильного созревания эритроидов in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 32 (16): 3281–92. дои : 10.1128/MCB.00173-12 . ПМЦ 3434552 . ПМИД 22711990 .

[9] Итон С.А., Funnell AP, Сью Н., Николас Х., Пирсон Р.К., Кроссли М. (август 2008 г.). «Сеть факторов, подобных Круппелю (Klfs). Klf8 подавляется Klf3 и активируется Klf1 in vivo» . Ж. Биол. Хим . 283 (40): 26937–47. дои : 10.1074/jbc.M804831200 . ПМК 2556010 . ПМИД 18687676 .

[pmid23716600-10] Funnell AP, Mak KS, Twine NA, Pelka GJ, Norton LJ, Radziewic T, Power M, Wilkins MR, Bell-Anderson KS, Fraser ST, Perkins AC, Tam PP, Pearson RC, Crossley M (август 2013 г.). «Поколение мышей с дефицитом KLF3/BKLF и KLF8 показывает генетическое взаимодействие и роль этих факторов в подавлении эмбрионального глобинового гена» . Мол. Клетка. Биол . 33 (15): 2976–87. дои : 10.1128/MCB.00074-13 . ПМЦ 3719677 . ПМИД 23716600 .

[pmid18391014-11] Сью Н., Джек Б.Х., Итон С.А., Пирсон Р.К., Фаннелл А.П., Тернер Дж., Чолидж Р., Деньер Г., Бао С., Молеро-Навахас Дж.К., Перкинс А., Фудзивара Ю., Оркин Ш., Белл-Андерсон К., Кроссли М. (июнь 2008). «Направленное разрушение основного гена круппелеподобного фактора (Klf3) раскрывает роль в адипогенезе» . Мол Клеточная Биол . 28 (12): 3967–78. дои : 10.1128/MCB.01942-07 . ПМЦ 2423134 . ПМИД 18391014 .

[pmid22003205-12] Ву Т., Гатто Д., Тернер В., Фаннелл А.П., Мак К.С., Нортон Л.Дж., Каплан В., Коули М.Дж., Аженес Ф., Кирберг Дж., Бринк Р., Пирсон Р.К., Кроссли М. (ноябрь 2011 г.). «Нарушение развития В-клеток в отсутствие Круппелеподобного фактора 3» . Дж. Иммунол . 187 (10): 5032–42. doi : 10.4049/jimmunol.1101450 . ПМИД 22003205 .

[pmid23633521-13] Белл-Андерсон К.С., Фаннелл А.П., Уильямс Х., Мэт Джусо Х., Скалли Т., Лим В.Ф., Бурдах Дж.Г., Мак К.С., Найтс А.Дж., Хой Эй.Дж., Николас Х.Р., Сэйнсбери А., Тернер Н., Пирсон Р.К., Кроссли М. (апрель 2013 г.) ). «Потеря Круппелеподобного фактора 3 (KLF3/BKLF) приводит к усилению регуляции инсулино-сенсибилизирующего фактора адиполина (FAM132A/CTRP12/C1qdc2)» . Диабет . 62 (8): 2728–37. дои : 10.2337/db12-1745 . ПМЦ 3717849 . ПМИД 23633521 .

[pmid21360637-14] Пирсон Р.К., Funnell AP, Кроссли М. (февраль 2011 г.). «Фактор транскрипции цинковых пальцев млекопитающих, подобный Круппелю фактор 3 (KLF3/BKLF)» . ИУБМБ Жизнь . 63 (2): 86–93. дои : 10.1002/iub.422 . ПМИД 21360637 . S2CID 38842040 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]