CTBP2

CTBP2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2OME, 4LCJ
Идентификаторы
Псевдонимы	CTBP2 , С-концевой связывающий белок 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 602619 ; МГИ : 1201686 ; Гомологен : 75187 ; Генные карты : CTBP2 ; OMA : CTBP2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	125,161,170 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	133,124,354 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; buccal mucosa cell; ; mucosa of paranasal sinus; ; pylorus; ; cardia; ; retinal pigment epithelium; ; renal medulla; ; dorsal motor nucleus of vagus nerve; ; nasal epithelium; ; caput epididymis;
	Top expressed in
	saccule; ; otic placode; ; otic vesicle; ; migratory enteric neural crest cell; ; abdominal wall; ; retina; ; epiblast; ; Gonadal ridge; ; neural layer of retina; ; vas deferens;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor; NAD binding; protein binding; oxidoreductase activity; hydroxypyruvate reductase activity; protein kinase binding; glyoxylate reductase (NADP+) activity; protein homodimerization activity; protein-containing complex binding; transcription corepressor activity; chromatin binding; transcription coactivator activity; retinoic acid receptor binding; structural constituent of presynaptic active zone;
Cellular component	synapse; cell junction; nucleus; cytosol; transcription repressor complex; ribbon synapse; presynaptic active zone cytoplasmic component; glutamatergic synapse; GABA-ergic synapse; presynaptic cytosol; photoreceptor ribbon synapse;
Biological process	cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; viral genome replication; transcription, DNA-templated; metabolism; viral process; negative regulation of cell population proliferation; negative regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of retinoic acid receptor signaling pathway; white fat cell differentiation; positive regulation of chromatin binding; cellular response to leukemia inhibitory factor; synaptic vesicle docking; maintenance of presynaptic active zone structure;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1488
	13017
	ENSG00000175029
	ENSMUSG00000030970
	P56545
	P56546
showНМ_001083914 ; НМ_001290214 ; НМ_001290215 ; НМ_001329 ; НМ_022802 ;
	NM_001321012; NM_001321013; NM_001321014; NM_001363508
	НМ_001170744 ; НМ_009980 ; НМ_001347623
showНП_001077383 ; НП_001277143 ; НП_001277144 ; НП_001307941 ; НП_001307942 ;
	NP_001307943; NP_001320; NP_073713; NP_001350437
	НП_001164215 ; НП_001334552 ; НП_034110
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

С-концевой связывающий белок 2, также известный как CtBP2, представляет собой белок , который у человека кодируется CTBP2 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

CtBP - CtBP1 и CtBP2 у млекопитающих - являются одними из наиболее изученных корепрессоров транскрипции . ^[8] Обычно они отключают свои целевые гены. Они делают это путем связывания с ДНК-связывающими белками, специфичными для последовательности, которые несут короткий мотив общей формы пролин-изолейцин-аспартат-лейцин-серин (мотив PIDLS). Затем они рекрутируют ферменты, модифицирующие гистоны, деацетилазы гистонов гистонов , метилазы и деметилазы гистонов . Считается, что эти ферменты работают вместе, удаляя активирующие и добавляя репрессивные гистоновые метки. Например, гистондеацетилаза 1 ( HDAC1 ) и HDAC2 могут удалять активирующую метку гистона 3 ацетиллизина 9 (H3K9Ac), затем гистонметилаза G9a может добавлять метильные группы, в то время как деметилаза гистонов лизинспецифическая деметилаза 1 ( LSD1 ) может удалять активирующий отметьте H3K4me. ^[9]

CtBP связываются со многими различными ДНК-связывающими белками, а также с ко-репрессорами, которые сами связаны с ДНК-связывающими белками, такими как Friend of GATA ( Fog ). ^[10] CtBP также могут димеризоваться и мультимеризоваться, образуя мостики с более крупными транскрипционными комплексами. По-видимому, они представляют собой в первую очередь каркасные белки, которые позволяют собирать комплексы репрессии генов.

Одним из интересных аспектов CtBP является их способность связываться с НАДН и, в меньшей степени, с НАД. ⁺. Было высказано предположение, что это позволит им определять метаболический статус клетки и регулировать гены в ответ на изменения НАДН/НАД. ⁺ соотношение. Соответственно, было обнаружено, что CtBP играют важную роль в биологии жира, связываясь с ключевыми белками, такими как PRDM16 , NRIP и FOG2 . ^[11]

Полную функциональную роль белков CtBP у млекопитающих трудно оценить из-за частичной избыточности между CtBP1 и CtBP2. ^[12] Аналогичным образом, ранняя летальность мышей с нокаутом CtBP2 и мышей с двойным нокаутом не позволила провести детальный анализ клеточных эффектов удаления этих белков. Важные результаты были получены на модельных организмах, в которых имеется только один ген CtBP. У дрозофилы CtBP участвует в развитии и циркадных ритмах . ^[13] У червя C. elegans CtBP участвует в продолжительности жизни. ^[14] И циркадные ритмы, и продолжительность жизни, по-видимому, связаны с метаболизмом, что подтверждает роль CtBP в метаболическом восприятии.

Ген CtBP2 млекопитающих производит альтернативные транскрипты, кодирующие два разных белка. В дополнение к репрессору транскрипции ( корепрессору ), обсуждавшемуся выше, существует более длинная изоформа, которая является основным компонентом специализированных синапсов, известных как синаптические ленты . Оба белка содержат НАД. ⁺ связывающий домен, аналогичный NAD ⁺-зависимые дегидрогеназы 2-гидроксикислот . Часть 3'-нетранслируемой области была использована для картирования этого гена на хромосоме 21q21.3; однако было отмечено, что вероятны аналогичные локусы и в других частях генома. Бластный анализ показывает, что этот ген присутствует на хромосоме 10. ^[7]

Альтернативное использование промоутера

позвоночных В сетчатке ген CtBP2 транскрибируется с альтернативных промоторов во время развития сетчатки, образуя корегулятор транскрипции CTBP2, а также более крупный белок RIBEYE, поддерживающий ленточные синапсы. ^[15] Многофункциональная функциональность локуса CtBP2, по-видимому, сохраняется в сетчатке птиц и приматов, при этом выработка мРНК RIBEYE задерживается в процессе развития за счет эпигенетического механизма молчания. ^[16] В развивающейся сетчатке человека транскрипция изоформы мРНК RIBEYE эпигенетически регулируется посредством метилирования ДНК . Последовательности ДНК, содержащие проксимальный промотор RIBEYE, обогащены метилированием ДНК и задержкой транскрипции этой изоформы, возможно, за счет ингибирования связывания транскрипционного фактора гомеобокса конуса-стержня (CRX) . ^[16] сетчатки, полученных из плюрипотентных стволовых клеток человека (hPSC), Анализ глобальных транскриптов трехмерных органоидов демонстрирует раннюю и постоянную экспрессию изоформы CTPB2 с последующей отсроченной экспрессией RIBEYE в развивающемся человеческом глазу. ^[17]

Взаимодействия

Было показано, что CTBP2 взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000175029 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030970 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Тернер Дж., Кроссли М. (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика mCtBP2, ко-репрессора, который связывается с основным фактором Круппеля и другими регуляторами транскрипции млекопитающих» . ЭМБО Дж . 17 (17): 5129–40. дои : 10.1093/emboj/17.17.5129 . ПМК 1170841 . ПМИД 9724649 .
^ Чиннадурай Г. (февраль 2002 г.). «CtBP, нетрадиционный корепрессор транскрипции в развитии и онкогенезе» . Мол. Клетка . 9 (2): 213–24. дои : 10.1016/S1097-2765(02)00443-4 . ПМИД 11864595 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: С-концевой связывающий белок 2 CTBP2» .
^ Тернер Дж., Кроссли М. (август 2001 г.). «Семейство CtBP: загадочные и ферментативные корепрессоры транскрипции» . Биоэссе . 23 (8): 683–90. дои : 10.1002/bies.1097 . ПМИД 11494316 . S2CID 22273095 .
^ Ши Ю, Лан Ф, Мэтсон С, Маллиган П, Уэтстайн-младший, Коул П.А., Касеро Р.А., Ши Ю (декабрь 2004 г.). «Деметилирование гистонов, опосредованное гомологом ядерной аминоксидазы LSD1» . Клетка . 119 (7): 941–53. дои : 10.1016/j.cell.2004.12.012 . ПМИД 15620353 . S2CID 10847230 .
^ Фокс А.Х., Лью С., Холмс М., Ковальски К., Маккей Дж., Кроссли М. (май 1999 г.). «Транскрипционные кофакторы семейства FOG взаимодействуют с белками GATA посредством множества цинковых пальцев» . ЭМБО Дж . 18 (10): 2812–22. дои : 10.1093/emboj/18.10.2812 . ПМЦ 1171362 . ПМИД 10329627 .
^ Джек Б.Х., Пирсон Р.К., Кроссли М. (май 2011 г.). «С-концевой связывающий белок: метаболический сенсор, участвующий в регуляции адипогенеза». Межд. Дж. Биохим. Клеточная Биол . 43 (5): 693–6. doi : 10.1016/j.biocel.2011.01.017 . ПМИД 21281737 .
^ Хильдебранд Дж. Д., Сориано П. (август 2002 г.). «Перекрывающиеся и уникальные роли С-концевого связывающего белка 1 (CtBP1) и CtBP2 во время развития мышей» . Мол. Клетка. Биол . 22 (15): 5296–307. дои : 10.1128/mcb.22.15.5296-5307.2002 . ПМЦ 133942 . ПМИД 12101226 .
^ Ито TQ, Мацумото А, Танимура Т (2013). «С-концевой связывающий белок (CtBP) активирует экспрессию генов часов E-box с помощью CLOCK/CYCLE у дрозофилы» . ПЛОС ОДИН . 8 (4): е63113. Бибкод : 2013PLoSO...863113I . дои : 10.1371/journal.pone.0063113 . ПМК 3640014 . ПМИД 23646183 .
^ Чен С., Уэтстин-младший, Гош С., Ганновер Дж.А., Гали Р.Р., Гросу П., Ши Ю (февраль 2009 г.). «Консервативный НАД(Н)-зависимый корепрессор CTBP-1 регулирует продолжительность жизни Caenorhabditis elegans» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 106 (5): 1496–501. Бибкод : 2009PNAS..106.1496C . дои : 10.1073/pnas.0802674106 . ПМЦ 2635826 . ПМИД 19164523 .
^ Шмитц Ф., Кенигсторфер А. и Судхоф Т.К. (2000). «РИБАЙ, компонент синаптических лент: путь белка в процессе эволюции дает представление о функции синаптических лент» . Нейрон . 28 (3): 857–872. дои : 10.1016/s0896-6273(00)00159-8 . ПМИД 11163272 .
^ Jump up to: ^а ^б Гейдж Э., Агарвал Д., Шено С., Вашингтон-Браун К., Светец С., Джахан Н., Ван З., Джонс М., Зак, Энке Р.А., Валин К.Дж. (январь 2022 г.). «Временная и специфичная для изоформы экспрессия CTBP2 эволюционно консервативна между развивающейся сетчаткой курицы и человека» . Передний. Мол. Нейроски . 14 : 773356. doi : 10.3389/fnmol.2021.773356 . ПМЦ 8793361 . ПМИД 35095414 .
^ Агарвал Д., Кунс Р., Димитриу С., Барлоу Э., Валин К.Дж., Энке Р.А. (декабрь 2022 г.). «Анализ объемного секвенирования РНК для разработки органоидов сетчатки, полученных из плюрипотентных стволовых клеток человека» . наук. Данные . 9 (1): 759. doi : 10.1038/s41597-022-01853-x . ПМЦ 9734101 . ПМИД 36494376 .
^ Jump up to: ^а ^б Тернер Дж., Николас Х., Бишоп Д., Мэтьюз Дж. М., Кроссли М. (2003). «Белок LIM FHL3 связывает основной Krüppel-подобный фактор/Krüppel-подобный фактор 3 и его ко-репрессорный C-концевой связывающий белок 2» . Ж. Биол. Хим . 278 (15): 12786–95. дои : 10.1074/jbc.M300587200 . ПМИД 12556451 .
^ ван Влит Дж., Тернер Дж., Кроссли М. (2000). «Человеческий фактор 8, подобный Круппелю: белок, связывающий CACCC-бокс, который связывается с CtBP и подавляет транскрипцию» . Нуклеиновые кислоты Рез . 28 (9): 1955–62. дои : 10.1093/нар/28.9.1955 . ПМЦ 103308 . ПМИД 10756197 .
^ Мирнезами А.Х., Кэмпбелл С.Дж., Дарли М., Примроуз Дж.Н., Джонсон П.В., Блейдс Дж.П. (2003). «Hdm2 привлекает чувствительный к гипоксии корепрессор для негативной регуляции p53-зависимой транскрипции» (PDF) . Курс. Биол . 13 (14): 1234–9. Бибкод : 2003CBio...13.1234M . дои : 10.1016/S0960-9822(03)00454-8 . ПМИД 12867035 . S2CID 2451241 .
^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Касте А, Булатуф А, Версини Ж, Бонне С, Ожеро П, Виньон Ф, Хохбин С, Жалагье С, Кавайлес В (2004). «Множественные домены взаимодействующего с рецептором белка 140 способствуют ингибированию транскрипции» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (6): 1957–66. дои : 10.1093/nar/gkh524 . ПМК 390375 . ПМИД 15060175 .
^ Мураками А., Исида С., Терлоу Дж., Ревест Дж. М., Диксон С. (2001). «SOX6 связывает CtBP2, подавляя транскрипцию промотора Fgf-3» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (16): 3347–55. дои : 10.1093/нар/29.16.3347 . ПМЦ 55854 . ПМИД 11504872 .
^ Холмс М., Тернер Дж., Фокс А., Чисхолм О., Кроссли М., Чонг Б. (1999). «hFOG-2, новый белок цинковых пальцев, связывает ко-репрессор mCtBP2 и модулирует GATA-опосредованную активацию» . Ж. Биол. Хим . 274 (33): 23491–8. дои : 10.1074/jbc.274.33.23491 . ПМИД 10438528 .

Дальнейшее чтение

Шепер У., Бойд Дж.М., Верма С., Ульманн Э., Субраманиан Т., Чиннадурай Г. (ноябрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика клеточного фосфопротеина, который взаимодействует с консервативным С-концевым доменом аденовируса Е1А, участвующим в негативной модуляции онкогенной трансформации» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (23): 10467–71. Бибкод : 1995PNAS...9210467S . дои : 10.1073/pnas.92.23.10467 . ПМК 40632 . ПМИД 7479821 .
Севальт Р.Г., Гюнстер М.Дж., ван дер Влаг Дж., Сатин Д.П., Отте А.П. (январь 1999 г.). «С-концевой связывающий белок представляет собой репрессор транскрипции, который взаимодействует с определенным классом белков Polycomb позвоночных» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 777–87. дои : 10.1128/MCB.19.1.777 . ПМК 83934 . ПМИД 9858600 .
Фурусава Т., Морибе Х., Кондо Х., Хигаси Ю. (декабрь 1999 г.). «Идентификация CtBP1 и CtBP2 как корепрессоров гомеодоменного фактора цинковых пальцев deltaEF1» . Мол. Клетка. Биол . 19 (12): 8581–90. дои : 10.1128/mcb.19.12.8581 . ПМК 84984 . ПМИД 10567582 .
Ю Х, Баер Р. (июнь 2000 г.). «Ядерная локализация и специфическая для клеточного цикла экспрессия CtIP, белка, который связывается с опухолевым супрессором BRCA1» . Ж. Биол. Хим . 275 (24): 18541–9. дои : 10.1074/jbc.M909494199 . ПМИД 10764811 .
Шмитц Ф, Кенигсторфер А, Зюдхоф ТЦ (декабрь 2000 г.). «РИБАЙ, компонент синаптических лент: путь белка в процессе эволюции дает представление о функции синаптических лент» . Нейрон . 28 (3): 857–72. дои : 10.1016/S0896-6273(00)00159-8 . ПМИД 11163272 . S2CID 15695695 .
Валента Т., Лукас Дж., Коринек В. (май 2003 г.). «Взаимодействие фактора транскрипции HMG-бокса TCF-4 с CtBP1 контролирует экспрессию целевого Wnt Axin2/Conductin в клетках эмбриональных почек человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (9): 2369–80. дои : 10.1093/нар/gkg346 . ПМЦ 154232 . ПМИД 12711682 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Г.Дж., Ли Ю, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л.В. (июнь 2004 г.). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Нат. Биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Алпатов Р., Мунгуба Г.К., Катон П., Джу Дж.Х., Ши Ю, Ши Ю., Хант М.Э., Сагрю С.П. (декабрь 2004 г.). «Белок Pnn/DRS, ассоциированный с ядерными спеклами, связывается с корепрессором транскрипции CtBP и снимает опосредованную CtBP репрессию гена E-кадгерина» . Мол. Клетка. Биол . 24 (23): 10223–35. дои : 10.1128/MCB.24.23.10223-10235.2004 . ПМК 529029 . ПМИД 15542832 .

Внешние ссылки

ФакторБук CtBP2
человека Местоположение генома CTBP2 и CTBP2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000175029 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030970 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9724649-5] Jump up to: ^а ^б Тернер Дж., Кроссли М. (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика mCtBP2, ко-репрессора, который связывается с основным фактором Круппеля и другими регуляторами транскрипции млекопитающих» . ЭМБО Дж . 17 (17): 5129–40. дои : 10.1093/emboj/17.17.5129 . ПМК 1170841 . ПМИД 9724649 .

[pmid11864595-6] Чиннадурай Г. (февраль 2002 г.). «CtBP, нетрадиционный корепрессор транскрипции в развитии и онкогенезе» . Мол. Клетка . 9 (2): 213–24. дои : 10.1016/S1097-2765(02)00443-4 . ПМИД 11864595 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: С-концевой связывающий белок 2 CTBP2» .

[pmid11494316-8] Тернер Дж., Кроссли М. (август 2001 г.). «Семейство CtBP: загадочные и ферментативные корепрессоры транскрипции» . Биоэссе . 23 (8): 683–90. дои : 10.1002/bies.1097 . ПМИД 11494316 . S2CID 22273095 .

[pmid15620353-9] Ши Ю, Лан Ф, Мэтсон С, Маллиган П, Уэтстайн-младший, Коул П.А., Касеро Р.А., Ши Ю (декабрь 2004 г.). «Деметилирование гистонов, опосредованное гомологом ядерной аминоксидазы LSD1» . Клетка . 119 (7): 941–53. дои : 10.1016/j.cell.2004.12.012 . ПМИД 15620353 . S2CID 10847230 .

[pmid10329627-10] Фокс А.Х., Лью С., Холмс М., Ковальски К., Маккей Дж., Кроссли М. (май 1999 г.). «Транскрипционные кофакторы семейства FOG взаимодействуют с белками GATA посредством множества цинковых пальцев» . ЭМБО Дж . 18 (10): 2812–22. дои : 10.1093/emboj/18.10.2812 . ПМЦ 1171362 . ПМИД 10329627 .

[pmid21281737-11] Джек Б.Х., Пирсон Р.К., Кроссли М. (май 2011 г.). «С-концевой связывающий белок: метаболический сенсор, участвующий в регуляции адипогенеза». Межд. Дж. Биохим. Клеточная Биол . 43 (5): 693–6. doi : 10.1016/j.biocel.2011.01.017 . ПМИД 21281737 .

[pmid12101226-12] Хильдебранд Дж. Д., Сориано П. (август 2002 г.). «Перекрывающиеся и уникальные роли С-концевого связывающего белка 1 (CtBP1) и CtBP2 во время развития мышей» . Мол. Клетка. Биол . 22 (15): 5296–307. дои : 10.1128/mcb.22.15.5296-5307.2002 . ПМЦ 133942 . ПМИД 12101226 .

[pmid23646183-13] Ито TQ, Мацумото А, Танимура Т (2013). «С-концевой связывающий белок (CtBP) активирует экспрессию генов часов E-box с помощью CLOCK/CYCLE у дрозофилы» . ПЛОС ОДИН . 8 (4): е63113. Бибкод : 2013PLoSO...863113I . дои : 10.1371/journal.pone.0063113 . ПМК 3640014 . ПМИД 23646183 .

[pmid19164523-14] Чен С., Уэтстин-младший, Гош С., Ганновер Дж.А., Гали Р.Р., Гросу П., Ши Ю (февраль 2009 г.). «Консервативный НАД(Н)-зависимый корепрессор CTBP-1 регулирует продолжительность жизни Caenorhabditis elegans» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 106 (5): 1496–501. Бибкод : 2009PNAS..106.1496C . дои : 10.1073/pnas.0802674106 . ПМЦ 2635826 . ПМИД 19164523 .

[doi10.1016/s0896-6273(00)00159-8-15] Шмитц Ф., Кенигсторфер А. и Судхоф Т.К. (2000). «РИБАЙ, компонент синаптических лент: путь белка в процессе эволюции дает представление о функции синаптических лент» . Нейрон . 28 (3): 857–872. дои : 10.1016/s0896-6273(00)00159-8 . ПМИД 11163272 .

[doi10.3389/fnmol.2021.773356-16] Jump up to: ^а ^б Гейдж Э., Агарвал Д., Шено С., Вашингтон-Браун К., Светец С., Джахан Н., Ван З., Джонс М., Зак, Энке Р.А., Валин К.Дж. (январь 2022 г.). «Временная и специфичная для изоформы экспрессия CTBP2 эволюционно консервативна между развивающейся сетчаткой курицы и человека» . Передний. Мол. Нейроски . 14 : 773356. doi : 10.3389/fnmol.2021.773356 . ПМЦ 8793361 . ПМИД 35095414 .

[10.1038/s41597-022-01853-x-17] Агарвал Д., Кунс Р., Димитриу С., Барлоу Э., Валин К.Дж., Энке Р.А. (декабрь 2022 г.). «Анализ объемного секвенирования РНК для разработки органоидов сетчатки, полученных из плюрипотентных стволовых клеток человека» . наук. Данные . 9 (1): 759. doi : 10.1038/s41597-022-01853-x . ПМЦ 9734101 . ПМИД 36494376 .

[pmid12556451-18] Jump up to: ^а ^б Тернер Дж., Николас Х., Бишоп Д., Мэтьюз Дж. М., Кроссли М. (2003). «Белок LIM FHL3 связывает основной Krüppel-подобный фактор/Krüppel-подобный фактор 3 и его ко-репрессорный C-концевой связывающий белок 2» . Ж. Биол. Хим . 278 (15): 12786–95. дои : 10.1074/jbc.M300587200 . ПМИД 12556451 .

[pmid10756197-19] ван Влит Дж., Тернер Дж., Кроссли М. (2000). «Человеческий фактор 8, подобный Круппелю: белок, связывающий CACCC-бокс, который связывается с CtBP и подавляет транскрипцию» . Нуклеиновые кислоты Рез . 28 (9): 1955–62. дои : 10.1093/нар/28.9.1955 . ПМЦ 103308 . ПМИД 10756197 .

[pmid12867035-20] Мирнезами А.Х., Кэмпбелл С.Дж., Дарли М., Примроуз Дж.Н., Джонсон П.В., Блейдс Дж.П. (2003). «Hdm2 привлекает чувствительный к гипоксии корепрессор для негативной регуляции p53-зависимой транскрипции» (PDF) . Курс. Биол . 13 (14): 1234–9. Бибкод : 2003CBio...13.1234M . дои : 10.1016/S0960-9822(03)00454-8 . ПМИД 12867035 . S2CID 2451241 .

[pmid16189514-21] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid15060175-22] Касте А, Булатуф А, Версини Ж, Бонне С, Ожеро П, Виньон Ф, Хохбин С, Жалагье С, Кавайлес В (2004). «Множественные домены взаимодействующего с рецептором белка 140 способствуют ингибированию транскрипции» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (6): 1957–66. дои : 10.1093/nar/gkh524 . ПМК 390375 . ПМИД 15060175 .

[pmid11504872-23] Мураками А., Исида С., Терлоу Дж., Ревест Дж. М., Диксон С. (2001). «SOX6 связывает CtBP2, подавляя транскрипцию промотора Fgf-3» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (16): 3347–55. дои : 10.1093/нар/29.16.3347 . ПМЦ 55854 . ПМИД 11504872 .

[pmid10438528-24] Холмс М., Тернер Дж., Фокс А., Чисхолм О., Кроссли М., Чонг Б. (1999). «hFOG-2, новый белок цинковых пальцев, связывает ко-репрессор mCtBP2 и модулирует GATA-опосредованную активацию» . Ж. Биол. Хим . 274 (33): 23491–8. дои : 10.1074/jbc.274.33.23491 . ПМИД 10438528 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

v т и Корегуляторы транскрипции
Coactivators	ARA (54, 55, 70) BCAS3 CARM1 p300-CBP (EP300, CREBBP) CRTC (1, 2, 3) DRIP/TRAP (MED1 Drip205/Trap220) MN1 PCAF PNRC (1, 2) PPARGC (1A, 1B) TGFB1I1 NCOA1 (SRC-1) NCOA2 (GRIP1/SRC-2/TIF2) NCOA3 (AIB/SRC-3/TRAM-1) NCOA4 (ARA70) NCOA5 (CIA) NCOA6 (RAP250) NCOA7 (ERAP140)
Corepressors	CTBP (1, 2) Hairless homolog LCOR NRIP1 (RIP140) PELP-1 RCOR1 Rb SIN3A SIN3B Tripartite motif family TRIM (24, 28, 33) NCOR1 NCOR2 (SMRT)
ATP-dependent remodeling factors	Chromatin Structure Remodeling (RSC) Complex SWI/SNF