PPARGC1B

PPARGC1B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	3SP6
Идентификаторы
Псевдонимы	PPARGC1B , ERRL1, PERC, PGC-1(бета), PGC1B, коактиватор PPARG 1 бета
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 608886 ; МГИ : 2444934 ; Гомологен : 15776 ; Генные карты : PPARGC1B ; OMA : PPARGC1B — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	149,855,022 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	61,533,502 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; secondary oocyte; ; germinal epithelium; ; jejunal mucosa; ; duodenum; ; testicle; ; Brodmann area 23; ; gonad; ; apex of heart; ; monocyte;
	Top expressed in
	right ventricle; ; brown adipose tissue; ; ciliary body; ; cerebellar vermis; ; epithelium of stomach; ; lobe of cerebellum; ; left colon; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; olfactory tubercle; ; pyloric antrum;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	transcription coregulator activity; AF-2 domain binding; nuclear receptor coactivator activity; RNA binding; nucleic acid binding; transcription factor binding; estrogen receptor binding;
Cellular component	mediator complex; mitochondrion; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	mitochondrial transcription; regulation of transcription, DNA-templated; ossification; actin filament organization; positive regulation of osteoclast differentiation; positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; response to glucocorticoid; bone trabecula formation; positive regulation of bone resorption; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; cellular response to reactive oxygen species; positive regulation of alkaline phosphatase activity; response to cAMP; positive regulation of phosphorylation; negative regulation of transcription, DNA-templated; intracellular estrogen receptor signaling pathway; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of cold-induced thermogenesis; regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	133522
	170826
	ENSG00000155846
	ENSMUSG00000033871
	Q86YN6
	Q8VHJ7
	НМ_001172698 ; НМ_001172699 ; НМ_133263
	НМ_133249 ; НМ_001364996
	НП_001166169 ; НП_001166170 ; НП_573570
	НП_573512 ; НП_001351925
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Коактиватор гамма-коактиватора 1-бета рецептора, активирующего пролифератор пероксисом, представляет собой белок , который у человека кодируется PPARGC1B геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000155846 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033871 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Эк Дж., Андерсен Г., Урхаммер С.А., Гаеде П.Х., Дривсхольм Т., Борх-Джонсен К., Хансен Т., Педерсен О. (январь 2002 г.). «Мутационный анализ рецептора, активирующего пролифератор пероксисомы, и гамма-коактиватора-1 (PGC-1) и связь выявленных полиморфизмов аминокислот с сахарным диабетом II типа» . Диабетология . 44 (12): 2220–6. дои : 10.1007/s001250100032 . ПМИД 11793024 .
^ Кресслер Д., Шрайбер С.Н., Кнутти Д., Кралли А. (апрель 2002 г.). «Белок PERC, родственный PGC-1, является селективным коактиватором альфа-рецептора эстрогена» . J Биол Хим . 277 (16): 13918–25. дои : 10.1074/jbc.M201134200 . ПМИД 11854298 .
^ «Ген Энтрез: гамма-рецептор, активирующий пролифератор пероксисомы PPARGC1B, коактиватор 1 бета» .

Дальнейшее чтение

Хандшин С., Шпигельман Б.М. (2007). «Коактиваторы гамма-коактиватора 1 рецептора, активирующего пролифератор пероксисом, энергетический гомеостаз и метаболизм» . Эндокр. Преподобный . 27 (7): 728–35. дои : 10.1210/er.2006-0037 . ПМИД 17018837 .
Эстербауэр Х., Оберкофлер Х., Кремплер Ф., Патч В. (2000). «Ген гамма-коактиватора 1 рецептора, активирующего пролифератор пероксисом человека (PPARGC1): последовательность кДНК, геномная организация, хромосомная локализация и тканевая экспрессия». Геномика . 62 (1): 98–102. дои : 10.1006/geno.1999.5977 . ПМИД 10585775 .
Кнутти Д., Каул А., Кралли А. (2000). «Тканеспецифический коактиватор стероидных рецепторов, идентифицированный в ходе функционального генетического скрининга» . Мол. Клетка. Биол . 20 (7): 2411–22. дои : 10.1128/MCB.20.7.2411-2422.2000 . ПМЦ 85422 . ПМИД 10713165 .
Лин Дж., Пучсервер П., Донован Дж. и др. (2002). «Коактиватор гамма-рецептора 1beta, активируемый пролифератором пероксисомы (PGC-1beta), новый коактиватор транскрипции, связанный с PGC-1, связанный с фактором клетки-хозяина» . Ж. Биол. Хим . 277 (3): 1645–8. дои : 10.1074/jbc.C100631200 . ПМИД 11733490 .
Лакеман С., Чикри М., Бутин П. и др. (2002). «Нет связи между полиморфизмом G482S гена активируемого пролифератором рецептора гамма-коактиватора-1 (PGC-1) и диабетом II типа у французских европеоидов». Диабетология . 45 (4): 602–3, ответ автора 604. doi : 10.1007/s00125-002-0783-z . ПМИД 12032643 .
Хара К., Тобе К., Окада Т. и др. (2003). «Генетическая вариация гена PGC-1 может приводить к резистентности к инсулину и предрасположенности к диабету II типа» . Диабетология . 45 (5): 740–3. дои : 10.1007/s00125-002-0803-z . ПМИД 12107756 .
Хасс Дж. М., Копп Р. П., Келли Д. П. (2002). «Коактиватор-1-альфа, активируемый пролифератором пероксисомы (PGC-1-альфа), коактивирует сердечные обогащенные ядерные рецепторы, связанные с эстрогеном рецепторы-альфа и -гамма. Идентификация нового богатого лейцином мотива взаимодействия в PGC-1альфа» . Ж. Биол. Хим . 277 (43): 40265–74. дои : 10.1074/jbc.M206324200 . ПМИД 12181319 .
Хентшке М., Зюсенс Ю., Боргмейер У. (2003). «PGC-1 и PERC, коактиваторы гамма-рецептора, связанного с рецептором эстрогена». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 299 (5): 872–9. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02753-5 . ПМИД 12470660 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Шираки Т., Сакаи Н., Канайя Э., Джингами Х. (2003). «Активация сиротского ядерного конститутивного рецептора андростана требует субъядерного нацеливания с помощью рецептора гамма-коактиватора-1 альфа, активируемого пролифератором пероксисом. Возможная связь между реакцией на ксенобиотик и состоянием питания» . Ж. Биол. Хим . 278 (13): 11344–50. дои : 10.1074/jbc.M212859200 . ПМИД 12551939 .
Хаммарштедт А., Янссон П.А., Весслау С. и др. (2003). «Снижение экспрессии PGC-1 и сигнальных молекул инсулина в жировой ткани связано с резистентностью к инсулину». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 301 (2): 578–82. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00014-7 . ПМИД 12565902 .
Мейрхаге А., Кроули В., Ленаган С. и др. (2003). «Характеристика человеческого, мышиного и крысиного гена PGC1 бета (рецептор, активирующий пероксисому-пролифератор, гамма-коактиватор 1 бета) in vitro и in vivo» . Биохим. Дж . 373 (Часть 1): 155–65. дои : 10.1042/BJ20030200 . ПМК 1223480 . ПМИД 12678921 .
Патти М.Э., Бьютт А.Дж., Кранкхорн С. и др. (2003). «Координированное снижение генов окислительного метаболизма у людей с инсулинорезистентностью и диабетом: потенциальная роль PGC1 и NRF1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (14): 8466–71. Бибкод : 2003PNAS..100.8466P . дои : 10.1073/pnas.1032913100 . ПМК 166252 . ПМИД 12832613 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Линг С., Поулсен П., Карлссон Э. и др. (2004). «Множество экологических и генетических факторов влияют на экспрессию генов PGC-1alpha и PGC-1beta в скелетных мышцах у близнецов» . Дж. Клин. Инвестируйте . 114 (10): 1518–26. дои : 10.1172/JCI21889 . ПМК 525741 . ПМИД 15546003 .
Андерсен Г., Вегнер Л., Янагисава К. и др. (2006). «Доказательства связи между генетическими вариациями коактиватора PGC-1beta и ожирением» . Дж. Мед. Жене . 42 (5): 402–7. дои : 10.1136/jmg.2004.026278 . ПМК 1736055 . ПМИД 15863669 .
Стайгер Х., Стайгер К., Хаас С. и др. (2005). «Дифференциальная регуляция, индуцированная жирными кислотами, генов, кодирующих рецептор, активирующий пролифератор пероксисомы, гамма-коактиватор-1альфа и -1бета в клетках скелетных мышц человека, которые были дифференцированы in vitro» . Диабетология . 48 (10): 2115–8. дои : 10.1007/s00125-005-1895-z . ПМИД 16132959 .
Виртенбергер М., Чачу С., Хемминки К. и др. (2006). «Ассоциации генетических вариантов коактиваторов рецепторов эстрогена PPARGC1A, PPARGC1B и EP300 с семейным раком молочной железы» . Канцерогенез . 27 (11): 2201–8. дои : 10.1093/carcin/bgl067 . ПМИД 16704985 .

Внешние ссылки

Белок PPARGC1B, человеческий, в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
НУРСА C21

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000155846 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033871 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11793024-5] Эк Дж., Андерсен Г., Урхаммер С.А., Гаеде П.Х., Дривсхольм Т., Борх-Джонсен К., Хансен Т., Педерсен О. (январь 2002 г.). «Мутационный анализ рецептора, активирующего пролифератор пероксисомы, и гамма-коактиватора-1 (PGC-1) и связь выявленных полиморфизмов аминокислот с сахарным диабетом II типа» . Диабетология . 44 (12): 2220–6. дои : 10.1007/s001250100032 . ПМИД 11793024 .

[pmid11854298-6] Кресслер Д., Шрайбер С.Н., Кнутти Д., Кралли А. (апрель 2002 г.). «Белок PERC, родственный PGC-1, является селективным коактиватором альфа-рецептора эстрогена» . J Биол Хим . 277 (16): 13918–25. дои : 10.1074/jbc.M201134200 . ПМИД 11854298 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: гамма-рецептор, активирующий пролифератор пероксисомы PPARGC1B, коактиватор 1 бета» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и Корегуляторы транскрипции
Coactivators	ARA (54, 55, 70) BCAS3 CARM1 p300-CBP (EP300, CREBBP) CRTC (1, 2, 3) DRIP/TRAP (MED1 Drip205/Trap220) MN1 PCAF PNRC (1, 2) PPARGC (1A, 1B) TGFB1I1 NCOA1 (SRC-1) NCOA2 (GRIP1/SRC-2/TIF2) NCOA3 (AIB/SRC-3/TRAM-1) NCOA4 (ARA70) NCOA5 (CIA) NCOA6 (RAP250) NCOA7 (ERAP140)
Corepressors	CTBP (1, 2) Hairless homolog LCOR NRIP1 (RIP140) PELP-1 RCOR1 Rb SIN3A SIN3B Tripartite motif family TRIM (24, 28, 33) NCOR1 NCOR2 (SMRT)
ATP-dependent remodeling factors	Chromatin Structure Remodeling (RSC) Complex SWI/SNF