ТРИМ33

ТРИМ33
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3U5M, 3U5N, 3U5O, 3U5P
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIM33 , ECTO, PTC7, RFG7, TF1G, TIF1G, TIF1GAMMA, TIFGAMMA, трехчастный мотив, содержащий 33
Внешние идентификаторы	Опустить : 605769 ; МГИ : 2137357 ; Гомологен : 9296 ; Генные карты : TRIM33 ; OMA : TRIM33 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	114,511,203 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	103,266,091 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; Epithelium of choroid plexus; ; Brodmann area 23; ; corpus epididymis; ; nipple; ; cerebellar vermis; ; tibia; ; Region I of hippocampus proper; ; epithelium of nasopharynx; ; seminal vesicula;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; primitive streak; ; tail of embryo; ; ciliary body; ; zygote; ; trigeminal ganglion; ; iris; ; Epithelium of choroid plexus; ; retinal pigment epithelium; ; secondary oocyte;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; R-SMAD binding; co-SMAD binding; zinc ion binding; metal ion binding; ubiquitin-protein transferase activity; protein binding; transferase activity;
Cellular component	intracellular anatomical structure; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; negative regulation of BMP signaling pathway; protein ubiquitination; negative regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51592
	94093
	ENSG00000197323
	ENSMUSG00000033014
	Q9UPN9
	Q99PP7
	НМ_015906 ; НМ_033020
	НМ_001079830 ; НМ_053170
	НП_056990 ; НП_148980
	НП_001073299 ; НП_444400
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Е3 убиквитин-белковая лигаза TRIM33 , также известная как (гомолог эктодермина и трехчастный мотив, содержащий 33), представляет собой белок, кодируемый в организме человека геном TRIM33 , членом семейства трехчастных мотивов . ^{[ 5 ]} ^{[ 6 ]}

TRIM33 считается транскрипции корепрессором . Однако в отличие от родственных белков TRIM24 и TRIM28 несколько факторов транскрипции , таких как SMAD4 , которые взаимодействуют с TRIM33. было идентифицировано ^{[ 7 ]}

Структура

Белок является членом семейства трехчастных мотивов . ^{[ 8 ]} Этот мотив включает три цинксвязывающих домена :

КОЛЬЦО
B-box тип 1, цинковый палец
B-box тип 2, цинковый палец

и спирально-спиральная область.

Описаны три альтернативно сплайсированных варианта транскрипта этого гена, однако полноразмерная природа одного варианта не определена. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TRIM33 взаимодействует с TRIM24 . ^{[ 9 ]}

Роль в раке

TRIM33 действует как ген-супрессор опухоли, предотвращающий развитие хронического миеломоноцитарного лейкоза. ^{[ 10 ]} TRIM33 также регулирует рецептор TRIM28 и способствует физиологическому старению гемопоэтических стволовых клеток. ^{[ 11 ]} TRIM33 действует как онкоген , предотвращая апоптоз при В-клеточных лейкозах. ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197323 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033014 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «ЮниПрот» . www.uniprot.org . Проверено 19 декабря 2022 г.
^ Вентурини Л., Ю Дж., Стадлер М., Галиен Р., Лаллеманд В., Кокен М.Х., Маттей М.Г., Гансер А., Шамбон П., Лоссон Р., де Те Х (февраль 1999 г.). «TIF1gamma, новый член семейства транскрипционных промежуточных факторов 1». Онкоген . 18 (5): 1209–17. дои : 10.1038/sj.onc.1202655 . ПМИД 10022127 . S2CID 45515641 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: TRIM33, содержащий трехчастный мотив 33» .
^ Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каиро С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные отсеки» . Журнал ЭМБО . 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140 . ПМК 125245 . ПМИД 11331580 .
^ Пэн Х., Фельдман И., Раушер Ф.Дж. (июль 2002 г.). «Гетероолигомеризация среди семейства TIF ядерных кофакторов, содержащих домен RBCC/TRIM: потенциальный механизм регулирования переключения между коактивацией и корепрессией». Журнал молекулярной биологии . 320 (3): 629–44. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00477-1 . ПМИД 12096914 .
^ Окань Р., Друан Н., Паггетти Дж., Лагранж Б., Ларго А., Хамманн А., Батай А., Мартин Л., Ян КП, Фено П., Лоссон Р., Солари Э., Басти Дж. Н., Дельва Л. (июнь 2011 г.). «Промежуточный фактор транскрипции 1γ является супрессором опухоли при хроническом миеломоноцитарном лейкозе у мышей и человека» . Журнал клинических исследований . 121 (6): 2361–70. дои : 10.1172/JCI45213 . ПМК 3104753 . ПМИД 21537084 .
^ Кере Р., Сен-Поль Л., Карминьяк В., Мартен Р.З., Кретьен М.Л., Ларжо А., Хамманн А., Паис де Баррос Ж.П., Басти Ж.Н., Дельва Л. (июль 2014 г.). «Tif1γ регулирует рецептор TGF-β1 и способствует физиологическому старению гемопоэтических стволовых клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (29): 10592–7. Бибкод : 2014PNAS..11110592Q . дои : 10.1073/pnas.1405546111 . ПМЦ 4115559 . ПМИД 25002492 .
^ Ван Э., Каваока С., Роу Дж.С., Ши Дж., Хохманн А.Ф., Сюй Ю., Бхагват А.С., Сузуки Ю., Кинни Дж.Б., Вакок Ч.Р. (апрель 2015 г.). «Транскрипционный кофактор TRIM33 предотвращает апоптоз при B-лимфобластном лейкозе путем деактивации одного энхансера» . электронная жизнь . 4 : e06377. doi : 10.7554/eLife.06377 . ПМЦ 4409649 . ПМИД 25919951 .

Дальнейшее чтение

Вентурини Л., Ю Дж., Стадлер М., Галиен Р., Лаллеманд В., Кокен М.Х., Маттей М.Г., Гансер А., Шамбон П., Лоссон Р., де Те Х (февраль 1999 г.). «TIF1gamma, новый член семейства транскрипционных промежуточных факторов 1». Онкоген . 18 (5): 1209–17. дои : 10.1038/sj.onc.1202655 . ПМИД 10022127 . S2CID 45515641 .
Клугбауэр С., Рабес Х.М. (июль 1999 г.). «Коактиватор транскрипции HTIF1 и родственный ему белок слиты с тирозинкиназой рецептора RET при папиллярных карциномах щитовидной железы у детей». Онкоген . 18 (30): 4388–93. дои : 10.1038/sj.onc.1202824 . ПМИД 10439047 . S2CID 2166439 .
Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июнь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 6 (3): 197–205. дои : 10.1093/dnares/6.3.197 . ПМИД 10470851 .
Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каиро С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные отсеки» . Журнал ЭМБО . 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140 . ПМК 125245 . ПМИД 11331580 .
Пэн Х., Фельдман И., Раушер Ф.Дж. (июль 2002 г.). «Гетероолигомеризация среди семейства TIF ядерных кофакторов, содержащих домен RBCC/TRIM: потенциальный механизм регулирования переключения между коактивацией и корепрессией». Журнал молекулярной биологии . 320 (3): 629–44. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00477-1 . ПМИД 12096914 .
Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует зависимую от метилирования ДНК репрессию через метил-CpG-связывающий белок Kaiso» . Молекулярная клетка . 12 (3): 723–34. doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . ПМИД 14527417 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Г.Дж., Ли Ю, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л.В. (июнь 2004 г.). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природная биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Дюпон С., Заккинья Л., Корденонси М., Солиго С., Адорно М., Ругге М., Пикколо С. (апрель 2005 г.). «Спецификация зародышевого слоя и контроль роста клеток с помощью эктодермина, убиквитинлигазы Smad4» . Клетка . 121 (1): 87–99. дои : 10.1016/j.cell.2005.01.033 . hdl : 11577/2439217 . ПМИД 15820681 . S2CID 16628152 .
Хе В., Дорн, округ Колумбия, Эрдьюмент-Бромаж Х., Темпст П., Мур М.А., Массаге Дж. (июнь 2006 г.). «Гематопоэз контролируется отдельными ветвями TIF1gamma и Smad4 пути TGFbeta» . Клетка . 125 (5): 929–41. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.045 . ПМИД 16751102 . S2CID 17708166 .

Внешние ссылки

TRIM33 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197323 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033014 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[UniProt-5] «ЮниПрот» . www.uniprot.org . Проверено 19 декабря 2022 г.

[pmid10022127-6] Вентурини Л., Ю Дж., Стадлер М., Галиен Р., Лаллеманд В., Кокен М.Х., Маттей М.Г., Гансер А., Шамбон П., Лоссон Р., де Те Х (февраль 1999 г.). «TIF1gamma, новый член семейства транскрипционных промежуточных факторов 1». Онкоген . 18 (5): 1209–17. дои : 10.1038/sj.onc.1202655 . ПМИД 10022127 . S2CID 45515641 .

[entrez_51592-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: TRIM33, содержащий трехчастный мотив 33» .

[pmid11331580-8] Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каиро С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные отсеки» . Журнал ЭМБО . 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140 . ПМК 125245 . ПМИД 11331580 .

[pmid12096914-9] Пэн Х., Фельдман И., Раушер Ф.Дж. (июль 2002 г.). «Гетероолигомеризация среди семейства TIF ядерных кофакторов, содержащих домен RBCC/TRIM: потенциальный механизм регулирования переключения между коактивацией и корепрессией». Журнал молекулярной биологии . 320 (3): 629–44. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00477-1 . ПМИД 12096914 .

[10] Окань Р., Друан Н., Паггетти Дж., Лагранж Б., Ларго А., Хамманн А., Батай А., Мартин Л., Ян КП, Фено П., Лоссон Р., Солари Э., Басти Дж. Н., Дельва Л. (июнь 2011 г.). «Промежуточный фактор транскрипции 1γ является супрессором опухоли при хроническом миеломоноцитарном лейкозе у мышей и человека» . Журнал клинических исследований . 121 (6): 2361–70. дои : 10.1172/JCI45213 . ПМК 3104753 . ПМИД 21537084 .

[11] Кере Р., Сен-Поль Л., Карминьяк В., Мартен Р.З., Кретьен М.Л., Ларжо А., Хамманн А., Паис де Баррос Ж.П., Басти Ж.Н., Дельва Л. (июль 2014 г.). «Tif1γ регулирует рецептор TGF-β1 и способствует физиологическому старению гемопоэтических стволовых клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (29): 10592–7. Бибкод : 2014PNAS..11110592Q . дои : 10.1073/pnas.1405546111 . ПМЦ 4115559 . ПМИД 25002492 .

[12] Ван Э., Каваока С., Роу Дж.С., Ши Дж., Хохманн А.Ф., Сюй Ю., Бхагват А.С., Сузуки Ю., Кинни Дж.Б., Вакок Ч.Р. (апрель 2015 г.). «Транскрипционный кофактор TRIM33 предотвращает апоптоз при B-лимфобластном лейкозе путем деактивации одного энхансера» . электронная жизнь . 4 : e06377. doi : 10.7554/eLife.06377 . ПМЦ 4409649 . ПМИД 25919951 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

v т и Корегуляторы транскрипции
Coactivators	ARA (54, 55, 70) BCAS3 CARM1 p300-CBP (EP300, CREBBP) CRTC (1, 2, 3) DRIP/TRAP (MED1 Drip205/Trap220) MN1 PCAF PNRC (1, 2) PPARGC (1A, 1B) TGFB1I1 NCOA1 (SRC-1) NCOA2 (GRIP1/SRC-2/TIF2) NCOA3 (AIB/SRC-3/TRAM-1) NCOA4 (ARA70) NCOA5 (CIA) NCOA6 (RAP250) NCOA7 (ERAP140)
Corepressors	CTBP (1, 2) Hairless homolog LCOR NRIP1 (RIP140) PELP-1 RCOR1 Rb SIN3A SIN3B Tripartite motif family TRIM (24, 28, 33) NCOR1 NCOR2 (SMRT)
ATP-dependent remodeling factors	Chromatin Structure Remodeling (RSC) Complex SWI/SNF