ЛКОР

ЛКОР
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2COB
Идентификаторы
Псевдонимы	LCOR , MLR2, корепрессор лиганд-зависимого ядерного рецептора, C10orf12
Внешние идентификаторы	Опустить : 607698 ; МГИ : 2443930 ; Гомологен : 22914 ; GeneCards : LCOR ; ОМА : LCOR – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	96,995,956 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	41,574,975 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; jejunal mucosa; ; mucosa of paranasal sinus; ; mucosa of ileum; ; visceral pleura; ; cardia; ; pylorus; ; renal medulla; ; nipple; ; mucosa of sigmoid colon;
	Top expressed in
	epithelium of stomach; ; ventromedial nucleus; ; migratory enteric neural crest cell; ; Rostral migratory stream; ; ciliary body; ; lateral septal nucleus; ; mammillary body; ; human fetus; ; retinal pigment epithelium; ; left colon;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity; transcription factor binding;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	84458
	212391
	ENSG00000196233
	ENSMUSG00000025019
	Q96JN0
	Q6ZPI3
	НМ_001170765 ; НМ_001170766 ; НМ_001346516 ; НМ_015652 ; НМ_032440
	НМ_172154 ; НМ_001370767
	НП_001164236 ; НП_001164237 ; НП_001333445 ; НП_115816
	НП_742166 ; НП_001357696
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Лиганд-зависимый корепрессор — белок , который у человека кодируется LCOR геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

транскрипции, LCOR представляет собой корепрессор широко экспрессирующийся в тканях плода и взрослого человека, который рекрутируется на связанные с агонистами ядерные рецепторы посредством единственного мотива LxxLL, также называемого боксом ядерного рецептора (NR). ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196233 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025019 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фернандес И, Бастьен Ю, Вай Т, Найгард К, Лин Р, Кормье О, Ли Х.С., Энг Ф, Бертос Н.Р., Пеллетье Н., Мадер С., Хан В.К., Ян XJ, Уайт Дж.Х. (январь 2003 г.). «Лиганд-зависимый корепрессор ядерного рецептора LCoR функционирует с помощью гистондеацетилаз-зависимых и независимых механизмов» . Мол Клетка . 11 (1): 139–50. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00014-5 . ПМИД 12535528 .
^ Уайт Дж.Х., Фернандес I, Мадер С., Ян XJ (июнь 2004 г.). «Привлечение корепрессоров с помощью ядерных рецепторов, связанных с агонистами». Витам Хорм . Витамины и гормоны. 68 : 123–43. дои : 10.1016/S0083-6729(04)68004-6 . ISBN 978-0-12-709868-5 . ПМИД 15193453 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: корепрессор лиганд-зависимого ядерного рецептора LCOR» .

Дальнейшее чтение

Нагасе Т., Накаяма М., Накадзима Д. и др. (2001). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют крупные белки in vitro» . ДНК Рез . 8 (2): 85–95. дои : 10.1093/dnares/8.2.85 . ПМИД 11347906 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Куниеда Т., Пак Дж. М., Такеучи Х., Кубо Т. (2003). «Идентификация и характеристика Mlr1,2: два мышиных гомолога Mblk-1, фактора транскрипции из мозга медоносной пчелы (1)». ФЭБС Летт . 535 (1–3): 61–5. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03858-9 . ПМИД 12560079 . S2CID 83745027 .
Ши Ю., Савада Дж., Суй Дж. и др. (2003). «Координированные модификации гистонов, опосредованные ко-репрессорным комплексом CtBP». Природа . 422 (6933): 735–8. Бибкод : 2003Natur.422..735S . дои : 10.1038/nature01550 . ПМИД 12700765 . S2CID 2670859 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Делоукас П., Земляной М.Э., Графхэм Д.В. и др. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 10-й хромосомы человека» . Природа . 429 (6990): 375–81. Бибкод : 2004Natur.429..375D . дои : 10.1038/nature02462 . ПМИД 15164054 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для лиганд-зависимого корепрессора человека.

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 10 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196233 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025019 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12535528-5] Фернандес И, Бастьен Ю, Вай Т, Найгард К, Лин Р, Кормье О, Ли Х.С., Энг Ф, Бертос Н.Р., Пеллетье Н., Мадер С., Хан В.К., Ян XJ, Уайт Дж.Х. (январь 2003 г.). «Лиганд-зависимый корепрессор ядерного рецептора LCoR функционирует с помощью гистондеацетилаз-зависимых и независимых механизмов» . Мол Клетка . 11 (1): 139–50. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00014-5 . ПМИД 12535528 .

[pmid15193453-6] Уайт Дж.Х., Фернандес I, Мадер С., Ян XJ (июнь 2004 г.). «Привлечение корепрессоров с помощью ядерных рецепторов, связанных с агонистами». Витам Хорм . Витамины и гормоны. 68 : 123–43. дои : 10.1016/S0083-6729(04)68004-6 . ISBN 978-0-12-709868-5 . ПМИД 15193453 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: корепрессор лиганд-зависимого ядерного рецептора LCOR» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и Корегуляторы транскрипции
Коактиваторы	ТЕЛО ( 54 , 55 , 70 ) BCAS3 КАРМ1 p300-CBP ( EP300 , CREBBP ) CRTC ( 1 , 2 , 3 ) КАПЕЛЬНАЯ/ЛОВУШКА ( MED1 Капельная205/Ловушка220) МН1 ПКАФ ПНРК ( 1 , 2 ) ППАРГК ( 1А , 1Б ) ТГФБ1И1 НКОА1 ( SRC-1 ) НКОА2 ( GRIP1/SRC-2/TIF2 ) NCOA3 ( АИБ/SRC-3/ТРАМ-1 ) НКОА4 ( АРА70 ) NCOA5 ( ЦРУ ) НКОА6 ( РАП250 ) НКОА7 ( ЕРАП140 )
Корепрессоры	CTBP ( 1 , 2 ) Безволосый гомолог ЛКОР НРИП1 ( РИП140 ) ПЭЛП-1 РЦОР1 руб. СИН3А СИН3Б Семейство трехсторонних мотивов TRIM ( 24 , 28 , 33 ) НКОР1 NCOR2 ( СМЕРТЬ )
АТФ-зависимые факторы ремоделирования	Комплекс ремоделирования структуры хроматина (RSC) СВИ/СНФ