Семейство трехсторонних мотивов
Семейство трехчастных мотивов ( TRIM ) представляет собой семейство белков . [ 1 ]
Функция
[ редактировать ]Многие белки TRIM индуцируются интерферонами , которые являются важным компонентом устойчивости к патогенам, и известно, что некоторые белки TRIM необходимы для ограничения заражения лентивирусами . Белки TRIM участвуют в распознавании патогенов и регуляции путей транскрипции в защите хозяина. [ 2 ]
Структура
[ редактировать ]Трехчастный мотив всегда присутствует на N-конце белков TRIM. Мотив TRIM включает следующие три домена: [ 1 ]
- (1) RING-пальца домен
- (2) один или два цинковых пальцев B-box домена
- когда присутствует только один B-box, это всегда B-box типа 2
- при наличии двух B-Box B-Box типа 1 всегда предшествует B-Box типа 2.
- (3) спиральной катушки область
С -конец белков TRIM содержит:
- Белки группы 1 : С-концевой домен, выбранный из следующего списка:
- Домены NHL и IGFLMN, либо вместе, либо по отдельности.
- Домен PHD, связанный с бромодоменом
- Домен MATH (например, TRIM37 )
- Домен ARF (например, TRIM23 )
- Домен EXOIII (например, TRIM19 ) или
- Белки группы 2 : С-концевой домен SPRY.
- например TRIM21
Члены семьи
[ редактировать ]Семейство TRIM разделено на две группы, которые различаются доменной структурой и геномной организацией: [ 3 ]
- Члены группы 1 обладают множеством С-концевых доменов и представлены как у позвоночных, так и у беспозвоночных.
- Группа 2 отсутствует у беспозвоночных, имеет С-концевой домен SPRY. [ 4 ]
К членам семьи относятся:
- Группа 1
- Домен PHD-BROMO, содержащий: TRIM24 (TIF1α), TRIM28 (TIF1β), TRIM33 (TIF1γ) – действуют как корепрессоры.
- 1-10: TRIM1 , TRIM2 , TRIM3 , TRIM8 , TRIM9
- 11-20: TRIM12 , TRIM13 , TRIM14 , TRIM16 , TRIM18 , TRIM19
- 21-30: TRIM23 , TRIM25 , TRIM29 , TRIM30
- 31-40: ТРИМ32 , ТРИМ36 , ТРИМ37
- 41-50: ТРИМ42 , ТРИМ44 , ТРИМ45 , ТРИМ46 , ТРИМ47
- 51-60: TRIM51 , TRIM53 , TRIM54 , TRIM55 , TRIM56 , TRIM57 , TRIM59
- 61-70: TRIM62 , TRIM63 , TRIM65 , TRIM66 , TRIM67 , TRIM69 , TRIM70
- 71-75: ТРИМ71
- Группа 2
- 1-10: TRIM4 , TRIM5 , TRIM6 , TRIM7 , TRIM10
- 11-20: TRIM11 , TRIM12 , TRIM15 , TRIM17 , TRIM20
- 21-30: TRIM21 , TRIM22 , TRIM26 , TRIM27 , TRIM30
- 31-40: TRIM31 , TRIM34 , TRIM35 , TRIM38 , TRIM39 , TRIM40
- 41-50: ТРИМ41 , ТРИМ43 , ТРИМ48 , ТРИМ49 , ТРИМ50
- 51-60: TRIM51 , TRIM52 , TRIM53 , TRIM57 , TRIM58 , TRIM60
- 61-70: ТРИМ61 , ТРИМ64 , ТРИМ68 , ТРИМ69 , ТРИМ70
- 71-75: ТРИМ72 , ТРИМ73 , ТРИМ74 , ТРИМ75
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каиро С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные отсеки» . ЭМБО Дж. 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140 . ПМК 125245 . ПМИД 11331580 .
- ^ Озато К., Шин Д.М., Чанг Т.Х., Морс Х.К. (ноябрь 2008 г.). «Белки семейства TRIM и их новая роль во врожденном иммунитете» . Нат. Преподобный Иммунол . 8 (11): 849–60. дои : 10.1038/nri2413 . ПМЦ 3433745 . ПМИД 18836477 .
- ^ Сардиелло М., Каиро С., Фонтанелла Б., Баллабио А., Мерони Г. (2008). «Геномный анализ семейства TRIM выявил две группы генов с различными эволюционными свойствами» . БМК Эвол. Биол . 8 (1): 225. Бибкод : 2008BMCEE...8..225S . дои : 10.1186/1471-2148-8-225 . ПМЦ 2533329 . ПМИД 18673550 .
- ^ Понтинг С., Шульц Дж., Борк П. (июнь 1997 г.). «Домены SPRY в рианодиновых рецепторах (каналы высвобождения Ca (2+))». Тенденции биохимии. Наука . 22 (6): 193–4. дои : 10.1016/S0968-0004(97)01049-9 . ПМИД 9204703 .
 | Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |