ТРИМ21

ТРИМ21
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 2IWG
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIM21 , RNF81, RO52, Ro/SSA, SSA, SSA1, трехсторонний мотив, содержащий 21, белок 21, содержащий трехсторонний мотив
Внешние идентификаторы	Опустить : 109092 ; МГИ : 106657 ; Гомологен : 2365 ; Генные карты : TRIM21 ; ОМА : TRIM21 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 11 (human) Band 11p15.4 Start 4,384,897 bp End 4,393,702 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 7 (mouse) Band 7|7 E3 Start 102,207,128 bp End 102,214,693 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in granulocyte monocyte blood mucosa of transverse colon spleen rectum epithelium of colon apex of heart Descending thoracic aorta mucosa of ileum Top expressed in Ileal epithelium Paneth cell mesenteric lymph nodes lumbar spinal ganglion thymus blood granulocyte carotid body spleen Epithelium of choroid plexus More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function DNA binding zinc ion binding metal ion binding protein binding RNA binding identical protein binding ubiquitin-protein transferase activity transferase activity Cellular component cytoplasm cytosol SCF ubiquitin ligase complex P-body intracellular anatomical structure autophagosome cytoplasmic vesicle nucleus nucleoplasm ribonucleoprotein complex Biological process negative regulation of protein deubiquitination response to interferon-gamma positive regulation of autophagy interferon-gamma-mediated signaling pathway protein trimerization positive regulation of viral entry into host cell positive regulation of DNA-binding transcription factor activity protein monoubiquitination regulation of type I interferon production positive regulation of cell cycle protein destabilization protein ubiquitination cell cycle negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity protein autoubiquitination innate immune response protein polyubiquitination negative regulation of viral transcription Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 6737 20821 Вместе ENSG00000132109 ENSMUSG00000030966 ЮниПрот P19474 Q62191 RefSeq (мРНК) НМ_003141 НМ_001082552 НМ_009277 RefSeq (белок) НП_003132 н/д Местоположение (UCSC) Чр 11: 4,38 – 4,39 Мб Чр 7: 102,21 – 102,21 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Содержащий трехчастный мотив белок 21 , также известный как E3 убиквитин-белковая лигаза TRIM21 , представляет собой белок , который у людей кодируется TRIM21 геном . Были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскрипта этого гена, но полноразмерная природа только одного из них была определена. Он экспрессируется в большинстве тканей человека.

Структура

TRIM21 является членом семейства трехсторонних мотивов (TRIM). Мотив TRIM включает три цинксвязывающих домена, домен RING-пальца B-box типа 1 и цинковый палец B-box типа 2 , цинковый палец , а также область спиральной спирали .

Функция

TRIM21 представляет собой эффектор внутриклеточных антител во внутриклеточном пути протеолиза, опосредованного антителами . Он распознает домен Fc и связывается с иммуноглобулином G , иммуноглобулином А и иммуноглобулин М на маркированных антителами вирионах без оболочки, которые инфицировали клетку. Либо путем аутоубиквитинирования , либо путем убиквитинирования кофактора он затем отвечает за направление вирионов к протеасоме . Сам TRIM21 не разлагается в протеасоме, в отличие как от вирусного капсида, так и от связанного антитела.

TRIM21 является частью рибонуклеопротеина RoSSA, который включает один полипептид и одну из четырех малых молекул РНК. Частица RoSSA локализуется как в цитоплазме, так и в ядре.

Клиническое значение

RoSSA взаимодействует с аутоантигенами у пациентов с синдромом Шегрена и системной красной волчанкой . Кроме того, неспособность склонных к волчанке макрофагов разрушать иммунные комплексы в лизосомах приводит к утечке аутоантител в цитозоль, которые могут связываться с TRIM21 и усиливать передачу сигналов NF-κB.

TRIM21 можно использовать для нокаута определенных белков с помощью соответствующих антител — метод, известный как Trim-Away. В этом анализе TRIM21 и антитела доставляются в клетки посредством электропорации , и целевой белок разрушается в течение нескольких минут.

Дальнейшее чтение

• Джонс С.К. (июнь 1992 г.). «Ультрафиолетовое излучение (УФИ) индуцирует экспрессию антигена Ro / SSA на клеточной поверхности кератиноцитами человека in vitro: возможный механизм индукции УФ-излучением кожных поражений волчанки». Британский журнал дерматологии . 126 (6): 546–53. дои : 10.1111/j.1365-2133.1992.tb00098.x . ПМИД   1610705 . S2CID   24542694 .
• Ито К., Ито Ю., Фрэнк М.Б. (январь 1991 г.). «Белковая гетерогенность рибонуклеопротеинов Ro/SSA человека. Аутоантигены Ro/SSA массой 52 и 60 кДа кодируются отдельными генами» . Журнал клинических исследований . 87 (1): 177–86. дои : 10.1172/JCI114968 . ПМК   295020 . ПМИД   1985094 .
• Чан Э.К., Хамель Дж.К., Буйон Дж.П., Тан Э.М. (январь 1991 г.). «Молекулярное определение и мотивы последовательности компонента 52 кДа человеческого аутоантигена SS-A/Ro» . Журнал клинических исследований . 87 (1): 68–76. дои : 10.1172/JCI115003 . ПМК   294993 . ПМИД   1985112 .
• Миягава С., Окада Н., Инагаки Ю., Китано Ю., Уэки Х., Сакамото К., Стейнберг М.Л. (март 1988 г.). «Экспрессия антигена SSA/Ro в кератиноцитах человека, трансформированных обезьяньим вирусом 40». Журнал исследовательской дерматологии . 90 (3): 342–5. дои : 10.1111/1523-1747.ep12456308 . ПМИД   2450143 .
• Чан Э.К., Ди Донато Ф., Хамель Дж.К., Ценг С.Э., Буйон Дж.П. (октябрь 1995 г.). «52-кДа SS-A/Ro: геномная структура и идентификация альтернативно сплайсированного транскрипта, кодирующего новый аутоантиген лейциновой молнии, экспрессируемый в сердце плода и взрослого» . Журнал экспериментальной медицины . 182 (4): 983–92. дои : 10.1084/jem.182.4.983 . ПМК   2192297 . ПМИД   7561701 .
• Цугу Х., Горовиц Р., Гибсон Н., Фрэнк М.Б. (декабрь 1994 г.). «Расположение полиморфизма, связанного с заболеванием, и геномная структура человеческого локуса Ro / SSA 52 кДа (SSA1)». Геномика . 24 (3): 541–8. дои : 10.1006/geno.1994.1664 . ПМИД   7713506 .
• Фрэнк М.Б., МакКаббин В.Р., Хелдермон С. (январь 1995 г.). «Экспрессия и связывание ДНК человеческого аутоантигена Ro/SSA 52 кДа» . Биохимический журнал . 305 (2): 359–62. дои : 10.1042/bj3050359 . ПМЦ   1136368 . ПМИД   7832745 .
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Кич С.Л., Гордон Т.П., Маккласки Дж. (май 1996 г.). «Структурные различия между аутоантигенами Ro 52 кДа человека и мыши, связанные с плохо консервативной активностью аутоантител у разных видов» . Клиническая и экспериментальная иммунология . 104 (2): 255–63. дои : 10.1046/j.1365-2249.1996.16726.x . ПМК   2200432 . ПМИД   8625517 .
• Игараси Т., Ито Ю., Фукунага Ю., Ямамото М. (1996). «Стресс-индуцированная экспрессия клеточной поверхности и антигенное изменение аутоантигена Ro/SSA». Аутоиммунитет . 22 (1): 33–42. дои : 10.3109/08916939508995297 . ПМИД   8882420 .
• Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• Беплер Дж., О'Брайант К.К., Ким Ю.К., Шрайбер Г., Питтерл Д.М. (январь 1999 г.). «Физическая карта высокого разрешения размером 1,4 МБ и контиг сегмента хромосомы 11p15.5 и генов в области супрессора метастазов LOH11A». Геномика . 55 (2): 164–75. дои : 10.1006/geno.1998.5659 . ПМИД   9933563 .
• Ценг С.Э., Миранда Э., Ди Донато Ф., Бутжддир М., Рашбаум В., Чан Э.К., Буйон Дж.П. (февраль 1999 г.). «Экспрессия мРНК и белков SSA/Ro и SSB/La в кардиомиоцитах плода человека, культивированных с использованием нового применения процедуры Лангендорфа» . Педиатрические исследования . 45 (2): 260–9. дои : 10.1203/00006450-199902000-00018 . ПМИД   10022600 .
• Фабини Г., Рутьес С.А., Циммерманн С., Прюйн Г.Дж., Штайнер Г. (май 2000 г.). «Анализ молекулярного состава Ro-рибонуклеопротеиновых комплексов. Идентификация новых Y-РНК-связывающих белков» . Европейский журнал биохимии . 267 (9): 2778–89. дои : 10.1046/j.1432-1327.2000.01298.x . ПМИД   10785401 .
• Куриен Б.Т., Чемберс Т.Л., Томас П.И., Фрэнк М.Б., Скофилд Р.Х. (март 2001 г.). «Аутоантитело к области лейциновой молнии 52 кДа Ro/SSA связывает нативный Ro/SSA 60 кДа: идентификация третичного эпитопа с компонентами из 60 кДа Ro/SSA и 52 кДа Ro/SSA» . Скандинавский журнал иммунологии . 53 (3): 268–76. дои : 10.1046/j.1365-3083.2001.00870.x . ПМИД   11251884 . S2CID   7923255 .
• Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каиро С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехсторонних мотивов идентифицирует клеточные отсеки» . Журнал ЭМБО . 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140 . ПМК   125245 . ПМИД   11331580 .
• Ди Донато Ф., Чан Э.К., Асканасе А.Д., Миранда-Карус М., Буйон Дж.П. (сентябрь 2001 г.). «Взаимодействие между 52 кДа SSA/Ro и деубиквитинирующим ферментом UnpEL: ключ к функционированию». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 33 (9): 924–34. дои : 10.1016/S1357-2725(01)00055-3 . ПМИД   11461834 .
• Фукуда-Камитани Т., Камитани Т. (июль 2002 г.). «Убиквитинирование аутоантигена Ro52». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 295 (4): 774–8. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00750-7 . ПМИД   12127959 .