TRIM37

TRIM37
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3LRQ
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIM37, MUL, POB1, TEF3, tripartite motif containing 37
Внешние идентификаторы	Омим : 605073 ; MGI : 2153072 ; Гомологен : 9084 ; GeneCards : TRIM37 ; OMA : TRIM37 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	59,106,921 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	87,111,509 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	endothelial cell; ; secondary oocyte; ; sperm; ; Brodmann area 23; ; middle temporal gyrus; ; postcentral gyrus; ; pons; ; Brodmann area 46; ; superior frontal gyrus; ; frontal pole;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; spermatid; ; medial vestibular nucleus; ; pontine nuclei; ; primary motor cortex; ; deep cerebellar nuclei; ; medial dorsal nucleus; ; inferior colliculus; ; seminiferous tubule; ; central gray substance of midbrain;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; ubiquitin protein ligase activity; zinc ion binding; chromatin binding; metal ion binding; ubiquitin-protein transferase activity; protein binding; tumor necrosis factor receptor binding; ubiquitin protein ligase binding; transferase activity;
Cellular component	cytosol; ESC/E(Z) complex; intracellular anatomical structure; aggresome; perinuclear region of cytoplasm; peroxisome; cytoplasm;
Biological process	negative regulation of centriole replication; positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; protein ubiquitination; negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; aggresome assembly; protein autoubiquitination; histone H2A monoubiquitination; histone H2A-K119 monoubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4591
	68729
	ENSG00000108395
	Ensmusg00000018548
	O94972
	Q6PCX9
showNM_001005207 ; NM_015294 ; NM_001320987 ; NM_001320988 ; NM_001320989 ;
	NM_001320990; NM_001353082; NM_001353083; NM_001353084; NM_001353085; NM_001353086
	NM_197987 ; NM_001363025 ; NM_001363026 ; NM_001363027 ; NM_001363028
showNP_001005207 ; NP_001307916 ; NP_001307917 ; NP_001307918 ; NP_001307919 ;
	NP_056109; NP_001340011; NP_001340012; NP_001340013; NP_001340014; NP_001340015
	NP_932104 ; NP_001349954 ; NP_001349955 ; NP_001349956 ; NP_001349957
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Трехсторонний мотив, содержащий белок 37, является убиквитин-лигазой E3 у людей, которая кодируется TRIM37 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена семейства трехсторонних мотивов (TRIM), члены которых участвуют в различных клеточных функциях, таких как паттерна развития и онкогенез . The TRIM motif includes zinc-binding domains , a RING finger region, a B-box motif and a coiled-coil domain . The RING finger and B-box domains chelate zinc and might be involved in protein–protein and/or protein–nucleic acid interactions. Мутации генов связаны с нанизм Mulibrey (мышечный-ливер-мозговой глаз) , аутосомно-рецессивное расстройство, которое включает в себя несколько тканей мезодермального происхождения. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been identified. ^{[ 7 ]} Он отвечает за монобиквитинирование гистона H2A репрессией в лизине 119, модификации, обычно связанной с транскрипции . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Роль в раке молочной железы

Было показано, что хромосомная область 17Q23, в которой расположен ген TRIM37, усиливается при 40% рака молочной железы. ^{[ 10 ]} Считается, что белок TRIM37 играет роль в онкогенезе рака молочной железы путем убиквитинирующего гистона H2A в областях, занятых генами, подавляющими опухоль. Эта репрессия генов, подавляющих опухоль, увеличивает вероятность того, что опухоль произойдет или что существующая опухоль будет более агрессивной. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TRIM37 взаимодействует с PRC1 . ^{[ 11 ]} Также было показано, что TRIM37 взаимодействует с PRC2 для изменения его специфичности, и когда TRIM37 сверхэкспрессируется, существует много изменений в экспрессии генов, которые приводят к молчанию генов, подавляющих опухоль. ^{[ 8 ]} Также было показано, что TRIM37, PRC2, PRC1 работают вместе, чтобы соединить гены-мишени, что приводит к их транскрипционной репрессии. Показано, что нокдаун экспрессии TRIM37 через РНК-интерференцию приводит к тому, что H2A станет деубиквитинированным и диссоциации PRC1 и PRC2 из генов-мишеней. Эти изменения позволяют целевому геном стать транскрипционно активным. ^{[ 8 ]}

Смотрите также

Многоблейный нанизм

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000108395 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000018548 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Avela K, Lipsanen-Nonman M, Perheentupa J, Wallgren-Petersson C, Marchand S, Fauré S, et al. (Апрель 1997). «Назначение гена нанизма Mulibrey до 17Q путем анализа связи и сцепления-дисеквилибей » » Американский журнал человеческой генетики 60 (4): 896–9 1712467PMC 9106536PMID
^ Avela K, Lipsanen-Nonman M, Idänheimo N, Seemanová E, Rosengren S, Mäkelä TP, et al. (Июль 2000 г.). «Ген, кодирующий новый белок с кольцом с кольцом, мутируется в нанизме мулибри». Природа генетика . 25 (3): 298–301. doi : 10.1038/77053 . PMID 10888877 . S2CID 24257747 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: TRIM37 Триптитный мотив, содержащий 37» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Bhatnagar S, Gazin C, Chamberlain L, Ou J, Zhu X, Tushir JS, et al. (Декабрь 2014). «TRIM37 - это новая гистоновая H2A -убиквитин -лигаза и онкопротеин рака молочной железы» . Природа . 516 (7529): 116–20. Bibcode : 2014natur.516..116b . doi : 10.1038/nature13955 . PMC 4269325 . PMID 25470042 .
^ Weake VM, Workman JL (март 2008 г.). «Гистоновое убиквитинирование: запуск генной активности» . Молекулярная клетка . 29 (6): 653–63. doi : 10.1016/j.molcel.2008.02.014 . PMID 18374642 .
^ Синклер, Коллин с.; Роули, Мэтью; Надери, Али; Couch, Fergus J. (2003-04-01). «Ампликон и рак молочной железы 17Q23». Исследования и лечения рака молочной железы . 78 (3): 313–322. doi : 10.1023/a: 1023081624133 . ISSN 1573-7217 . PMID 12755490 . S2CID 23751525 .
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (Октябрь 2005 г.). «На пути к масштабе протеома карты взаимодействия белкового белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005natur.437.1173r . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .

Дальнейшее чтение

Нагасе Т., Ишикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Мияджима Н. и др. (Декабрь 1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые код для крупных белков in vitro» . ДНК -исследования . 5 (6): 355–64. doi : 10.1093/dnares/5.6.355 . PMID 10048485 .
Zapata JM, Pawlowski K, Haas E, Ware CF, Godzik A, Reed JC (июнь 2001 г.). «Разнообразное семейство белков, содержащих домены факторных доменов, связанных с рецептором некроза опухоли» . Журнал биологической химии . 276 (26): 24242–52. doi : 10.1074/jbc.m100354200 . PMID 11279055 .
Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, et al. (Май 2001). «Семейство трехсторонних мотивов идентифицирует клеточные отсеки» . Embo Journal . 20 (9): 2140–51. doi : 10.1093/emboj/20.9.2140 . PMC 125245 . PMID 11331580 .
Lehesjoki AE, Reed VA, Mark Gardiner R, Greene ND (октябрь 2001 г.). «Экспрессия Mul, гена, кодирующего новый белок кольца RBCC, у эмбриогенеза человека и мыши» . Механизмы развития . 108 (1–2): 221–5. doi : 10.1016/s0925-4773 (01) 00491-9 . PMID 11578880 . S2CID 15474684 .
Kallijärvi J, Avela K, Lipsanen-Nonman M, Ulmanen I, Lehesjoki AE (май 2002). «Ген TRIM37 кодирует пероксисомальный кольцевой кольцевой белок с подачей катушки: классификация нанизма мулибри как нового пероксисомального расстройства» . Американский журнал человеческой генетики . 70 (5): 1215–28. doi : 10.1086/340256 . PMC 447596 . PMID 11938494 .
Jagiello P, Hammans C, Wieczorek S, Arning L, Stefanski A, Strehl H, et al. (Июнь 2003 г.). «Новая мутация сайта сплайсинга в гене TRIM37 вызывает нанизм мулибри в турецком семействе с фенотипической гетерогенностью» . Человеческая мутация . 21 (6): 630–5. doi : 10.1002/Humu.10220 . PMID 12754710 . S2CID 24074182 .
Hämäläinen RH, Avela K, Lambert JA, Kallijärvu J, Eyaid W, Gronau J, et al. (Май 2004 г.). «Новые мутации в жанре TREM37 в мулибри нанизм» . Человеческая мутация . 23 (5): 522. doi : 10.1002/Humu.9233 . PMID 15108285 S2CID 2299120 .
Kallijärvi J, Lahtinen U, Hämäläinen R, Lipsanen-Nyman M, Palvimo JJ, Lehesjoki AE (август 2005 г.). «TRIM37 Defective in Mulibrey Nanism - это новый Ring Finger Ubiquit E3 Liga». Экспериментальные исследования клеток . 308 (1): 146-55. Doi : 10.1016/j.yexcr.2005.04.001 . PMID 15885686 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (Октябрь 2005 г.). «На пути к масштабе протеома карты взаимодействия белкового белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005natur.437.1173r . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Карлберг Н., Джаланко Х., Каллиджарви Дж., Лехесоки А.Е., Липсанен-Найман М. (декабрь 2005 г.). «Синдром устойчивости инсула у субъектов с мутированным белком с белком наглубков TRIM37» . Диабет . 54 (12): 3577-81. Doi : 10.2337/диабет.54.12.3577 . PMID 16306379 .
Hämäläinen RH, Joensuu T, Kallijärvi J, Lehesjoki AE (январь 2006 г.). «Характеристика гена TRIM37, ассоциированного с нанизмом, связанного с нанизмом: инициация транскрипции, промоторная область и альтернативный сплайсинг». Ген . 366 (1): 180–8. doi : 10.1016/j.gene.2005.08.008 . PMID 16310976 .
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, et al. (Май 2006 г.). «Белковая сеть взаимодействия для унаследованных человеческих атаксий и расстройства дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (ноябрь 2006 г.). «Глобальная динамика фосфорилирования в Global, in vivo и сайт в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Hämäläinen RH, Mowat D, Gabbett MT, O'Brien TA, Kalijärvi J, Lehesjoki AE (декабрь 2006 г.). «Опухоль и новые мутации TRIM37 у австралийских пациентов с Мулибри Насмом» Клиническая генетика 70 (6): 473–9 Doi : 10.1111/ j.1399-0004.2006.00700.x 17100991PMID 20007234S2CID
Doğanc T, Yüksel Konuk BE, Alpan N, Guest O, Hämäläinen RH, Lehesjoki AE, Tekin M (июль 2007 г.). «Новая мутация в TRIM37 связана с Мулибри Нанизм у турецкого мальчика». Клиническая дисморфология . 16 (3): 173–6. Doi : 10.1097/mcd.0b013e3280f6d00b . PMI 17551331 . S2CID 45965305 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : O94972 (E3 Ubiquitin-протеиновый лигаза TRIM37) в PDBE-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000108395 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000018548 - ENSEMBL , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9106536-5] Avela K, Lipsanen-Nonman M, Perheentupa J, Wallgren-Petersson C, Marchand S, Fauré S, et al. (Апрель 1997). «Назначение гена нанизма Mulibrey до 17Q путем анализа связи и сцепления-дисеквилибей » » Американский журнал человеческой генетики 60 (4): 896–9 1712467PMC 9106536PMID

[pmid10888877-6] Avela K, Lipsanen-Nonman M, Idänheimo N, Seemanová E, Rosengren S, Mäkelä TP, et al. (Июль 2000 г.). «Ген, кодирующий новый белок с кольцом с кольцом, мутируется в нанизме мулибри». Природа генетика . 25 (3): 298–301. doi : 10.1038/77053 . PMID 10888877 . S2CID 24257747 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: TRIM37 Триптитный мотив, содержащий 37» .

[:0-8] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Bhatnagar S, Gazin C, Chamberlain L, Ou J, Zhu X, Tushir JS, et al. (Декабрь 2014). «TRIM37 - это новая гистоновая H2A -убиквитин -лигаза и онкопротеин рака молочной железы» . Природа . 516 (7529): 116–20. Bibcode : 2014natur.516..116b . doi : 10.1038/nature13955 . PMC 4269325 . PMID 25470042 .

[9] Weake VM, Workman JL (март 2008 г.). «Гистоновое убиквитинирование: запуск генной активности» . Молекулярная клетка . 29 (6): 653–63. doi : 10.1016/j.molcel.2008.02.014 . PMID 18374642 .

[10] Синклер, Коллин с.; Роули, Мэтью; Надери, Али; Couch, Fergus J. (2003-04-01). «Ампликон и рак молочной железы 17Q23». Исследования и лечения рака молочной железы . 78 (3): 313–322. doi : 10.1023/a: 1023081624133 . ISSN 1573-7217 . PMID 12755490 . S2CID 23751525 .

[pmid16189514-11] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (Октябрь 2005 г.). «На пути к масштабе протеома карты взаимодействия белкового белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005natur.437.1173r . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]