ТРИМ32
| ТРИМ32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | TRIM32 , BBS11, HT2A, LGMD2H, TATIP, трехчастный мотив, содержащий 32, LGMDR8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 602290 ; МГИ : 1917057 ; Гомологен : 36327 ; Генные карты : TRIM32 ; OMA : TRIM32 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок 32, содержащий трехчастный мотив, представляет собой белок , который у человека кодируется TRIM32 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Было показано, что с момента своего открытия в 1995 году TRIM32 участвует в ряде разнообразных биологических путей.
Структура
[ редактировать ]Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства трехчастных мотивов (TRIM). Мотив TRIM включает три цинксвязывающих домена: RING , B-box типа 1 и B-box типа 2, а также область спиральной спирали . [ 8 ]
Субклеточное распределение
[ редактировать ]Белок локализуется в цитоплазматических тельцах . Белок также локализован в ядре , где он взаимодействует с доменом активации ВИЧ-1 белка Tat . Белок Tat активирует транскрипцию генов ВИЧ-1. [ 8 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что TRIM32 взаимодействует с:
Функция
[ редактировать ]Механизм
[ редактировать ]В настоящее время считается, что TRIM32 использует два разных механизма воздействия на молекулярные мишени. Во-первых, он может действовать через свой N-концевой КОЛЬЦЕВОЙ палец как убиквитинлигаза E3 , ответственная за прикрепление молекул убиквитина к остаткам лизина белков-мишеней, чтобы пометить их для протеосомной деградации. В настоящее время имеются данные, свидетельствующие о том, что TRIM32 убиквитинирует несколько белков, включая c-Myc, дисбиндин, актин, пиази и Abl-interactor2 (ABI2). Второй механизм, посредством которого, как полагают, действует TRIM32, включает связывание белков с C-концевым повтором НХЛ , который, как было показано, активирует микроРНК . [ 11 ]
Разработка
[ редактировать ]Недавно исследования показали важность TRIM32 в развитии неокортекса мыши . В неокортексе мыши нейрональные клетки-предшественники генерируют дочерние клетки, которые либо дифференцируются в специфические нейроны, либо поддерживают состояние предшественников материнской клетки. TRIM32 помогает контролировать баланс между дифференцирующими клетками и клетками-предшественниками, локализуясь на полюсе во время деления клеток-предшественников и, таким образом, концентрируясь в одной из двух дочерних клеток. Это асимметричное деление TRIM32 индуцирует дифференцировку нейронов в дочерних клетках, которые содержат высокие концентрации TRIM32, тогда как клетки с низкими концентрациями TRIM32 сохраняют судьбу клеток-предшественников. Предлагаемые теории о том, как TRIM32 индуцирует дифференцировку, включают убиквитинирование транскрипционного фактора c-Myc и связывание Argonaute-1 (Ago-1). Связывание Ago-1 индуцирует активность miRNAs, особенно Let-7a , которая, как было показано, играет роль в регуляции пролиферации и дифференцировки нейронов. [ 11 ]
Скелетные мышцы
[ редактировать ]TRIM32 экспрессируется в скелетных мышцах , где он взаимодействует с миозином и может убиквитинировать актин (было показано, что это происходит in vitro). [ 9 ] Однако между диким типом и TRIM32 с мутацией LHMD2H не наблюдалось с точки зрения связывания актина или миозина, и, таким образом, механизм, вызывающий мышечную дистрофию, LGMD2H, все еще неизвестен. [ 14 ] Кроме того, известно, что TRIM32 убиквитинирует дисбиндин, белок, связанный как со скелетными мышцами, так и с нервной тканью. Цель и последствия убиквитинирования дисбиндина пока неясны. [ 12 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Заболевания, связанные с мутациями
[ редактировать ]Синдром Барде-Бидля (BBS): TRIM32 является одним из 14 [ 15 ] гены, которые, как известно, связаны с BBS. В частности, мутация (P130S) в B-боксе TRIM32 приводит к развитию BBS. [ 12 ]
Мышечная дистрофия конечностей 2H (LGMD2H): LGMD2H вызвана 4 мутациями TRIM32 в C-концевом домене НХЛ: D487N (третий повтор НХЛ), R394H (первый повтор НХЛ), T520TfsX13 (четвертый повтор НХЛ) и D588del ( пятый повтор НХЛ). [ 12 ]
Рак
[ редактировать ]TRIM32 сверхэкспрессируется в клетках рака кожи. Считается, что TRIM32 регулирует активность NF-κB посредством убиквитинирования белка-ингибитора активированного STAT Y ( Piasy ). [ 13 ] Пиазис действует как ингибитор NF-κB, а NF-κB действует как антиапоптотический фактор. Таким образом, когда присутствует Piasy, NF-κB ингибируется, а кератиноциты подвергаются апоптозу при воздействии ультрафиолетового излучения B или TNFα, предотвращая образование рака. Когда TRIM32 сверхэкспрессируется, Piasy разрушается, позволяя NF-κB функционировать, и, таким образом, когда клетки подвергаются воздействию ультрафиолетового излучения B или TNFα, апоптоз не происходит, что потенциально способствует образованию рака. [ 14 ]
TRIM32 дополнительно способствует образованию рака за счет убиквитинирования Abl-interactor 2 ( Abi2 ), который является супрессором опухоли и ингибитором миграции клеток. [ 13 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000119401 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051675 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каиро С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехсторонних мотивов идентифицирует клеточные отсеки» . ЭМБО Дж. 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140 . ПМК 125245 . ПМИД 11331580 .
- ^ Фриделл Р.А., Хардинг Л.С., Богерд Х.П., Каллен Б.Р. (июль 1995 г.). «Идентификация нового человеческого белка цинковых пальцев, который специфически взаимодействует с доменом активации лентивирусных белков Tat» . Вирусология . 209 (2): 347–57. дои : 10.1006/виро.1995.1266 . ПМИД 7778269 .
- ^ Чан А.П., Бек Дж.С., Йен Х.Дж., Тайе М.К., Шитц Т.Е., Свидерски Р.Э., Нисимура Д.Я., Браун Т.А., Ким К.Ю., Хуанг Дж., Эльбедур К., Карми Р., Слюсарски Д.К., Казавант Т.Л., Стоун Э.М., Шеффилд В.К. (апрель 2006 г.) ). «Картирование гомозиготности с помощью массивов SNP идентифицирует TRIM32, убиквитинлигазу E3, как ген синдрома Барде-Бидля (BBS11)» . Proc Natl Acad Sci США . 103 (16): 6287–92. Бибкод : 2006PNAS..103.6287C . дои : 10.1073/pnas.0600158103 . ПМЦ 1458870 . ПМИД 16606853 .
- ^ Jump up to: а б с «Ген Энтрез: трехчастный мотив TRIM32, содержащий 32» .
- ^ Jump up to: а б Кудряшова Е, Кудряшов Д, Крамерова И, Спенсер МДж (ноябрь 2005 г.). «Trim32 представляет собой убиквитинлигазу, мутировавшую при поясной мышечной дистрофии конечностей типа 2H, которая связывается с миозином скелетных мышц и убиквитинирует актин». Дж Мол Биол . 354 (2): 413–24. дои : 10.1016/j.jmb.2005.09.068 . ПМИД 16243356 .
- ^ Кано С., Миядзима Н., Фукуда С., Хатакеяма С. (июль 2008 г.). «Белок 32 с трехсторонним мотивом облегчает рост и миграцию клеток посредством деградации Abl-интерактора 2» . Рак Рез . 68 (14): 5572–80. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-07-6231 . ПМИД 18632609 .
- ^ Jump up to: а б с Швамборн Дж., Березиков Е., Кноблих Дж. (март 2009 г.). «Белок TRIM-NHL TRIM32 активирует микроРНК и предотвращает самообновление в нейронных предшественниках мыши» . Клетка . 136 (5): 913–925. дои : 10.1016/j.cell.2008.12.024 . ПМК 2988196 . ПМИД 19269368 .
- ^ Jump up to: а б с д Локк М., Тинсли С.Л., Бенсон М.А., Блейк DJ (апрель 2009 г.). «TRIM32 представляет собой убиквитинлигазу E3 для дисбиндина» . Хум Мол Жене . 18 (13): 2344–58. дои : 10.1093/hmg/ddp167 . ПМЦ 2694686 . ПМИД 19349376 .
- ^ Jump up to: а б с Кудряшова Э., Ву Дж., Хэвтон Л.А., Спенсер М.Дж. (апрель 2009 г.). «Дефицит убиквитинлигазы Е3 TRIM32 у мышей приводит к миопатии с нейрогенным компонентом» . Хум Мол Жене . 18 (7): 1353–67. дои : 10.1093/hmg/ddp036 . ПМК 2722196 . ПМИД 19155210 .
- ^ Jump up to: а б Альбор А., Эль-Хизави С., Хорн Э.Дж., Ледерих М., Фроск П., Врогеманн К., Кулеш-Мартин М. (июнь 2006 г.). «Взаимодействие Piasy с Trim32, E3-убиквитин-лигазой, мутировавшей при мышечной дистрофии конечностей типа 2H, способствует деградации Piasy и регулирует апоптоз кератиноцитов, индуцированный UVB, посредством NFkappaB» . J Биол Хим . 281 (35): 25850–66. дои : 10.1074/jbc.M601655200 . ПМИД 16816390 .
- ^ Хамош, Ада (2 ноября 2012 г.). «Запись OMIM № 209900 Синдром Барде-Бидля; BBS» . Интернет-менделевское наследование у человека . Институт генетической медицины МакКьюсика-Натанса, Медицинский факультет Университета Джонса Хопкинса . Проверено 4 сентября 2013 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Альбор А., Эль-Хизави С., Хорн Э.Дж. и др. (2006). «Взаимодействие Piasy с Trim32, E3-убиквитин-лигазой, мутировавшей при мышечной дистрофии конечностей типа 2H, способствует деградации Piasy и регулирует апоптоз кератиноцитов, индуцированный UVB, посредством NFkappaB» . Ж. Биол. Хим . 281 (35): 25850–66. дои : 10.1074/jbc.M601655200 . ПМИД 16816390 .
- Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
- Шозер Б.Г., Фроск П., Энгель А.Г. и др. (2005). «Общность мутации TRIM32 в возникновении саркотубулярной миопатии и LGMD2H». Энн. Нейрол . 57 (4): 591–5. дои : 10.1002/ana.20441 . ПМИД 15786463 . S2CID 6766847 .
- Бензингер А., Мустер Н., Кох Х.Б. и др. (2005). «Целевой протеомный анализ сигмы 14-3-3, эффектора p53, который обычно подавляется при раке» . Мол. Клетка. Протеомика . 4 (6): 785–95. дои : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . ПМИД 15778465 .
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
- Хамфри С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ 9 хромосомы человека» . Природа . 429 (6990): 369–74. Бибкод : 2004Natur.429..369H . дои : 10.1038/nature02465 . ПМК 2734081 . ПМИД 15164053 .
- Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
- Фроск П., Вейлер Т., Найлен Э. и др. (2002). «Мышечная дистрофия конечностей типа 2H, связанная с мутацией TRIM32, предполагаемого гена E3-убиквитин-лигазы» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 70 (3): 663–72. дои : 10.1086/339083 . ПМК 447621 . ПМИД 11822024 .
- Вейлер Т., Гринберг С.Р., Зелински Т. и др. (1998). «Ген аутосомно-рецессивной мышечной дистрофии пояса конечностей у гуттеритов Манитобы картируется в области хромосомы 9q31-q33: свидетельство другого локуса мышечной дистрофии пояса конечностей» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 63 (1): 140–7. дои : 10.1086/301925 . ПМЦ 1377246 . ПМИД 9634523 .