Полицистин 1

ПКД1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1B4R
Идентификаторы
Псевдонимы	PKD1 , PBP, Pc-1, TRPP1, полицистин 1, взаимодействие каналов транзиторного рецепторного потенциала, PC1
Внешние идентификаторы	Опустить : 601313 ; МГИ : 97603 ; Гомологен : 250 ; Генные карты : PKD1 ; ОМА : ПКД1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	2,135,898 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	24,596,508 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; anterior pituitary; ; right frontal lobe; ; gastric mucosa; ; ascending aorta; ; Descending thoracic aorta; ; muscle layer of sigmoid colon; ; body of uterus; ; right coronary artery; ; popliteal artery;
	Top expressed in
	cerebellar cortex; ; layer of retina; ; neural layer of retina; ; primary visual cortex; ; hypothalamus; ; superior frontal gyrus; ; islet of Langerhans; ; uterus; ; olfactory bulb; ; striatum of neuraxis;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transmembrane transporter binding; protein domain specific binding; calcium channel activity; protein binding; protein kinase binding; carbohydrate binding;
Cellular component	cytoplasm; integral component of membrane; Golgi apparatus; cell projection; lateral plasma membrane; membrane; Golgi membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane; cilium; cell surface; basolateral plasma membrane; ciliary membrane; Golgi-associated vesicle membrane; extracellular exosome; nucleus; polycystin complex; motile cilium;
Biological process	calcium-independent cell-matrix adhesion; calcium ion transport; regulation of proteasomal protein catabolic process; mesonephric tubule development; renal system development; receptor signaling pathway via JAK-STAT; metanephric distal tubule morphogenesis; regulation of mitotic spindle organization; mesonephric duct development; kidney development; cytoplasmic sequestering of transcription factor; positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; anatomical structure morphogenesis; placenta blood vessel development; embryonic placenta development; in utero embryonic development; response to fluid shear stress; genitalia development; metanephric ascending thin limb development; metanephric proximal tubule development; heart development; cartilage development; regulation of cell adhesion; nitrogen compound metabolic process; blood vessel development; calcium ion transmembrane transport; peptidyl-serine phosphorylation; lymph vessel morphogenesis; neural tube development; protein export from nucleus; detection of mechanical stimulus; establishment of cell polarity; spinal cord development; metanephric collecting duct development; liver development; positive regulation of protein binding; digestive tract development; cell-matrix adhesion; lung epithelium development; branching morphogenesis of an epithelial tube; cartilage condensation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; skin development; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; cell-cell adhesion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5310
	18763
	ENSG00000008710
	ENSMUSG00000032855
	P98161
	О08852
	НМ_000296 ; НМ_001009944
	НМ_013630
	НП_000287 ; НП_001009944
	НП_038658
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Полицистин 1 ( PC1 ) представляет собой белок , который у человека кодируется PKD1 геном . ^[5]^[6] Мутации PKD1 связаны с большинством случаев аутосомно-доминантного поликистозного заболевания почек — тяжелого наследственного заболевания почек , характеризующегося развитием почечных кист и тяжелой дисфункцией почек. ^[7]

Структура и функции белка

PC1 представляет собой мембраносвязанный белок 4303 аминокислоты, длиной экспрессирующийся в основном на первичных ресничках , а также на апикальных мембранах , слипчивых соединениях и десмосомах . ^[8] Он имеет 11 трансмембранных доменов , большой внеклеточный N-концевой домен и короткий (около 200 аминокислот) цитоплазматический С-концевой домен. ^[8]^[9] Этот внутриклеточный домен содержит спиральный домен, посредством которого PC1 взаимодействует с полицистином 2 (PC2), мембраносвязанным кальцием. ²⁺-проницаемый ионный канал .

Было предложено, что PC1 действует как рецептор, связанный с G-белком . ^[8]^[10] С-концевой домен можно расщепить различными способами. В одном случае было обнаружено, что часть хвоста размером ~35 кДа накапливается в ядре клетки в ответ на уменьшение потока жидкости в почках мыши. ^[11] В другом случае может быть получен фрагмент массой 15 кДа, взаимодействующий с активатором и коактиватором транскрипции STAT6 и p100 или компонентами канонического сигнального пути Wnt ингибирующим образом. ^[12]^[13]

Структура человеческого комплекса PKD1-PKD2 была расшифрована с помощью криоэлектронной микроскопии , которая показала соотношение PKD1 и PKD2 в структуре 1:3. PKD1 состоит из складки потенциалзависимого ионного канала , которая взаимодействует с PKD2. ^[14]

PC1 опосредует механоощущение потока жидкости первичной ресничкой почечного эпителия и механическую деформацию суставного хряща . ^[15]

Ген

были отмечены сплайсинговые варианты, кодирующие разные изоформы Для PKD1 . Ген тесно связан с шестью псевдогенами в известной дублированной области хромосомы 16p. ^[16]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000008710 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032855 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хьюз Дж., Уорд С.Дж., Перал Б., Аспинволл Р., Кларк К., Сан Миллан Дж.Л., Гэмбл В., Харрис ПК (июнь 1995 г.). «Ген поликистозной болезни почек 1 (PKD1) кодирует новый белок с несколькими доменами клеточного распознавания». Природная генетика . 10 (2): 151–60. дои : 10.1038/ng0695-151 . ПМИД 7663510 . S2CID 20636101 .
^ «Поликистоз почек: полная структура гена PKD1 и его белка. Международный консорциум по поликистозу почек» . Клетка . 81 (2): 289–98. Апрель 1995 г. doi : 10.1016/0092-8674(95)90339-9 . ПМИД 7736581 . S2CID 11114706 .
^ Торрес В.Е., Харрис ПК, Пирсон Ю. (апрель 2007 г.). «Аутосомно-доминантный поликистоз почек». Ланцет . 369 (9569): 1287–301. дои : 10.1016/S0140-6736(07)60601-1 . ПМИД 17434405 . S2CID 1700992 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Чжоу Дж (2009). «Полицистины и первичные реснички: праймеры для развития клеточного цикла». Ежегодный обзор физиологии . 71 : 83–113. дои : 10.1146/annurev.phyol.70.113006.100621 . ПМИД 19572811 .
^ Далагиоргу Г., Басдра Е.К., Папавассилиу А.Г. (октябрь 2010 г.). «Полицистин-1: функция механосенсора». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 42 (10): 1610–3. doi : 10.1016/j.biocel.2010.06.017 . ПМИД 20601082 .
^ Трудель М., Яо Ц, Цянь Ф (январь 2016 г.). «Роль расщепления полицистина-1 рецептором, связанным с G-белком, в физиологии почек и поликистозе почек» . Клетки . 5 (1): 3. doi : 10,3390/cells5010003 . ПМК 4810088 . ПМИД 26805887 .
^ Шове В., Тиан Х., Хассон Х., Гримм Д.Х., Ван Т., Хисбергер Т., Хизебергер Т., Игараши П., Беннетт А.М., Ибрагимов-Бескровная О., Сомло С., Каплан М.Дж. (ноябрь 2004 г.). «Механические стимулы вызывают расщепление и ядерную транслокацию С-конца полицистина-1» . Журнал клинических исследований . 114 (10): 1433–43. дои : 10.1172/JCI21753 . ПМК 1052027 . ПМИД 15545994 .
^ Лоу Ш., Васант С., Ларсон Ч., Мукерджи С., Шарма Н., Кинтер М.Т., Кейн М.Е., Обара Т., Веймбс Т. (январь 2006 г.). «Полицистин-1, STAT6 и P100 функционируют в пути, который преобразует цилиарную механочувствительность и активируется при поликистозе почек» . Развивающая клетка . 10 (1): 57–69. дои : 10.1016/j.devcel.2005.12.005 . ПМИД 16399078 .
^ Лал М., Сонг X, Плужник Дж.Л., Ди Джованни В., Меррик Д.М., Розенблюм Н.Д., Шове В., Готтарди С.Дж., Пей Ю., Каплан М.Дж. (октябрь 2008 г.). «С-концевой хвост полицистина-1 связывается с бета-катенином и ингибирует каноническую передачу сигналов Wnt» . Молекулярная генетика человека . 17 (20): 3105–17. дои : 10.1093/hmg/ddn208 . ПМЦ 2722884 . ПМИД 18632682 .
^ Ши Ю, Мэй С, Чжоу Ц, Ван Т, Ю С, Лэй Дж, Гэ Икс, Ху Ф, Су Ц (07 сентября 2018 г.). «Строение комплекса PKD1-PKD2 человека» . Наука . 361 (6406): eaat9819. дои : 10.1126/science.aat9819 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 30093605 .
^ Наули С.М., Аленгат Ф.Дж., Луо Й., Уильямс Э., Васильев П., Ли Х, Элиа А.Е., Лу В., Браун Э.М., Куинн С.Дж., Ингбер Д.Э., Чжоу Дж. (февраль 2003 г.). «Полицистины 1 и 2 опосредуют механочувствительность в первичных ресничках клеток почек». Природная генетика . 33 (2): 129–37. дои : 10.1038/ng1076 . ПМИД 12514735 . S2CID 23149223 .
^ «Ген Энтрез: поликистоз почек PKD1 1 (аутосомно-доминантный тип)» .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW о поликистозе почек, аутосомно-доминантном типе

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000008710 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032855 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7663510-5] Хьюз Дж., Уорд С.Дж., Перал Б., Аспинволл Р., Кларк К., Сан Миллан Дж.Л., Гэмбл В., Харрис ПК (июнь 1995 г.). «Ген поликистозной болезни почек 1 (PKD1) кодирует новый белок с несколькими доменами клеточного распознавания». Природная генетика . 10 (2): 151–60. дои : 10.1038/ng0695-151 . ПМИД 7663510 . S2CID 20636101 .

[pmid7736581-6] «Поликистоз почек: полная структура гена PKD1 и его белка. Международный консорциум по поликистозу почек» . Клетка . 81 (2): 289–98. Апрель 1995 г. doi : 10.1016/0092-8674(95)90339-9 . ПМИД 7736581 . S2CID 11114706 .

[TP-150518-E20-7] Торрес В.Е., Харрис ПК, Пирсон Ю. (апрель 2007 г.). «Аутосомно-доминантный поликистоз почек». Ланцет . 369 (9569): 1287–301. дои : 10.1016/S0140-6736(07)60601-1 . ПМИД 17434405 . S2CID 1700992 .

[:0-8] Jump up to: ^а ^б ^с Чжоу Дж (2009). «Полицистины и первичные реснички: праймеры для развития клеточного цикла». Ежегодный обзор физиологии . 71 : 83–113. дои : 10.1146/annurev.phyol.70.113006.100621 . ПМИД 19572811 .

[9] Далагиоргу Г., Басдра Е.К., Папавассилиу А.Г. (октябрь 2010 г.). «Полицистин-1: функция механосенсора». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 42 (10): 1610–3. doi : 10.1016/j.biocel.2010.06.017 . ПМИД 20601082 .

[10] Трудель М., Яо Ц, Цянь Ф (январь 2016 г.). «Роль расщепления полицистина-1 рецептором, связанным с G-белком, в физиологии почек и поликистозе почек» . Клетки . 5 (1): 3. doi : 10,3390/cells5010003 . ПМК 4810088 . ПМИД 26805887 .

[11] Шове В., Тиан Х., Хассон Х., Гримм Д.Х., Ван Т., Хисбергер Т., Хизебергер Т., Игараши П., Беннетт А.М., Ибрагимов-Бескровная О., Сомло С., Каплан М.Дж. (ноябрь 2004 г.). «Механические стимулы вызывают расщепление и ядерную транслокацию С-конца полицистина-1» . Журнал клинических исследований . 114 (10): 1433–43. дои : 10.1172/JCI21753 . ПМК 1052027 . ПМИД 15545994 .

[12] Лоу Ш., Васант С., Ларсон Ч., Мукерджи С., Шарма Н., Кинтер М.Т., Кейн М.Е., Обара Т., Веймбс Т. (январь 2006 г.). «Полицистин-1, STAT6 и P100 функционируют в пути, который преобразует цилиарную механочувствительность и активируется при поликистозе почек» . Развивающая клетка . 10 (1): 57–69. дои : 10.1016/j.devcel.2005.12.005 . ПМИД 16399078 .

[13] Лал М., Сонг X, Плужник Дж.Л., Ди Джованни В., Меррик Д.М., Розенблюм Н.Д., Шове В., Готтарди С.Дж., Пей Ю., Каплан М.Дж. (октябрь 2008 г.). «С-концевой хвост полицистина-1 связывается с бета-катенином и ингибирует каноническую передачу сигналов Wnt» . Молекулярная генетика человека . 17 (20): 3105–17. дои : 10.1093/hmg/ddn208 . ПМЦ 2722884 . ПМИД 18632682 .

[14] Ши Ю, Мэй С, Чжоу Ц, Ван Т, Ю С, Лэй Дж, Гэ Икс, Ху Ф, Су Ц (07 сентября 2018 г.). «Строение комплекса PKD1-PKD2 человека» . Наука . 361 (6406): eaat9819. дои : 10.1126/science.aat9819 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 30093605 .

[15] Наули С.М., Аленгат Ф.Дж., Луо Й., Уильямс Э., Васильев П., Ли Х, Элиа А.Е., Лу В., Браун Э.М., Куинн С.Дж., Ингбер Д.Э., Чжоу Дж. (февраль 2003 г.). «Полицистины 1 и 2 опосредуют механочувствительность в первичных ресничках клеток почек». Природная генетика . 33 (2): 129–37. дои : 10.1038/ng1076 . ПМИД 12514735 . S2CID 23149223 .

[16] «Ген Энтрез: поликистоз почек PKD1 1 (аутосомно-доминантный тип)» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

v т и Цилиарные белки
Нефроцистин	НПХП1 ИНВС НПХП3 НПХП4 IQCB1 CEP290 ГЛИС2 РПГРИП1Л
Базальное тело	BBsome ББС1 ББС2 ББС4 ББС5 ББС7 ТТС8 ББС9 сопровождающий МККС ББС10 ББС12 Другой АРЛ6 ТРИМ32 АЛМС1 CC2D2A CEP290 МКС1 РПГРИП1Л ОФД1 АХИ1 ИНВС НПХП4 НЭК8 НПХП1
Реснички	соединительные реснички LCA5 РП1 РПГР РПГРИП1 ТУЛЬП1 первичные реснички ARL13B ИАЭС5Е IQCB1 ПКХД1 ПКД1 ПКД2 ТМЕМ67
Дайнейн	внешние динеиновые рукава ДНКH5 ДНКI2 ДНКЛ1 аксонема ДНКH11 ДНКАИ1
Радиальные спицы	РСПХ1 РСПХ3 РСФ4А РСФ6А РСПХ9 РСПХ10Б
Другой	цитоплазма КТУ ядро ГЛИС2 внутрижгутиковый транспорт IFT80 другой АХИ1 ARL13B БРСС3 ИАЭС5Е КИФ3А ЛРРК50 SDCCAG8 ТМЕМ216 TXNDC3
Смотрите также: цилиопатия