CLCA1

CLCA1
Идентификаторы
Псевдонимы	CLCA1 , CACC, CACC1, CLCRG1, CaCC-1, GOB5, hhCaCC-1, аксессуар для хлоридного канала 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603906 ; МГИ : 1346342 ; Гомологен : 984 ; Генные карты : CLCA1 ; OMA : CLCA1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	86,500,259 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	144,738,537 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of ileum; ; mucosa of sigmoid colon; ; jejunal mucosa; ; mucosa of transverse colon; ; rectum; ; duodenum; ; cecum; ; appendix; ; pancreatic ductal cell; ; epithelium of colon;
	Top expressed in
	left colon; ; intestinal villus; ; cervix; ; pyloric antrum; ; ileum; ; duodenum; ; mucous cell of stomach; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; epithelium of small intestine; ; jejunum;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; peptidase activity; hydrolase activity; chloride channel activity; metallopeptidase activity; metalloendopeptidase activity; intracellular calcium activated chloride channel activity;
Cellular component	extracellular region; integral component of membrane; integral component of plasma membrane; microvillus; zymogen granule membrane; membrane; plasma membrane; secretory granule; extracellular space;
Biological process	calcium ion transport; proteolysis; chloride transport; ion transport; ion transmembrane transport; cellular response to hypoxia; chloride transmembrane transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1179
	23844
	ENSG00000016490
	ENSMUSG00000028255
	А8К7И4
	Q9D7Z6
	НМ_001285
	НМ_017474
	НП_001276
	НП_059502
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Аксессуар 1 хлоридного канала представляет собой белок , который у человека кодируется CLCA1 геном . ^[5]^[6]

Этот ген кодирует члена семейства белков хлоридной проводимости, чувствительных к кальцию. На сегодняшний день все члены этого семейства генов картируются в одной и той же области хромосомы 1p31-p22 и имеют высокую степень гомологии по размеру, последовательности и предполагаемой структуре, но значительно различаются по распределению в тканях. Кодируемый белок экспрессируется как белок-предшественник, который процессируется в две субъединицы, ассоциированные с клеточной поверхностью, хотя сайт, в котором расщепляется предшественник, точно не определен. Кодируемый белок может участвовать в обеспечении проводимости хлоридов, активируемой кальцием, в кишечнике. ^[6] Методы прогнозирования структуры белка предполагают, что N-концевая область белка CLCA1 представляет собой металлопротеазу цинка . ^[7]

См. также

Хлоридный канал

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000016490 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028255 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Грубер А.Д., Эльбле Р.К., Джи Х.Л., Шрёр К.Д., Фуллер К.М., Паули Б.У. (январь 1999 г.). «Геномное клонирование, молекулярная характеристика и функциональный анализ человеческого CLCA1, первого человеческого члена семейства Ca. ²⁺-активирован Cl ⁻ белки каналов» . Genomics . 54 (2): 200–14. doi : 10.1006/geno.1998.5562 . PMID 9828122 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: хлоридный канал CLCA1, активированный кальцием, член семейства 1» .
^ Павловский К., Леписто М., Мейнандер Н. и др. (2006). «Новый консервативный гидролазный домен в семействе CLCA предполагаемых хлоридных каналов, активируемых кальцием». Белки . 63 (3): 424–39. дои : 10.1002/прот.20887 . ПМИД 16470849 . S2CID 40041491 .

Дальнейшее чтение

Хьюм Дж.Р., Дуан Д., Коллиер М.Л. и др. (2000). «Транспорт анионов в сердце» . Физиол. Преподобный . 80 (1): 31–81. дои : 10.1152/physrev.2000.80.1.31 . ПМИД 10617765 . S2CID 15954128 .
Паули Б.У., Абдель-Гани М., Ченг Х.К. и др. (2001). «Молекулярные характеристики и функциональное разнообразие членов семейства CLCA». Клин. Эксп. Фармакол. Физиол . 27 (11): 901–5. дои : 10.1046/j.1440-1681.2000.03358.x . ПМИД 11071307 . S2CID 28762005 .
Агнель М., Вермат Т., Кулуску Ж.М. (1999). «Идентификация трех новых членов семейства кальций-зависимых хлоридных каналов (CaCC), преимущественно экспрессируемых в пищеварительном тракте и трахее» . ФЭБС Летт . 455 (3): 295–301. дои : 10.1016/S0014-5793(99)00891-1 . ПМИД 10437792 . S2CID 82094058 .
Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК 16267 . ПМИД 10737800 .
Лю К.Х., Уильямс Д.А., Макманус С. и др. (2000). «Gp120 ВИЧ-1 и хемокины активируют ионные каналы в первичных макрофагах посредством стимуляции CCR5 и CXCR4» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (9): 4832–7. Бибкод : 2000PNAS...97.4832L . дои : 10.1073/pnas.090521697 . ЧВК 18318 . ПМИД 10758170 .
Тода М., Тулик М.К., Левитт Р.К., Хамид К. (2002). «Хлоридный канал, активируемый кальцием (HCLCA1), тесно связан с экспрессией IL-9 и выработкой слизи в бронхиальном эпителии пациентов с астмой» . Дж. Аллергическая клиника. Иммунол . 109 (2): 246–50. дои : 10.1067/май.2002.121555 . ПМИД 11842292 .
Гринвуд И.А., Миллер Л.Дж., Охья С., Горовиц Б. (2002). «Бета-субъединица калиевого канала с большой проводимостью может взаимодействовать и модулировать функциональные свойства кальций-активируемого хлоридного канала, CLCA1» . Ж. Биол. Хим . 277 (25): 22119–22. дои : 10.1074/jbc.C200215200 . ПМИД 11994272 .
Абдель-Гани М., Ченг Х.К., Эльбле Р.К., Паули БУ (2002). «Киназа фокальной адгезии, активируемая лигированием бета (4) интегрина с mCLCA1, опосредует ранний метастатический рост» . Ж. Биол. Хим . 277 (37): 34391–400. дои : 10.1074/jbc.M205307200 . ПМИД 12110680 .
Лоуэн М.Е., Бекар Л.К., Габриэль С.Е. и др. (2002). «pCLCA1 становится цАМФ-зависимым медиатором хлоридной проводимости в клетках Caco-2». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 298 (4): 531–6. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02498-1 . ПМИД 12408984 .
Чжоу Ю, Шапиро М, Донг К и др. (2003). «Активируемый кальцием блокатор хлоридных каналов ингибирует метаплазию бокаловидных клеток и перепроизводство слизи». Гиперсекреция слизи при респираторных заболеваниях . Симпозиумы Фонда Новартис. Том. 248. стр. 150–65, обсуждение 165–70, 277–82. дои : 10.1002/0470860790.ch10 . ISBN 9780470844786 . ПМИД 12568493 .
Абдель-Гани М., Ченг Х.К., Эльбл Р.К. и др. (2004). «Взаимодействующие связывающие домены бета (4) интегрина и кальций-активируемых хлоридных каналов (CLCA) при метастазах» . Ж. Биол. Хим . 278 (49): 49406–16. дои : 10.1074/jbc.M309086200 . ПМИД 14512419 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Хегаб А.Е., Сакамото Т., Учида Ю. и др. (2004). «Полиморфизмы гена CLCA1 при хронической обструктивной болезни легких» . Дж. Мед. Жене . 41 (3): 27д–27. дои : 10.1136/jmg.2003.012484 . ПМЦ 1735703 . ПМИД 14985398 .
Камада Ф., Сузуки Ю., Шао С. и др. (2005). «Связь гена hCLCA1 с астмой у детей и взрослых» . Гены Иммунитет . 5 (7): 540–7. дои : 10.1038/sj.gene.6364124 . ПМИД 15318163 .
Рицка М., Станке Ф., Янсен С. и др. (2005). «Локус гена CLCA как модулятор основного дефекта желудочно-кишечного тракта при муковисцидозе». Хм. Жене . 115 (6): 483–91. дои : 10.1007/s00439-004-1190-y . ПМИД 15490240 . S2CID 12935280 .
Гибсон А., Льюис А.П., Аффлек К. и др. (2005). «hCLCA1 и mCLCA3 представляют собой секретируемые неинтегральные мембранные белки и, следовательно, не являются ионными каналами» . Ж. Биол. Хим . 280 (29): 27205–12. дои : 10.1074/jbc.M504654200 . ПМИД 15919655 .
Чон С.М., Пак Х.К., Юн И.С. и др. (2005). «Клонирование и экспрессия Ca ²⁺-активированный хлоридный канал из мозга крысы». Biochem. Biophys. Res. Commun . 334 (2): 569–76. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.06.122 . PMID 16023076 .

Внешние ссылки

CLCA1+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
человека Расположение генома CLCA1 и CLCA1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000016490 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028255 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9828122-5] Грубер А.Д., Эльбле Р.К., Джи Х.Л., Шрёр К.Д., Фуллер К.М., Паули Б.У. (январь 1999 г.). «Геномное клонирование, молекулярная характеристика и функциональный анализ человеческого CLCA1, первого человеческого члена семейства Ca. ²⁺-активирован Cl ⁻ белки каналов» . Genomics . 54 (2): 200–14. doi : 10.1006/geno.1998.5562 . PMID 9828122 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: хлоридный канал CLCA1, активированный кальцием, член семейства 1» .

[pmid16470849-7] Павловский К., Леписто М., Мейнандер Н. и др. (2006). «Новый консервативный гидролазный домен в семействе CLCA предполагаемых хлоридных каналов, активируемых кальцием». Белки . 63 (3): 424–39. дои : 10.1002/прот.20887 . ПМИД 16470849 . S2CID 40041491 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]