CLCA3

CLCA3P
Идентификаторы
Псевдонимы	CLCA3P , CLCA3, аксессуар 3 хлоридного канала, псевдоген
Внешние идентификаторы	Опустить : 604337 ; Генные карты : CLCA3P ; OMA : CLCA3P — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	86,655,376 bp
showГенная онтология
Molecular function	voltage-gated ion channel activity; chloride channel activity; calcium channel activity; transporter activity; metalloendopeptidase activity;
Cellular component	extracellular region; plasma membrane; chloride channel complex; extracellular space;
Biological process	calcium ion transport; ion transmembrane transport; regulation of ion transmembrane transport; chloride transport; chloride transmembrane transport; ion transport; calcium ion transmembrane transport; proteolysis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9629
	н/д
	ENSG00000153923
	н/д
	Q9Y6N3
	н/д
	НМ_004921
	н/д
	н/д
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Аксессуар 3 хлоридного канала , также известный как CLCA3 , представляет собой белок , который у человека кодируется CLCA3P псевдогеном . Белок , кодируемый этим геном, представляет собой хлоридный канал . ^[3] По данным HGNC, этот белок не экспрессируется у людей, но присутствует у некоторых других видов, таких как мыши. Однако в некоторых противоречивых сообщениях утверждается, что клетки человека производят и гликозилируют этот белок. ^[3]

Функция

Этот ген представляет собой транскрибируемый псевдоген, принадлежащий к семейству белков хлоридной проводимости, чувствительных к кальцию. На сегодняшний день все члены этого семейства генов локализованы в одном и том же участке хромосомы 1p31-p22 и имеют высокую степень гомологии по размеру, последовательности и предполагаемой структуре, но значительно различаются по распределению в тканях. Этот ген содержит несколько нонсенс-кодонов по сравнению с другими членами семейства, которые делают транскрипт кандидатом на нонсенс-опосредованный распад мРНК (NMD), хотя этот ген транслируется в хорошо изученный белок, который, как было показано, украшает муциновые гранулы, содержащие везикулы. Методы прогнозирования структуры белка предполагают, что N-концевая область белка CLCA3 представляет собой металлопротеазу цинка , а сам белок не является ионным каналом. ^[4]

См. также

Хлоридный канал

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000153923 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Грубер А.Д., Паули Б.У. (март 1999 г.). «Молекулярное клонирование и биохимическая характеристика укороченного секретируемого члена человеческого семейства Ca2+-активируемых Cl-каналов» . Биохимика и биофизика Acta . 1444 (3): 418–23. дои : 10.1016/S0167-4781(99)00008-1 . ПМИД 10095065 .
^ Павловский К., Леписто М., Мейнандер Н., Сиварс У., Варга М., Вислендер Э. (май 2006 г.). «Новый консервативный гидролазный домен в семействе CLCA предполагаемых хлоридных каналов, активируемых кальцием». Белки . 63 (3): 424–39. дои : 10.1002/прот.20887 . ПМИД 16470849 . S2CID 40041491 .

Дальнейшее чтение

Лю К.Х., Уильямс Д.А., Макманус С., Барибо Ф., Домс Р.В., Шолс Д. и др. (апрель 2000 г.). «Gp120 ВИЧ-1 и хемокины активируют ионные каналы в первичных макрофагах посредством стимуляции CCR5 и CXCR4» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (9): 4832–7. Бибкод : 2000PNAS...97.4832L . дои : 10.1073/pnas.090521697 . ЧВК 18318 . ПМИД 10758170 .
Паули Б.У., Абдель-Гани М., Ченг Х.К., Грубер А.Д., Арчибальд Х.А., Эльбль Р.К. (ноябрь 2000 г.). «Молекулярные характеристики и функциональное разнообразие членов семейства CLCA». Клиническая и экспериментальная фармакология и физиология . 27 (11): 901–5. дои : 10.1046/j.1440-1681.2000.03358.x . ПМИД 11071307 . S2CID 28762005 .
Грубер А.Д., Паули Б.У. (октябрь 1999 г.). «Кластеризация семейства генов человека CLCA на коротком плече хромосомы 1 (1p22-31)». Геном . 42 (5): 1030–2. дои : 10.1139/gen-42-5-1030 . ПМИД 10584316 .

Внешние ссылки

CLCA3+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта мембранных белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000153923 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10095065-3] Jump up to: ^а ^б Грубер А.Д., Паули Б.У. (март 1999 г.). «Молекулярное клонирование и биохимическая характеристика укороченного секретируемого члена человеческого семейства Ca2+-активируемых Cl-каналов» . Биохимика и биофизика Acta . 1444 (3): 418–23. дои : 10.1016/S0167-4781(99)00008-1 . ПМИД 10095065 .

[pmid16470849-4] Павловский К., Леписто М., Мейнандер Н., Сиварс У., Варга М., Вислендер Э. (май 2006 г.). «Новый консервативный гидролазный домен в семействе CLCA предполагаемых хлоридных каналов, активируемых кальцием». Белки . 63 (3): 424–39. дои : 10.1002/прот.20887 . ПМИД 16470849 . S2CID 40041491 .

[1]

[2]

[3]

[4]