Protein-coding gene in the species Homo sapiens
РЦОР1 Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать 2IW5 , 2UXN , 2UXX , 2V1D , 2X0L , 2XAF , 2XAG , 2XAH , 2XAJ , 2XAQ , 2XAS , 2Y48 , 3ZMS , 3ZMT , 3ZMU , 3ZMV , 3ZMZ , 3ZN0 , 3ZN1 , 4BAY , 4KUM , 4UV8 , 4UV9 , 4UVA , 4UVB , 4UVC , 4UXN , 5L3D , 5L3B , 5L3C , 4XBF
Идентификаторы Псевдонимы RCOR1 Внешние идентификаторы Опустить : 607675 ; МГИ : 106340 ; Гомологен : 32246 ; GeneCards : RCOR1 ; OMA : RCOR1 — ортологи показывать Мышь ) Chr. Chromosome 12 (mouse)[ 2] Band 12 F1|12 60.93 cM Start 111,005,785 bp [ 2] End 111,082,335 bp [ 2]
Викиданные
Корепрессор REST 1, также известный как CoREST, представляет собой белок , который у человека кодируется RCOR1 геном . [ 5 ] [ 6 ]
Этот ген кодирует белок, который является хорошо консервативным, экспрессия которого снижается при рождении и играет специфическую роль в определении нервных клеток дифференцировки . Кодируемый белок связывается с C-концевым доменом REST (фактор транскрипции, подавляющий репрессорный элемент-1). [ 6 ]
Было показано, что RCOR1 взаимодействует с
^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000089902 – Ensembl , май 2017 г. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037896 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Перейти обратно: а б Андрес М.Э., Бургер С., Перал-Рубио М.Дж., Баттальоли Е., Андерсон М.Е., Граймс Дж., Даллман Дж., Баллас Н., Мандель Г. (сентябрь 1999 г.). «CoREST: функциональный корепрессор, необходимый для регуляции экспрессии нейроспецифических генов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (17): 9873–8. Бибкод : 1999PNAS...96.9873A . дои : 10.1073/pnas.96.17.9873 ПМК 22303 ПМИД 10449787 . ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: корепрессор 1 RCOR1 REST» . ^ Перейти обратно: а б с д Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий деацетилазу гистонов, опосредует репрессию нейронально-специфичных генов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (11): 7420–5. Бибкод : 2002PNAS...99.7420H . дои : 10.1073/pnas.112008599 ПМК 124246 ПМИД 12032298 . ^ Перейти обратно: а б Ю А, Тонг Дж. К., Грозингер С. М., Шрайбер С. Л. (февраль 2001 г.). «CoREST является неотъемлемым компонентом комплекса CoREST-гистондеацетилазы человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (4): 1454–8. Бибкод : 2001PNAS...98.1454Y . дои : 10.1073/pnas.98.4.1454 ПМК 29278 ПМИД 11171972 . ^ Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммуна 322 (2): 601–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . ПМИД 15325272 .
Номура Н., Нагасе Т., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Сато С., Секи Н., Каварабаяши Ю., Исикава К., Табата С. (1994). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . ДНК Рез . 1 (5): 223–9. дои : 10.1093/dnares/1.5.223 ПМИД 7584044 . Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 . Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геном Рез . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 ПМИД 9110174 . Граймс Дж.А., Нильсен С.Дж., Баттальоли Э., Миска Э.А., Спе Дж.К., Берри Д.Л., Атуф Ф., Холденер BC, Мандель Г., Кузаридес Т (2000). «Ко-репрессор mSin3A является функциональным компонентом репрессорного комплекса REST-CoREST» . Ж. Биол. Хим . 275 (13): 9461–7. дои : 10.1074/jbc.275.13.9461 ПМИД 10734093 . Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2000). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 ПМИД 11076863 . Хамфри Г.В., Ван Ю., Русанова В.Р., Хираи Т., Цинь Дж., Накатани Ю., Говард Б.Х. (2001). «Стабильные комплексы гистондеацетилазы, отличающиеся наличием белков домена SANT CoREST/kiaa0071 и Mta-L1» . Ж. Биол. Хим . 276 (9): 6817–24. дои : 10.1074/jbc.M007372200 ПМИД 11102443 . Ю А, Тонг Дж.К., Грозингер С.М., Шрайбер С.Л. (2001). «CoREST является неотъемлемым компонентом комплекса CoREST-гистондеацетилазы человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (4): 1454–8. Бибкод : 2001PNAS...98.1454Y . дои : 10.1073/pnas.98.4.1454 ПМК 29278 ПМИД 11171972 . Баллас Н., Баттальоли Э., Атуф Ф., Андрес М.Е., Ченовет Дж., Андерсон М.Е., Бургер С., Монива М., Дэви Дж.Р., Бауэрс В.Дж., Федерофф Х.Дж., Роуз Д.В., Розенфельд М.Г., Брем П., Мандель Г. (2001). «Регуляция свойств нейронов с помощью нового транскрипционного комплекса» . Нейрон . 31 (3): 353–65. дои : 10.1016/S0896-6273(01)00371-3 ПМИД 11516394 . Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (2002). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий деацетилазу гистонов, опосредует репрессию специфичных для нейронов генов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (11): 7420–5. Бибкод : 2002PNAS...99.7420H . дои : 10.1073/pnas.112008599 ПМК 124246 ПМИД 12032298 . Баттальоли Э., Андрес М.Е., Роуз Д.В., Ченовет Дж.Г., Розенфельд М.Г., Андерсон М.Е., Мандель Г. (2002). «Репрессия REST нейрональных генов требует компонентов комплекса hSWI.SNF» . Ж. Биол. Хим . 277 (43): 41038–45. дои : 10.1074/jbc.M205691200 ПМИД 12192000 . Луньяк В.В., Берджесс Р., Префонтейн Г.Г., Нельсон С., Сзе Ш., Ченовет Дж., Шварц П., Певзнер П.А., Гласс С., Мандель Г., Розенфельд М.Г. (2002). «Корепрессор-зависимое замалчивание хромосомных областей, кодирующих гены нейронов». Наука . 298 (5599): 1747–52. Бибкод : 2002Sci...298.1747L . CiteSeerX 10.1.1.136.7131 дои : 10.1126/science.1076469 . ПМИД 12399542 . S2CID 13507921 . Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (2003). «Кандидат на Х-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу» . Ж. Биол. Хим . 278 (9): 7234–9. дои : 10.1074/jbc.M208992200 ПМИД 12493763 . Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (2004). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммуна 322 (2): 601–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . ПМИД 15325272 . Гу Х, Лян Й, Мандель Г, Ройзман Б (2005). «Компоненты комплекса репрессора REST/CoREST/гистондеацетилазы разрушаются, модифицируются и транслоцируются в клетках, инфицированных ВПГ-1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (21): 7571–6. Бибкод : 2005PNAS..102.7571G . дои : 10.1073/pnas.0502658102 ПМК 1140450 ПМИД 15897453 . Ли М.Г., Виндер С., Куч Н., Шихаттар Р. (2005). «Важная роль CoREST в деметилировании нуклеосомного гистона 3 лизина 4». Природа . 437 (7057): 432–5. Бибкод : 2005Natur.437..432L . дои : 10.1038/nature04021 . ПМИД 16079794 . S2CID 4396351 . Ши Ю.Дж., Мэтсон С., Лан Ф., Ивасе С., Баба Т., Ши Ю. (2005). «Регуляция активности деметилазы гистонов LSD1 с помощью связанных с ней факторов» . Мол. Клетка . 19 (6): 857–64. doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.027 ПМИД 16140033 . Ноусиайнен М., Силье Х.Х., Зауэр Г., Нигг Э.А., Кернер Р. (2006). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (14): 5391–6. Бибкод : 2006PNAS..103.5391N . дои : 10.1073/pnas.0507066103 ПМЦ 1459365 ПМИД 16565220 .
показывать галерея PDB
2iw5 : STRUCTURAL BASIS FOR COREST-DEPENDENT DEMETHYLATION OF NUCLEOSOMES BY THE HUMAN LSD1 HISTONE DEMETHYLASE
2uxn : STRUCTURAL BASIS OF HISTONE DEMETHYLATION BY LSD1 REVEALED BY SUICIDE INACTIVATION
2v1d : STRUCTURAL BASIS OF LSD1-COREST SELECTIVITY IN HISTONE H3 RECOGNITION
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
