HMG20B

HMG20B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2CRJ
Идентификаторы
Псевдонимы	HMG20B , BRAF25, BRAF35, HMGX2, HMGXB2, PP7706, SMARCE1r, SOXL, pp8857, группа высокой мобильности 20B
Внешние идентификаторы	Опустить : 605535 ; МГИ : 1341190 ; Гомологен : 74949 ; Генные карты : HMG20B ; ОМА : HMG20B – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	3,579,088 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	81,186,314 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; stromal cell of endometrium; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; skin of leg; ; muscle layer of sigmoid colon; ; canal of the cervix; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; skin of abdomen; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	interventricular septum; ; lip; ; yolk sac; ; genital tubercle; ; granulocyte; ; ventricular zone; ; lens; ; internal carotid artery; ; tail of embryo; ; duodenum;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein heterodimerization activity; DNA binding; protein binding; histone deacetylase activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm; chromosome; nuclear body;
Biological process	skeletal muscle cell differentiation; cell cycle; negative regulation of protein sumoylation; blood coagulation; regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of neuron differentiation; transcription, DNA-templated; histone deacetylation; chromatin organization; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10362
	15353
	ENSG00000064961
	ENSMUSG00000020232
	Q9P0W2
	Q9Z104
	НМ_006339
	НМ_001163165 ; НМ_001163166 ; НМ_010440
	НП_006330
	НП_001156637 ; НП_001156638 ; НП_034570
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

SWI/SNF-связанный с матриксом актин-зависимый регулятор подсемейства Е хроматина. Родственный члену 1 представляет собой белок , который у человека кодируется HMG20B геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

HMG20B представляет собой ДНК-связывающий белок группы высокой подвижности (HMG). HMG20B содержит карбокси-концевую область, которая важна для цитокинеза, поскольку регулирует переход клеточного цикла от фазы G2 к митозу. ^{[ 7 ]} Эта карбокси-концевая область HMG20B взаимодействует с белком-супрессором опухоли BRCA2 . Особая мутация в этой области гена HMG20B связана с раком легких . Эта мутация препятствует ассоциации белков HMG20B и BRCA2. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что HMG20B взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000064961 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020232 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сумой Л., Карим Л., Эскарселлер М., Надаль М., Гратакос М., Пухана М.А., Эстивилл Х., Перал Б. (июнь 2000 г.). «HMG20A и HMG20B картируются на хромосомах человека 15q24 и 19p13.3 и составляют отдельный класс генов HMG-бокса с повсеместной экспрессией». Цитогенетика и клеточная генетика . 88 (1–2): 62–7. дои : 10.1159/000015486 . ПМИД 10773667 . S2CID 22921110 .
^ «Энтрез Ген: Высокомобильная группа HMG20B 20B» .
^ Jump up to: ^а ^б Ли М., Венкитараман А.Р. (2014). «Мутация, связанная с раком, инактивирует область белка группы высокой подвижности HMG20b, необходимую для цитокинеза» . Клеточный цикл . 13 (16): 2554–63. дои : 10.4161/15384101.2014.942204 . ПМЦ 4614378 . ПМИД 25486196 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий деацетилазу гистонов, опосредует репрессию нейронально-специфичных генов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (11): 7420–5. Бибкод : 2002PNAS...99.7420H . дои : 10.1073/pnas.112008599 . ПМК 124246 . ПМИД 12032298 .
^ Марморштейн Л.Ю., Кинев А.В., Чан Г.К., Бочар Д.А., Бения Х., Эпштейн Дж.А., Йен Т.Дж., Шихаттар Р. (январь 2001 г.). «Комплекс BRCA2 человека, содержащий структурный компонент, связывающийся с ДНК, влияет на развитие клеточного цикла» . Клетка . 104 (2): 247–57. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . ПМИД 11207365 . S2CID 5822368 .
^ Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат на Х-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7234–9. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763 .
^ Ли Ю.М., Ким В. (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация белка 4 суперсемейства кинезинов человека с BRCA2-ассоциированным фактором 35» . Биохимический журнал . 374 (Часть 2): 497–503. дои : 10.1042/BJ20030452 . ПМЦ 1223617 . ПМИД 12809554 .
^ Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 322 (2): 601–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . ПМИД 15325272 .

Дальнейшее чтение

Уоттлер Ф., Уоттлер С., Келли М., Скиннер Х.Б., Нельс М. (сентябрь 1999 г.). «Клонирование, хромосомное расположение и анализ экспрессии мышиного родственника Smarce1, нового члена семейства генов группы 365 с высокой мобильностью». Геномика . 60 (2): 172–8. дои : 10.1006/geno.1999.5913 . ПМИД 10486208 .
Марморштейн Л.Ю., Кинев А.В., Чан Г.К., Бочар Д.А., Бения Х., Эпштейн Дж.А., Йен Т.Дж., Шихаттар Р. (январь 2001 г.). «Комплекс BRCA2 человека, содержащий структурный компонент, связывающийся с ДНК, влияет на развитие клеточного цикла» . Клетка . 104 (2): 247–57. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . ПМИД 11207365 . S2CID 5822368 .
Ли Ю.М., Шин Х., Чхве В., Ан С., Ким В. (апрель 2002 г.). «Характеристика белка группы высокой подвижности человека SMARCE1r» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1574 (3): 269–76. дои : 10.1016/s0167-4781(01)00373-6 . ПМИД 11997092 .
Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий деацетилазу гистонов, опосредует репрессию нейронально-специфичных генов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (11): 7420–5. Бибкод : 2002PNAS...99.7420H . дои : 10.1073/pnas.112008599 . ПМК 124246 . ПМИД 12032298 .
Ван С., Маккарти И.М., Балаж Л., Ли Ю., Штайнер М.С. (июль 2002 г.). «Клонирование кДНК, кодирующей альтернативно сплайсированный белок BRCA2-ассоциированного фактора 35». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 295 (1): 129–35. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00624-1 . ПМИД 12083779 .
Ван С., Маккарти И.М., Балаж Л., Ли Ю., Штайнер М.С. (июль 2002 г.). «Иммуногистологическое обнаружение BRAF25 в образцах опухоли предстательной железы и рака человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 295 (1): 136–41. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00625-3 . ПМИД 12083780 .
Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат на Х-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7234–9. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763 .
Ли Ю.М., Ким В. (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация белка 4 суперсемейства кинезинов человека с BRCA2-ассоциированным фактором 35» . Биохимический журнал . 374 (Часть 2): 497–503. дои : 10.1042/BJ20030452 . ПМЦ 1223617 . ПМИД 12809554 .
Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 322 (2): 601–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . ПМИД 15325272 .
Руаль Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

Внешние ссылки

HMG20B Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека HMG20B в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000064961 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020232 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10773667-5] Сумой Л., Карим Л., Эскарселлер М., Надаль М., Гратакос М., Пухана М.А., Эстивилл Х., Перал Б. (июнь 2000 г.). «HMG20A и HMG20B картируются на хромосомах человека 15q24 и 19p13.3 и составляют отдельный класс генов HMG-бокса с повсеместной экспрессией». Цитогенетика и клеточная генетика . 88 (1–2): 62–7. дои : 10.1159/000015486 . ПМИД 10773667 . S2CID 22921110 .

[entrez-6] «Энтрез Ген: Высокомобильная группа HMG20B 20B» .

[Lee2014-7] Jump up to: ^а ^б Ли М., Венкитараман А.Р. (2014). «Мутация, связанная с раком, инактивирует область белка группы высокой подвижности HMG20b, необходимую для цитокинеза» . Клеточный цикл . 13 (16): 2554–63. дои : 10.4161/15384101.2014.942204 . ПМЦ 4614378 . ПМИД 25486196 .

[pmid12032298-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий деацетилазу гистонов, опосредует репрессию нейронально-специфичных генов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (11): 7420–5. Бибкод : 2002PNAS...99.7420H . дои : 10.1073/pnas.112008599 . ПМК 124246 . ПМИД 12032298 .

[pmid11207365-9] Марморштейн Л.Ю., Кинев А.В., Чан Г.К., Бочар Д.А., Бения Х., Эпштейн Дж.А., Йен Т.Дж., Шихаттар Р. (январь 2001 г.). «Комплекс BRCA2 человека, содержащий структурный компонент, связывающийся с ДНК, влияет на развитие клеточного цикла» . Клетка . 104 (2): 247–57. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . ПМИД 11207365 . S2CID 5822368 .

[pmid12493763-10] Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат на Х-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7234–9. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763 .

[pmid12809554-11] Ли Ю.М., Ким В. (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация белка 4 суперсемейства кинезинов человека с BRCA2-ассоциированным фактором 35» . Биохимический журнал . 374 (Часть 2): 497–503. дои : 10.1042/BJ20030452 . ПМЦ 1223617 . ПМИД 12809554 .

[pmid15325272-12] Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 322 (2): 601–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . ПМИД 15325272 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]