Гистондеацетилаза 2
HDAC2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | HDAC2 , HD2, RPD3, YAF1, деацетилаза гистонов 2, KDAC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 605164 ; МГИ : 1097691 ; Гомологен : 68187 ; Генные карты : HDAC2 ; OMA : HDAC2 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Гистондеацетилаза 2 ( HDAC2 ) представляет собой фермент , который у человека кодируется HDAC2 геном . [ 5 ] Он принадлежит к классу ферментов гистондеацетилазы, ответственных за удаление ацетильных групп из остатков лизина в N-концевой области коровых гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). По существу, он играет важную роль в экспрессии генов, способствуя образованию комплексов репрессоров транскрипции, и по этой причине его часто считают важной мишенью для терапии рака. [ 6 ]
Хотя функциональная роль класса, к которому принадлежит HDAC2, тщательно изучена, механизм взаимодействия HDAC2 с деацетилазами гистонов других классов еще не выяснен. HDAC2 в целом регулируется протеинкиназой 2 (CK2) и протеинфосфатазой 1 (PP1) , но биохимический анализ предполагает, что ее регуляция более сложна (о чем свидетельствует сосуществование HDAC1 и HDAC2 в трех различных белковых комплексах). [ 7 ] По сути, механизм регуляции HDAC2 до сих пор неясен из-за его различных взаимодействий, хотя механизм, включающий p300/CBP-ассоциированный фактор и HDAC5, был предложен в контексте перепрограммирования сердца. [ 8 ]
Как правило, HDAC2 считается предполагаемой мишенью для лечения различных заболеваний из-за его участия в развитии клеточного цикла. В частности, было показано, что HDAC2 играет роль в гипертрофии сердца . [ 8 ] болезнь Альцгеймера , [ 9 ] болезнь Паркинсона , [ 10 ] острый миелоидный лейкоз (ОМЛ), [ 11 ] остеосаркома , [ 12 ] и рак желудка . [ 13 ]
Структура и механизм
[ редактировать ]
HDAC2 принадлежит к первому классу гистондеактилаз. Активный сайт HDAC2 содержит Zn 2+ ион, координированный с карбонильной группой лизинового субстрата и молекулой воды. Ион металла облегчает нуклеофильную атаку карбонильной группы координированной молекулой воды, что приводит к образованию тетраэдрического промежуточного соединения. Это промежуточное соединение на мгновение стабилизируется за счет взаимодействия водородных связей и координации металлов, пока оно в конечном итоге не разрушается, что приводит к деацетилированию остатка лизина. [ 14 ]
Активный центр HDAC2 состоит из липофильной трубки, ведущей от поверхности к каталитическому центру, и «кармана для ног», содержащего в основном молекулы воды. Активный сайт связан с Gly154, Phe155, His183, Phe210 и Leu276. Ножный карман связан с Tyr29, Met35, Phe114 и Leu144. [ 15 ]
Функция
[ редактировать ]Этот генный продукт принадлежит к семейству гистондеацетилаз . Гистоновые деацетилазы действуют посредством образования крупных мультибелковых комплексов и отвечают за деацетилирование остатков лизина в N-концевой области основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Этот белок также образует комплексы репрессоров транскрипции, связываясь со многими различными белками, включая YY1, фактор транскрипции с цинковыми пальцами млекопитающих. Таким образом, он играет важную роль в регуляции транскрипции, развитии клеточного цикла и событиях развития. [ 16 ]
Актуальность заболевания
[ редактировать ]Сердечная гипертрофия
[ редактировать ]Было показано, что HDAC2 играет роль в регуляторном пути гипертрофии сердца. Было показано, что дефицит HDAC2 смягчает гипертрофию сердца в сердцах, подвергшихся гипертрофическим стимулам. Однако у трансгенных мышей HDAC2 с инактивированной киназой гликогенсинтазы 3beta (Gsk3beta) гипертрофия наблюдалась с более высокой частотой. У мышей с активированными ферментами Gsk3beta и дефицитом HDAC2 чувствительность к гипертрофическому стимулу наблюдалась с большей частотой. Результаты предполагают регуляторную роль HDAC2 и GSK3beta. [ 17 ]

Были предложены механизмы, с помощью которых HDAC2 реагирует на гипертрофический стресс, хотя общего консенсуса не достигнуто. Один из предложенных механизмов предполагает казеин-киназо- зависимое фосфорилирование HDAC2, тогда как более поздний механизм предполагает ацетилирование, регулируемое p300/CBP-ассоциированным фактором и HDAC5 . [ 8 ]
болезнь Альцгеймера
[ редактировать ]Было обнаружено, что у пациентов с болезнью Альцгеймера наблюдается снижение экспрессии нейрональных генов. [ 18 ] Кроме того, недавнее исследование показало, что ингибирование HDAC2 посредством c-Abl посредством фосфорилирования тирозина предотвращает когнитивные и поведенческие нарушения у мышей с болезнью Альцгеймера. [ 19 ] Результаты исследования подтверждают роль c-Abl и HDAC2 в сигнальном пути экспрессии генов у пациентов с болезнью Альцгеймера. В настоящее время усилия по синтезу ингибитора HDAC2 для лечения болезни Альцгеймера основаны на фармакофоре с четырьмя характеристиками: одним акцептором водородной связи, одним донором водородной связи и двумя ароматическими кольцами. [ 9 ]
болезнь Паркинсона
[ редактировать ]Ингибиторы HDAC рассматриваются как потенциальное средство лечения нейродегенеративных заболеваний, таких как болезнь Паркинсона . Болезнь Паркинсона обычно сопровождается увеличением количества микроглиальных белков в черной субстанции головного мозга. Данные in vivo показали корреляцию между количеством микроглиальных белков и активацией HDAC2. [ 10 ] Поэтому считается, что ингибиторы HDAC2 могут быть эффективны при лечении микроглиальной потери дофаминергических нейронов в головном мозге.
Терапия рака
[ редактировать ]Изучена роль HDAC2 при различных формах рака, таких как остеосаркома, рак желудка и острый миелолейкоз. Недавнее исследование обнаружило снижение образования метастазов у мышей, у которых развился рак поджелудочной железы, когда мышиный ортолог Hdac2 был генетически истощен. [ 20 ] Текущие исследования сосредоточены на создании ингибиторов, которые уменьшают активацию HDAC2.
Фактор вируса гриппа
[ редактировать ]HDAC2 играет роль в регуляции преобразователя сигнала и активатора транскрипции I (STAT1) и стимулируемого интерфероном гена, такого как виперин. Это показывает, что HDAC2 может быть компонентом врожденного клеточного противовирусного ответа. Чтобы обойти антивирусный потенциал, вирус гриппа А нарушает регуляцию HDAC2, вызывая его деградацию путем протеасомной деградации. [ 21 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что гистондеацетилаза 2 взаимодействует с:
- Атаксия-телеангиэктазия и связанная с Rad3 [ 22 ]
- БУБ3 , [ 23 ]
- CDC20 , [ 23 ]
- CDH1 , [ 23 ]
- CHD3 , [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ]
- CHD4 , [ 22 ] [ 24 ] [ 25 ]
- ДНМТ1 , [ 27 ]
- ЕЕД , [ 28 ]
- ЭЖ2 [ 28 ] и
- ФКБП3 , [ 29 ]
- ГАТА4 , [ 30 ]
- ГТФ2И , [ 24 ] [ 31 ]
- HDAC10 , [ 32 ]
- HDAC1 , [ 24 ] [ 25 ] [ 28 ] [ 32 ] [ 33 ] [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ] [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] [ 41 ]
- ХМГ20Б , [ 24 ] [ 34 ]
- HSPA4 , [ 35 ]
- Фактор клетки-хозяина C1 , [ 42 ]
- МТА1 , [ 24 ] [ 33 ] [ 43 ]
- МТА2 , [ 24 ] [ 33 ] [ 39 ]
- MXD1 , [ 44 ] [ 45 ]
- Еда1 , [ 23 ]
- Белок 2 метил-CpG-связывающего домена , [ 39 ] [ 46 ] [ 47 ]
- ПХФ21А , [ 24 ] [ 34 ] [ 48 ]
- ППП1Р8 , [ 49 ]
- РБП4 , [ 24 ] [ 25 ] [ 50 ] [ 51 ]
- РЦОР1 , [ 34 ] [ 52 ]
- РЕЛА , [ 53 ] [ 54 ]
- белок ретинобластомы , [ 55 ]
- САП30 , [ 39 ] [ 56 ] [ 57 ]
- СИН3А , [ 24 ] [ 25 ] [ 44 ] [ 50 ] [ 51 ] [ 58 ] [ 59 ]
- СМАРКА5 , [ 26 ]
- СНВ1 , [ 60 ]
- внедорожник39H1 , [ 61 ]
- Транскрипционный фактор Sp1 , [ 51 ] [ 62 ] [ 63 ]
- Транскрипционный фактор Sp3 , [ 62 ] [ 63 ]
- ТОП2Б , [ 64 ] и
- ГГ1 . [ 65 ] [ 66 ] [ 67 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196591 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019777 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Бетц Р., Грей С.Г., Экстрем С., Ларссон С., Экстрём Т.Дж. (сентябрь 1998 г.). «Человеческая гистондеацетилаза 2, HDAC2 (Human RPD3), локализована в 6q21 с помощью радиационного гибридного картирования». Геномика . 52 (2): 245–246. дои : 10.1006/geno.1998.5435 . ПМИД 9782097 .
- ^ «Тканевая экспрессия HDAC2 - Резюме - Атлас белков человека» . www.proteinatlas.org . Проверено 14 марта 2019 г.
- ^ Сето Э., Ёсида М. (апрель 2014 г.). «Ластики ацетилирования гистонов: ферменты деацетилазы гистонов» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 6 (4): а018713. doi : 10.1101/cshperspect.a018713 . ПМК 3970420 . ПМИД 24691964 .
- ^ Jump up to: а б с Эом Г.Х., Нам Ю.С., О Дж.Г., Чхве Н., Мин Х.К., Ю Е.К. и др. (март 2014 г.). «Регуляция ацетилирования деацетилазы гистонов 2 с помощью p300/CBP-ассоциированного фактора/деацетилазы гистонов 5 при развитии сердечной гипертрофии» . Исследование кровообращения . 114 (7): 1133–1143. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.114.303429 . ПМИД 24526703 .
- ^ Jump up to: а б Чуби С.К., Джеякантан Дж. (июнь 2018 г.). «Подходы, основанные на молекулярной динамике и квантовой химии, для идентификации изоформ селективного ингибитора HDAC2 - новой мишени для предотвращения болезни Альцгеймера». Журнал исследований рецепторов и передачи сигналов . 38 (3): 266–278. дои : 10.1080/10799893.2018.1476541 . ПМИД 29932788 . S2CID 49385438 .
- ^ Jump up to: а б Тан Ю., Дельво Э., Нольц Дж., Коулман П.Д., Чен С., Мастроени Д. (август 2018 г.). «Повышение регуляции деацетилазы гистонов 2 при лазерном захвате черной микроглии при болезни Паркинсона». Нейробиология старения . 68 : 134–141. doi : 10.1016/j.neurobiolaging.2018.02.018 . ПМИД 29803514 . S2CID 44067840 .
- ^ Лэй Л., Ся С., Лю Д., Ли Х., Фэн Дж., Чжу Ю. и др. (июль 2018 г.). «Полногеномная характеристика днРНК при остром миелолейкозе» . Брифинги по биоинформатике . 19 (4): 627–635. дои : 10.1093/нагрудник/bbx007 . ПМК 6355113 . ПМИД 28203711 .
- ^ Ла Ноче М., Пайно Ф., Меле Л., Папаччо Г., Регад Т., Ломбарди А. и др. (декабрь 2018 г.). «Истощение HDAC2 способствует развитию остеосаркомы как in vitro, так и in vivo: исследование предполагаемой новой мишени для терапии, направленной на ОСК» . Журнал экспериментальных и клинических исследований рака . 37 (1): 296. doi : 10.1186/s13046-018-0978-x . ПМК 6276256 . ПМИД 30509303 .
- ^ Вэй Дж, Ван З, Ван З, Ян Ю, Фу С, Чжу Дж, Цзян Д (2017). «Функция микроРНК-31 как супрессора регулировалась эпигенетическими механизмами при раке желудка» . БиоМед Исследования Интернэшнл . 2017 : 5348490. doi : 10.1155/2017/5348490 . ПМЦ 5733238 . ПМИД 29333444 .
- ^ Ломбарди П.М., Коул К.Е., Даулинг Д.П., Кристиансон Д.В. (декабрь 2011 г.). «Структура, механизм и ингибирование деацетилаз гистонов и родственных металлоферментов» . Современное мнение в области структурной биологии . 21 (6): 735–743. дои : 10.1016/j.sbi.2011.08.004 . ПМЦ 3232309 . ПМИД 21872466 .
- ^ Бресси Дж.С., Дженнингс А.Дж., Скин Р., Ву Ю., Мелкус Р., Де Йонг Р. и др. (май 2010 г.). «Исследование кармана стопы HDAC2: синтез и SAR замещенных N-(2-аминофенил)бензамидов». Письма по биоорганической и медицинской химии . 20 (10): 3142–3145. дои : 10.1016/j.bmcl.2010.03.091 . ПМИД 20392638 .
- ^ «Ген Энтреза: деацетилаза гистонов HDAC2 2» .
- ^ Триведи CM, Луо Й, Инь З, Чжан М, Чжу В, Ван Т и др. (март 2007 г.). «Hdac2 регулирует гипертрофическую реакцию сердца путем модуляции бета-активности Gsk3». Природная медицина . 13 (3): 324–331. дои : 10.1038/nm1552 . ПМИД 17322895 . S2CID 33021404 .
- ^ Гинзберг С.Д., Оллдред М.Дж., Че С. (январь 2012 г.). «Уровни экспрессии генов, оцененные с помощью пирамидного нейрона CA1 и региональной диссекции гиппокампа при болезни Альцгеймера» . Нейробиология болезней . 45 (1): 99–107. дои : 10.1016/j.nbd.2011.07.013 . ПМК 3220746 . ПМИД 21821124 .
- ^ Гонсалес-Суньига М., Контрерас П.С., Эстрада Л.Д., Чаморро Д., Вильягра А., Занлунго С. и др. (октябрь 2014 г.). «c-Abl стабилизирует уровни HDAC2 за счет фосфорилирования тирозина, подавляя экспрессию нейрональных генов при болезни Альцгеймера» . Молекулярная клетка . 56 (1): 163–173. doi : 10.1016/j.molcel.2014.08.013 . ПМИД 25219501 .
- ^ Краус Л., Урбан Б.С., Хастрайтер С., Шнайдер С., Венцель П., Хасан З. и др. (февраль 2022 г.). «HDAC2 способствует метастазированию рака поджелудочной железы» . Исследования рака . 82 (4): 695–707. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-20-3209 . ПМЦ 9359718 . ПМИД 34903606 . S2CID 245193477 .
- ^ Нагеш П.Т., Хусейн М., Галвин Х.Д., Хусейн М. (2017). «Гистондеацетилаза 2 является компонентом противовирусного ответа хозяина, индуцированного вирусом гриппа А» . Границы микробиологии . 8 : 1315. дои : 10.3389/fmicb.2017.01315 . ПМК 5511851 . ПМИД 28769891 .
- ^ Jump up to: а б Шмидт Д.Р., Шрайбер С.Л. (ноябрь 1999 г.). «Молекулярная связь между ATR и двумя компонентами комплекса ремоделирования и деацетилирования нуклеосом, HDAC2 и CHD4». Биохимия . 38 (44): 14711–14717. дои : 10.1021/bi991614n . ПМИД 10545197 .
- ^ Jump up to: а б с д Юн Ю.М., Пэк К.Х., Чон С.Дж., Шин Х.Дж., Ха Г.Х., Чон А.Х. и др. (сентябрь 2004 г.). «Белки митотической контрольной точки, содержащие повторы WD, действуют как репрессоры транскрипции во время интерфазы» . Письма ФЭБС . 575 (1–3): 23–29. дои : 10.1016/j.febslet.2004.07.089 . ПМИД 15388328 . S2CID 21762011 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж Хакими М.А., Донг Ю., Лейн В.С., Спейчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат на Х-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7234–7239. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763 .
- ^ Jump up to: а б с д и Тонг Дж.К., Хассиг К.А., Шницлер Г.Р., Кингстон Р.Э., Шрайбер С.Л. (октябрь 1998 г.). «Деацетилирование хроматина с помощью АТФ-зависимого комплекса ремоделирования нуклеосом». Природа . 395 (6705): 917–921. Бибкод : 1998Natur.395..917T . дои : 10.1038/27699 . ПМИД 9804427 . S2CID 4355885 .
- ^ Jump up to: а б Хакими М.А., Бочар Д.А., Шмисинг Дж.А., Донг Й., Барак О.Г., Спейчер Д.В. и др. (август 2002 г.). «Комплекс ремоделирования хроматина, который загружает когезин в хромосомы человека». Природа . 418 (6901): 994–998. Бибкод : 2002Natur.418..994H . дои : 10.1038/nature01024 . ПМИД 12198550 . S2CID 4344470 .
- ^ Раунтри М.Р., Бахман К.Е., Бэйлин С.Б. (июль 2000 г.). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый ко-репрессор DMAP1, образуя комплекс в фокусах репликации». Природная генетика . 25 (3): 269–277. дои : 10.1038/77023 . ПМИД 10888872 . S2CID 26149386 .
- ^ Jump up to: а б с ван дер Влаг Дж., Отте А.П. (декабрь 1999 г.). «Транкрипционная репрессия, опосредованная белком EED группы полисот человека, включает деацетилирование гистонов». Природная генетика . 23 (4): 474–478. дои : 10.1038/70602 . ПМИД 10581039 . S2CID 6748531 .
- ^ Ян ВМ, Яо ЮЛ, Сето Э (сентябрь 2001 г.). «FK506-связывающий белок 25 функционально связан с деацетилазами гистонов и с фактором транскрипции YY1» . Журнал ЭМБО . 20 (17): 4814–4825. дои : 10.1093/emboj/20.17.4814 . ПМЦ 125595 . ПМИД 11532945 .
- ^ «Трёхсторонний контроль пролиферации сердечных клеток плода может помочь в регенерации сердечных клеток» . 7 октября 2010 г.
- ^ Вэнь Ю.Д., Кресс В.Д., Рой А.Л., Сето Э. (январь 2003 г.). «Гистондеацетилаза 3 связывается с многофункциональным фактором транскрипции TFII-I и регулирует его» . Журнал биологической химии . 278 (3): 1841–1847. дои : 10.1074/jbc.M206528200 . ПМИД 12393887 .
- ^ Jump up to: а б Фишер Д.Д., Кай Р., Бхатия У., Ассельбергс Ф.А., Сонг С., Терри Р. и др. (февраль 2002 г.). «Выделение и характеристика новой деацетилазы гистонов класса II, HDAC10» . Журнал биологической химии . 277 (8): 6656–6666. дои : 10.1074/jbc.M108055200 . ПМИД 11739383 .
- ^ Jump up to: а б с Яо Ю.Л., Ян В.М. (октябрь 2003 г.). «Связанные с метастазами белки 1 и 2 образуют отдельные белковые комплексы с активностью гистондеацетилазы» . Журнал биологической химии . 278 (43): 42560–42568. дои : 10.1074/jbc.M302955200 . ПМИД 12920132 .
- ^ Jump up to: а б с д Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий деацетилазу гистонов, опосредует репрессию нейронально-специфичных генов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (11): 7420–7425. Бибкод : 2002PNAS...99.7420H . дои : 10.1073/pnas.112008599 . ПМК 124246 . ПМИД 12032298 .
- ^ Jump up to: а б Джонсон Калифорния, Уайт Д.А., Лаванда Дж.С., О'Нил Л.П., Тернер Б.М. (март 2002 г.). «Комплексы деацетилазы гистонов класса I человека проявляют повышенную каталитическую активность в присутствии АТФ и коиммунопреципитируют с АТФ-зависимым белком-шапероном Hsp70» . Журнал биологической химии . 277 (11): 9590–9597. дои : 10.1074/jbc.M107942200 . ПМИД 11777905 .
- ^ Фишле В., Декиедт Ф., Хендзель М.Дж., Гюнтер М.Г., Лазар М.А., Фельтер В., Вердин Э. (январь 2002 г.). «Ферментативная активность, связанная с HDAC класса II, зависит от мультибелкового комплекса, содержащего HDAC3 и SMRT/N-CoR». Молекулярная клетка . 9 (1): 45–57. дои : 10.1016/s1097-2765(01)00429-4 . hdl : 11858/00-001M-0000-002C-9FF9-9 . ПМИД 11804585 .
- ^ Фишле В., Декиедт Ф., Филлион М., Хендзель М.Дж., Фельтер В., Вердин Э. (сентябрь 2001 г.). «Активность деацетилазы гистонов HDAC7 человека связана с HDAC3 in vivo» . Журнал биологической химии . 276 (38): 35826–35835. дои : 10.1074/jbc.M104935200 . ПМИД 11466315 .
- ^ Эшбернер Б.П., Вестерхайде С.Д., Болдуин А.С. (октябрь 2001 г.). «Субъединица p65 (RelA) NF-kappaB взаимодействует с корепрессорами гистондеацетилазы (HDAC) HDAC1 и HDAC2, отрицательно регулируя экспрессию генов» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (20): 7065–7077. дои : 10.1128/MCB.21.20.7065-7077.2001 . ПМК 99882 . ПМИД 11564889 .
- ^ Jump up to: а б с д Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Гены и развитие . 13 (15): 1924–1935. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК 316920 . ПМИД 10444591 .
- ^ Хассиг К.А., Тонг Дж.К., Флейшер Т.К., Ова Т., Грейбл П.Г., Айер Д.Е., Шрайбер С.Л. (март 1998 г.). «Роль активности гистондеацетилазы в репрессии транскрипции, опосредованной HDAC1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (7): 3519–3524. Бибкод : 1998PNAS...95.3519H . дои : 10.1073/pnas.95.7.3519 . ЧВК 19868 . ПМИД 9520398 .
- ^ Чжан Й., Иратни Р., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Рейнберг Д. (май 1997 г.). «Гистондеацетилазы и SAP18, новый полипептид, являются компонентами человеческого комплекса Sin3» . Клетка . 89 (3): 357–364. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80216-0 . ПМИД 9150135 .
- ^ Высоцка Дж., Майерс, член парламента, Лаэрти К.Д., Эйзенман Р.Н., Герр В. (апрель 2003 г.). «Человеческая деацетилаза Sin3 и связанная с тритораксом гистоновая метилтрансфераза Set1/Ash2 H3-K4 избирательно связаны вместе фактором клеточной пролиферации HCF-1» . Гены и развитие . 17 (7): 896–911. дои : 10.1101/gad.252103 . ЧВК 196026 . ПМИД 12670868 .
- ^ Мазумдар А., Ван Р.А., Мишра С.К., Адам Л., Багери-Ярманд Р., Мандал М. и др. (январь 2001 г.). «Транкрипционная репрессия рецептора эстрогена с помощью корепрессора белка 1, связанного с метастазами». Природная клеточная биология . 3 (1): 30–37. дои : 10.1038/35050532 . ПМИД 11146623 . S2CID 23477845 .
- ^ Jump up to: а б Лаэрти CD, Ян ВМ, Сунь Дж.М., Дэви Дж.Р., Сето Э., Эйзенман Р.Н. (май 1997 г.). «Гистоновые деацетилазы, связанные с корепрессором mSin3, опосредуют безумную репрессию транскрипции» . Клетка . 89 (3): 349–356. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80215-9 . ПМИД 9150134 . S2CID 13490886 .
- ^ Спронк К.А., Тессари М., Каан А.М., Янсен Дж.Ф., Вермюлен М., Стунненберг Х.Г., Вуистер Г.В. (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие Mad1-Sin3B включает в себя новую спиральную складку». Структурная биология природы . 7 (12): 1100–1104. дои : 10.1038/81944 . ПМИД 11101889 . S2CID 12451972 .
- ^ Бракерц М., Буке Дж., Чжан Р., Ренкавиц Р. (октябрь 2002 г.). «Два родственных белка p66 составляют новое семейство мощных репрессоров транскрипции, взаимодействующих с MBD2 и MBD3» . Журнал биологической химии . 277 (43): 40958–40966. дои : 10.1074/jbc.M207467200 . ПМИД 12183469 .
- ^ Нг Х.Х., Чжан Ю., Хендрих Б., Джонсон К.А., Тернер Б.М., Эрджюмент-Бромаж Х. и др. (сентябрь 1999 г.). «MBD2 представляет собой репрессор транскрипции, принадлежащий комплексу гистондеацетилазы MeCP1». Природная генетика . 23 (1): 58–61. дои : 10.1038/12659 . hdl : 1842/684 . ПМИД 10471499 . S2CID 6147725 .
- ^ Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 322 (2): 601–608. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . ПМИД 15325272 .
- ^ Джин К., ван Эйнде А., Бёлленс М., Рой Н., Тиль Г., Сталманс В., Боллен М. (август 2003 г.). «Регулятор протеинфосфатазы-1 (PP1), ядерный ингибитор PP1 (NIPP1), взаимодействует с белком группы поликомб, развитием эмбриональной эктодермы (EED), и действует как репрессор транскрипции» . Журнал биологической химии . 278 (33): 30677–30685. дои : 10.1074/jbc.M302273200 . ПМИД 12788942 .
- ^ Jump up to: а б Чжан Ю, Дюфау М.Л. (июнь 2003 г.). «Двойные механизмы регуляции транскрипции гена рецептора лютеинизирующего гормона с помощью ядерных орфанных рецепторов и комплексов гистондеацетилазы» . Журнал биохимии стероидов и молекулярной биологии . 85 (2–5): 401–414. дои : 10.1016/s0960-0760(03)00230-9 . ПМИД 12943729 . S2CID 28512341 .
- ^ Jump up to: а б с Чжан Ю, Дюфау М.Л. (сентябрь 2002 г.). «Замалчивание транскрипции гена рецептора лютеинизирующего гормона человека комплексом гистондеацетилаза-mSin3A» . Журнал биологической химии . 277 (36): 33431–33438. дои : 10.1074/jbc.M204417200 . ПМИД 12091390 .
- ^ Ю А, Тонг Дж. К., Грозингер С. М., Шрайбер С. Л. (февраль 2001 г.). «CoREST является неотъемлемым компонентом комплекса CoREST-гистондеацетилазы человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (4): 1454–1458. Бибкод : 2001PNAS...98.1454Y . дои : 10.1073/pnas.98.4.1454 . ПМК 29278 . ПМИД 11171972 .
- ^ Кирнан Р., Брес В., Нг Р.В., Кудар М.П., Эль Мессауди С., Сардет С. и др. (январь 2003 г.). «Постактивационное выключение NF-каппа B-зависимой транскрипции регулируется ацетилированием р65» . Журнал биологической химии . 278 (4): 2758–2766. дои : 10.1074/jbc.M209572200 . ПМИД 12419806 .
- ^ Ю З, Чжан В, Коне BC (август 2002 г.). «Гистондеацетилазы усиливают индукцию цитокинов гена iNOS» . Журнал Американского общества нефрологов . 13 (8): 2009–2017. дои : 10.1097/01.asn.0000024253.59665.f1 . ПМИД 12138131 .
- ^ Лай А., Ли Дж.М., Ян В.М., ДеКаприо Дж.А., Кэлин В.Г., Сето Э., Брэнтон П.Е. (октябрь 1999 г.). «RBP1 рекрутирует как зависимую, так и независимую от гистондеацетилазы репрессивную активность в белках семейства ретинобластомы» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (10): 6632–6641. дои : 10.1128/mcb.19.10.6632 . ПМЦ 84642 . ПМИД 10490602 .
- ^ Чжан Ю, Сунь З.В., Иратни Р., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Хэмпси М., Рейнберг Д. (июнь 1998 г.). «SAP30, новый белок, консервативный у человека и дрожжей, является компонентом комплекса гистондеацетилазы» . Молекулярная клетка . 1 (7): 1021–1031. дои : 10.1016/s1097-2765(00)80102-1 . ПМИД 9651585 .
- ^ Кузьмичев А., Чжан Ю., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Рейнберг Д. (февраль 2002 г.). «Роль комплекса Sin3-гистондеацетилазы в регуляции роста кандидатным супрессором опухоли p33 (ING1)» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (3): 835–848. дои : 10.1128/mcb.22.3.835-848.2002 . ПМЦ 133546 . ПМИД 11784859 .
- ^ Флейшер Т.С., Юн У.Дж., Айер Д.Э. (май 2003 г.). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов корепрессорного комплекса mSin3A» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (10): 3456–3467. дои : 10.1128/mcb.23.10.3456-3467.2003 . ПМК 164750 . ПМИД 12724404 .
- ^ Ян Л., Мэй К., Зелинска-Квятковска А., Мацуи Ю., Блэкберн М.Л., Бенедетти Д. и др. (февраль 2003 г.). «Гистон-метилтрансфераза, связанная с ERG (ets-связанным геном), взаимодействует с гистондеацетилазами 1/2 и ко-репрессорами транскрипции mSin3A/B» . Биохимический журнал . 369 (Часть 3): 651–657. дои : 10.1042/BJ20020854 . ПМЦ 1223118 . ПМИД 12398767 .
- ^ Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Хейворд С.Д. (февраль 2000 г.). «Роль SKIP в активации EBNA2 промоторов, репрессированных CBF1» . Журнал вирусологии . 74 (4): 1939–1947. дои : 10.1128/jvi.74.4.1939-1947.2000 . ПМК 111672 . ПМИД 10644367 .
- ^ Воте О, Николя Э, Вандель Л, Труш Д (январь 2002 г.). «Функциональное и физическое взаимодействие между метилтрансферазой гистонов Suv39H1 и деацетилазами гистонов» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (2): 475–481. дои : 10.1093/нар/30.2.475 . ПМК 99834 . ПМИД 11788710 .
- ^ Jump up to: а б Вон Дж, Йим Дж, Ким ТК (октябрь 2002 г.). «Sp1 и Sp3 привлекают деацетилазу гистонов для подавления транскрипции промотора обратной транскриптазы теломеразы человека (hTERT) в нормальных соматических клетках человека» . Журнал биологической химии . 277 (41): 38230–38238. дои : 10.1074/jbc.M206064200 . ПМИД 12151407 .
- ^ Jump up to: а б Сунь Дж. М., Чен Х. И., Монива М., Личфилд Д. В., Сето Э., Дэви Дж. Р. (сентябрь 2002 г.). «Репрессор транскрипции Sp3 связан с CK2-фосфорилированной гистондеацетилазой 2» . Журнал биологической химии . 277 (39): 35783–35786. дои : 10.1074/jbc.C200378200 . ПМИД 12176973 .
- ^ Цай С.К., Валков Н., Ян В.М., Гамп Дж., Салливан Д., Сето Э. (ноябрь 2000 г.). «Гистондеацетилаза напрямую взаимодействует с ДНК-топоизомеразой II». Природная генетика . 26 (3): 349–353. дои : 10.1038/81671 . ПМИД 11062478 . S2CID 19301396 .
- ^ Ян В.М., Яо Ю.Л., Сунь Дж.М., Дэви-младший, Сето Э. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика кДНК, соответствующей дополнительному члену семейства генов деацетилазы гистонов человека» . Журнал биологической химии . 272 (44): 28001–28007. дои : 10.1074/jbc.272.44.28001 . ПМИД 9346952 .
- ^ Яо Ю.Л., Ян В.М., Сето Э. (сентябрь 2001 г.). «Регуляция фактора транскрипции YY1 путем ацетилирования и деацетилирования» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (17): 5979–5991. дои : 10.1128/mcb.21.17.5979-5991.2001 . ПМК 87316 . ПМИД 11486036 .
- ^ Каленик Дж.Л., Чен Д., Брэдли М.Э., Чен С.Дж., Ли Т.К. (февраль 1997 г.). «Двугибридное клонирование дрожжей нового белка цинковых пальцев, который взаимодействует с многофункциональным фактором транскрипции YY1» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (4): 843–849. дои : 10.1093/нар/25.4.843 . ПМК 146511 . ПМИД 9016636 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Арингер Дж. (август 2000 г.). «Комплексы гистондеацетилазы NuRD и SIN3 в разработке». Тенденции в генетике . 16 (8): 351–356. дои : 10.1016/S0168-9525(00)02066-7 . ПМИД 10904264 .
- Вердин Э., Декьедт Ф., Каслер Х.Г. (май 2003 г.). «Гистондеацетилазы класса II: универсальные регуляторы». Тенденции в генетике . 19 (5): 286–293. дои : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . hdl : 2268/80861 . ПМИД 12711221 .
- Чжан Ю, Дюфау М.Л. (июнь 2003 г.). «Двойные механизмы регуляции транскрипции гена рецептора лютеинизирующего гормона с помощью ядерных орфанных рецепторов и комплексов гистондеацетилазы» . Журнал биохимии стероидов и молекулярной биологии . 85 (2–5): 401–414. дои : 10.1016/S0960-0760(03)00230-9 . ПМИД 12943729 . S2CID 28512341 .
- Фурукава Ю, Каваками Т, Судо К, Инадзава Дж, Мацумине А, Акияма Т, Накамура Ю (1996). «Выделение и картирование человеческого гена (RPD3L1), который гомологичен RPD3, фактору транскрипции Saccharomyces cerevisiae». Цитогенетика и клеточная генетика . 73 (1–2): 130–133. дои : 10.1159/000134323 . PMID 8646880 .
- Ян В.М., Иноуе С., Цзэн Ю., Беарсс Д., Сето Э. (ноябрь 1996 г.). «Репрессия транскрипции с помощью YY1 опосредуется взаимодействием с гомологом дрожжевого глобального регулятора RPD3 у млекопитающих» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (23): 12845–12850. Бибкод : 1996PNAS...9312845Y . дои : 10.1073/pnas.93.23.12845 . ПМК 24008 . ПМИД 8917507 .
- Лаэрти CD, Ян ВМ, Сунь Дж.М., Дэви Дж.Р., Сето Э., Эйзенман Р.Н. (май 1997 г.). «Гистоновые деацетилазы, связанные с корепрессором mSin3, опосредуют безумную репрессию транскрипции» . Клетка . 89 (3): 349–356. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80215-9 . ПМИД 9150134 . S2CID 13490886 .
- Чжан Й., Иратни Р., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Рейнберг Д. (май 1997 г.). «Гистондеацетилазы и SAP18, новый полипептид, являются компонентами человеческого комплекса Sin3» . Клетка . 89 (3): 357–364. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . ПМИД 9150135 .
- Ян В.М., Яо Ю.Л., Сунь Дж.М., Дэви-младший, Сето Э. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика кДНК, соответствующей дополнительному члену семейства генов деацетилазы гистонов человека» . Журнал биологической химии . 272 (44): 28001–28007. дои : 10.1074/jbc.272.44.28001 . ПМИД 9346952 .
- Хассиг К.А., Тонг Дж.К., Флейшер Т.К., Ова Т., Грейбл П.Г., Айер Д.Е., Шрайбер С.Л. (март 1998 г.). «Роль активности гистондеацетилазы в репрессии транскрипции, опосредованной HDAC1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (7): 3519–3524. Бибкод : 1998PNAS...95.3519H . дои : 10.1073/pnas.95.7.3519 . ЧВК 19868 . ПМИД 9520398 .
- Рандхава Г.С., Белл Д.В., Теста Дж.Р., Файнберг А.П. (июль 1998 г.). «Идентификация и картирование гомологов гена модификатора ацетилирования гистонов человека» . Геномика . 51 (2): 262–269. дои : 10.1006/geno.1998.5370 . ПМИД 9722949 .
- Чжан Ю., Лерой Дж., Силиг Х.П., Лейн В.С., Рейнберг Д. (октябрь 1998 г.). «Специфический для дерматомиозита аутоантиген Mi2 является компонентом комплекса, содержащего деацетилазу гистонов и активность ремоделирования нуклеосом» . Клетка . 95 (2): 279–289. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . ПМИД 9790534 . S2CID 18786866 .
- Тонг Дж.К., Хассиг К.А., Шницлер Г.Р., Кингстон Р.Э., Шрайбер С.Л. (октябрь 1998 г.). «Деацетилирование хроматина с помощью АТФ-зависимого комплекса ремоделирования нуклеосом». Природа . 395 (6705): 917–921. Бибкод : 1998Natur.395..917T . дои : 10.1038/27699 . ПМИД 9804427 . S2CID 4355885 .
- Се Дж.Дж., Чжоу С., Чен Л., Янг Д.Б., Хейворд С.Д. (январь 1999 г.). «CIR, корепрессор, связывающий фактор связывания ДНК CBF1 с комплексом деацетилазы гистонов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (1): 23–28. Бибкод : 1999PNAS...96...23H . дои : 10.1073/pnas.96.1.23 . ПМК 15086 . ПМИД 9874765 .
- Ярден Р.И., Броуди Л.К. (апрель 1999 г.). «BRCA1 взаимодействует с компонентами комплекса деацетилазы гистонов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4983–4988. Бибкод : 1999PNAS...96.4983Y . дои : 10.1073/pnas.96.9.4983 . ПМК 21803 . ПМИД 10220405 .
- Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия Икароса и Айолоса опосредована комплексами деацетилазы гистонов» . Журнал ЭМБО . 18 (11): 3090–3100. дои : 10.1093/emboj/18.11.3090 . ПМЦ 1171390 . ПМИД 10357820 .
- Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Гены и развитие . 13 (15): 1924–1935. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК 316920 . ПМИД 10444591 .
- Нг Х.Х., Чжан Ю., Хендрих Б., Джонсон К.А., Тернер Б.М., Эрджюмент-Бромаж Х. и др. (сентябрь 1999 г.). «MBD2 представляет собой репрессор транскрипции, принадлежащий комплексу гистондеацетилазы MeCP1». Природная генетика . 23 (1): 58–61. дои : 10.1038/12659 . hdl : 1842/684 . ПМИД 10471499 . S2CID 6147725 .
- Уэйд П.А., Гегонн А., Джонс П.Л., Баллестар Э., Обри Ф., Вольф А.П. (сентябрь 1999 г.). «Комплекс Mi-2 сочетает метилирование ДНК с ремоделированием хроматина и деацетилированием гистонов». Природная генетика . 23 (1): 62–66. дои : 10.1038/12664 . ПМИД 10471500 . S2CID 52868103 .
- Лай А., Ли Дж.М., Ян В.М., ДеКаприо Дж.А., Кэлин В.Г., Сето Э., Брэнтон П.Е. (октябрь 1999 г.). «RBP1 рекрутирует как зависимую, так и независимую от гистондеацетилазы репрессивную активность в белках семейства ретинобластомы» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (10): 6632–6641. дои : 10.1128/mcb.19.10.6632 . ПМЦ 84642 . ПМИД 10490602 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- HDAC2 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- ФакторБук HDAC2
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q92769 (деацетилаза гистонов 2) в PDBe-KB .