Белок 2 метил-CpG-связывающего домена

МБД2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2L2L
Идентификаторы
Псевдонимы	MBD2 , DMTase, NY-CO-41, белок 2 домена связывания метил-CpG
Внешние идентификаторы	Опустить : 603547 ; МГИ : 1333813 ; Гомологен : 2918 ; Генные карты : MBD2 ; ОМА : MBD2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 18 (human)
End	54,224,669 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	70,759,202 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gingival epithelium; ; tonsil; ; epithelium of colon; ; oral cavity; ; bone marrow cells; ; parotid gland; ; white blood cell; ; sural nerve; ; mucosa of esophagus; ; monocyte;
	Top expressed in
	epithelium of urethra; ; granulocyte; ; Paneth cell; ; epithelium of male urethra; ; epithelium of female urethra; ; hair follicle; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; lip; ; submandibular gland;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA binding; protein domain specific binding; methyl-CpG binding; C2H2 zinc finger domain binding; chromatin binding; protein binding; siRNA binding; nucleosomal DNA binding; satellite DNA binding; mRNA binding;
Cellular component	cytoplasm; histone deacetylase complex; heterochromatin; chromatin; nucleus; nucleoplasm; cytosol; protein-containing complex;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; positive regulation of Wnt signaling pathway; regulation of cell population proliferation; maternal behavior; negative regulation of transcription, DNA-templated; human ageing; response to mechanical stimulus; response to estradiol; cellular response to organic cyclic compound; response to nutrient levels; response to organic cyclic compound; positive regulation of chromatin binding; heart development; embryonic organ development; rDNA heterochromatin assembly; regulation of DNA methylation; DNA methylation-dependent heterochromatin assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8932
	17191
	ENSG00000134046
	ENSMUSG00000024513
	Q9UBB5
	Q9Z2E1
	НМ_015832 ; НМ_003927
	НМ_010773 ; НМ_001311071
	НП_003918 ; НП_056647 ; НП_056647.1
	НП_001298000 ; НП_034903
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 2 метил-CpG-связывающего домена представляет собой белок , который у человека кодируется MBD2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Метилирование ДНК является основной модификацией геномов эукариот и играет важную роль в развитии млекопитающих. Белки человека MECP2 , MBD1 , MBD2 , MBD3 и MBD4 составляют семейство ядерных белков, родственных по наличию в каждом метил-CpG-связывающего домена (MBD). Каждый из этих белков, за исключением MBD3, способен специфически связываться с метилированной ДНК. MECP2, MBD1 и MBD2 также могут подавлять транскрипцию с промоторов метилированных генов. Белок, кодируемый этими генами, может выступать в качестве медиатора биологических последствий сигнала метилирования. Сообщается также, что MBD2 и MBD3 рекрутируют комплекс NuRD в области ДНК в зависимости от их избирательного связывания с метилированными сайтами CpG. Таким образом, MBD2/NuRD и MBD3/NuRD определяют два разных белковых комплекса с разными биохимическими и функциональными свойствами. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что белок 2 метил-CpG-связывающего домена взаимодействует с:

ГАТАД2Б , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}
HDAC1 , ^{[ 8 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}
Гистондеацетилаза 2 , ^{[ 8 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}
МБД3 ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}
МИЗФ , ^{[ 13 ]} и
СИН3А . ^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000134046 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024513 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хендрих Б., Бёрд А (ноябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика семейства метил-CpG-связывающих белков млекопитающих» . Мол Клеточная Биол . 18 (11): 6538–47. дои : 10.1128/mcb.18.11.6538 . ПМЦ 109239 . ПМИД 9774669 .
^ Хендрих Б., Эбботт С., Маккуин Х., Чемберс Д., Кросс С., Берд А. (сентябрь 1999 г.). «Геномная структура и хромосомное картирование генов Mbd1, Mbd2, Mbd3 и Mbd4 мыши и человека». Геном Мамм . 10 (9): 906–12. дои : 10.1007/s003359901112 . ПМИД 10441743 . S2CID 819148 .
^ Гезеннек, Ксавье; и др. (2006). «MBD2/NuRD и MBD3/NuRD, два разных комплекса с разными биохимическими и функциональными свойствами» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (3): 843–851. дои : 10.1128/MCB.26.3.843-851.2006 . ПМК 1347035 . ПМИД 16428440 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Бракерц М., Буке Дж., Чжан Р., Ренкавиц Р. (октябрь 2002 г.). «Два родственных белка p66 составляют новое семейство мощных репрессоров транскрипции, взаимодействующих с MBD2 и MBD3» . Ж. Биол. Хим . 277 (43): 40958–66. дои : 10.1074/jbc.M207467200 . ПМИД 12183469 .
^ Фэн Ц, Цао Р, Ся Л, Эрджумент-Бромаж Х, Темпст П, Чжан Ю (январь 2002 г.). «Идентификация и функциональная характеристика компонентов p66/p68 комплекса MeCP1» . Мол. Клетка. Биол . 22 (2): 536–46. doi : 10.1128/mcb.22.2.536-546.2002 . ПМК 139742 . ПМИД 11756549 .
^ Jump up to: ^а ^б Нг Х.Х., Чжан Ю., Хендрих Б., Джонсон К.А., Тернер Б.М., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Рейнберг Д., Берд А. (сентябрь 1999 г.). «MBD2 представляет собой репрессор транскрипции, принадлежащий комплексу гистондеацетилазы MeCP1». Нат. Жене 23 (1): 58–61. дои : 10.1038/12659 . hdl : 1842/684 . ПМИД 10471499 . S2CID 6147725 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Генс Дев . 13 (15): 1924–35. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК 316920 . ПМИД 10444591 .
^ Цзян К.Л., Цзинь С.Г., Пфайфер Г.П. (декабрь 2004 г.). «MBD3L1 представляет собой репрессор транскрипции, который взаимодействует с метил-CpG-связывающим белком 2 (MBD2) и компонентами комплекса NuRD» . Ж. Биол. Хим . 279 (50): 52456–64. дои : 10.1074/jbc.M409149200 . ПМИД 15456747 .
^ Секимата М., Такахаси А., Мураками-Секимата А., Хомма Ю. (ноябрь 2001 г.). «Участие нового белка цинковых пальцев, MIZF, в репрессии транскрипции путем взаимодействия с метил-CpG-связывающим белком, MBD2» . Ж. Биол. Хим . 276 (46): 42632–8. дои : 10.1074/jbc.M107048200 . ПМИД 11553631 .
^ Буке Дж., Аммерполь О., Кегель С., Мерен У., Ренкавиц Р. (ноябрь 2000 г.). «Домен минимальной репрессии MBD2b перекрывается с метил-CpG-связывающим доменом и напрямую связывается с Sin3A» . Ж. Биол. Хим . 275 (45): 34963–7. дои : 10.1074/jbc.M005929200 . ПМИД 10950960 .

Дальнейшее чтение

Сканлан М.Дж., Чен Ю.Т., Уильямсон Б., Гуре А.О., Стокерт Э., Гордан Дж.Д., Тюречи О., Сахин У., Пфройндшу М., Олд Л.Дж. (1998). «Характеристика антигенов рака толстой кишки человека, распознаваемых аутологичными антителами» . Межд. Дж. Рак . 76 (5): 652–8. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19980529)76:5<652::AID-IJC7>3.0.CO;2-P . ПМИД 9610721 .
Чжан Ю., Лерой Г., Силиг Х.П., Лейн В.С., Рейнберг Д. (1998). «Специфический для дерматомиозита аутоантиген Mi2 является компонентом комплекса, содержащего деацетилазу гистонов и активность ремоделирования нуклеосом» . Клетка . 95 (2): 279–89. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . ПМИД 9790534 . S2CID 18786866 .
Тонг Дж.К., Хассиг К.А., Шницлер Г.Р., Кингстон Р.Э., Шрайбер С.Л. (1998). «Деацетилирование хроматина с помощью АТФ-зависимого комплекса ремоделирования нуклеосом». Природа . 395 (6705): 917–21. Бибкод : 1998Natur.395..917T . дои : 10.1038/27699 . ПМИД 9804427 . S2CID 4355885 .
Бхаттачарья С.К., Рамчандани С., Червони Н., Шиф М. (1999). «Белок млекопитающих со специфической деметилазной активностью в отношении ДНК mCpG». Природа . 397 (6720): 579–83. Бибкод : 1999Natur.397..579B . дои : 10.1038/17533 . ПМИД 10050851 . S2CID 4408031 .
Чжан Й., Нг Х.Х., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (1999). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Генс Дев . 13 (15): 1924–35. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК 316920 . ПМИД 10444591 .
Нг Х.Х., Чжан Ю., Хендрих Б., Джонсон К.А., Тернер Б.М., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Рейнберг Д., Берд А. (1999). «MBD2 представляет собой репрессор транскрипции, принадлежащий комплексу гистондеацетилазы MeCP1». Нат. Жене 23 (1): 58–61. дои : 10.1038/12659 . hdl : 1842/684 . ПМИД 10471499 . S2CID 6147725 .
Татемацу К.И., Ямазаки Т., Исикава Ф. (2000). «Комплекс MBD2-MBD3 связывается с полуметилированной ДНК и образует комплекс, содержащий DNMT1, в фокусах репликации в поздней S-фазе» . Генные клетки . 5 (8): 677–88. дои : 10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x . ПМИД 10947852 . S2CID 25185979 .
Боке Дж., Аммерполь О., Кегель С., Мерен У., Ренкавиц Р. (2001). «Домен минимальной репрессии MBD2b перекрывается с метил-CpG-связывающим доменом и напрямую связывается с Sin3A» . Ж. Биол. Хим . 275 (45): 34963–7. дои : 10.1074/jbc.M005929200 . ПМИД 10950960 .
Хамфри Г.В., Ван Ю., Русанова В.Р., Хираи Т., Цинь Дж., Накатани Ю., Ховард Б.Х. (2001). «Стабильные комплексы гистондеацетилазы, отличающиеся наличием белков домена SANT CoREST/kiaa0071 и Mta-L1» . Ж. Биол. Хим . 276 (9): 6817–24. дои : 10.1074/jbc.M007372200 . ПМИД 11102443 .
Фэн Ц, Чжан Ю (2001). «Комплекс MeCP1 подавляет транскрипцию посредством преимущественного связывания, ремоделирования и деацетилирования метилированных нуклеосом» . Генс Дев . 15 (7): 827–32. дои : 10.1101/gad.876201 . ПМК 312663 . ПМИД 11297506 .
Секимата М, Такахаши А, Мураками-Секимата А, Хомма Ю (2001). «Участие нового белка цинковых пальцев, MIZF, в репрессии транскрипции путем взаимодействия с метил-CpG-связывающим белком, MBD2» . Ж. Биол. Хим . 276 (46): 42632–8. дои : 10.1074/jbc.M107048200 . ПМИД 11553631 .
Мюллер-Тидов С., Кюглер К., Дидерихс С., Клюмпен С., Мёллер М., Фогт У., Мецгер Р., Шнайдер П.М., Бердель В.Е., Серве Х (2001). «Потеря экспрессии белков метил-CpG-связывающего домена HDAC при раке человека» . Бр. Дж. Рак . 85 (8): 1168–74. дои : 10.1054/bjoc.2001.2041 . ПМК 2375156 . ПМИД 11710831 .
Фэн Ц, Цао Р, Ся Л, Эрджумент-Бромаж Х, Темпст П, Чжан Ю (2002). «Идентификация и функциональная характеристика компонентов p66/p68 комплекса MeCP1» . Мол. Клетка. Биол . 22 (2): 536–46. дои : 10.1128/MCB.22.2.536-546.2002 . ПМК 139742 . ПМИД 11756549 .
Баккер Дж., Лин X, Нельсон В.Г. (2002). «Белок 2 связывающего домена метил-CpG подавляет транскрипцию с гиперметилированных промоторов гена глутатион S-трансферазы pi-класса в клетках гепатоцеллюлярной карциномы» . Ж. Биол. Хим . 277 (25): 22573–80. дои : 10.1074/jbc.M203009200 . ПМИД 11960994 .
Сайто М., Исикава Ф (2002). «mCpG-связывающий домен человеческого MBD3 не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD/Mi2 HDAC1 и MTA2» . Ж. Биол. Хим . 277 (38): 35434–9. дои : 10.1074/jbc.M203455200 . ПМИД 12124384 .
Детич Н., Теберг Дж., Шиф М. (2002). «Промотор-специфическая активация и деметилирование с помощью MBD2/деметилазы» . Ж. Биол. Хим . 277 (39): 35791–4. дои : 10.1074/jbc.C200408200 . ПМИД 12177048 .
Бракерц М., Буке Дж., Чжан Р., Ренкавиц Р. (2002). «Два родственных белка p66 составляют новое семейство мощных репрессоров транскрипции, взаимодействующих с MBD2 и MBD3» . Ж. Биол. Хим . 277 (43): 40958–66. дои : 10.1074/jbc.M207467200 . ПМИД 12183469 .
Критивас А., Фуджимуро М., Вайднер М., Янг Д.Б., Хейворд С.Д. (2002). «Взаимодействия белков, направленные на латентный ядерный антиген герпесвируса, ассоциированного с саркомой Капоши, с клеточными хромосомами» . Дж. Вирол . 76 (22): 11596–604. doi : 10.1128/JVI.76.22.11596-11604.2002 . ПМЦ 136775 . ПМИД 12388720 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000134046 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024513 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9774669-5] Хендрих Б., Бёрд А (ноябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика семейства метил-CpG-связывающих белков млекопитающих» . Мол Клеточная Биол . 18 (11): 6538–47. дои : 10.1128/mcb.18.11.6538 . ПМЦ 109239 . ПМИД 9774669 .

[pmid10441743-6] Хендрих Б., Эбботт С., Маккуин Х., Чемберс Д., Кросс С., Берд А. (сентябрь 1999 г.). «Геномная структура и хромосомное картирование генов Mbd1, Mbd2, Mbd3 и Mbd4 мыши и человека». Геном Мамм . 10 (9): 906–12. дои : 10.1007/s003359901112 . ПМИД 10441743 . S2CID 819148 .

[Guezennec-7] Гезеннек, Ксавье; и др. (2006). «MBD2/NuRD и MBD3/NuRD, два разных комплекса с разными биохимическими и функциональными свойствами» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (3): 843–851. дои : 10.1128/MCB.26.3.843-851.2006 . ПМК 1347035 . ПМИД 16428440 .

[pmid12183469-8] Jump up to: ^а ^б ^с Бракерц М., Буке Дж., Чжан Р., Ренкавиц Р. (октябрь 2002 г.). «Два родственных белка p66 составляют новое семейство мощных репрессоров транскрипции, взаимодействующих с MBD2 и MBD3» . Ж. Биол. Хим . 277 (43): 40958–66. дои : 10.1074/jbc.M207467200 . ПМИД 12183469 .

[pmid11756549-9] Фэн Ц, Цао Р, Ся Л, Эрджумент-Бромаж Х, Темпст П, Чжан Ю (январь 2002 г.). «Идентификация и функциональная характеристика компонентов p66/p68 комплекса MeCP1» . Мол. Клетка. Биол . 22 (2): 536–46. doi : 10.1128/mcb.22.2.536-546.2002 . ПМК 139742 . ПМИД 11756549 .

[pmid10471499-10] Jump up to: ^а ^б Нг Х.Х., Чжан Ю., Хендрих Б., Джонсон К.А., Тернер Б.М., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Рейнберг Д., Берд А. (сентябрь 1999 г.). «MBD2 представляет собой репрессор транскрипции, принадлежащий комплексу гистондеацетилазы MeCP1». Нат. Жене 23 (1): 58–61. дои : 10.1038/12659 . hdl : 1842/684 . ПМИД 10471499 . S2CID 6147725 .

[pmid10444591-11] Jump up to: ^а ^б ^с Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Генс Дев . 13 (15): 1924–35. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК 316920 . ПМИД 10444591 .

[pmid15456747-12] Цзян К.Л., Цзинь С.Г., Пфайфер Г.П. (декабрь 2004 г.). «MBD3L1 представляет собой репрессор транскрипции, который взаимодействует с метил-CpG-связывающим белком 2 (MBD2) и компонентами комплекса NuRD» . Ж. Биол. Хим . 279 (50): 52456–64. дои : 10.1074/jbc.M409149200 . ПМИД 15456747 .

[pmid11553631-13] Секимата М., Такахаси А., Мураками-Секимата А., Хомма Ю. (ноябрь 2001 г.). «Участие нового белка цинковых пальцев, MIZF, в репрессии транскрипции путем взаимодействия с метил-CpG-связывающим белком, MBD2» . Ж. Биол. Хим . 276 (46): 42632–8. дои : 10.1074/jbc.M107048200 . ПМИД 11553631 .

[pmid10950960-14] Буке Дж., Аммерполь О., Кегель С., Мерен У., Ренкавиц Р. (ноябрь 2000 г.). «Домен минимальной репрессии MBD2b перекрывается с метил-CpG-связывающим доменом и напрямую связывается с Sin3A» . Ж. Биол. Хим . 275 (45): 34963–7. дои : 10.1074/jbc.M005929200 . ПМИД 10950960 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]