ФКБП3

ФКБП3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1PBK, 2KFV, 2MPH, 5D75
Идентификаторы
Псевдонимы	FKBP3 , FKBP-25, FKBP-3, FKBP25, PPIаза, FK506-связывающий белок 3, FKBP-пролилизомераза 3
Внешние идентификаторы	ПРОПУСКАТЬ : 186947 ; МГИ : 1353460 ; Гомологен : 1525 ; Генные карты : ФКБП3 ; ОМА : FKBP3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	45,135,319 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	65,120,781 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; vastus lateralis muscle; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; Brodmann area 23; ; body of tongue; ; muscle of thigh; ; gastrocnemius muscle; ; sperm; ; thoracic diaphragm; ; right ventricle;
	Top expressed in
	medial vestibular nucleus; ; mammillary body; ; lateral hypothalamus; ; intercostal muscle; ; ventromedial nucleus; ; tail of embryo; ; deep cerebellar nuclei; ; lateral septal nucleus; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; paraventricular nucleus of hypothalamus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	isomerase activity; FK506 binding; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; protein binding; RNA binding; signaling receptor activity;
Cellular component	nucleus; cytoplasm;
Biological process	chaperone-mediated protein folding; protein peptidyl-prolyl isomerization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2287
	30795
	ENSG00000100442
	ENSMUSG00000020949
	Q00688
	Q62446
	НМ_002013
	НМ_013902
	НП_002004
	НП_038930
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

FK506-связывающий белок 3, также известный как FKBP25, представляет собой белок , который у человека кодируется FKBP3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков иммунофилинов , которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включающих сворачивание и транспортировку белка. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс-пролилизомеразу , которая связывает иммунодепрессанты FK506 и рапамицин . Он имеет более высокое сродство к рапамицину, чем к FK506, и, таким образом, может быть важной молекулой-мишенью для иммуносупрессии рапамицина. ^{[ 8 ]}^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что FKBP3 взаимодействует с YY1 , ^{[ 9 ]} HDAC1 , ^{[ 9 ]} Гистондеацетилаза 2 , ^{[ 9 ]} ДНК , ^{[ 10 ]} и Мдм2 . ^{[ 11 ]} Как кристаллическая структура FKBP25 с FK506, так и структура ЯМР полноразмерного FKBP25 были опубликованы с идентификатором PDB 5D75 и 2MPH соответственно. ^{[ 8 ]}^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100442 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020949 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хунг Д.Т., Шрайбер С.Л. (июнь 1992 г.). «Клонирование кДНК человеческого FK506 массой 25 кДа и белка, связывающего рапамицин». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 184 (2): 733–8. дои : 10.1016/0006-291X(92)90651-Z . ПМИД 1374240 .
^ Порат Р., Пуциака Д.Д., Миллер Л.К., Грановиц Е.В., Динарелло Калифорния (май 1992 г.). «Блокада рецептора интерлейкина-1 (IL-1) снижает синтез IL-8, стимулируемый эндотоксином и Borrelia burgdorferi, в мононуклеарных клетках человека» . ФАСЕБ Дж . 6 (7): 2482–6. дои : 10.1096/fasebj.6.7.1532945 . ПМИД 1532945 . S2CID 29899093 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок 3, связывающий FKBP3 FK506, 25 кДа» .
^ Jump up to: ^а ^б Пракаш А., Раджан С., Юн Х.С. (апрель 2016 г.). «Кристаллическая структура связывающего домена FK506 человеческого FKBP25 в комплексе с FK506» . Белковая наука . 25 (4): 905–910. дои : 10.1002/pro.2875 . ISSN 1469-896X . ПМЦ 4941220 . ПМИД 26749369 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ян ВМ, Яо ЮЛ, Сето Э (сентябрь 2001 г.). «FK506-связывающий белок 25 функционально связан с деацетилазами гистонов и с фактором транскрипции YY1» . ЭМБО Дж . 20 (17): 4814–25. дои : 10.1093/emboj/20.17.4814 . ПМЦ 125595 . ПМИД 11532945 .
^ Пракаш А., Шин Дж., Раджан С., Юн Х.С. (2016). «Структурные основы распознавания нуклеиновых кислот FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином» . Нуклеиновые кислоты Рез . 44 (6): 2909–25. дои : 10.1093/nar/gkw001 . ПМЦ 4824100 . ПМИД 26762975 .
^ Очока А.М., Кампанис П., Никол С., Альенде-Вега Н., Кокс М., Маркар Л., Милн Д., Фуллер-Пейс Ф., Мик Д. (февраль 2009 г.). «FKBP25, новый регулятор пути p53, вызывает деградацию MDM2 и активацию p53». ФЭБС Летт . 583 (4): 621–6. дои : 10.1016/j.febslet.2009.01.009 . ПМИД 19166840 . S2CID 6110 .
^ Пракаш А., Шин Дж., Раджан С., Юн Х.С. (07.04.2016). «Структурные основы распознавания нуклеиновых кислот FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (6): 2909–2925. дои : 10.1093/nar/gkw001 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 4824100 . ПМИД 26762975 .

Дальнейшее чтение

Джин Ю.Дж., Буракофф С.Дж., Бирер Б.Е. (1992). «Молекулярное клонирование белка, связывающего рапамицин с высоким сродством 25 кДа, FKBP25» . Ж. Биол. Хим . 267 (16): 10942–5. дои : 10.1016/S0021-9258(19)49856-6 . ПМИД 1375932 .
Видеррехт Г., Мартин М.М., Сигал Н.Х., Секерка Дж.Дж. (1992). «Выделение кДНК человека, кодирующей белок FK-506 массой 25 кДа и рапамицин». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 185 (1): 298–303. дои : 10.1016/S0006-291X(05)80990-8 . ПМИД 1376117 .
Джин Ю.Дж., Буракофф С.Дж. (1993). «Белок, связывающий FK506 массой 25 кДа, локализован в ядре и связывается с казеинкиназой II и нуклеолином» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 90 (16): 7769–73. Бибкод : 1993PNAS...90.7769J . дои : 10.1073/pnas.90.16.7769 . ПМЦ 47224 . ПМИД 7689229 .
Кросс С.Х., Чарльтон Дж.А., Нэн X, Берд А.П. (1994). «Очистка CpG-островков с использованием колонки для связывания метилированной ДНК». Нат. Жене . 6 (3): 236–44. дои : 10.1038/ng0394-236 . ПМИД 8012384 . S2CID 12847618 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Мэн X, Чен Дж, Ян Ц, Ван С, Чао Ю, Ин К, Се Ю, Мао Ю (2002). «Клонирование и идентификация новой кДНК, которая может быть связана с FKBP25». Биохим. Жене . 40 (9–10): 303–10. дои : 10.1023/A:1020256718720 . ПМИД 12392168 . S2CID 24265377 .
Руаль Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для пептидил-пролил-цис-транс-изомеразы человека FKBP3.
PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для мышиной пептидил-пролил-цис-транс-изомеразы FKBP3.

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 14 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100442 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020949 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1374240-5] Хунг Д.Т., Шрайбер С.Л. (июнь 1992 г.). «Клонирование кДНК человеческого FK506 массой 25 кДа и белка, связывающего рапамицин». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 184 (2): 733–8. дои : 10.1016/0006-291X(92)90651-Z . ПМИД 1374240 .

[pmid1532945-6] Порат Р., Пуциака Д.Д., Миллер Л.К., Грановиц Е.В., Динарелло Калифорния (май 1992 г.). «Блокада рецептора интерлейкина-1 (IL-1) снижает синтез IL-8, стимулируемый эндотоксином и Borrelia burgdorferi, в мононуклеарных клетках человека» . ФАСЕБ Дж . 6 (7): 2482–6. дои : 10.1096/fasebj.6.7.1532945 . ПМИД 1532945 . S2CID 29899093 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок 3, связывающий FKBP3 FK506, 25 кДа» .

[Prakash_905–910-8] Jump up to: ^а ^б Пракаш А., Раджан С., Юн Х.С. (апрель 2016 г.). «Кристаллическая структура связывающего домена FK506 человеческого FKBP25 в комплексе с FK506» . Белковая наука . 25 (4): 905–910. дои : 10.1002/pro.2875 . ISSN 1469-896X . ПМЦ 4941220 . ПМИД 26749369 .

[pmid11532945-9] Jump up to: ^а ^б ^с Ян ВМ, Яо ЮЛ, Сето Э (сентябрь 2001 г.). «FK506-связывающий белок 25 функционально связан с деацетилазами гистонов и с фактором транскрипции YY1» . ЭМБО Дж . 20 (17): 4814–25. дои : 10.1093/emboj/20.17.4814 . ПМЦ 125595 . ПМИД 11532945 .

[pmid26762975-10] Пракаш А., Шин Дж., Раджан С., Юн Х.С. (2016). «Структурные основы распознавания нуклеиновых кислот FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином» . Нуклеиновые кислоты Рез . 44 (6): 2909–25. дои : 10.1093/nar/gkw001 . ПМЦ 4824100 . ПМИД 26762975 .

[pmid19166840-11] Очока А.М., Кампанис П., Никол С., Альенде-Вега Н., Кокс М., Маркар Л., Милн Д., Фуллер-Пейс Ф., Мик Д. (февраль 2009 г.). «FKBP25, новый регулятор пути p53, вызывает деградацию MDM2 и активацию p53». ФЭБС Летт . 583 (4): 621–6. дои : 10.1016/j.febslet.2009.01.009 . ПМИД 19166840 . S2CID 6110 .

[12] Пракаш А., Шин Дж., Раджан С., Юн Х.С. (07.04.2016). «Структурные основы распознавания нуклеиновых кислот FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (6): 2909–2925. дои : 10.1093/nar/gkw001 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 4824100 . ПМИД 26762975 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )