ФКБП8

ФКБП8
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2AWG, 2D9F, 2F2D, 2MF9, 3EY6
Идентификаторы
Псевдонимы	FKBP8 , FKBP38, FKBPr38, FK506-связывающий белок 8, FKBP-пролилизомераза 8
Внешние идентификаторы	Опустить : 604840 ; МГИ : 1341070 ; Гомологен : 7720 ; Генные карты : FKBP8 ; ОМА : FKBP8 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	18,544,077 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	70,987,978 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right frontal lobe; ; right testis; ; left testis; ; right hemisphere of cerebellum; ; anterior pituitary; ; C1 segment; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; muscle layer of sigmoid colon; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	superior frontal gyrus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; primary visual cortex; ; spermatocyte; ; neural layer of retina; ; granulocyte; ; lip; ; perirhinal cortex; ; entorhinal cortex; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	FK506 binding; isomerase activity; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; metal ion binding; protein binding; identical protein binding; disordered domain specific binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; mitochondrial membranes; integral component of endoplasmic reticulum membrane; mitochondrial envelope; mitochondrion; endoplasmic reticulum; cytosol; cytoplasm; protein-containing complex;
Biological process	apoptotic process; intracellular signal transduction; multicellular organism growth; cell fate specification; negative regulation of apoptotic process; regulation of BMP signaling pathway; neural tube development; positive regulation of BMP signaling pathway; regulation of gene expression; smoothened signaling pathway; camera-type eye development; dorsal/ventral neural tube patterning; viral process; dorsal/ventral pattern formation; chaperone-mediated protein folding; protein peptidyl-prolyl isomerization; negative regulation of protein phosphorylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23770
	14232
	ENSG00000105701
	ENSMUSG00000019428
	Q14318
	О35465
	НМ_001308373 ; НМ_012181
	НМ_001111066 ; НМ_001199631 ; НМ_010223
	НП_001295302 ; НП_036313 ; НП_001295302.1
	НП_001104536 ; НП_001186560 ; НП_034353
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

FK506-связывающий белок 8 представляет собой белок , который у человека кодируется FKBP8 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков иммунофилинов , которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включающих сворачивание и транспортировку белка. В отличие от других членов семейства, этот кодируемый белок, по-видимому, не обладает PPIазной /ротамазной активностью. Он может играть роль в нейронах, связанных с функцией памяти. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105701 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019428 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Лам Э., Мартин М., Видеррехт Г. (сентябрь 1995 г.). «Выделение кДНК, кодирующей новый гомолог человеческого FK506-связывающего белка, содержащий мотивы лейциновой застежки-молнии и тетратрикопептидных повторов». Джин . 160 (2): 297–302. дои : 10.1016/0378-1119(95)00216-С . ПМИД 7543869 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: FKBP8, связывающий белок FK506 8, 38 кДа» .

Дальнейшее чтение

Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Педерсен К.М., Финсен Б., Селис Дж.Е., Дженсен Н.А. (1999). «muFKBP38: новый гомолог мышиного иммунофилина, дифференциально экспрессирующийся в клетках шванномы и нейронах центральной нервной системы in vivo». Электрофорез . 20 (2): 249–55. doi : 10.1002/(SICI)1522-2683(19990201)20:2<249::AID-ELPS249>3.0.CO;2-F . ПМИД 10197430 . S2CID 23007045 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ширане М., Накаяма К.И. (2003). «Внутренний ингибитор кальциневрина FKBP38 нацеливает Bcl-2 на митохондрии и ингибирует апоптоз». Нат. Клеточная Биол . 5 (1): 28–37. дои : 10.1038/ncb894 . ПМИД 12510191 . S2CID 11653096 .
Рознер М., Хофер К., Кубиста М., Хенгстшлегер М. (2003). «Регуляция размера клеток белками-супрессорами опухолей TSC человека зависит от PI3K и FKBP38» . Онкоген . 22 (31): 4786–98. дои : 10.1038/sj.onc.1206776 . ПМИД 12894220 .
Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология 19-й хромосомы человека» . Природа . 428 (6982): 529–35. Бибкод : 2004Natur.428..529G . дои : 10.1038/nature02399 . ПМИД 15057824 .
Булгаков О.В., Эггеншвилер Дж.Т., Хонг Д.Х. и др. (2004). «FKBP8 является негативным регулятором передачи сигналов звукового ежа мыши в нервных тканях». Разработка . 131 (9): 2149–59. дои : 10.1242/dev.01122 . ПМИД 15105374 . S2CID 8203913 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Кан CB, Тай Дж, Чиа Дж, Юн Х.С. (2005). «Гибкая петля Bcl-2 необходима для молекулярного взаимодействия с иммунодепрессантным белком 38, связывающим FK-506 (FKBP38)» . ФЭБС Летт . 579 (6): 1469–76. doi : 10.1016/j.febslet.2005.01.053 . hdl : 10356/95126 . ПМИД 15733859 . S2CID 19114701 .
Вейвад М., Эдлих Ф., Эрдманн Ф. и др. (2005). «Переоценка ингибирующей способности человеческого FKBP38 в отношении кальциневрина» . ФЭБС Летт . 579 (7): 1591–6. дои : 10.1016/j.febslet.2004.12.098 . ПМИД 15757646 . S2CID 12995306 .
Эдлих Ф., Вейвад М., Эрдманн Ф. и др. (2005). «Регулятор Bcl-2 FKBP38 активируется Ca2+/кальмодулином» . ЭМБО Дж . 24 (14): 2688–99. дои : 10.1038/sj.emboj.7600739 . ПМК 1176465 . ПМИД 15990872 .
Кан CB, Фэн Л., Чиа Дж., Юн Х.С. (2005). «Молекулярная характеристика белка 38, связывающего FK-506, и его потенциальная регуляторная роль в отношении антиапоптотического белка Bcl-2». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 337 (1): 30–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.09.023 . hdl : 10356/94816 . ПМИД 16176796 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
О Дж.Х., Ян Дж.О., Хан Ю. и др. (2006). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном . 16 (12): 942–54. дои : 10.1007/s00335-005-0075-2 . ПМИД 16341674 . S2CID 69278 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105701 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019428 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7543869-5] Лам Э., Мартин М., Видеррехт Г. (сентябрь 1995 г.). «Выделение кДНК, кодирующей новый гомолог человеческого FK506-связывающего белка, содержащий мотивы лейциновой застежки-молнии и тетратрикопептидных повторов». Джин . 160 (2): 297–302. дои : 10.1016/0378-1119(95)00216-С . ПМИД 7543869 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: FKBP8, связывающий белок FK506 8, 38 кДа» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )