ФКБП
| Пептидил-пролил-цис-транс-изомераза FKBP-типа | |||
|---|---|---|---|
 Человеческий белок FKBP12 связан с FK506 (такролимус). Поверхность белка окрашена гидрофобностью; глубокая щель, в которой связан лиганд, гидрофобна. | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ФКБП_С | ||
| Пфам | PF00254 | ||
| ИнтерПро | IPR001179 | ||
| PROSITE | PDOC00426 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1фкб / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Мембраном | 336 | ||
| |||
FKBP функциям или FK506- связывающие белки представляют собой семейство белков , которые обладают пролилизомеразной активностью и родственны циклофилинам по , но не по аминокислотной последовательности . [1] FKBP были идентифицированы у многих эукариот , от дрожжей до человека , и действуют как сворачивания белков шапероны для белков, содержащих пролина остатки . Наряду с циклофилином FKBP относятся к семейству иммунофилинов . [2]
FKBP1A (также известный как FKBP12) у людей известен тем, что связывает иммунодепрессантную молекулу такролимус (первоначально обозначенную FK506), которая используется при лечении пациентов после трансплантации органов и пациентов с аутоиммунными заболеваниями. [3] Было обнаружено, что такролимус уменьшает количество случаев отторжения органов по сравнению с аналогичным препаратом циклоспорином , который связывает циклофилин. [4] [5] И комплекс FKBP-такролимус, и комплекс циклоспорин-циклофилин ингибируют фосфатазу , называемую кальциневрином , блокируя таким образом передачу сигнала по пути трансдукции Т- лимфоцитов . [6] Эта терапевтическая роль не связана с его пролилизомеразной активностью. FKBP25 представляет собой ядерный FKBP, который неспецифически связывается с ДНК и играет роль в репарации ДНК. [7]
Использование в качестве инструмента биологических исследований.
[ редактировать ]FKBP (FKBP1A) обычно не образует димер, но димеризуется в присутствии FK1012 , производного препарата такролимус (FK506). Это сделало его полезным инструментом для приложений химически индуцированной димеризации , где его можно использовать для управления локализацией белка, сигнальными путями и активацией белка. [8]
Примеры
[ редактировать ]Гены человека, кодирующие белки этого семейства, включают:
- АИП ; AIPL1
- ФКБПЛ ; ФКБП1А ; ФКБП1Б ; ФКБП2 ; ФКБП3 ; ФКБП4 ; ФКБП5 ; ФКБП6 ; ФКБП7 ; ФКБП8 ; ФКБП9 ; ФКБП10 ; ФКБП11 ; ФКБП14 ; ФКБП15 ; [9]
Ген с неясным статусом (может быть псевдогеном ):
- FKBP1C [10]
Псевдогены у человека:
- ЛОК541473; ФКБП9Л;
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Секерка Дж. Дж., Хунг Ш., По М., Лин К.С., Сигал Н.Х. (октябрь 1989 г.). «Цитозольный связывающий белок иммунодепрессанта FK506 обладает пептидил-пролилизомеразной активностью, но отличается от циклофилина». Природа . 341 (6244): 755–7. Бибкод : 1989Natur.341..755S . дои : 10.1038/341755a0 . ПМИД 2477714 . S2CID 4363530 .
- ^ Бальбах Дж., Шмид FX (2000). «Изомеризация пролина и ее катализ при сворачивании белка». В боли Р.Х. (ред.). Механизмы сворачивания белков (2-е изд.). Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. стр. 212–237. ISBN 0-19-963789-Х .
- ^ Ван Т., Донахью П.К., Зервос А.С. (июль 1994 г.). «Специфическое взаимодействие рецепторов I типа семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука . 265 (5172): 674–6. Бибкод : 1994Sci...265..674W . дои : 10.1126/science.7518616 . ПМИД 7518616 .
- ^ Майер А.Д., Дмитревски Дж., Сквиффлет Дж.П., Бесс Т., Грабензее Б., Кляйн Б., Эйглер Ф.В., Химанн Ю., Пихльмайр Р., Беренд М., Ванрентергем Ю., Донк Дж., Ван Хоофф Дж., Кристианс М., Моралес Дж.М., Андрес А. Джонсон. Р.В., Шорт С., Буххольц Б., Ремерт Н., Ланд В., Шляйбнер С., Форсайт Дж.Л., Талбот Д., Поханка Э. (август 1997 г.). «Многоцентровое рандомизированное исследование, сравнивающее такролимус (FK506) и циклоспорин в профилактике отторжения почечного аллотрансплантата: отчет Европейской многоцентровой группы по изучению почек такролимуса» . Трансплантация . 64 (3): 436–43. дои : 10.1097/00007890-199708150-00012 . ПМИД 9275110 .
- ^ Пракаш, Аджит; Раджан, Шрикант; Юн, Хо Соп (апрель 2016 г.). «Кристаллическая структура связывающего домена FK506 человеческого FKBP25 в комплексе с FK506» . Белковая наука . 25 (4): 905–910. дои : 10.1002/pro.2875 . ISSN 1469-896X . ПМЦ 4941220 . ПМИД 26749369 .
- ^ Лю Дж., Фармер Дж.Д., Лейн В.С., Фридман Дж., Вайсман И., Шрайбер С.Л. (август 1991 г.). «Кальцинеурин является общей мишенью комплексов циклофилин-циклоспорин А и FKBP-FK506». Клетка . 66 (4): 807–15. дои : 10.1016/0092-8674(91)90124-H . ПМИД 1715244 . S2CID 22094672 .
- ^ Пракаш, Аджит; Шин, Джун; Раджан, Шрикант; Юн, Хо Соп (7 апреля 2016 г.). «Структурные основы распознавания нуклеиновых кислот FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (6): 2909–2925. дои : 10.1093/nar/gkw001 . ISSN 1362-4962 . ПМЦ 4824100 . ПМИД 26762975 .
- ^ Феган, А; Белый, Б; Карлсон, Дж. К.; Вагнер, ЧР (9 июня 2010 г.). «Химически контролируемая сборка белка: методы и применение». Химические обзоры . 110 (6): 3315–36. дои : 10.1021/cr8002888 . ПМИД 20353181 .
- ^ «Группа генов: пролилоизомеразы FKBP (FKBP)» . Комитет по генной номенклатуре Хьюго .
- ^ «Отчет по символам для FKBP1C» . Комитет по генной номенклатуре Хьюго .
Внешние ссылки
[ редактировать ]