Jump to content

ДНМТ1

ДНМТ1
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы DNMT1 , ADCADN, AIM, CXXC9, DNMT, HSN1E, MCMT, m.HsaI, ДНК (цитозин-5-)-метилтрансфераза 1, ДНК-метилтрансфераза 1
Внешние идентификаторы ОМИМ : 126375 ; МГИ : 94912 ; Гомологен : 124071 ; Генные карты : DNMT1 ; ОМА : DNMT1 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001130823
НМ_001379
НМ_001318730
НМ_001318731

НМ_001199431
НМ_001199432
НМ_001199433
НМ_010066
НМ_001314011

RefSeq (белок)

НП_001124295
НП_001305659
НП_001305660
НП_001370

Местоположение (UCSC) Чр 19: 10.13 – 10.23 Мб Чр 9: 20,82 – 20,87 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

ДНК (цитозин-5)-метилтрансфераза 1 (Dnmt1) представляет собой фермент , который катализирует перенос метильных групп на определенные сайты CpG в ДНК (процесс, называемый метилированием ДНК) . У человека он кодируется DNMT1 геном . [5] Dnmt1 является частью семейства ферментов ДНК-метилтрансфераз , которое состоит в основном из DNMT1, DNMT3A и DNMT3B .

Этот фермент отвечает за поддержание метилирования ДНК, что обеспечивает точность эпигенетических паттернов при клеточных делениях. В соответствии с этой ролью он отдает явное предпочтение метилированию CpG на полуметилированной ДНК. [6] Однако DNMT1 может катализировать метилирование ДНК de novo в определенных геномных контекстах, включая мобильные элементы и области контроля отцовского импринта. [7] [8] Паттерны аберрантного метилирования связаны с некоторыми опухолями человека и аномалиями развития. [9] [10]

См. также

[ редактировать ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что DNMT1 взаимодействует с UHRF1:

DNMT1 хорошо транскрибируется во время S-фазы клеточного цикла, когда он необходим для метилирования вновь созданных гемиметилированных сайтов на дочерних цепях ДНК. [18] Его взаимодействие с PCNA и UHRF1 участвует в локализации его в репликационной вилке. [19] Прямое сотрудничество между DNMT1 и G9a координирует метилирование ДНК и H3K9 во время деления клеток. [17] Это метилирование хроматина необходимо для стабильной репрессии экспрессии генов во время развития млекопитающих.

Модельные организмы

[ редактировать ]

Эксперименты с нокаутом показали, что этот фермент отвечает за основную часть метилирования в клетках мыши и важен для эмбрионального развития. [20] Также было показано, что отсутствие как материнского, так и зиготического Dnmt1 приводит к полному деметилированию импринтированных генов в бластоцистах. [21]

Клиническое значение

[ редактировать ]

DNMT1 играет решающую роль в поддержании гемопоэтических стволовых клеток (HSC). ЗКП со сниженным содержанием DNMT1 не способны эффективно самообновляться после трансплантации. [22] Также было показано, что он имеет решающее значение для других типов стволовых клеток, таких как кишечные стволовые клетки (ISC) и стволовые клетки молочной железы (MaSC). Условное удаление DNMT1 приводит к общему гипометилированию кишечника, расширению крипт и изменению времени дифференцировки ISCs, а также пролиферации и поддержанию MaSCs. [23]

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130816 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004099 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Йен Р.В., Вертино П.М., Нелькин Б.Д., Ю Дж.Дж., эль-Дейри В., Кумарасвами А., Леннон Г.Г., Траск Б.Дж., Селано П., Байлин С.Б. (май 1992 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей ДНК-метилтрансферазу человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (9): 2287–91. дои : 10.1093/нар/20.9.2287 . ПМЦ   312343 . ПМИД   1594447 .
  6. ^ Герман А., Гоял Р., Йельч А. (ноябрь 2004 г.). «ДНК-(цитозин-C5)-метилтрансфераза Dnmt1 процессивно метилирует ДНК с большим предпочтением гемиметилированных сайтов-мишеней» . Журнал биологической химии . 279 (46): 48350–9. дои : 10.1074/jbc.M403427200 . ПМИД   15339928 .
  7. ^ Ярычковская О, Шахабуддин З, Комфорт Н, Булар М, Бестор Т.Д. (декабрь 2018 г.). «Домены BAH и гистоноподобный мотив в ДНК-метилтрансферазе 1 (DNMT1) регулируют de novo и поддерживающее метилирование in vivo» . Журнал биологической химии . 293 (50): 19466–19475. дои : 10.1074/jbc.RA118.004612 . ПМК   6302165 . ПМИД   30341171 .
  8. ^ Хаггерти С., Крецмер Х., Рименшнейдер С. и др. (июнь 2021 г.). «Dnmt1 обладает активностью de novo, направленной на мобильные элементы» . Структурная и молекулярная биология природы . 28 (7): 594–603. дои : 10.1038/s41594-021-00603-8 . ПМК   8279952 . ПМИД   34140676 .
  9. ^ Кляйн С.Дж., Ботуян М.В., Ву Ю., Уорд С.Дж., Николсон Г.А., Хамманс С., Ходжо К., Яманиши Х., Карпф А.Р., Уоллес Д.С., Саймон М., Ландер С., Бордман Л.А., Каннингем Дж.М., Смит Г.Е., Личи У.Дж., Боес Б. , Аткинсон Э.Дж., Миддха С., Б. Дайк П.Дж., Паризи Дж.Э., Мер Дж., Смит Д.И., Дайк П.Дж. (июнь 2011 г.). «Мутации в DNMT1 вызывают наследственную сенсорную нейропатию с деменцией и потерей слуха» . Природная генетика . 43 (6): 595–600. дои : 10.1038/ng.830 . ПМК   3102765 . ПМИД   21532572 .
  10. ^ «Ген Энтреза: ДНК DNMT1 (цитозин-5-)-метилтрансфераза 1» .
  11. ^ Перейти обратно: а б с Раунтри М.Р., Бахман К.Е., Бэйлин С.Б. (июль 2000 г.). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый корепрессор DMAP1, образуя комплекс в фокусах репликации». Природная генетика . 25 (3): 269–77. дои : 10.1038/77023 . ПМИД   10888872 . S2CID   26149386 .
  12. ^ Перейти обратно: а б Ким Г.Д., Ни Дж., Келесоглу Н., Робертс Р.Дж., Прадхан С. (август 2002 г.). «Сотрудничество и связь между содержанием человека и метилтрансферазами ДНК (цитозин-5) de novo» . Журнал ЭМБО . 21 (15): 4183–95. дои : 10.1093/emboj/cdf401 . ПМК   126147 . ПМИД   12145218 .
  13. ^ Ленертц Б., Уеда Й., Дерийк А.А., Брауншвейг Ю., Перес-Бургос Л., Кубичек С., Чен Т., Ли Е., Дженувейн Т., Петерс А.Х. (июль 2003 г.). «Метилирование лизина 9 гистона H3, опосредованное Suv39h, направляет метилирование ДНК к основным сателлитным повторам в перицентрическом гетерохроматине» . Современная биология . 13 (14): 1192–200. Бибкод : 2003CBio...13.1192L . дои : 10.1016/s0960-9822(03)00432-9 . ПМИД   12867029 .
  14. ^ Иида Т., Суэтаке И., Тадзима С., Мориока Х., Охта С., Обусе К., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Зажим PCNA облегчает действие ДНК-цитозинметилтрансферазы 1 на полуметилированную ДНК» . Гены в клетки . 7 (10): 997–1007. дои : 10.1046/j.1365-2443.2002.00584.x . ПМИД   12354094 . S2CID   25310911 .
  15. ^ Чуанг Л.С., Ян Х.И., Ко Т.В., Нг Х.Х., Сюй Г., Ли Б.Ф. (сентябрь 1997 г.). «Комплекс ДНК человека-(цитозин-5) метилтрансфераза-PCNA как мишень для p21WAF1». Наука . 277 (5334): 1996–2000. дои : 10.1126/science.277.5334.1996 . ПМИД   9302295 .
  16. ^ Робертсон К.Д., Айт-Си-Али С., Йокочи Т., Уэйд П.А., Джонс П.Л., Вольф А.П. (июль 2000 г.). «DNMT1 образует комплекс с Rb, E2F1 и HDAC1 и подавляет транскрипцию с E2F-чувствительных промоторов». Природная генетика . 25 (3): 338–42. дои : 10.1038/77124 . ПМИД   10888886 . S2CID   10983932 .
  17. ^ Перейти обратно: а б Эстев П.О., Чин Х.Г., Смоллвуд А., Фири Г.Р., Гангисетти О., Карпф А.Р., Кэри М.Ф., Прадхан С. (ноябрь 2006 г.). «Прямое взаимодействие между DNMT1 и G9a координирует метилирование ДНК и гистонов во время репликации» . Гены и развитие . 20 (22): 3089–103. дои : 10.1101/gad.1463706 . ПМЦ   1635145 . ПМИД   17085482 .
  18. ^ Робертсон К.Д., Кейомарси К., Гонсалес Ф.А., Велическу М., Джонс П.А. (май 2000 г.). «Дифференциальная экспрессия мРНК ДНК-метилтрансфераз человека (DNMT) 1, 3a и 3b во время фазового перехода G(0)/G(1) в S в нормальных и опухолевых клетках» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (10): 2108–13. дои : 10.1093/нар/28.10.2108 . ПМЦ   105379 . ПМИД   10773079 .
  19. ^ Джонс, Пенсильвания, Лян Дж. (ноябрь 2009 г.). «Переосмысление того, как поддерживаются закономерности метилирования ДНК» . Обзоры природы. Генетика . 10 (11): 805–11. дои : 10.1038/nrg2651 . ПМЦ   2848124 . ПМИД   19789556 .
  20. ^ Ли Э., Бестор Т.Х., Джениш Р. (июнь 1992 г.). «Направленная мутация гена ДНК-метилтрансферазы приводит к эмбриональной смертности». Клетка . 69 (6): 915–26. дои : 10.1016/0092-8674(92)90611-F . ПМИД   1606615 . S2CID   19879601 .
  21. ^ Хирасава Р., Чиба Х., Канеда М., Таджима С., Ли Э., Джениш Р., Сасаки Х. (июнь 2008 г.). «Материнская и зиготическая Dnmt1 необходимы и достаточны для поддержания отпечатков метилирования ДНК во время предимплантационного развития» . Гены и развитие . 22 (12): 1607–16. дои : 10.1101/gad.1667008 . ПМК   2428059 . ПМИД   18559477 .
  22. ^ Троубридж Дж.Дж., Сноу Дж.В., Ким Дж., Оркин Ш.Х. (октябрь 2009 г.). «ДНК-метилтрансфераза 1 необходима и уникальным образом регулирует гемопоэтические стволовые клетки и клетки-предшественники» . Клеточная стволовая клетка . 5 (4): 442–9. дои : 10.1016/j.stem.2009.08.016 . ПМК   2767228 . ПМИД   19796624 .
  23. ^ Августинова А, Бенита С.А. (октябрь 2016 г.). «Эпигенетический контроль функции взрослых стволовых клеток». Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 17 (10): 643–58. дои : 10.1038/номер.2016.76 . ПМИД   27405257 . S2CID   24795361 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: c7c3f4387cf2d4d8efaab37eb43404f0__1711615740
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/c7/f0/c7c3f4387cf2d4d8efaab37eb43404f0.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
DNMT1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)