✖


Jump to content

ДНК-метилтрансфераза

ДНК-метилаза N-6
кристаллическая структура белка рестрикции i типа ecoki m (ec 2.1.1.72) (m.ecoki)
Идентификаторы
Символ N6_Mtase
Пфам PF02384
Пфам Клан CL0063
ИнтерПро ИПР003356
PROSITE PDOC00087
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
N-концевой домен HsdM
Идентификаторы
Символ HsdM_N
Пфам PF12161
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
C-5 цитозинспецифическая ДНК-метилаза
структура человеческого dnmt2, загадочного гомолога ДНК-метилтрансферазы
Идентификаторы
Символ ДНК_метилаза
Пфам PF00145
Пфам Клан CL0063
ИнтерПро ИПР001525
PROSITE PDOC00089
СКОП2 1хмы / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / СУПФАМ
CDD cd00315
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
ДНК-метилаза
кристаллическая структура метилтрансферазы mboia (moraxella bovis)
Идентификаторы
Символ N6_N4_Mtase
Пфам PF01555
Пфам Клан CL0063
ИнтерПро ИПР002941
PROSITE PDOC00088
СКОП2 1boo / SCOPe / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

В биохимии ДНК -метилтрансферазы ( ДНК-МТаза , DNMT семейство ферментов ) катализирует перенос метильной группы на ДНК . Метилирование ДНК выполняет широкий спектр биологических функций. Все известные ДНК-метилтрансферазы используют S-аденозилметионин (SAM) в качестве донора метила.

Классификация

[ редактировать ]

Субстрат

[ редактировать ]

МТазы можно разделить на три различные группы в зависимости от химических реакций, которые они катализируют:

Метилтрансферазы m6A и m4C обнаружены преимущественно у прокариот (хотя недавние данные свидетельствуют о том, что m6A в изобилии встречается у эукариот). [1] ). Метилтрансферазы m5C обнаружены у некоторых низших эукариот, у большинства высших растений и у животных, начиная с иглокожих .

Метилтрансферазы m6A (N-6-аденин-специфическая ДНК-метилаза) (A-Mtase) представляют собой ферменты , которые специфически метилируют аминогруппу в положении C-6 аденинов в ДНК. Они обнаружены в трех существующих типах бактериальных рестрикционно-модификационных систем (в системе I типа А-Мтаза является продуктом гена hsdM, а в типе III — продуктом гена mod). Эти ферменты ответственны за метилирование определенных последовательностей ДНК , чтобы предотвратить переваривание хозяином собственного генома с помощью ферментов рестрикции . Эти метилазы обладают той же специфичностью последовательности , что и соответствующие им ферменты рестрикции. Эти ферменты содержат консервативный мотив Asp / Asn - Pro -Pro- Tyr / Phe в своем N-концевом участке , этот консервативный участок может участвовать в субстрата связывании или в каталитической активности. [2] [3] [4] [5] Структура N6-MTase TaqI ( M.TaqI разрешена до 2,4 А. ) Молекула сайты складывается в 2 домена: N-концевой каталитический домен, который содержит связывания каталитического и кофактора , и включает центральный 9-нитевой бета-лист, окруженный 5 спиралями; и С-концевой домен распознавания ДНК, который образован 4 небольшими бета-листами и 8 альфа-спиралями . N- и C-концевые домены образуют щель, в которой размещается ДНК- субстрат . [6] Была предложена классификация N-MTases, основанная на расположении консервативных мотивов (CM). [5] Согласно этой классификации, N6-Мтазы, имеющие мотив DPPY (CM II), расположенный после мотива FxGxG (CM I), обозначаются N6-адениновыми МТазами класса D12. Система рестрикции и модификации типа I состоит из трех полипептидов M (hsdM) и S R, M и S. Субъединицы вместе образуют метилтрансферазу , которая метилирует два адениновых остатка в комплементарных цепях двудольной последовательности распознавания ДНК . В присутствии субъединицы R комплекс также может действовать как эндонуклеаза , связываясь с той же целевой последовательностью , но разрезая ДНК на некотором расстоянии от этого сайта. Будет ли ДНК разрезана или модифицирована, зависит от состояния метилирования целевой последовательности . Когда целевой сайт не модифицирован, ДНК разрезается. Когда целевой сайт гемиметилирован, комплекс действует как поддерживающая метилтрансфераза, модифицируя ДНК так, что обе цепи становятся метилированными . hsdM содержит альфа-спиральный домен на N-конце , N-концевой домен HsdM. [7]

Среди m6A-метилтрансфераз (N-6-аденин-специфическая ДНК-метилаза) существует группа орфанных МТаз, не участвующих в бактериальной системе рестрикции/метилирования. [8] Эти ферменты играют регулирующую роль в экспрессии генов и регуляции клеточного цикла. EcoDam из кишечной палочки [9] и CcrM из Caulobacter crescentus [10] являются хорошо охарактеризованными членами этого семейства. Совсем недавно было показано, что CamA из Clostridioides difficile играет ключевую функциональную роль в споруляции , образовании биопленок и адаптации к хозяину. [11]

Метилтрансферазы m4C (специфичные для цитозина ДНК-метилазы N-4) представляют собой ферменты , которые специфически метилируют аминогруппу в положении C-4 цитозинов в ДНК. [5] Такие ферменты встречаются как компоненты систем рестрикции-модификации типа II у прокариот . Такие ферменты распознают определенную последовательность ДНК и метилируют цитозин в этой последовательности . Этим действием они защищают ДНК от расщепления ферментами рестрикции типа II, которые распознают ту же последовательность. [ нужна ссылка ]

Метилтрансферазы m5C (цитозин-специфическая ДНК-метилаза C-5) (C5 Mtase) представляют собой ферменты, которые специфически метилируют углерод в C- 5 цитозинов ДНК с образованием C5-метилцитозина . [12] [13] [14] В клетках млекопитающих цитозинспецифические метилтрансферазы метилируют определенные последовательности CpG , которые, как полагают, модулируют экспрессию генов и дифференцировку клеток . У бактерий эти ферменты являются компонентом систем рестрикции-модификации и служат ценными инструментами для манипулирования ДНК. [13] [15] Структура домен метилтрансферазы HhaI (M.HhaI) разрешена до 2,5 А : молекула складывается в 2 домена - более крупный каталитический , содержащий сайты связывания каталитических и кофакторов , и меньший домен узнавания ДНК. [16]

Сообщалось о высококонсервативных ДНК-метилтрансферазах типов m4C, m5C и m6A. [17] которые представляются многообещающими целями для разработки новых эпигенетических ингибиторов для борьбы с бактериальной вирулентностью, устойчивостью к антибиотикам, а также для других биомедицинских применений.

Опять против. обслуживание

[ редактировать ]

Метилтрансферазы de novo распознают в ДНК что-то, что позволяет им заново метилировать цитозины. Они экспрессируются главным образом на ранних стадиях развития эмбриона и определяют структуру метилирования. Метилтрансферазы de novo также активны, когда клетка, реагирующая на сигнал, такая как нейрон , должна изменить экспрессию белка. [18] Например, когда обусловленность страхом создает у крысы новые воспоминания , 9,17% генов в геноме нейронов гиппокампа крысы дифференциально метилированы. [19]

Поддерживающие метилтрансферазы добавляют метилирование к ДНК, когда одна цепь уже метилирована. Они работают на протяжении всей жизни организма, поддерживая структуру метилирования, установленную метилтрансферазами de novo. [ нужна ссылка ]

млекопитающее

[ редактировать ]

У млекопитающих идентифицированы по крайней мере четыре ДНК-метилтрансферазы различной активности. Они называются DNMT1 , [20] две изоформы, транскрибируемые из гена DNMT3a : DNMT3a1 и DNMT3a2, [21] и DNMT3b . [22] Недавно был обнаружен еще один фермент DNMT3c, специфически экспрессирующийся в мужской зародышевой линии мышей. [23]

Некоторые сигналы активации нуклеосомы . Нуклеосомы состоят из четырех пар белков -гистонов в плотно собранной сердцевинной области плюс до 30% каждого гистона, остающегося в свободно организованном хвосте (показан только один хвост каждой пары). ДНК обернута вокруг белков ядра гистонов в хромосомах . Лизины (К) обозначены цифрами, обозначающими их положение, например (К4), что указывает на то, что лизин является четвертой аминокислотой от амино(N)-конца хвоста в гистоновом белке. Метилирование {Me} и ацетилирование [Ac] являются распространенными посттрансляционными модификациями лизинов гистоновых хвостов.

[ нужна ссылка ]

Некоторые сигналы репрессии на нуклеосоме .

Манзо и др. [24] наблюдали различия в геномном связывании DNMT3a1, DNMT3a2 и DNMT3b. Они обнаружили 3970 областей, обогащенных исключительно DNMT3a1, 3838, обогащенных исключительно DNMT3a2, и 3432, обогащенных исключительно DNMT3b.

Ферменты DNMT регулируются не только в местах их метилирования в геноме, но и в том месте, где они связываются с ДНК. [24] но они также регулируются посттрансляционными модификациями гистоновых которых белков нуклеосом, вокруг обернута геномная ДНК (см. рисунки). Роуз и Клозе [25] рассмотрели взаимосвязь между метилированием ДНК и гистонов метилированием лизина . Например, они указали, что H3K4me3, по-видимому, блокирует метилирование ДНК, тогда как H3K9me3 играет роль в стимулировании метилирования ДНК.

ДНМТ3Л [26] представляет собой белок, тесно связанный с DNMT3a и DNMT3b по структуре и имеющий решающее значение для метилирования ДНК, но, по-видимому, сам по себе неактивен.

ДНМТ1

[ редактировать ]

DNMT1 является наиболее распространенной ДНК-метилтрансферазой в клетках млекопитающих и считается ключевой поддерживающей метилтрансферазой у млекопитающих . Он преимущественно метилирует гемиметилированные CpG динуклеотиды в геноме млекопитающих. Мотив узнавания человеческого фермента включает только три основания в паре динуклеотидов CpG: C на одной цепи и CpG на другой. Это смягченное требование к специфичности субстрата позволяет ему метилировать необычные структуры, такие как промежуточные соединения проскальзывания ДНК, со скоростью de novo, которая равна скорости его поддержания. [27] Как и другие ДНК-цитозин-5-метилтрансферазы, человеческий фермент распознает перевернутые цитозины в двухцепочечной ДНК и действует по механизму нуклеофильной атаки. [28] В раковых клетках человека DNMT1 отвечает как за метилирование de novo , так и за поддерживающее метилирование генов-супрессоров опухоли. [29] [30] Фермент аминокислот имеет длину около 1620 . Первые 1100 аминокислот составляют регуляторный домен фермента, а остальные остатки составляют каталитический домен. К ним присоединяется Гли – повторяет Лис . Оба домена необходимы для каталитической функции DNMT1. [ нужна ссылка ]

DNMT1 имеет несколько изоформ : соматическую DNMT1, сплайсинговый вариант (DNMT1b) и ооцит -специфическую изоформу (DNMT1o). DNMT1o синтезируется и хранится в цитоплазме ооцита и транслоцируется в ядро ​​клетки на ранних стадиях эмбрионального развития, тогда как соматический DNMT1 всегда обнаруживается в ядре соматической ткани. [ нужна ссылка ]

с нулевой мутацией DNMT1 Эмбриональные стволовые клетки были жизнеспособны и содержали небольшой процент метилированной ДНК и активности метилтрансферазы. Мышиные эмбрионы, гомозиготные по делеции Dnmt1, погибают на 10–11 день беременности. [31]

ТРДМТ1

[ редактировать ]

Хотя этот фермент имеет сильное сходство последовательностей с 5-метилцитозинметилтрансферазами как прокариот, так и эукариот, в 2006 году было показано, что фермент метилирует положение 38 в транспортной РНК аспарагиновой кислоты и не метилирует ДНК. [32] Название этой метилтрансферазы было изменено с DNMT2 на TRDMT1 (тРНК метилтрансфераза аспарагиновой кислоты 1), чтобы лучше отражать ее биологическую функцию. [33] TRDMT1 — первая РНК-цитозинметилтрансфераза, идентифицированная в клетках человека.

ДНМТ3

[ редактировать ]

DNMT3 представляет собой семейство ДНК- метилтрансфераз, которые могут метилировать гемиметилированные и неметилированные CpG с одинаковой скоростью. Архитектура ферментов DNMT3 аналогична архитектуре DNMT1, с регуляторной областью, прикрепленной к каталитическому домену. Существует как минимум пять членов семейства DNMT3: DNMT3a1, DNMT3a2, 3b, 3c и 3L. [ нужна ссылка ]

DNMT3a1, DNMT3a2 и DNMT3b могут опосредовать метилирование сайтов CpG в промоторах генов, что приводит к репрессии генов . Эти ДНК-метилтрансферазы могут также метилировать сайты CpG в кодирующих областях генов, где такое метилирование может увеличивать транскрипцию генов. [34] Работа с DNMT3a1 показала, что он преимущественно локализован на CpG-островках, бивалентно маркированных H3K4me3 (метка, способствующая транскрипции) и H3K27me3 (метка, репрессирующая транскрипцию), совпадающих с промоторами многих факторов транскрипции . Работа с DNMT3a2 в нейронах показала, что изменения метилирования ДНК, вызванные DNMT3a2, преимущественно происходят в межгенных и интронных областях. Считалось, что эти межгенные и интронные метилирования ДНК, вероятно, регулируют активность энхансеров , альтернативный сплайсинг или экспрессию некодирующих РНК . [35]

DNMT3a1 может совместно локализоваться с белком гетерохроматина (HP1) и метил-CpG-связывающим белком (MeCBP), а также с рядом других факторов. [36] Они также могут взаимодействовать с DNMT1, что может быть сопутствующим событием во время метилирования ДНК. DNMT3a предпочитает CpG метилирование метилированию CpA, CpT и CpC, хотя, по-видимому, существует некоторое предпочтение последовательностей метилирования для DNMT3a и DNMT3b. DNMT3a метилирует сайты CpG со скоростью, намного меньшей, чем DNMT1, но большей, чем DNMT3b.

Экспрессия DNMT3a2 отличается от DNMT3a1 и DNMT3b, поскольку экспрессия DNMT3a2 происходит по образцу непосредственно раннего гена . Экспрессия DNMT3a2 в нейронах индуцируется, например, за счет новой активности нейронов. [37] [35] Это может иметь значение для формирования долговременной памяти . [38] У крыс высокие уровни метилирования новой ДНК в нейронах гиппокампа возникают после того, как крысе было навязано запоминающееся событие, такое как контекстуальное обусловливание страха . [19] Байрактар ​​и Крейц [39] обнаружили, что ингибиторы DNMT, применяемые в мозге, предотвращают формирование долговременных воспоминаний.

DNMT3L содержит мотивы ДНК-метилтрансферазы и необходим для установления материнских геномных отпечатков , несмотря на то, что он каталитически неактивен. DNMT3L экспрессируется во время гаметогенеза , когда геномный импринтинг происходит . Потеря DNMT3L приводит к биаллельной экспрессии генов, обычно не экспрессируемых материнским аллелем. DNMT3L взаимодействует с DNMT3a и DNMT3b и совместно локализуется в ядре. Хотя DNMT3L, по-видимому, неспособен к метилированию , он может участвовать в транскрипции репрессии .

Клиническое значение

[ редактировать ]

Ингибиторы ДНМТ

[ редактировать ]
Основная статья: Гипометилирующий агент

Из-за эпигенетических эффектов семейства DNMT некоторые ингибиторы DNMT исследуются для лечения некоторых видов рака: [40]

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Айер Л.М., Чжан Д., Аравинд Л. (январь 2016 г.). «Метилирование аденина у эукариот: понимание сложной эволюционной истории и функционального потенциала эпигенетической модификации» . Биоэссе . 38 (1): 27–40. doi : 10.1002/bies.201500104 . ПМЦ   4738411 . ПМИД   26660621 .
  2. ^ Лоенен В.А., Дэниел А.С., Браймер Х.Д., Мюррей Н.Е. (ноябрь 1987 г.). «Организация и последовательность генов hsd Escherichia coli K-12». Журнал молекулярной биологии . 198 (2): 159–70. дои : 10.1016/0022-2836(87)90303-2 . ПМИД   3323532 .
  3. ^ Нарва К.Э., Ван Эттен Дж.Л., Слатко Б.Е., Беннер Дж.С. (декабрь 1988 г.). «Аминокислотная последовательность эукариотической ДНК [N6-аденин] метилтрансферазы, M.CviBIII, имеет области сходства с прокариотическим изошизомером M.TaqI и другими ДНК [N6-аденин] метилтрансферазами». Джин . 74 (1): 253–9. дои : 10.1016/0378-1119(88)90298-3 . ПМИД   3248728 .
  4. ^ Лаустер Р. (март 1989 г.). «Эволюция ДНК-метилтрансфераз типа II. Модель дупликации генов». Журнал молекулярной биологии . 206 (2): 313–21. дои : 10.1016/0022-2836(89)90481-6 . ПМИД   2541254 .
  5. ^ Перейти обратно: а б с Тиминскас А, Буткус В, Янулайтис А (май 1995 г.). «Мотивы последовательности, характерные для ДНК [цитозин-N4] и ДНК [аденин-N6] метилтрансфераз. Классификация всех ДНК-метилтрансфераз». Джин . 157 (1–2): 3–11. дои : 10.1016/0378-1119(94)00783-О . ПМИД   7607512 .
  6. ^ Лабан Дж., Гранзин Дж., Шлюкебир Г., Робинсон Д.П., Джек В.Е., Шильдкраут И., Сенгер В. (ноябрь 1994 г.). «Трехмерная структура аденинспецифической ДНК-метилтрансферазы M.Taq I в комплексе с кофактором S-аденозилметионином» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (23): 10957–61. дои : 10.1073/pnas.91.23.10957 . ПМК   45145 . ПМИД   7971991 .
  7. ^ Келлехер Дж.Э., Дэниел А.С., Мюррей Н.Е. (сентябрь 1991 г.). «Мутации, которые придают активность de novo поддерживающей метилтрансферазе». Журнал молекулярной биологии . 221 (2): 431–40. дои : 10.1016/0022-2836(91)80064-2 . ПМИД   1833555 .
  8. ^ Адхикари С., Кертис П.Д. (сентябрь 2016 г.). «ДНК-метилтрансферазы и эпигенетическая регуляция у бактерий» . Обзоры микробиологии FEMS . 40 (5): 575–91. дои : 10.1093/femsre/fuw023 . ПМИД   27476077 .
  9. ^ Чахар С., Эльсави Х., Рагозин С., Елч А. (январь 2010 г.). «Изменение специфичности распознавания ДНК ДНК-(аденин-N6)-метилтрансферазы EcoDam путем направленной эволюции». Журнал молекулярной биологии . 395 (1): 79–88. дои : 10.1016/j.jmb.2009.09.027 . ПМИД   19766657 .
  10. ^ Майер Дж.А., Албу Р.Ф., Юрковски Т.П., Елч А. (декабрь 2015 г.). «Исследование С-концевого домена бактериальной ДНК-(аденин N6)-метилтрансферазы CcrM». Биохимия . 119 : 60–7. дои : 10.1016/j.biochi.2015.10.011 . ПМИД   26475175 .
  11. ^ Оливейра П.Х., Рибис Дж.В., Гарретт Э.М., Трзилова Д., Ким А., Секулович О. и др. (январь 2020 г.). «Эпигеномная характеристика Clostridioides difficile выявила консервативную ДНК-метилтрансферазу, которая опосредует споруляцию и патогенез» . Природная микробиология . 5 (1): 166–180. дои : 10.1038/s41564-019-0613-4 . ПМК   6925328 . ПМИД   31768029 .
  12. ^ Посфаи Дж., Бхагват А.С., Робертс Р.Дж. (декабрь 1988 г.). «Мотивы последовательности, специфичные для цитозинметилтрансфераз». Джин . 74 (1): 261–5. дои : 10.1016/0378-1119(88)90299-5 . ПМИД   3248729 .
  13. ^ Перейти обратно: а б Кумар С., Ченг Х., Климасаускас С., Ми С., Посфаи Дж., Робертс Р.Дж., Уилсон Г.Г. (январь 1994 г.). «ДНК (цитозин-5) метилтрансферазы» . Исследования нуклеиновых кислот . 22 (1): 1–10. дои : 10.1093/нар/22.1.1 . ПМК   307737 . ПМИД   8127644 .
  14. ^ Лаустер Р., Траутнер Т.А., Нойер-Вейднер М. (март 1989 г.). «Цитозинспецифические ДНК-метилтрансферазы типа II. Консервативное ядро ​​фермента с вариабельными доменами, распознающими мишень». Журнал молекулярной биологии . 206 (2): 305–12. дои : 10.1016/0022-2836(89)90480-4 . ПМИД   2716049 .
  15. ^ Ченг Икс (февраль 1995 г.). «Модификация ДНК метилтрансферазами». Современное мнение в области структурной биологии . 5 (1): 4–10. дои : 10.1016/0959-440X(95)80003-J . ПМИД   7773746 .
  16. ^ Ченг X, Кумар С., Посфаи Дж., Пфлуграт Дж.В., Робертс Р.Дж. (июль 1993 г.). «Кристаллическая структура ДНК-метилтрансферазы HhaI в комплексе с S-аденозил-L-метионином». Клетка . 74 (2): 299–307. дои : 10.1016/0092-8674(93)90421-L . ПМИД   8343957 . S2CID   54238106 .
  17. ^ Оливейра П.Х., Фанг Дж. (май 2020 г.). «Консервативные ДНК-метилтрансферазы: окно в фундаментальные механизмы эпигенетической регуляции у бактерий» . Тенденции в микробиологии . 29 (1): 28–40. дои : 10.1016/j.tim.2020.04.007 . ПМК   7666040 . ПМИД   32417228 .
  18. ^ МакКлунг, Калифорния, Нестлер Э.Дж. (январь 2008 г.). «Нейропластичность, опосредованная измененной экспрессией генов» . Нейропсихофармакология . 33 (1): 3–17. дои : 10.1038/sj.npp.1301544 . ПМИД   17728700 . S2CID   18241370 .
  19. ^ Перейти обратно: а б Дьюк К.Г., Кеннеди Эй.Дж., Гэвин К.Ф., Дэй Дж.Дж., Суэтт Дж.Д. (июль 2017 г.). «Эпигеномная реорганизация в гиппокампе, зависящая от опыта» . Изучите Мем . 24 (7): 278–288. дои : 10.1101/lm.045112.117 . ПМК   5473107 . ПМИД   28620075 .
  20. ^ «ДНМТ1» . Отчет о генных символах . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . Архивировано из оригинала 6 октября 2012 г. Проверено 27 сентября 2012 г.
  21. ^ Чен Т, Уэда Ю, Се С, Ли Э ​​(октябрь 2002 г.). «Новая изоформа Dnmt3a, полученная с помощью альтернативного промотора, локализуется в эухроматине, и ее экспрессия коррелирует с активным метилированием de novo» . J Биол Хим . 277 (41): 38746–54. дои : 10.1074/jbc.M205312200 . ПМИД   12138111 .
  22. ^ «ДНМТ3Б» . Отчет о генных символах . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . Архивировано из оригинала 20 ноября 2012 г. Проверено 27 сентября 2012 г.
  23. ^ Барау Дж., Тейсандье А., Самудио Н., Рой С., Налессо В., Эро И. и др. (ноябрь 2016 г.). «ДНК-метилтрансфераза DNMT3C защищает мужские половые клетки от активности транспозонов». Наука . 354 (6314): 909–912. Бибкод : 2016Sci...354..909B . дои : 10.1126/science.aah5143 . ПМИД   27856912 . S2CID   30907442 .
  24. ^ Перейти обратно: а б Манзо М., Вирц Дж., Амбрози С., Вилласеньор Р., Рошицкий Б., Баубек Т. (декабрь 2017 г.). «Изоформ-специфическая локализация DNMT3A регулирует точность метилирования ДНК на двухвалентных CpG-островках» . ЭМБО Дж . 36 (23): 3421–3434. дои : 10.15252/embj.201797038 . ПМЦ   5709737 . ПМИД   29074627 .
  25. ^ Роуз Н.Р., Клозе Р.Дж. (декабрь 2014 г.). «Понимание связи между метилированием ДНК и метилированием лизина гистонов» . Биохим Биофиз Акта . 1839 (12): 1362–72. дои : 10.1016/j.bbagrm.2014.02.007 . ПМК   4316174 . ПМИД   24560929 .
  26. ^ «ДНМТ3Л» . Отчет о генных символах . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . Проверено 27 сентября 2012 г.
  27. ^ Хо М.Р., Бейкер Д.Д., Лааюн А., Смит С.С. (январь 1998 г.). «Остановка метилтрансферазы ДНК человека (цитозин-5) на одноцепочечных конформерах из места динамической мутации». Журнал молекулярной биологии . 275 (1): 67–79. дои : 10.1006/jmbi.1997.1430 . ПМИД   9451440 .
  28. ^ Смит С.С., Каплан Б.Е., Сауэрс Л.К., Ньюман Э.М. (май 1992 г.). «Механизм метил-направленной ДНК-метилтрансферазы человека и точность метилирования цитозина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (10): 4744–8. Бибкод : 1992PNAS...89.4744S . дои : 10.1073/pnas.89.10.4744 . ПМК   49160 . ПМИД   1584813 .
  29. ^ Джаир К.В., Бахман К.Е., Сузуки Х., Тинг А.Х., Ри И., Йен Р.В. и др. (январь 2006 г.). «Метилирование CpG-островков de novo в раковых клетках человека». Исследования рака . 66 (2): 682–92. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-1980 . ПМИД   16423997 .
  30. ^ Тинг А.Х., Джаир К.В., Шубель К.Е., Байлин С.Б. (январь 2006 г.). «Дифференциальная потребность в ДНК-метилтрансферазе 1 для поддержания гиперметилирования промотора гена раковых клеток человека». Исследования рака . 66 (2): 729–35. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-05-1537 . ПМИД   16424002 .
  31. ^ Ли Э., Бестор Т.Х., Джениш Р. (июнь 1992 г.). «Направленная мутация гена ДНК-метилтрансферазы приводит к эмбриональной смертности». Клетка . 69 (6): 915–26. дои : 10.1016/0092-8674(92)90611-F . ПМИД   1606615 . S2CID   19879601 .
  32. ^ Голл М.Г., Кирпекар Ф., Маггерт К.А., Йодер Дж.А., Се С.Л., Чжан X и др. (январь 2006 г.). «Метилирование тРНКАсп гомологом ДНК-метилтрансферазы Dnmt2» . Наука . 311 (5759): 395–8. Бибкод : 2006Sci...311..395G . дои : 10.1126/science.1120976 . ПМИД   16424344 . S2CID   39089541 .
  33. ^ «TRDMT1 тРНК метилтрансфераза 1 аспарагиновой кислоты (Homo sapiens)» . Энтрез Джин . НКБИ. 01.11.2010 . Проверено 7 ноября 2010 г.
  34. ^ Ян X, Хан Х, Де Карвалью Д.Д., Лэй Ф.Д., Джонс П.А., Лян Г. (октябрь 2014 г.). «Метилирование тел генов может изменить экспрессию генов и является терапевтической мишенью при раке» . Раковая клетка . 26 (4): 577–90. дои : 10.1016/j.ccr.2014.07.028 . ПМК   4224113 . ПМИД   25263941 .
  35. ^ Перейти обратно: а б Караджа К.Г., Купке Дж., Брито Д.В., Цейх Б., Томе С., Вейхенхан Д., Луцик П., Пласс С., Оливейра А.М. (январь 2020 г.). «Метилирование ДНК, специфичное для нейронных ансамблей, усиливает стабильность энграмм» . Нат Коммун . 11 (1): 639. Бибкод : 2020NatCo..11..639G . дои : 10.1038/s41467-020-14498-4 . ПМК   6994722 . ПМИД   32005851 .
  36. ^ Хегде М., Джоши М.Б. (апрель 2021 г.). «Комплексный анализ регуляции изоформ ДНК-метилтрансферазы в опухолях молочной железы человека» . J Cancer Res Clin Oncol . 147 (4): 937–971. дои : 10.1007/s00432-021-03519-4 . ПМЦ   7954751 . PMID   33604794 .
  37. ^ Оливейра А.М., Хемстедт Т.Дж., Бадинг Х. (июль 2012 г.). «Спасение связанного со старением снижения экспрессии Dnmt3a2 восстанавливает когнитивные способности». Нат Нейроски . 15 (8): 1111–3. дои : 10.1038/nn.3151 . ПМИД   22751036 . S2CID   10590208 .
  38. ^ Бернштейн С (2022). «Метилирование ДНК и установление памяти» . Эпигенетические идеи . 15 : 25168657211072499. дои : 10.1177/25168657211072499 . ПМЦ   8793415 . ПМИД   35098021 .
  39. ^ Байрактар ​​Г., Кройц М.Р. (2018). «Роль деметилирования ДНК, зависящего от активности, в мозге взрослого человека и при неврологических расстройствах» . Фронт Мол Нейроски . 11 : 169. дои : 10.3389/fnmol.2018.00169 . ПМЦ   5975432 . ПМИД   29875631 .
  40. ^ Мак Г.С. (декабрь 2010 г.). «До избирательности и не только». Природная биотехнология . 28 (12): 1259–66. дои : 10.1038/nbt.1724 . ПМИД   21139608 . S2CID   11480326 .
  41. ^ «ЕС утверждает разрешение на продажу препарата DACOGEN для лечения острого миелоидного лейкоза» . 28 сентября 2012 г. Проверено 28 сентября 2012 г.

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001525.
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR003356.
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR012327.
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR002941.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=DNA_methyltransferase&oldid=1216036379"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: e8540912e010cf9bd0acd5d4ff87afe6__1711635360
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/e8/e6/e8540912e010cf9bd0acd5d4ff87afe6.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
DNA methyltransferase - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)