Jump to content

Аминометилтрансфераза

АМТ
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы АМТ , аминометилтрансфераза, GCE, GCST, GCVT, NKH
Внешние идентификаторы ОМИМ : 238310 ; МГИ : 3646700 ; Гомологен : 409 ; GeneCards : АМТ ; ОМА : АМТ – ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_000481
НМ_001164710
НМ_001164711
НМ_001164712

НМ_001013814

RefSeq (белок)

НП_000472
НП_001158182
НП_001158183
НП_001158184

НП_001013836

Местоположение (UCSC) Chr 3: 49,42 – 49,42 Мб Чр 9: 108,17 – 108,18 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши
Аминометилтрансфераза
Идентификаторы
Номер ЕС. 2.1.2.10
Номер CAS. 37257-08-2
Базы данных
ИнтЭнк вид IntEnz
БРЕНДА БРЕНДА запись
Экспаси Просмотр NiceZyme
КЕГГ КЕГГ запись
МетаЦик метаболический путь
ПРЯМОЙ профиль
PDB Структуры RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология АмиГО / QuickGO
Поиск
PMCarticles
PubMedarticles
NCBIproteins
Аминометилтрансфераза
Кристаллографическая структура АМТ человека. [ 5 ]
Идентификаторы
Символ АМТ
ген NCBI 275
HGNC 473 АМТ
МОЙ БОГ 238310
ПДБ 1ВСР
RefSeq НМ_000481
ЮниПрот P48728
Другие данные
Номер ЕС 2.1.2.10
Локус Хр. 3 п21.2-21.1
Искать
StructuresSwiss-model
DomainsInterPro

Аминометилтрансфераза — фермент, катаболизирующий образование метилентетрагидрофолата . Он входит в состав глициндекарбоксилазного комплекса .

Структура

[ редактировать ]

Ген имеет около 6 т.п.н. длину и состоит из девяти экзонов . В 5'-фланкирующей области гена отсутствует типичная последовательность TATAA, но имеется один определенный сайт инициации транскрипции, обнаруженный методом удлинения праймера. Присутствуют два предполагаемых элемента, чувствительных к глюкокортикоидам, и предполагаемый элемент, чувствительный к гормонам щитовидной железы. Ген АМТ был локализован в 3p21.2-p21.1 путем флуоресцентной гибридизации in situ. [ 6 ] из 1209 пар оснований Открытая рамка считывания кодирует белок-предшественник из 403 аминокислот, а выведенная аминокислотная последовательность зрелого пептида демонстрирует 90 и 68% гомологию с последовательностями бычьего и куриного аналога соответственно. [ 7 ]

Кристаллическая структура белка, кодируемого этим геном, разрешена при 2 ангстремах . Самая последняя модель содержит два мономера, связанных некристаллографической осью 2-го порядка, 1176 молекул воды и 11 молекул сульфат-ионов в асимметричной единице. Несколько димерных взаимодействий наблюдаются между остатками на N-концевой петле, на α-спирали D и на флангах по обе стороны от β-цепи 8 двух мономеров. [ 8 ]

Белок, кодируемый АМТ, катализирует высвобождение аммиака и перенос метиленового углеродного звена на тетрагидрофолатный фрагмент. Аминометильное промежуточное соединение представляет собой продукт декарбоксилирования глицина, катализируемого P-белком. В обратной реакции Т-белок катализирует образование промежуточного соединения аминометиллипоата, связанного с H-белком, из 5,10-CH2-H4фолата, аммиака и восстановленного H-белка по упорядоченному механизму Ter Bi, при котором восстанавливается H-белок. является первым связывающимся субстратом, за которым следуют 5,10-CH2-H4фолат и аммиак. [ 9 ] [ 10 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Мутации в гене AMT связаны с глициновой энцефалопатией , также известной как некетотическая гиперглицинемия (NKH), которая представляет собой врожденную ошибку метаболизма глицина, определяемую недостаточной активностью фермента, расщепляющего глицин, и, как следствие, накоплением больших количеств глицина в организме. все ткани организма, включая мозг. В большинстве случаев глициновая энцефалопатия развивается в неонатальном периоде (85% в виде неонатальной тяжелой формы и 15% в виде неонатальной ослабленной формы). Среди детей, поступивших в младенчестве, 50% имеют инфантильную аттенуированную форму и 50% — инфантильную тяжелую форму. В целом, 20% всех детей, поступивших как новорожденные, так и младенцы, имеют менее тяжелый исход, определяемый как коэффициент развития, превышающий 20. У меньшинства пациентов наблюдаются легкие или атипичные формы глициновой энцефалопатии. [ 11 ] Неонатальная форма проявляется в первые часы-дни жизни прогрессирующей вялостью, гипотонией и миоклоническими подергиваниями, приводящими к апноэ и часто к смерти. Выжившие младенцы имеют глубокую умственную отсталость и трудноизлечимые судороги. Инфантильная форма характеризуется гипотонией, задержкой развития и судорогами. Атипичные формы варьируются от более легких форм заболевания, с началом от позднего младенчества до взрослого возраста, до быстро прогрессирующих и тяжелых заболеваний с поздним началом. Глициновую энцефалопатию подозревают у лиц с повышенной концентрацией глицина в крови и спинномозговой жидкости. Увеличение концентрации глицина в спинномозговой жидкости вместе с увеличением соотношения глицина в спинномозговой жидкости и плазме позволяет предположить диагноз. [ 12 ] [ 13 ] Ферментативное подтверждение диагноза основано на измерении активности ферментов системы расщепления глицина (GCS) в печени, полученном с помощью открытой биопсии или аутопсии. [ 14 ] [ 15 ] У большинства больных людей не наблюдается обнаруживаемой активности ферментов. Известно, что биаллельные мутации в которых вызывают глициновую энцефалопатию вызывают три гена: GLDC (кодирующий P-белковый компонент комплекса GCS и ответственный за 70–75% заболеваний), AMT (на долю которого приходится ~20% заболеваний), и GCSH (кодирующий H-белковый компонент комплекса GCS и на долю которого приходится <1% заболеваний). Около 5% людей с подтвержденной ферментами глициновой энцефалопатией не имеют мутаций ни в одном из этих трех генов и имеют вариантную форму глициновой энцефалопатии. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ]

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000145020 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032607 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ PDB : 1WSR ; Окамура-Икеда К., Хосака Х., Ёсимура М., Ямашита Е., Тома С., Накагава А., Фудзивара К., Мотокава Ю., Танигучи Х. (сентябрь 2005 г.). «Кристаллическая структура человеческого Т-белка системы расщепления глицина при разрешении 2,0 А и ее значение для понимания некетотической гиперглицинемии». Журнал молекулярной биологии . 351 (5): 1146–59. дои : 10.1016/j.jmb.2005.06.056 . ПМИД   16051266 .
  6. ^ Нанао, К; Такада, Г; Такахаши, Э; Секи, Н; Комацу, Ю; Окамура-Икеда, К.; Мотокава, Ю; Хаясака, К. (1 января 1994 г.). «Структура и хромосомная локализация гена аминометилтрансферазы (АМТ)». Геномика . 19 (1): 27–30. дои : 10.1006/geno.1994.1007 . ПМИД   8188235 .
  7. ^ Хаясака, К; Нанао, К; Такада, Г; Окамура-Икеда, К.; Мотокава, Ю. (30 апреля 1993 г.). «Выделение и определение последовательности кДНК, кодирующей Т-белок человека системы расщепления глицина». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 192 (2): 766–71. дои : 10.1006/bbrc.1993.1480 . ПМИД   7916605 .
  8. ^ Окамура-Икеда, К.; Хосака, Х; Ёсимура, М; Ямасита, Э; Тома, С; Накагава, А; Фудзивара, К; Мотокава, Ю; Танигучи, Х. (2 сентября 2005 г.). «Кристаллическая структура человеческого Т-белка системы расщепления глицина при разрешении 2,0 А и ее значение для понимания некетотической гиперглицинемии». Журнал молекулярной биологии . 351 (5): 1146–59. дои : 10.1016/j.jmb.2005.06.056 . ПМИД   16051266 .
  9. ^ Фудзивара, К; Окамура-Икеда, К.; Мотокава, Ю. (10 сентября 1984 г.). «Механизм реакции расщепления глицина. Дальнейшая характеристика промежуточного продукта, присоединенного к Н-белку, и реакции, катализируемой Т-белком» . Журнал биологической химии . 259 (17): 10664–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)90562-4 . ПМИД   6469978 .
  10. ^ Окамура-Икеда, К.; Фудзивара, К; Мотокава, Ю. (15 мая 1987 г.). «Механизм реакции расщепления глицина. Свойства обратной реакции, катализируемой Т-белком» . Журнал биологической химии . 262 (14): 6746–9. дои : 10.1016/S0021-9258(18)48307-X . ПМИД   3571285 .
  11. ^ Алиефендиоглу, Д; Тана Аслан, Ай; Джошкун, Т; Дурсун, А; Чакмак, ФН; Кесимер, М. (февраль 2003 г.). «Транзиторная некетотическая гиперглицинемия: два описания случаев и обзор литературы». Детская неврология . 28 (2): 151–5. дои : 10.1016/s0887-8994(02)00501-5 . ПМИД   12699870 .
  12. ^ Брёр, С; Бейли, CG; Ковальчук, С; Нг, С; Вансламбрук, Дж. М.; Роджерс, Х; Оре-Бле, К .; Кавано, Дж.А.; Брёр, А; Раско, Дж. Э. (декабрь 2008 г.). «Иминоглицинурия и гиперглицинурия представляют собой отдельные фенотипы человека, возникающие в результате сложных мутаций в переносчиках пролина и глицина» . Журнал клинических исследований . 118 (12): 3881–92. дои : 10.1172/jci36625 . ПМК   2579706 . ПМИД   19033659 .
  13. ^ Штайнер, Р.Д.; Свитсер, Д.А.; Рорбо, младший; Даутон, Южная Каролина; Тун, младший; Эпплгарт, Д.А. (февраль 1996 г.). «Некетотическая гиперглицинемия: атипичные клинические и биохимические проявления». Журнал педиатрии . 128 (2): 243–6. дои : 10.1016/s0022-3476(96)70399-2 . ПМИД   8636821 .
  14. ^ Куре, С; Шинка, Т; Саката, Ю; Осаму, Н; Такаянаги, М; Тада, К; Мацубара, Ю; Нарисава, К. (1998). «Одноосновательная делеция (183delC) и миссенс-мутация (D276H) в гене Т-белка из японской семьи с некетотической гиперглицинемией» . Журнал генетики человека . 43 (2): 135–7. дои : 10.1007/s100380050055 . ПМИД   9621520 .
  15. ^ Куре, С; Мандель, Х; Роллан, Миссури; Саката, Ю; Шинка, Т; Друган, А; Бонех, А; Тада, К; Мацубара, Ю; Нарисава, К. (апрель 1998 г.). «Миссенс-мутация (His42Arg) в гене Т-белка от крупного израильско-арабского родственника с некетотической гиперглицинемией». Генетика человека . 102 (4): 430–4. дои : 10.1007/s004390050716 . ПМИД   9600239 . S2CID   20224399 .
  16. ^ Куре, С; Корман, С.Х.; Канно, Дж; Нарисава, А; Рождение, М; Такаянаги, Т; Такаянаги, М; Сайто, Т; Мацуи, А; Камада, Ф; Аоки, Ю; Клятва, Т; Мацубара, Ю. (май 2006 г.). «Экспресс-диагностика глициновой энцефалопатии с помощью 13С-глицинового дыхательного теста». Анналы неврологии 59 (5): 862–7. дои : 10.1002/ana.20853 . ПМИД   16634033 . S2CID   34980421 .
  17. ^ Куре, С; Като, К; Динопулос, А; Гейл, К; ДеГрау, ТиДжей; Христодулу, Дж; Бздуч, В; Калманчей, Р; Фекете, Г; Троёвский, А; Плечко, Б; Бренингстолл, Дж; Тохьяма, Дж.; Аоки, Ю; Мацубара, Ю. (апрель 2006 г.). «Комплексный анализ мутаций GLDC, AMT и GCSH при некетотической гиперглицинемии». Человеческая мутация . 27 (4): 343–52. дои : 10.1002/humu.20293 . ПМИД   16450403 . S2CID   26911122 .
  18. ^ Тун, младший; Эпплгарт, Д.А.; Коултер-Маки, МБ; Джеймс, скорая помощь (апрель 2001 г.). «Рекуррентные мутации в P- и T-белках комплекса расщепления глицина и новая мутация T-белка (N145I): стратегия молекулярного исследования пациентов с некетотической гиперглицинемией (NKH)». Молекулярная генетика и обмен веществ . 72 (4): 322–5. дои : 10.1006/mgme.2001.3158 . ПМИД   11286506 .
[ редактировать ]

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 0684576217e0b1dbf0cc59cb14fd69e1__1719496320
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/06/e1/0684576217e0b1dbf0cc59cb14fd69e1.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Aminomethyltransferase - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)