Электронный ящик
E -box (бокс-энхансер) — это ответный элемент ДНК, обнаруженный у некоторых эукариот , который действует как сайт связывания белка и, как было обнаружено, регулирует экспрессию генов в нейронах , мышцах и других тканях. [1] Его специфическая последовательность ДНК, CANNTG (где N может быть любым нуклеотидом ), с палиндромной канонической последовательностью CACGTG, [2] распознается и связывается факторами транскрипции , чтобы инициировать гена транскрипцию . Как только факторы транскрипции связываются с промоторами через E-бокс, другие ферменты могут связываться с промотором и облегчать транскрипцию с ДНК на мРНК .
Открытие
[ редактировать ]Электронный ящик был открыт в результате сотрудничества лабораторий Сусуму Тонегавы и Уолтера Гилберта в 1985 году в качестве контрольного элемента в иммуноглобулина . усилителе тяжелой цепи [3] [4] Они обнаружили, что участка из 140 пар оснований в тканеспецифичном элементе-энхансере транскрипции достаточно для разных уровней усиления транскрипции в разных тканях и последовательностях. Они предположили, что белки, вырабатываемые определенными тканями, действуют на эти усилители, активируя наборы генов во время дифференцировки клеток.
В 1989 году лаборатория Дэвида Балтимора обнаружила первые два белка, связывающих Е-бокс , Е12 и Е47. [5] Эти усилители иммуноглобулинов могут связываться с белками в виде гетеродимеров через домены bHLH . В 1990 году был открыт еще один E-белок, ITF-2A (позже переименованный в E2-2Alt), который может связываться с иммуноглобулина усилителями легкой цепи . [6] Два года спустя третий белок, связывающий E-бокс, HEB, был обнаружен путем скрининга библиотеки кДНК из клеток HeLa . [7] Сплайс-вариант E2-2 был обнаружен в 1997 году и, как было обнаружено, ингибирует промотор мышечно-специфического гена. [8]
С тех пор исследователи установили, что E-box влияет на транскрипцию генов у нескольких эукариот, и обнаружили факторы связывания E-box, которые идентифицируют консенсусные последовательности E-box . [9] В частности, несколько экспериментов показали, что E-box является неотъемлемой частью петли обратной связи транскрипции-трансляции, которая включает в себя циркадные часы .
Связывание
[ редактировать ]Белки, связывающие E-бокс, играют важную роль в регуляции транскрипционной активности. Эти белки обычно содержат спираль-петля-спираль белка основной структурный мотив , который позволяет им связываться в виде димеров . [10] Этот мотив состоит из двух амфипатических α-спиралей , разделенных небольшой последовательностью аминокислот , которые образуют один или несколько β-витков. Гидрофобные . взаимодействия между этими α-спиралями стабилизируют димеризацию bHLH Кроме того, каждый мономер имеет основную область, которая помогает опосредовать узнавание между мономером bHLH и E-боксом (основная область взаимодействует с основной бороздкой ДНК ) . В зависимости от мотива ДНК («CAGCTG» или «CACGTG») белок bHLH имеет различный набор основных остатков.

Привязка E-box модулируется Zn 2+ у мышей. Области, богатые CT (CTRR), расположенные примерно на 23 нуклеотида выше E-box, важны для связывания E-box, трансактивации (повышения скорости генетической экспрессии) и транскрипции комплексов циркадных генов BMAL1 / NPAS2 и BMAL1/ CLOCK . [11]
Установлено, что специфичность связывания различных электронных ящиков важна для их функции. Электронные ящики с разными функциями имеют разное количество и тип привязки. [12]
Консенсусная последовательность E-box обычно CANNTG; однако существуют и другие E-боксы с похожими последовательностями, называемые неканоническими E-box. К ним относятся, помимо прочего:
- Последовательность CACGTT находится на 20 п.н. выше мышиного гена Period2 ( PER2 ) и регулирует его экспрессию. [13]
- Последовательность CAGCTT обнаружена в MyoD основном энхансере [14]
- Последовательность CACCTCGTGAC в проксимальной промоторной области человека и крысы APOE , которая является белковым компонентом липопротеинов . [15]
Роль в циркадных часах
[ редактировать ]Связь между генами, регулируемыми E-box, и циркадными часами была обнаружена в 1997 году, когда Хао, Аллен и Хардин (факультет биологии Техасского университета A&M ) проанализировали ритмичность гена period ( per ) у Drosophila melanogaster . [16] Они обнаружили циркадный усилитель транскрипции выше каждого гена во фрагменте ДНК длиной 69 п.о. В зависимости от уровней белка PER энхансер обеспечивал высокие уровни транскрипции мРНК как в условиях LD (свет-темнота), так и DD (постоянная темнота). Было обнаружено, что энхансер необходим для экспрессии генов высокого уровня , но не для циркадной ритмичности. Он также работает самостоятельно как мишень комплекса BMAL1/CLOCK.
Электронный ящик играет важную роль в циркадных генах; на данный момент идентифицировано девять циркадных генов, контролируемых E/E'BOX: PER1 , PER2, BHLHB2 , BHLHB3 , CRY1 , DBP , Nr1d1 , Nr1d2 и RORC. [17] Поскольку Е-бокс связан с несколькими циркадными генами, вполне возможно, что связанные с ним гены и белки являются «важнейшими и уязвимыми точками в (циркадной) системе». [18]
E-box входит в пятерку основных семейств транскрипционных факторов, связанных с циркадной фазой, и обнаруживается в большинстве тканей. [19] Всего 320 генов, контролируемых E-box, обнаружены в SCN ( супрахиазматическом ядре ), печени , аорте , надпочечниках , WAT ( белой жировой ткани ), головном мозге , предсердиях , желудочках , префронтальной коре , скелетных мышцах , BAT ( бурой жировой ткани). ) и черепной кости.
E-box, подобные элементам, связанным с CLOCK (EL-box; GGCACGAGGC), также важен для поддержания циркадной ритмичности в генах, контролируемых часами. Подобно E-box, E-box, подобный элементу, родственному CLOCK, также может индуцировать транскрипцию BMAL1/CLOCK, что затем может привести к экспрессии в других генах, содержащих EL-box (Ank, DBP, Nr1d1). [20] Однако между EL-box и обычным E-box есть различия. Подавление DEC1 и DEC2 оказывает более сильное воздействие на E-box, чем на EL-box. Более того, HES1, который может связываться с другой консенсусной последовательностью (CACNAG, известной как N-бокс), демонстрирует эффект подавления в EL-боксе, но не в E-боксе.
Как неканонические Е-боксы, так и последовательности, подобные Е-боксам, имеют решающее значение для циркадных колебаний. Недавние исследования по этому вопросу формируют гипотезу о том, что либо канонический, либо неканонический E-box, за которым следует E-box-подобная последовательность с интервалом в 6 пар оснований между ними, является необходимой комбинацией для циркадной транскрипции. [21] Анализ in silico также предполагает, что такой интервал существовал и в других известных генах, контролируемых часами.
Роль белков, связывающихся с E-боксами
[ редактировать ]Существует несколько белков, которые связываются с E-box и влияют на транскрипцию генов.
Комплекс ЧАСЫ-АРНТЛ
[ редактировать ]Комплекс CLOCK- ARNTL (BMAL1) является неотъемлемой частью циркадного цикла млекопитающих и жизненно важен для поддержания циркадной ритмичности.
Зная, что связывание активирует транскрипцию каждого гена в промоторной области, исследователи обнаружили в 2002 году, что DEC1 и DEC2 (факторы транскрипции bHLH) подавляют комплекс CLOCK-BMAL1 посредством прямого взаимодействия с BMAL1 и/или конкуренции за элементы E-box. Они пришли к выводу, что DEC1 и DEC2 являются регуляторами молекулярных часов млекопитающих. [22]
В 2006 году Риппергер и Шиблер обнаружили, что связывание этого комплекса с E-боксом запускает циркадную транскрипцию DBP и переходы хроматина (переход от хроматина к факультативному гетерохроматину ). [23] Был сделан вывод, что CLOCK регулирует экспрессию DBP путем связывания с мотивами E-box в энхансерных областях, расположенных в первом и втором интронах .
MYC (c-Myc, онкоген )
[ редактировать ]MYC ( c-Myc ), ген, который кодирует фактор транскрипции Myc , играет важную роль в регуляции клеток пролиферации и апоптоза млекопитающих .
В 1991 году исследователи проверили, может ли c-Myc связываться с ДНК путем димеризации ее до E12. Димеры Е6, химерного белка, были способны связываться с элементом Е-бокса (GGCCACGTGACC), который распознавался другими белками HLH. [24] Экспрессия E6 подавляла функцию c-Myc, что указывает на связь между ними.
В 1996 году было обнаружено, что Myc гетеродимеризуется с MAX и что этот гетеродимерный комплекс может связываться с последовательностью E-бокса CAC(G/A)TG и активировать транскрипцию. [25]
В 1998 году был сделан вывод, что функция c-Myc зависит от активации транскрипции определенных генов посредством элементов E-box. [26]
МИОД1 (МиОД)
[ редактировать ]MyoD происходит из семейства Mrf bHLH , и его основная роль — миогенез , образование мышечной ткани. [9] Другие члены этого семейства включают myogenin , Myf5 , Myf6 , Mist1 и Nex-1.
Когда MyoD связывается с мотивом E-box CANNTG, мышц и экспрессия мышечно-специфичных белков. инициируется дифференцировка [27] Исследователи удалили различные части рекомбинантной последовательности MyoD и пришли к выводу, что MyoD использует окружающие элементы для связывания E-box и тетраплексной структуры промоторной последовательности интегрина специфического для мышц гена α7 и саркомерного sMtCK .
MyoD регулирует HB-EGF ( гепарин-связывающий EGF-подобный фактор роста ), члена семейства EGF ( эпидермального фактора роста ), который стимулирует рост и пролиферацию клеток. [9] Он играет роль в развитии гепатоцеллюлярной карциномы , рака простаты , рака молочной железы , рака пищевода и рака желудка .
MyoD также может связываться с неканоническими E-боксами MyoG и регулировать его экспрессию. [28]
MyoG (Миогенин)
[ редактировать ]MyoG принадлежит к семейству транскрипционных факторов MyoD. Связывание MyoG-E-Box необходимо для образования нервно-мышечных сигнальный путь HDAC-Dach2- миогенин в экспрессии генов скелетных мышц. синапсов, поскольку был идентифицирован [29] Снижение экспрессии MyoG было показано у пациентов с симптомами атрофии мышц. [30]
Также было показано, что MyoG и MyoD участвуют в дифференцировке миобластов . [31] Они действуют путем трансактивации активности промотора катепсина B и индуцирования экспрессии его мРНК.
ТКФ3(Е47)
[ редактировать ]E47 продуцируется альтернативным сплайсингом E2A в Е47-специфичных экзонах , кодирующих bHLH . Его роль заключается в регуляции экспрессии и дифференцировки тканеспецифичных генов. Многие киназы связаны с E47, включая 3pk и MK2. Эти 2 белка образуют комплекс с Е47 и снижают его транскрипционную активность. [32] Также показано, что CKII и PKA фосфорилируют E47 in vitro. [33] [34] [35]
Подобно другим белкам, связывающим E-бокс, E47 также связывается с последовательностью CANNTG в E-box. У гомозиготных мышей с нокаутом E2A развитие B-клеток прекращается до стадии DJ-организации, и B-клетки не созревают. [36] Было показано, что E47 связывается либо в виде гетеродимера (с E12), либо в виде гетеродимера (с E12). [37] или как гомодимер (но более слабый). [38]
Недавние исследования
[ редактировать ]Хотя структурная основа взаимодействия BMAL1/CLOCK с E-box неизвестна, недавние исследования показали, что белковые домены bHLH BMAL1/CLOCK очень похожи на другие белки, содержащие bHLH, например Myc/Max, которые были кристаллизованы с помощью Электронные ящики. [39] Предполагается, что определенные основания для поддержки такого связывания с высокой аффинностью необходимы . Более того, ограничения последовательности в области вокруг циркадного Е-бокса не до конца понятны: считается, что необходимо, но недостаточно, чтобы Е-боксы были случайным образом расположены друг от друга в генетической последовательности, чтобы происходила циркадная транскрипция. . Недавние исследования с использованием E-box были направлены на попытку найти больше связывающих белков, а также обнаружить больше механизмов ингибирования связывания.
Исследователи из Медицинской школы Нанкинского университета обнаружили, что амплитуда FBXL3 (F-box/белок с богатыми повторами лейцина) выражается через E-box. [40] Они изучали мышей с дефицитом FBXL3 и обнаружили, что он регулирует петли обратной связи в циркадных ритмах, влияя на продолжительность циркадного периода.
Исследование, опубликованное 4 апреля 2013 года исследователями Гарвардской медицинской школы, показало, что нуклеотиды по обе стороны от E-box влияют на то, какие факторы транскрипции могут связываться с самим E-box. [41] Эти нуклеотиды определяют трехмерное пространственное расположение цепи ДНК и ограничивают размер связывающих факторов транскрипции . Исследование также выявило различия в характере связывания между нитями in vivo и in vitro .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Массари, Мэн; Мурре, К. (2000). «Белки спираль-петля-спираль: регуляторы транскрипции в эукариотических организмах» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (2): 429–440. CiteSeerX 10.1.1.321.6077 . дои : 10.1128/mcb.20.2.429-440.2000 . ПМК 85097 . ПМИД 10611221 .
- ^ Чаудхари, Дж; Скиннер, М.К. (май 1999 г.). «Основные белки спираль-петля-спираль могут действовать в E-боксе внутри элемента ответа сыворотки промотора c-fos, влияя на гормон-индуцированную активацию промотора в клетках Сертоли» . Мол Эндокринол . 13 (5): 774–786. дои : 10.1210/mend.13.5.0271 . ПМИД 10319327 .
- ^ Эфрусси, А; Черч, генеральный директор; Тонегава, С; Гилберт, В. (1985). «Специфические для линии B взаимодействия усилителя иммуноглобулина с клеточными факторами in vivo». Наука . 227 (4683): 134–140. Бибкод : 1985Sci...227..134E . дои : 10.1126/science.3917574 . ПМИД 3917574 .
- ^ Черч, генеральный директор; Эфрусси, А; Гилберт, В; Тонегава, С. (1985). «Специфические для типа клеток контакты с энхансерами иммуноглобулина в ядрах». Природа . 313 (6005): 798–801. Бибкод : 1985Natur.313..798C . дои : 10.1038/313798a0 . ПМИД 3919308 . S2CID 1878459 .
- ^ Мурре, К; Мак Коу, PS; Вассин, Х; и др. (август 1989 г.). «Взаимодействия между гетерологичными белками спираль-петля-спираль создают комплексы, которые специфически связываются с общей последовательностью ДНК». Клетка . 58 (3): 537–544. дои : 10.1016/0092-8674(89)90434-0 . ПМИД 2503252 . S2CID 29339773 .
- ^ Хентхорн, П; Киледжян, М; Кадеш, Т. (1990). «Два различных фактора транскрипции, которые связывают мотив энхансера иммуноглобулина microE5/каппа 2». Наука . 247 (4941): 467–470. Бибкод : 1990Sci...247..467H . дои : 10.1126/science.2105528 . ПМИД 2105528 .
- ^ Ху С.Дж., Олсон Э.Н.; Кингстон, Р. Э. (1992). «ЕВР» . Мол Клеточная Биол . 12 (3): 1031–1042. дои : 10.1128/MCB.12.3.1031 . ПМК 369535 . ПМИД 1312219 .
- ^ Чен, Б; Лим, Р.В. (январь 1997 г.). «Физические и функциональные взаимодействия между ингибиторами транскрипции Id3 и ITF-2b. Доказательства нового механизма, регулирующего экспрессию специфичных для мышц генов» . J Биол Хим . 272 (4): 2459–2463. дои : 10.1074/jbc.272.4.2459 . ПМИД 8999959 .
- ^ Jump up to: а б с Мэдж Б.: E-Box. В: Шваб М. (ред.) Энциклопедия рака. Springer-Verlag Берлин Гейдельберг, 2009 г.
- ^ Элленбергер, Т; Фасс, Д; Арно, М; Харрисон, Южная Каролина (апрель 1994 г.). «Кристаллическая структура фактора транскрипции E47: распознавание E-box с помощью димера спираль-петля-спираль основной области» . Генс Дев . 8 (8): 970–980. дои : 10.1101/gad.8.8.970 . ПМИД 7926781 .
- ^ Муньос, Эстела; Мишель Брюэр; Рубен Балер (2006). «Модуляция активности комплекса BMAL/CLOCK/E-Box с помощью цис-действующего элемента, богатого CT». Молекулярная и клеточная эндокринология . 252 (1–2): 74–81. дои : 10.1016/j.mce.2006.03.007 . ПМИД 16650525 . S2CID 38180029 .
- ^ Бозе, Судип; Букфор, Фредрик Р. (2010). «Эпизоды экспрессии гена пролактина в клетках GH3 зависят от селективного связывания промотора нескольких циркадных элементов» . Эндокринология . 151 (5): 2287–2296. дои : 10.1210/en.2009-1252 . ПМЦ 2869263 . ПМИД 20215567 .
- ^ Йоу, Ш.; Ко, CH; Лоури, Польша; и др. (2005). «Неканонический энхансер E-box управляет циркадными колебаниями Period2 мыши in vivo» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (7): 2608–2613. Бибкод : 2005PNAS..102.2608Y . дои : 10.1073/pnas.0409763102 . ПМЦ 548324 . ПМИД 15699353 .
- ^ Чжан, X.; Патель, СП; Маккарти, Джей-Джей; Рабчевский А.Г.; Голдхамер, диджей; Эссер, К.А. (2012). «Неканонический E-box в основном энхансере MyoD необходим для циркадной экспрессии в скелетных мышцах» . Нуклеиновые кислоты Рез . 40 (8): 3419–3430. дои : 10.1093/nar/gkr1297 . ПМЦ 3333858 . ПМИД 22210883 .
- ^ Салеро, Энрике; Хименес, Сесилио; Сафра, Франциско (15 марта 2003 г.). «Идентификация неканонического мотива E-box как регуляторного элемента в проксимальной промоторной области гена аполипопротеина E» . Биохимический журнал . 370 (3): 979–986. дои : 10.1042/BJ20021142 . ПМЦ 1223214 . ПМИД 12444925 .
- ^ Хао, Х; Аллен, DL; Хардин, П. Э. (июль 1997 г.). «Циркадный усилитель опосредует PER-зависимый цикл мРНК у Drosophila melanogaster» . Мол Клеточная Биол . 17 (7): 3687–3693. дои : 10.1128/MCB.17.7.3687 . ПМК 232220 . ПМИД 9199302 .
- ^ Панда, С; Анточ депутат; Миллер Б.Х.; Су А.И.; Шук А.Б.; Страуме М; Шульц П.Г.; Кей С.А.; Такахаши Дж.С.; Хогенеш Дж.Б. (май 2002 г.). «Координированная транскрипция ключевых путей у мышей с помощью циркадных часов» . Клетка . 109 (3): 307–320. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00722-5 . ПМИД 12015981 .
- ^ Херцог, Эрик (октябрь 2007 г.). «Нейроны и сети в суточных ритмах». Обзоры природы Неврология . 8 (10): 790–802. дои : 10.1038/nrn2215 . ПМИД 17882255 . S2CID 33687097 .
- ^ Ян, Джун; Хайфан Ван; Ютин Лю; Чуньсюань Шао (октябрь 2008 г.). «Анализ сетей регуляции генов в циркадном ритме млекопитающих» . PLOS Вычислительная биология . 4 (10): e1000193. Бибкод : 2008PLSCB...4E0193Y . дои : 10.1371/journal.pcbi.1000193 . ПМК 2543109 . ПМИД 18846204 .
- ^ Уэсима, Т; Кавамото Т; Хонда КК; Носиро М; Фудзимото К; Накао С; Ичиносе Н; Хашимото С; Гото О; Като Ю. (декабрь 2012 г.). «Идентификация нового элемента EL-box, связанного с часами, участвующего в циркадной регуляции с помощью BMAL1 / CLOCK и HES1». Джин . 510 (2): 118–125. дои : 10.1016/j.gene.2012.08.022 . ПМИД 22960268 .
- ^ Накахата, Ю; Ёсида М; Такано А; Сома Х; Ямамото Т; Ясуда А; Накацу Т; Такуми Т. (январь 2008 г.). «Прямое повторение элементов, подобных E-box, необходимо для клеточно-автономного циркадного ритма часовых генов» . БМК Мол Биол . 9 (1): 1. дои : 10.1186/1471-2199-9-1 . ПМК 2254435 . ПМИД 18177499 .
- ^ Хонма, С; Кавамото, Т; Такаги, Ю; Фудзимото, К; Сато, Ф; Носиро, М; Като, Ю; Хонма, К. (2002). «Dec1 и Dec2 являются регуляторами молекулярных часов млекопитающих». Природа . 419 (6909): 841–844. Бибкод : 2002Natur.419..841H . дои : 10.1038/nature01123 . ПМИД 12397359 . S2CID 4426418 .
- ^ Риппергер, Дж. А.; Шиблер, У. (март 2006 г.). «Ритмическое связывание CLOCK-BMAL1 с несколькими мотивами E-box управляет циркадной транскрипцией Dbp и переходами хроматина» (PDF) . Нат. Жене . 38 (3): 369–374. дои : 10.1038/ng1738 . ПМИД 16474407 . S2CID 13433446 .
- ^ Прендергаст, GC; Зифф, Э. Б. (январь 1991 г.). «Чувствительное к метилированию специфическое связывание ДНК с помощью основной области c-Myc». Наука . 251 (4990): 186–189. Бибкод : 1991Sci...251..186P . дои : 10.1126/science.1987636 . ПМИД 1987636 .
- ^ Десбаратс, Л; Гаубац, С; Эйлерс, М. (февраль 1996 г.). «Дискриминация между различными белками, связывающими E-бокс, по эндогенному гену-мишени c-myc» . Генс Дев . 10 (4): 447–460. дои : 10.1101/gad.10.4.447 . ПМИД 8600028 .
- ^ Сяо, Вопрос; Клаассен, Г; Ши, Дж; Адачи, С; Сейви, Дж; Ханн, СР (декабрь 1998 г.). «Дефектный по трансактивации c-MycS сохраняет способность регулировать пролиферацию и апоптоз» . Генс Дев . 12 (24): 3803–3808. дои : 10.1101/gad.12.24.3803 . ПМК 317265 . ПМИД 9869633 .
- ^ Шкловер, Дж; Эциони, С; Вейсман-Шомер, П; Яфе, А; Бенгалия, Э; Фрай, М. (2007). «MyoD использует перекрывающиеся, но разные элементы для связывания E-box и тетраплексных структур регуляторных последовательностей специфичных для мышц генов» . Нуклеиновые кислоты Рез . 35 (21): 7087–7095. дои : 10.1093/нар/gkm746 . ПМК 2175354 . ПМИД 17942416 .
- ^ Бергстром, Д.А.; Пенн, Британская Колумбия; Стрэнд, А.; Перри, РЛ; Рудницкий, Массачусетс; Тапскотт, С.Дж. (2002). «Промотор-специфическая регуляция связывания MyoD и сигнальной трансдукции совместно определяют экспрессию генов» . Мол. Клетка . 9 (3): 587–600. дои : 10.1016/s1097-2765(02)00481-1 . ПМИД 11931766 .
- ^ Тан, Х; Гольдман, Д. (2006). «Зависимая от активности регуляция генов в скелетных мышцах опосредуется каскадом передачи сигнала гистондеацетилаза (HDAC)-Dach2-миогенин» . Proc Natl Acad Sci США . 103 (45): 16977–16982. Бибкод : 2006PNAS..10316977T . дои : 10.1073/pnas.0601565103 . ПМЦ 1636564 . ПМИД 17075071 .
- ^ Рамамурти, С; Донохью, М; Бак, М. (2009). «Снижение экспрессии Jun-D и миогенина при мышечной атрофии человека при кахексии» . Am J Physiol Endocrinol Metab . 297 (2): E392–401. дои : 10.1152/ajpendo.90529.2008 . ПМК 2724118 . ПМИД 19470832 .
- ^ Джейн, DT; Морвей, ЖК; Коблински, Дж.; и др. (2002). «Доказательства того, что элементы промотора E-box и факторы транскрипции MyoD играют роль в индукции экспрессии гена катепсина B во время дифференцировки миобластов человека». Биол. Хим . 383 (12): 1833–1844. дои : 10.1515/BC.2002.207 . ПМИД 12553720 . S2CID 26010667 .
- ^ Нойфельд, Бернд; Гросс-Уайльд, Энн; Хоффмайер, Анжелика; Джордан, Брюс ВМ; Чен, Пэйфэн; Динев, Драгомир; Людвиг, Стефан; Рапп, Ульф Р. (7 июля 2000 г.). «Серин/треониновые киназы 3pK и MAPK-активируемая протеинкиназа 2 взаимодействуют с основным фактором транскрипции спираль-петля-спираль E47 и подавляют его транскрипционную активность» . Журнал биологической химии . 275 (27): 20239–20242. дои : 10.1074/jbc.C901040199 . ПМИД 10781029 .
- ^ Джонсон, Салли Э.; Ван, Сюэянь; Харди, Серж; Тапаровски, Элизабет Дж.; Конечный, Стивен Ф. (апрель 1996 г.). «Казеинкиназа II увеличивает транскрипционную активность MRF4 и MyoD независимо от их прямого фосфорилирования» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (4): 1604–1613. дои : 10.1128/MCB.16.4.1604 . ПМК 231146 . ПМИД 8657135 .
- ^ Слоан, Стивен Р.; Шен, Чун-Пын; Маккаррик-Уолмсли, Рут; Кадеш, Том (декабрь 1996 г.). «Фосфорилирование E47 как потенциальный детерминант специфической активности B-клеток» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (12): 6900–6908. дои : 10.1128/MCB.16.12.6900 . ПМК 231693 . ПМИД 8943345 .
- ^ Шен, Чун-Пын; Кадеш, Том (август 1995 г.). «Специфическое для B-клеток связывание ДНК с помощью гомодимера E47» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (8): 4518–4524. дои : 10.1128/MCB.15.8.4518 . ПМК 230691 . ПМИД 7623842 .
- ^ Бэйн, Гретхен; Понедельник, Элс К.; Изон, Дэвид Дж.; Амсен, Дерк; Круисбек, Ада М.; Вайнтрауб, Беннетт Дж.; Кроп, Ян; Шлиссель, Марк С.; Фини, Энн Дж.; ван Роон, Мэриан; ван дер Валк, Мартин; Риле, Хейн П.Дж.; Бернс, Антон; Мурре, Корнелиус (2 декабря 1994 г.). «Белки E2A необходимы для правильного развития B-клеток и инициации перестройки генов иммуноглобулинов». Клетка . 79 (5): 885–92. дои : 10.1016/0092-8674(94)90077-9 . ПМИД 8001125 . S2CID 34325904 .
- ^ Лассар, Эндрю Б.; Дэвис, Роберт Л.; Райт, Вудринг Э.; Кадеш, Том; Мурре, Корнелиус; Воронова, Анна; Балтимор, Дэвид; Вайнтрауб, Гарольд (26 июля 1991 г.). «Функциональная активность миогенных белков HLH требует гетероолигомеризации с E12/E47-подобными белками in vivo». Клетка . 66 (2): 305–15. дои : 10.1016/0092-8674(91)90620-E . ПМИД 1649701 . S2CID 25957022 .
- ^ Мурре, Корнелиус; Маккоу, Патрик Шонлебер; Вассин, Х.; Коди, М.; Ян, Л.Ю.; Ян, Ю.Н.; Кабрера, Карлос В.; Бускин, Джин Н.; Хаушка, Стивен Д.; Лассар, Эндрю Б.; Вайнтрауб, Гарольд; Балтимор, Дэвид (11 августа 1989 г.). «Взаимодействия между гетерологичными белками спираль-петля-спираль создают комплексы, которые специфически связываются с общей последовательностью ДНК». Клетка . 58 (3): 537–44. дои : 10.1016/0092-8674(89)90434-0 . ПМИД 2503252 . S2CID 29339773 .
- ^ Муньос, Э; Брюэр, М; Бэйлер, Р. (сентябрь 2002 г.). «Циркадная транскрипция: МЫШЛЕНИЕ ВНЕ ЭЛЕКТРОННОЙ БОКСА» . J Биол Хим . 277 (39): 36009–36017. дои : 10.1074/jbc.m203909200 . ПМИД 12130638 .
- ^ Ши, Г; Син, Л; Лю, З; и др. (2013). «Двойная роль FBXL3 в циркадных петлях обратной связи млекопитающих важна для определения периода и устойчивости часов» . Proc Natl Acad Sci США . 110 (12): 4750–5. Бибкод : 2013PNAS..110.4750S . дои : 10.1073/pnas.1302560110 . ПМК 3606995 . ПМИД 23471982 .
- ^ Гордан, Р; Шен, Н; Дрор, я; Чжоу, Т; Хортон, Дж; Рохс, Р; Булык, МЛ. (апрель 2013 г.). «Геномные регионы, фланкирующие сайты связывания E-Box, влияют на специфичность связывания ДНК факторов транскрипции bHLH через форму ДНК» . Представитель ячейки . 3 (4): 1093–104. дои : 10.1016/j.celrep.2013.03.014 . ПМК 3640701 . ПМИД 23562153 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- E-Box + Elements в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)