HDAC10

HDAC10
Идентификаторы
Псевдонимы	HDAC10 , HD10, деацетилаза гистонов 10
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 608544 ; МГИ : 2158340 ; Гомологен : 23749 ; Генные карты : HDAC10 ; OMA : HDAC10 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	50,251,405 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	89,012,903 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; right uterine tube; ; right hemisphere of cerebellum; ; anterior pituitary; ; mucosa of transverse colon; ; spleen; ; right ovary; ; canal of the cervix; ; right frontal lobe; ; left ovary;
	Top expressed in
	granulocyte; ; right kidney; ; muscle of thigh; ; esophagus; ; lip; ; proximal tubule; ; neural layer of retina; ; lacrimal gland; ; mesenteric lymph nodes; ; neural tube;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); protein deacetylase activity; histone deacetylase binding; protein binding; enzyme binding; hydrolase activity; histone deacetylase activity; zinc ion binding; deacetylase activity; acetylputrescine deacetylase activity; acetylspermidine deacetylase activity; metal ion binding;
Cellular component	cytoplasm; histone deacetylase complex; nucleoplasm; nucleus;
Biological process	histone H3 deacetylation; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; protein deacetylation; oligodendrocyte development; negative regulation of transcription, DNA-templated; histone deacetylation; chromatin organization; macroautophagy; positive regulation of mismatch repair; peptidyl-lysine deacetylation; homologous recombination; polyamine deacetylation; spermidine deacetylation; DNA repair; DNA recombination; autophagy; cellular response to DNA damage stimulus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	83933
	170787
	ENSG00000100429
	ENSMUSG00000062906
	Q969S8 ; Q08AP5
	Q6P3E7
	НМ_032019 ; НМ_001159286
	НМ_199198
	НП_001152758 ; НП_114408
	НП_954668
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гистондеацетилаза 10 — это фермент , который у человека кодируется HDAC10 геном . ^[5]^[6]^[7]

Ацетилирование ядерных частиц гистонов модулирует структуру хроматина и экспрессию генов. Противоположные ферментативные активности ацетилтрансфераз гистонов и деацетилаз гистонов, таких как HDAC10, определяют статус ацетилирования хвостов гистонов (Kao et al., 2002). [предоставлено OMIM] ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что HDAC10 взаимодействует с деацетилазой гистонов 2. ^[8] и ко-репрессор ядерных рецепторов 2 . ^[8]

См. также

Гистоновая деацетилаза

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100429 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062906 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Као ХИ, Ли Ч., Комаров А., Хан К.С., Эванс Р.М. (январь 2002 г.). «Выделение и характеристика HDAC10 млекопитающих, новой деацетилазы гистонов» . J Биол Хим . 277 (1): 187–93. дои : 10.1074/jbc.M108931200 . ПМИД 11677242 .
^ Гвардиола А.Р., Яо Т.П. (январь 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика новой гистондеацетилазы HDAC10» . J Биол Хим . 277 (5): 3350–6. дои : 10.1074/jbc.M109861200 . ПМИД 11726666 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: деацетилаза гистонов HDAC10 10» .
^ Jump up to: ^а ^б Фишер, Дениз Д; Кай Ричард; Бхатия Умеш; Ассельбергс Фред AM; Сун Чуаньчжэн; Терри Роберт; Трогани Нэнси; Видмер Роланд; Атаджа Питер; Коэн Далия (февраль 2002 г.). «Выделение и характеристика новой деацетилазы гистонов класса II, HDAC10» . Ж. Биол. Хим . 277 (8). США: 6656–66. дои : 10.1074/jbc.M108055200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11739383 .

Дальнейшее чтение

Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Данэм И., Симидзу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .
Фишер Д.Д., Кай Р., Бхатия У. и др. (2002). «Выделение и характеристика новой деацетилазы гистонов класса II, HDAC10» . Ж. Биол. Хим . 277 (8): 6656–66. дои : 10.1074/jbc.M108055200 . ПМИД 11739383 .
Тонг Дж., Лю Дж., Бертос Н.Р., Ян XJ (2002). «Идентификация HDAC10, новой деацетилазы гистонов человека класса II, содержащей богатый лейцином домен» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (5): 1114–23. дои : 10.1093/нар/30.5.1114 . ПМЦ 101247 . ПМИД 11861901 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Родригес М., Юй Х, Чен Дж., Сунъян З. (2004). «Специфичность связывания фосфопептидов COOH-концевых доменов BRCA1 (BRCT)» . Ж. Биол. Хим . 278 (52): 52914–8. дои : 10.1074/jbc.C300407200 . ПМИД 14578343 .
Хиллман Р.Т., Грин Р.Э., Бреннер С.Е. (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК» . Геном Биол . 5 (2): С8. дои : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . ПМЦ 395752 . ПМИД 14759258 .
Осада Х., Татемацу Ю., Сайто Х. и др. (2004). «Снижение экспрессии генов деацетилазы гистонов класса II связано с плохим прогнозом у пациентов с раком легких» . Межд. Дж. Рак . 112 (1): 26–32. дои : 10.1002/ijc.20395 . ПМИД 15305372 . S2CID 23452893 .
Коллинз Дж.Э., Райт К.Л., Эдвардс К.А. и др. (2005). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома» . Геном Биол . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК 545604 . ПМИД 15461802 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .

Внешние ссылки

HDAC10+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 22 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100429 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062906 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11677242-5] Као ХИ, Ли Ч., Комаров А., Хан К.С., Эванс Р.М. (январь 2002 г.). «Выделение и характеристика HDAC10 млекопитающих, новой деацетилазы гистонов» . J Биол Хим . 277 (1): 187–93. дои : 10.1074/jbc.M108931200 . ПМИД 11677242 .

[pmid11726666-6] Гвардиола А.Р., Яо Т.П. (январь 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика новой гистондеацетилазы HDAC10» . J Биол Хим . 277 (5): 3350–6. дои : 10.1074/jbc.M109861200 . ПМИД 11726666 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: деацетилаза гистонов HDAC10 10» .

[pmid11739383-8] Jump up to: ^а ^б Фишер, Дениз Д; Кай Ричард; Бхатия Умеш; Ассельбергс Фред AM; Сун Чуаньчжэн; Терри Роберт; Трогани Нэнси; Видмер Роланд; Атаджа Питер; Коэн Далия (февраль 2002 г.). «Выделение и характеристика новой деацетилазы гистонов класса II, HDAC10» . Ж. Биол. Хим . 277 (8). США: 6656–66. дои : 10.1074/jbc.M108055200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11739383 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

v т и Гидролазы : углеродно-азотные непептидные ( EC 3,5)
3.5.1 : Линейные амиды/ Амидогидролазы	Аспарагиназа Глутаминаза Уреаза Биотинидаза Аминоацилаза ACY1 Аспартоацилаза (ACY2) ACY3 Керамидаза Аспартилглюкозаминидаза Гидролаза амидов жирных кислот Гистоновая деацетилаза Сиртуин
3.5.2 : Циклические амиды/ Амидогидролазы	Барбитураза Бета-лактамазы Дигидрооротаза
3.5.3 : Линейные амидины/ Уреогидролазы	Аргиназа Агматиназа Белково-аргининдезаминаза
3.5.4 : Циклические амидины/ Аминогидролазы	Гуаниндезаминаза Аденозиндезаминаза АМФ дезаминаза Инозинмонофосфатсинтаза ДКМП дезаминаза ГТФ-циклогидролаза I Цитидиндезаминаза АИКДА Цитидиндезаминаза, индуцированная активацией
3.5.5 : Нитрилы/ Аминогидролазы	Нитрилаза
3.5.99 : Другое	Рибофлавиназа Тиаминаза II

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )