МТА2
МТА2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | MTA2 , MTA1L1, PID, метастазы, связанные с 1 членом семьи 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | ОМИМ : 603947 ; МГИ : 1346340 ; Гомологен : 3480 ; Генные карты : MTA2 ; ОМА : МТА2 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Белок, ассоциированный с метастазами МТА2, представляет собой белок , который у человека кодируется МТА2 геном . [5] [6]
MTA2 является вторым членом семейства генов MTA. [5] [7] [8] Белок MTA2 локализуется в ядре и является компонентом ремоделирования нуклеосом и комплекса деацетилирования ( NuRD ). [8] Подобно члену семейства-основателя MTA1 , MTA2 действует как фактор ремоделирования хроматина и регулирует экспрессию генов. [9] [10] MTA2 сверхэкспрессируется при раке человека, и его нерегулируемый уровень хорошо коррелирует с инвазивностью рака и агрессивными фенотипами. [11]
Открытие
[ редактировать ]Первоначально MTA2 был признан MTA1-подобным геном 1, названным MTA1-L1, в результате крупномасштабного секвенирования случайно выбранных клонов из библиотек кДНК человека в 1999 году. [5] Подсказки о роли MTA2 в экспрессии генов были получены благодаря ассоциации полипептидов MTA2 с комплексом NuRD в протеомном исследовании. [7] За этим последовало целенаправленное клонирование мышиного Mta2 в 2001 году. [12]
Генные и сплайсированные варианты
[ редактировать ]МТА2 локализуется на хромосоме 11q12-q13.1 у человека и на хромосоме 19B у мышей. Человеческий ген MTA2 длиной 8,6 т.п.н. содержит 20 экзонов и семь транскриптов, включая три транскрипта, кодирующих белок, но, по прогнозам, он кодирует два полипептида из 688 аминокислот и 495 аминокислот. [13] Остальные четыре транскрипта MTA2 представляют собой некодирующие транскрипты РНК размером от 532 до 627 пар оснований. Мышиный Mta2 состоит из транскрипта, кодирующего белок размером 3,1 т.п.н., кодирующего белок из 668 аминокислот, и пяти транскриптов некодирующих РНК длиной от 620 до 839 п.н.
Структура
[ редактировать ]Аминокислотная последовательность MTA2 имеет гомологию 68,2% с . последовательностью MTA1 Домены MTA2 включают BAH (бром-смежную гомологию), ELM2 (egl-27 и гомологию MTA1), домен SANT (SWI, ADA2, N-CoR, TFIIIB-B) и GATA-подобный цинковый палец . [14] [15] [16] MTA2 ацетилируется по лизину 152 в домене BAH. [17]
Функция
[ редактировать ]Этот ген кодирует белок, который был идентифицирован как компонент NuRD , комплекса деацетилазы ремоделирования нуклеосом, обнаруженного в ядре клеток человека. Он демонстрирует очень широкий спектр экспрессии и сильно экспрессируется во многих тканях. Он может представлять собой одного из членов небольшого семейства генов, которые кодируют разные, но родственные белки, прямо или косвенно участвующие в регуляции транскрипции. Их косвенное влияние на регуляцию транскрипции может включать ремоделирование хроматина . [6]
MTA2 ингибирует функции трансактивации рецепторов эстрогена и участвует в выработке гормонов, независимых от клеток рака молочной железы. [11] MTA2 участвует в циркадном ритме через комплекс CLOCK-BMAL1. MTA2 ингибирует экспрессию генов-мишеней благодаря своей способности взаимодействовать с комплексами ремоделирования хроматина и модулирует пути, участвующие в клеточных функциях, включая инвазию, апоптоз, эпителиально-мезенхимальный переход и рост нормальных и раковых клеток. [9] [11]
Регулирование
[ редактировать ]Экспрессия MTA2 стимулируется транскрипционным фактором Sp1. [12] [18] и репрессирован Кайсо . [19] Регуляторная активность MTA2 модулируется путем его ацетилирования гистоновой ацетилазой p300 [12]. Экспрессия MTA2 ингибируется Rho GDIa в клетках рака молочной железы. [20] и человеческими β-дефензинами в клетках рака толстой кишки. [21] МикроРНК-146a и миР-34a также регулируют уровни мРНК MTA2 посредством посттранскрипционного механизма. [22] [23] [24]
Цели
[ редактировать ]MTA2 деацетилирует рецепторы эстрогена альфа и р53 и ингибирует их функции трансактивации. [25] [26] MTA2 подавляет экспрессию E-кадгерина в клетках немелкоклеточного рака легких. [27] но стимулирует экспрессию IL-11 в клетках рака желудка. [28] Комплекс ремоделирования хроматина, содержащий MTA2, нацелен на комплекс CLOCK - BMAL1 . [29]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что MTA2 взаимодействует с:
Примечания
[ редактировать ]Версия этой статьи 2016 года была обновлена внешним экспертом в рамках модели двойной публикации. Соответствующая академическая рецензируемая статья была опубликована в журнале Gene и может цитироваться как: Ракеш Кумар, Руй-Ан Ван (15 мая 2016 г.). «Структура, экспрессия и функции генов МТА» . Джин . Серия обзоров Gene Wiki. 582 (2): 112–21. дои : 10.1016/J.GENE.2016.02.012 . ISSN 0378-1119 . ПМЦ 4785049 . ПМИД 26869315 . Викиданные Q28273245 . |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000149480 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000071646 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Jump up to: а б с Футамура М., Нишимори Х., Ширацучи Т., Саджи С., Накамура Ю., Токино Т. (1999). «Молекулярное клонирование, картирование и характеристика нового человеческого гена MTA1-L1, демонстрирующего гомологию с геном, связанным с метастазами, MTA1» . Журнал генетики человека . 44 (1): 52–6. дои : 10.1007/s100380050107 . ПМИД 9929979 .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: метастазы MTA2 связаны с 1 семьей, членом 2» .
- ^ Jump up to: а б Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Гены и развитие . 13 (15): 1924–35. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК 316920 . ПМИД 10444591 .
- ^ Jump up to: а б Ли ДК, Кумар Р. (2015). Раскрытие сложности и функций корегуляторов МТА при раке человека . Том. 127. стр. 1–47. дои : 10.1016/bs.acr.2015.04.005 . ISBN 9780128029206 . ПМИД 26093897 .
{{cite book}}
:|journal=
игнорируется ( помогите ) - ^ Jump up to: а б Сен Н., Гуй Б., Кумар Р. (декабрь 2014 г.). «Физиологические функции белков семейства МТА» . Обзоры рака и метастазов . 33 (4): 869–77. дои : 10.1007/s10555-014-9514-4 . ПМЦ 4245464 . ПМИД 25344801 .
- ^ Кумар Р. (декабрь 2014 г.). «Функции и клиническое значение белков МТА при раке человека. Предисловие» . Обзоры рака и метастазов . 33 (4): 835. doi : 10.1007/s10555-014-9509-1 . ПМЦ 4245326 . ПМИД 25348751 .
- ^ Jump up to: а б с Ковингтон КР, Фукуа С.А. (декабрь 2014 г.). «Роль MTA2 в развитии рака человека» . Обзоры рака и метастазов . 33 (4): 921–8. дои : 10.1007/s10555-014-9518-0 . ПМЦ 4425804 . ПМИД 25394532 .
- ^ Jump up to: а б Ся Л, Чжан Ю (май 2001 г.). «Факторы транскрипции семейства Sp1 и ETS регулируют экспрессию гена Mta2 у мышей». Джин . 268 (1–2): 77–85. дои : 10.1016/s0378-1119(01)00429-2 . ПМИД 11368903 . S2CID 20705099 .
- ^ Кумар Р., Ван Р.А. (май 2016 г.). «Структура, экспрессия и функции генов МТА» . Джин . 582 (2): 112–21. дои : 10.1016/j.gene.2016.02.012 . ПМЦ 4785049 . ПМИД 26869315 .
- ^ Миллард С.Дж., Уотсон П.Дж., Селардо И., Гордиенко Ю., Коули С.М., Робинсон К.В., Фэйролл Л., Швабе Дж.В. (июль 2013 г.). «HDAC класса I имеют общий механизм регуляции с помощью инозитолфосфатов» . Молекулярная клетка . 51 (1): 57–67. doi : 10.1016/j.molcel.2013.05.020 . ПМЦ 3710971 . ПМИД 23791785 .
- ^ Алькарни С.С., Мурти А., Чжан В., Пшевлока М.Р., Сильва А.П., Уотсон А.А., Лейон С., Пей XY, Смитс А.Х., Клот С.Л., Ван Х., Шеперд Н.Е., Стоукс П.Х., Блобель Г.А., Вермюлен М., Гловер Д.М., Маккей Дж.П. , Лауэ ЭД (август 2014 г.). «Взгляд на архитектуру комплекса NuRD: структура субкомплекса RbAp48-MTA1» . Журнал биологической химии . 289 (32): 21844–55. дои : 10.1074/jbc.M114.558940 . ПМЦ 4139204 . ПМИД 24920672 .
- ^ Миллард С.Дж., Фэйролл Л., Швабе Дж.В. (декабрь 2014 г.). «На пути к пониманию структуры и функций MTA1» . Обзоры рака и метастазов . 33 (4): 857–67. дои : 10.1007/s10555-014-9513-5 . ПМЦ 4244562 . ПМИД 25352341 .
- ^ Чжоу Дж., Чжан С., Тан В., Ченг Р., Гонг Х., Чжу Ц. (февраль 2014 г.). «P300 связывается с MTA2 и ацетилирует его, способствуя росту клеток колоректального рака». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 444 (3): 387–90. дои : 10.1016/j.bbrc.2014.01.062 . ПМИД 24468085 .
- ^ Чжоу С, Цзи Дж, Цай Ц, Ши М, Чен Х, Ю Ю, Лю Б, Чжу Цз, Чжан Дж (8 сентября 2013 г.). «MTA2 способствует инвазии клеток рака желудка и транскрипционно регулируется Sp1» . Молекулярный рак . 12 (1): 102. дои : 10.1186/1476-4598-12-102 . ПМЦ 3851872 . ПМИД 24010737 .
- ^ Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует зависимую от метилирования ДНК репрессию через метил-CpG-связывающий белок Kaiso» . Молекулярная клетка . 12 (3): 723–34. doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . ПМИД 14527417 .
- ^ Бароне И., Бруско Л., Гу Г., Селевер Дж., Бейер А., Ковингтон К.Р., Цимельзон А., Ван Т., Хильзенбек С.Г. , Чамнесс Г.К., Андо С., Фукуа С.А. (апрель 2011 г.). «Потеря Rho GDIα и устойчивость к тамоксифену из-за воздействия на рецептор эстрогена α» . Журнал Национального института рака . 103 (7): 538–52. дои : 10.1093/jnci/djr058 . ПМК 3071355 . ПМИД 21447808 .
- ^ Ураки С., Сугимото К., Шираки К., Тамеда М., Инагаки Ю., Огура С., Касаи С., Нодзири К., Йонеда М., Ямамото Н., Такей Ю., Нобори Т., Ито М. (сентябрь 2014 г.). «Человеческий β-дефенсин-3 ингибирует миграцию раковых клеток толстой кишки посредством подавления экспрессии ассоциированного с метастазами 1 семейства, члена 2» . Международный журнал онкологии . 45 (3): 1059–64. дои : 10.3892/ijo.2014.2507 . ПМИД 24969834 .
- ^ Ли Ю, Ванденбум Т.Г., Ван З., Конг Д., Али С., Филип П.А., Саркар Ф.Х. (февраль 2010 г.). «МиР-146а подавляет инвазию клеток рака поджелудочной железы» . Исследования рака . 70 (4): 1486–95. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-09-2792 . ПМК 2978025 . ПМИД 20124483 .
- ^ Каллер М., Лифферс С.Т., Ольеклаус С., Кульманн К., Ре С., Хоффманн Р., Варшайд Б., Хермекинг Х. (август 2011 г.). «Полногеномная характеристика miR-34a, индуцированная изменениями в экспрессии белка и мРНК, с помощью комбинированного импульсного SILAC и анализа микрочипов» . Молекулярная и клеточная протеомика . 10 (8): М111.010462. дои : 10.1074/mcp.M111.010462 . ПМК 3149097 . ПМИД 21566225 .
- ^ Чжан Ю, Ван XF (декабрь 2014 г.). «Посттранскрипционная регуляция семейства МТА с помощью микроРНК в контексте рака» . Обзоры рака и метастазов . 33 (4): 1011–6. дои : 10.1007/s10555-014-9526-0 . ПМЦ 4245459 . ПМИД 25332146 .
- ^ Цуй Ю, Ню А, Пестел Р, Кумар Р, Карран Э.М., Лю Ю, Фукуа С.А. (сентябрь 2006 г.). «Белок 2, ассоциированный с метастазами, является репрессором альфа-рецептора эстрогена, чрезмерная экспрессия которого приводит к независимому от эстрогена росту клеток рака молочной железы человека» . Молекулярная эндокринология . 20 (9): 2020–35. дои : 10.1210/me.2005-0063 . ПМК 4484605 . ПМИД 16645043 .
- ^ Луо Дж, Су Ф, Чен Д, Шайло А, Гу В (ноябрь 2000 г.). «Деацетилирование р53 модулирует его влияние на рост клеток и апоптоз». Природа . 408 (6810): 377–81. Бибкод : 2000Natur.408..377L . дои : 10.1038/35042612 . ПМИД 11099047 . S2CID 4300392 .
- ^ Лу X, Ковалев Г.И., Чанг Х, Каллин Э, Кнудсен Г, Ся Л, Мишра Н, Руис П, Ли Э, Су Л, Чжан Ю (май 2008 г.). «Инактивация компонента NuRD Mta2 вызывает аномальную активацию Т-клеток и волчаночноподобное аутоиммунное заболевание у мышей» . Журнал биологической химии . 283 (20): 13825–33. дои : 10.1074/jbc.M801275200 . ПМК 2376246 . ПМИД 18353770 .
- ^ Чжоу С, Цзи Дж, Цай Ц, Ши М, Чен Х, Ю Ю, Чжу Цз, Чжан Дж (2 мая 2015 г.). «MTA2 усиливает образование колоний и рост опухолей клеток рака желудка посредством IL-11» . БМК Рак . 15 : 343. дои : 10.1186/s12885-015-1366-y . ПМЦ 4419442 . ПМИД 25929737 .
- ^ Ким Дж.Й., Квак П.Б., Вайц С.Дж. (декабрь 2014 г.). «Специфика обратной связи по циркадным часам при целенаправленном восстановлении корепрессора NuRD» . Молекулярная клетка . 56 (6): 738–48. дои : 10.1016/j.molcel.2014.10.017 . ПМИД 25453762 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж Яо Ю.Л., Ян В.М. (октябрь 2003 г.). «Белки 1 и 2, ассоциированные с метастазами, образуют отдельные белковые комплексы с активностью деацетилазы гистонов» . Журнал биологической химии . 278 (43): 42560–8. дои : 10.1074/jbc.M302955200 . ПМИД 12920132 .
- ^ Ю А, Тонг Дж. К., Грозингер С. М., Шрайбер С. Л. (февраль 2001 г.). «CoREST является неотъемлемым компонентом комплекса CoREST-гистондеацетилазы человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (4): 1454–8. Бибкод : 2001PNAS...98.1454Y . дои : 10.1073/pnas.98.4.1454 . ПМК 29278 . ПМИД 11171972 .
- ^ Jump up to: а б с д и Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Гены и развитие . 13 (15): 1924–35. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК 316920 . ПМИД 10444591 .
- ^ Jump up to: а б Ясуи Д., Мияно М., Цай С., Варга-Вайс П., Кохви-Сигемацу Т. (октябрь 2002 г.). «SATB1 нацелен на ремоделирование хроматина, чтобы регулировать работу генов на больших расстояниях» . Природа . 419 (6907): 641–5. Бибкод : 2002Natur.419..641Y . дои : 10.1038/nature01084 . ПМИД 12374985 . S2CID 25822700 .
- ^ Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат на Х-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7234–9. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763 .
- ^ Сакаи Х., Урано Т., Ооката К., Ким М.Х., Хираи Ю., Сайто М., Нодзима Ю., Исикава Ф. (декабрь 2002 г.). «MBD3 и HDAC1, два компонента комплекса NuRD, локализуются в Aurora-A-положительных центросомах в M-фазе» . Журнал биологической химии . 277 (50): 48714–23. дои : 10.1074/jbc.M208461200 . ПМИД 12354758 .
- ^ Сайто М., Исикава Ф. (сентябрь 2002 г.). «mCpG-связывающий домен человеческого MBD3 не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD/Mi2 HDAC1 и MTA2» . Журнал биологической химии . 277 (38): 35434–9. дои : 10.1074/jbc.M203455200 . ПМИД 12124384 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- MTA2 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .