HMGB2

HMGB2
Идентификаторы
Псевдонимы	HMGB2 , HMG2, групповой блок высокой мобильности 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 163906 ; МГИ : 96157 ; Гомологен : 37582 ; GeneCards : HMGB2 ; OMA : HMGB2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	173,334,432 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	57,969,033 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; secondary oocyte; ; amniotic fluid; ; embryo; ; trabecular bone; ; ganglionic eminence; ; bone marrow; ; tibia; ; thymus; ; germinal epithelium;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; ventricular zone; ; granulocyte; ; yolk sac; ; zygote; ; embryo; ; blastocyst; ; embryo; ; morula;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein domain specific binding; DNA-binding transcription factor activity; transcription factor binding; non-sequence-specific DNA binding, bending; single-stranded DNA binding; damaged DNA binding; protein binding; four-way junction DNA binding; cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; RAGE receptor binding; chemoattractant activity; double-stranded DNA binding; DNA binding, bending; supercoiled DNA binding; RNA binding; transcription coactivator activity;
Cellular component	cytoplasm; nucleoplasm; chromosome; extracellular region; nucleolus; perinuclear region of cytoplasm; condensed chromosome; nucleus; extracellular space; protein-containing complex;
Biological process	DNA geometric change; positive regulation of interferon-beta production; nucleosome assembly; DNA recombination; apoptotic DNA fragmentation; male gonad development; regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of endothelial cell proliferation; positive regulation of erythrocyte differentiation; inflammatory response to antigenic stimulus; immune system process; regulation of transcription by RNA polymerase II; response to steroid hormone; chromatin organization; negative regulation of gene expression; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; chemotaxis; response to lipopolysaccharide; positive regulation of gene expression; positive regulation of nuclease activity; defense response to Gram-negative bacterium; negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; V(D)J recombination; spermatogenesis; positive regulation of innate immune response; cell chemotaxis; DNA ligation involved in DNA repair; spermatid nucleus differentiation; positive regulation of DNA binding; innate immune response; negative regulation of transcription, DNA-templated; cellular response to lipopolysaccharide; inflammatory response; positive regulation of megakaryocyte differentiation; regulation of neurogenesis; regulation of stem cell proliferation; DNA topological change; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; defense response to Gram-positive bacterium; positive chemotaxis; chromatin remodeling;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3148
	97165
	ENSG00000164104
	ENSMUSG00000054717
	P26583
	P30681
	НМ_002129 ; НМ_001130688 ; НМ_001130689
	НМ_008252 ; НМ_001363443 ; НМ_001363444 ; НМ_001363445
	НП_001124160 ; НП_001124161 ; НП_002120
	НП_032278 ; НП_001350372 ; НП_001350373 ; НП_001350374
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок группы высокой подвижности B2, также известный как белок группы высокой подвижности 2 (HMG-2), представляет собой белок , который у человека кодируется HMGB2 геном . ^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства белков негистоновой хромосомной группы с высокой подвижностью . ^[7] Белки этого семейства ассоциированы с хроматином и повсеместно распространены в ядре высших эукариотических клеток. Исследования in vitro показали, что этот белок способен эффективно изгибать ДНК и образовывать кольца ДНК. Эти исследования предполагают роль в облегчении кооперативных взаимодействий между цис-действующими белками за счет повышения гибкости ДНК. что этот белок участвует в заключительном этапе лигирования в процессах соединения концов ДНК, репарации двухцепочечных разрывов ДНК и рекомбинации V (D) J. Сообщалось также , ^[6]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164104 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000054717 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Маджумдар А., Браун Д., Керби С., Рудзински И., Полте Т., Рандхава З., Зейдман М.М. (декабрь 1991 г.). «Последовательность кДНК HMG2 человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 19 (23): 6643. doi : 10.1093/nar/19.23.6643 . ПМК 329240 . ПМИД 1754403 .
^ Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: Высокомобильный групповой бокс HMGB2 2» .
^ Муругесапиллай Д., Макколи М.Дж., Махер Л.Д., Уильямс М.К. (15 ноября 2016 г.). «Одномолекулярные исследования высокомобильных белков, изгибающих архитектурную ДНК группы В» . Биофизические обзоры . 9 (1): 17–40. дои : 10.1007/s12551-016-0236-4 . ПМЦ 5331113 . ПМИД 28303166 .

Дальнейшее чтение

Александр С., Ли В.В., Ли А.С. (декабрь 1992 г.). «КДНК HMG2 человека с новой 3'-нетранслируемой областью» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (23): 6413. doi : 10.1093/nar/20.23.6413 . ПМЦ 334538 . ПМИД 1475204 .
Сиракава Х., Ёсида М. (апрель 1992 г.). «Структура гена, кодирующего белок HMG2 человека» . Журнал биологической химии . 267 (10): 6641–5. дои : 10.1016/S0021-9258(19)50475-6 . ПМИД 1551873 .
Бернуэс Дж., Эспель Э., Кероль Э. (май 1986 г.). «Идентификация основных гистон-связывающих доменов HMG1 и HMG2». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 866 (4): 242–51. дои : 10.1016/0167-4781(86)90049-7 . ПМИД 3697355 .
Цвиллинг С., Кениг Х., Вирт Т. (март 1995 г.). «Белок 2 группы высокой подвижности функционально взаимодействует с доменами POU октамерных факторов транскрипции» . Журнал ЭМБО . 14 (6): 1198–208. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07103.x . ПМК 398197 . ПМИД 7720710 .
Шикинд Б.М., Ким Дж., Шарп П.А. (июнь 1995 г.). «Активация комплекса ТФИИД-ТФИИА с помощью ГМГ-2» . Гены и развитие . 9 (11): 1354–65. дои : 10.1101/gad.9.11.1354 . ПМИД 7797075 .
Полл Т.Т., Хейкинсон М.Дж., Джонсон Р.К. (август 1993 г.). «Неспецифические ДНК-связывающие и изгибающие белки HMG1 и HMG2 способствуют сборке сложных нуклеопротеиновых структур» . Гены и развитие . 7 (8): 1521–34. дои : 10.1101/gad.7.8.1521 . ПМИД 8339930 .
Ваншура С., Шенмейкерс Э.Ф., Гюисманс К., Бартницке С., Ван де Вен В.Дж., Буллрдик Дж. (январь 1996 г.). «Картирование человеческого гена HMG2 с 4q31». Геномика . 31 (2): 264–5. дои : 10.1006/geno.1996.0046 . ПМИД 8824816 .
Нагаки С., Ямамото М., Юмото Ю., Сиракава Х., Ёсида М., Тераока Х. (май 1998 г.). «Негистоновые хромосомные белки HMG1 и 2 усиливают реакцию лигирования двухцепочечных разрывов ДНК». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 246 (1): 137–41. дои : 10.1006/bbrc.1998.8589 . ПМИД 9600082 .
Буньяратанакорнкит В., Мелвин В., Прендергаст П., Альтманн М., Ронфани Л., Бьянки М.Э., Тарасевичене Л., Нордин С.К., Аллегретто Э.А., Эдвардс Д.П. (август 1998 г.). «Белки 1 и 2 группы хроматина с высокой подвижностью функционально взаимодействуют с рецепторами стероидных гормонов, усиливая их связывание с ДНК in vitro и транскрипционную активность в клетках млекопитающих» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (8): 4471–87. дои : 10.1128/mcb.18.8.4471 . ПМК 109033 . ПМИД 9671457 .
Юмото Ю, Сиракава Х, Ёсида М, Сува А, Ватанабэ Ф, Тераока Х (сентябрь 1998 г.). «Белки групп 1 и 2 с высокой подвижностью могут функционировать как ДНК-связывающие регуляторные компоненты для ДНК-зависимой протеинкиназы in vitro». Журнал биохимии . 124 (3): 519–27. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022143 . ПМИД 9722660 .
Айдинис В., Бональди Т., Бельтрам М., Сантагата С., Бьянки М.Е., Спанопулу Э. (октябрь 1999 г.). «Гомеодомен RAG1 рекрутирует HMG1 и HMG2 для облегчения связывания рекомбинационной сигнальной последовательности и усиления внутренней активности RAG1-RAG2 по изгибу ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (10): 6532–42. дои : 10.1128/mcb.19.10.6532 . ПМЦ 84623 . ПМИД 10490593 .
Бутерони С., Де Феличи М., Шёлер Х.Р., Пеше М. (декабрь 2000 г.). «Скрининг фагового дисплея выявляет связь между специфичным для зародышевой линии фактором транскрипции Oct-4 и множеством клеточных белков». Журнал молекулярной биологии . 304 (4): 529–40. дои : 10.1006/jmbi.2000.4238 . ПМИД 11099378 .
Строс М., Одзаки Т., Бачикова А., Кагеяма Х., Накагавара А. (март 2002 г.). «HMGB1 и HMGB2 клеточно-специфично подавляют p53- и p73-зависимую специфичную для последовательностей трансактивацию промотора гена Bax человека» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7157–64. дои : 10.1074/jbc.M110233200 . ПМИД 11748232 .
Фан З., Бересфорд П.Дж., Чжан Д., Либерман Дж. (апрель 2002 г.). «HMG2 взаимодействует с белком сборки нуклеосомы SET и является мишенью гранзима А цитотоксической протеазы Т-лимфоцитов» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (8): 2810–20. дои : 10.1128/MCB.22.8.2810-2820.2002 . ПМК 133744 . ПМИД 11909973 .
Дюбуа Т., Хауэлл С., Землячкова Е., Эйткен А. (апрель 2002 г.). «Идентификация белков-партнеров, взаимодействующих с казеинкиназой Iальфа» . Письма ФЭБС . 517 (1–3): 167–71. Бибкод : 2002FEBSL.517..167D . дои : 10.1016/S0014-5793(02)02614-5 . ПМИД 12062430 . S2CID 84792445 .
Фан З., Бересфорд П.Дж., Чжан Д., Сюй З., Новина К.Д., Йошида А., Помье Ю., Либерман Дж. (февраль 2003 г.). «Расщепление белка окислительной репарации Ape1 усиливает гибель клеток, опосредованную гранзимом А». Природная иммунология . 4 (2): 145–53. дои : 10.1038/ni885 . ПМИД 12524539 . S2CID 29433133 .
Lv X, Сюй Д.Д., Лю Д.П., Ли Л, Хао Д.Л., Лян CC (2003). «Белок 2 группы высокой подвижности может участвовать в регуляции области локус-контроля кластера генов бета-глобина». Биохимия и клеточная биология . 80 (6): 765–70. дои : 10.1139/o02-164 . ПМИД 12555809 .
Палье С., Скаффиди П., Шопино-Пруст С., Агрести А., Нордманн П., Бьянки М.Э., Марешаль В. (август 2003 г.). «Ассоциация белков хроматина с высокой подвижностью группового бокса (HMGB) 1 и HMGB2 с митотическими хромосомами» . Молекулярная биология клетки . 14 (8): 3414–26. doi : 10.1091/mbc.E02-09-0581 . ПМК 181577 . ПМИД 12925773 .
Эйрд К.М., Ивасаки О., Косенков А.В., Танизава Х., Фатхутдинов Н., Битлер Б.Г., Ле Л., Алиса Г., Янг Т.Л., Джонсон Ф.Б., Нома К., Чжан Р. (октябрь 2016 г.). «HMGB2 управляет ландшафтом хроматина локусов генов секреторного фенотипа, связанных со старением» (PDF) . Журнал клеточной биологии . 215 (3): 325–334. дои : 10.1083/jcb.201608026 . ПМК 5100296 . ПМИД 27799366 . Потеря HMGB2 (белковый блок группы высокой подвижности 2) во время старения SASP (секреторный фенотип, связанный со старением) притупляет экспрессию гена , позволяя распространять репрессивный гетерохроматин в локусы гена SASP. Это коррелирует с включением локусов гена SASP в SAHF (очаги гетерохроматина, связанные со старением), что, в свою очередь, подавляет экспрессию гена SASP.