НФИКС

НФИКС
Идентификаторы
Псевдонимы	NFIX , MRSHSS, NF1A, SOTOS2, ядерный фактор IX, NF1-X, NF-I/X, CTF, MALNS
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 164005 ; МГИ : 97311 ; Гомологен : 1872 ; GeneCards : NFIX ; OMA : NFIX — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	13,098,796 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	84,800,344 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	nipple; ; ganglionic eminence; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; postcentral gyrus; ; internal globus pallidus; ; ventral tegmental area; ; tendon of biceps brachii; ; buccal mucosa cell; ; cardia; ; urethra;
	Top expressed in
	Rostral migratory stream; ; internal carotid artery; ; external carotid artery; ; ankle; ; utricle; ; tunica media of zone of aorta; ; subiculum; ; ascending aorta; ; lacrimal gland; ; vestibular membrane of cochlear duct;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; DNA binding; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	intracellular anatomical structure; nucleus;
Biological process	DNA replication; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	4784
	18032
	ENSG00000008441
	ENSMUSG00000001911
	Q14938
	P70257
показывать НМ_001271043 ; НМ_001271044 ; НМ_002501 ; НМ_001365902 ; НМ_001365982 ;
	NM_001365983; NM_001365984; NM_001365985; NM_001378404; NM_001378405
	НМ_001081981 ; НМ_001081982 ; НМ_001297601 ; НМ_010906
показывать НП_001257972 ; НП_001257973 ; НП_002492 ; НП_001352831 ; НП_001352911 ;
	NP_001352912; NP_001352913; NP_001352914; NP_001365333; NP_001365334
показывать НП_001075450 ; НП_001075451 ; НП_001284530 ; НП_035036 ; НП_001357981 ;
	NP_001357982; NP_001357983; NP_001357984; NP_001357985; NP_001357986; NP_001357987; NP_001357988; NP_001357989; NP_001357990; NP_001357991; NP_001357992
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ядерный фактор 1 X-типа — это белок , который у человека кодируется NFIX геном . ^[5]^[6]^[7] NFI-X3, сплайсинговый вариант NFIX, регулирует глиальный фибриллярный кислый белок и YKL-40 в астроцитах . ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что Nfix взаимодействует с белком SKI. ^[9] и также известно, что он взаимодействует с AP-1 . ^[8] Было показано, что NFI-X3 взаимодействует со STAT3 . ^[8]

Было показано, что в эмбриональных клетках Nfix регулирует образование промежуточных клеток-предшественников (IPC), способствуя транскрипции inscuteable белка (INSC). INSC регулирует ориентацию веретена, чтобы облегчить деление клеток радиальной глии на IPC. Считается, что Nfix необходим для фиксации потомства глии в промежуточных предшественниках. Мутации могут вызывать перепроизводство радиальной глии, нарушение и несвоевременное развитие IPC и недостаточное производство нейронов. ^[10]

При развитии взрослых время дифференцировки нейронов регулируется Nfix, что способствует постоянному росту гиппокампа и правильной функции памяти. Nfix может подавлять экспрессию олигодендроцитов , поэтому клетки продолжают участвовать в развитии нейронов внутри зубчатой извилины . Промежуточные клетки-предшественники могут делиться с образованием нейробластов . Нейроны, продуцируемые нулевыми IPC Nfix, не созревают, обычно умирают и могут способствовать когнитивным нарушениям. ^[11]

Nfix взаимодействует с миостатином и регулирует временное течение регенерации мышц посредством модуляции экспрессии миостатина. Nfix также ингибирует фенотип медленно сокращающихся мышц. ^[12]^[13]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000008441 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001911 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Зайзенбергер К., Виннакер Э.Л., Шертан Х. (август 1993 г.). «Локализация гена человеческого ядерного фактора I/X (NFI/X) на хромосоме 19p13 и обнаружение пяти других родственных локусов в 1p21-22, 1q42-43, 5q15, 11p13 и 20q13 с помощью FISH». Хум Жене . 91 (6): 535–537. дои : 10.1007/bf00205076 . ПМИД 8340106 . S2CID 22365562 .
^ Цянь Ф., Крузе У., Лихтер П., Сиппель А.Е. (декабрь 1995 г.). «Хромосомная локализация четырех генов (NFIA, B, C и X) ядерного фактора транскрипции человека I с помощью FISH». Геномика . 28 (1): 66–73. дои : 10.1006/geno.1995.1107 . ПМИД 7590749 .
^ «Ген Энтрез: ядерный фактор NFIX I/X (CCAAT-связывающий транскрипционный фактор)» .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Сингх С.К., Бхардвадж Р., Вильчинска К.М., Думур С.И., Кордула Т. (ноябрь 2011 г.). «Комплекс ядерного фактора I-X3 и STAT3 регулирует миграцию астроцитов и глиомы посредством секретируемого гликопротеина YKL-40» . Ж. Биол. Хим . 286 (46): 39893–39903. дои : 10.1074/jbc.M111.257451 . ПМК 3220556 . ПМИД 21953450 .
^ Тарапор П., Ричмонд С., Чжэн Г., Коэн С.Б., Келдер Б., Копчик Дж., Крузе У., Сиппель А.Е., Кольменарес С., Ставнезер Э. (октябрь 1997 г.). «Связывание ДНК и активация транскрипции онкобелком Ski, опосредованным взаимодействием с NFI» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (19): 3895–3903. дои : 10.1093/нар/25.19.3895 . ПМК 146989 . ПМИД 9380514 .
^ Харрис, Лахлан; Залуки, Орессия; Гобиус, Илан; Макдональд, Ханна; Осинки, Джейсон; Харви, Трейси Дж.; Эссебье, Александра; Видович, Диана; Гладвин-Нг, Иван; Бёрн, Томас Х.; Хенг, Джулиан И.; Ричардс, Линда Дж.; Гроностайски, Ричард М.; Пайпер, Майкл (28 октября 2016 г.). «Транкрипционная регуляция генерации промежуточных клеток-предшественников во время развития гиппокампа» . Разработка . 143 (24): 4620–4630. дои : 10.1242/dev.140681 . ПМК 5201028 . ПМИД 27965439 .
^ Харрис, Лахлан; Залуки, Орессия; Клеман, Оливье; Фрейзер, Джеймс; Матузельски, Элиза; Оиси, Сабрина; Харви, Трейси Дж.; Бёрн, Томас Х.Дж.; Хенг, Джулиан И.; Ричардс, Линда Дж.; Гроностайски, Ричард М.; Пайпер, Майкл (07 февраля 2018 г.). «Нейрогенная дифференцировка нейрональных стволовых клеток и клеток-предшественников гиппокампа зависит от экспрессии NFIX» . Разработка . 145 (3): 1–12. дои : 10.1242/dev.155689 . ПМИД 29437824 .
^ Омайри, Салех; Мацакас, Антониос; Дегенс, Ганс; Крец, Оливер; Ханссон, Кент-Арне; Солбро, Андреас Вованг; Брюусгаард, Джо К.; Йох, Барбара; Сартори, Роберта; Джаллуру, Натаса; Митчелл, Роберт; Коллинз-Хупер, Генри; Фостер, Кейт; Пастернак, Арья; Ритвос, Олли; Сандри, Марко; Наркар, Виханг; Суонн, Джонатан Р.; Хубер, Тобиас Б.; Патель, Кетан (5 августа 2016 г.). Коссу, Джулио (ред.). «Улучшение физических упражнений и регенеративной способности на мышиной модели, которая нарушает ограничения по размеру окислительных мышечных волокон | eLife» . электронная жизнь . 5 : е16940. doi : 10.7554/eLife.16940 . ПМЦ 4975572 . ПМИД 27494364 .
^ Росси, Джулиана; Антонини, Стефания; Бонфанти, Кьяра; Монтеверде, Стефания; Веццали, Кьяра; Таджбахш, Шахрагим; Коссу, Джулио; Мессина, Грациелла (8 марта 2016 г.). «Nfix регулирует временное прогрессирование регенерации мышц посредством модуляции экспрессии миостатина» . Отчеты по ячейкам . 14 (9): 2238–2249. дои : 10.1016/j.celrep.2016.02.014 . ПМЦ 4793149 . ПМИД 26923583 .

Дальнейшее чтение

Апт Д., Лю Ю, Бернард ХУ (1994). «Клонирование и функциональный анализ сплайсированных изоформ ядерного фактора IX человека: вмешательство в активацию транскрипции с помощью NFI/CTF специфичным для типа клеток способом» . Нуклеиновые кислоты Рез . 22 (19): 3825–3833. дои : 10.1093/нар/22.19.3825 . ПМК 308376 . ПМИД 7937100 .
Самнер С., Шинохара Т., Дарем Л., Трауб Р., Майор Э.О., Амемия К. (1996). «Экспрессия нескольких классов семейства ядерного фактора-1 в развивающемся мозге человека: дифференциальная экспрессия двух классов генов NF-1» . Дж. Нейровирол . 2 (2): 87–100. дои : 10.3109/13550289609146542 . ПМИД 8799200 .
Вендлер В.М., Креммер Э., Фёрстер Р., Виннакер Э.Л. (1997). «Идентификация пирина, нового высококонсервативного ядерного белка» . Ж. Биол. Хим . 272 (13): 8482–8489. дои : 10.1074/jbc.272.13.8482 . ПМИД 9079676 .
Лю Ю, Бернард ХУ, кв. D (1997). «NFI-B3, новый репрессор транскрипции семейства ядерного фактора I, генерируется путем альтернативного процессинга РНК» . Ж. Биол. Хим . 272 (16): 10739–10745. дои : 10.1074/jbc.272.16.10739 . ПМИД 9099724 .
Тарапор П., Ричмонд С., Чжэн Г., Коэн С.Б., Келдер Б., Копчик Дж., Крузе У., Сиппель А.Е., Кольменарес С., Ставнезер Э. (1997). «Связывание ДНК и активация транскрипции онкобелком Ski, опосредованным взаимодействием с NFI» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (19): 3895–3903. дои : 10.1093/нар/25.19.3895 . ПМК 146989 . ПМИД 9380514 .
Мюллер К., Мермод Н. (2000). «Взаимодействующий с гистонами домен ядерного фактора I активирует репликацию ДНК обезьяньего вируса 40 in vivo» . Ж. Биол. Хим . 275 (3): 1645–1650. дои : 10.1074/jbc.275.3.1645 . ПМИД 10636857 .
Наказато М., Чунг Х.К., Ульянич Л., Грассадония А., Сузуки К., Кон Л.Д. (2000). «Репрессия тиреоглобулина экспрессии гена фактора транскрипции 1 (TTF-1) щитовидной железы опосредована снижением связывания ДНК белков ядерного фактора I, которые контролируют конститутивную экспрессию TTF-1» . Мол. Клетка. Биол . 20 (22): 8499–8512. дои : 10.1128/MCB.20.22.8499-8512.2000 . ПМК 102156 . ПМИД 11046146 .
Имагава М., Сакауэ Р., Танабэ А., Осада С., Нисихара Т. (2000). «Для ядерной транслокации ядерного фактора 1-А необходимы два сигнала ядерной локализации» . ФЭБС Летт . 484 (2): 118–124. дои : 10.1016/S0014-5793(00)02119-0 . ПМИД 11068044 . S2CID 46556394 .
Норквей Л.Д., Ян X, Шеппард П., Грегуар С., Додд Дж.Г., Рейт В., Каттини П.А. (2003). «RFX1 и NF-1 связываются с последовательностями P локуса гормона роста человека в хроматине гипофиза» . Мол. Эндокринол . 17 (6): 1027–1038. дои : 10.1210/me.2003-0025 . ПМИД 12624117 .
Гопалан С.М., Вильчинска К.М., Коник Б.С., Брайан Л., Кордула Т. (2006). «Ядерный фактор-1-X регулирует специфическую для астроцитов экспрессию генов альфа1-антихимотрипсина и глиального фибриллярного кислого белка» . Ж. Биол. Хим . 281 (19): 13126–13133. дои : 10.1074/jbc.M601194200 . ПМИД 16565071 .
Равичандран В., Сабат Б.Ф., Дженсен П.Н., Хауфф С.А., Майор Э.О. (2006). «Взаимодействие между c-Jun, ядерным фактором 1 и последовательностями промотора вируса JC: значение для вирусного тропизма» . Дж. Вирол . 80 (21): 10506–10513. дои : 10.1128/JVI.01355-06 . ПМЦ 1641797 . ПМИД 16928756 .

Внешние ссылки

NFIX+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000008441 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001911 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8340106-5] Зайзенбергер К., Виннакер Э.Л., Шертан Х. (август 1993 г.). «Локализация гена человеческого ядерного фактора I/X (NFI/X) на хромосоме 19p13 и обнаружение пяти других родственных локусов в 1p21-22, 1q42-43, 5q15, 11p13 и 20q13 с помощью FISH». Хум Жене . 91 (6): 535–537. дои : 10.1007/bf00205076 . ПМИД 8340106 . S2CID 22365562 .

[pmid7590749-6] Цянь Ф., Крузе У., Лихтер П., Сиппель А.Е. (декабрь 1995 г.). «Хромосомная локализация четырех генов (NFIA, B, C и X) ядерного фактора транскрипции человека I с помощью FISH». Геномика . 28 (1): 66–73. дои : 10.1006/geno.1995.1107 . ПМИД 7590749 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: ядерный фактор NFIX I/X (CCAAT-связывающий транскрипционный фактор)» .

[pmid21953450-8] Перейти обратно: ^а ^б ^с Сингх С.К., Бхардвадж Р., Вильчинска К.М., Думур С.И., Кордула Т. (ноябрь 2011 г.). «Комплекс ядерного фактора I-X3 и STAT3 регулирует миграцию астроцитов и глиомы посредством секретируемого гликопротеина YKL-40» . Ж. Биол. Хим . 286 (46): 39893–39903. дои : 10.1074/jbc.M111.257451 . ПМК 3220556 . ПМИД 21953450 .

[pmid9380514-9] Тарапор П., Ричмонд С., Чжэн Г., Коэн С.Б., Келдер Б., Копчик Дж., Крузе У., Сиппель А.Е., Кольменарес С., Ставнезер Э. (октябрь 1997 г.). «Связывание ДНК и активация транскрипции онкобелком Ski, опосредованным взаимодействием с NFI» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (19): 3895–3903. дои : 10.1093/нар/25.19.3895 . ПМК 146989 . ПМИД 9380514 .

[Harris_2016-10] Харрис, Лахлан; Залуки, Орессия; Гобиус, Илан; Макдональд, Ханна; Осинки, Джейсон; Харви, Трейси Дж.; Эссебье, Александра; Видович, Диана; Гладвин-Нг, Иван; Бёрн, Томас Х.; Хенг, Джулиан И.; Ричардс, Линда Дж.; Гроностайски, Ричард М.; Пайпер, Майкл (28 октября 2016 г.). «Транкрипционная регуляция генерации промежуточных клеток-предшественников во время развития гиппокампа» . Разработка . 143 (24): 4620–4630. дои : 10.1242/dev.140681 . ПМК 5201028 . ПМИД 27965439 .

[Harris_2018-11] Харрис, Лахлан; Залуки, Орессия; Клеман, Оливье; Фрейзер, Джеймс; Матузельски, Элиза; Оиси, Сабрина; Харви, Трейси Дж.; Бёрн, Томас Х.Дж.; Хенг, Джулиан И.; Ричардс, Линда Дж.; Гроностайски, Ричард М.; Пайпер, Майкл (07 февраля 2018 г.). «Нейрогенная дифференцировка нейрональных стволовых клеток и клеток-предшественников гиппокампа зависит от экспрессии NFIX» . Разработка . 145 (3): 1–12. дои : 10.1242/dev.155689 . ПМИД 29437824 .

[urlEnhanced_exercise_and_regenerative_capacity_in_a_mouse_model_that_violates_size_constraints_of_oxidative_muscle_fibres_|_eLife-12] Омайри, Салех; Мацакас, Антониос; Дегенс, Ганс; Крец, Оливер; Ханссон, Кент-Арне; Солбро, Андреас Вованг; Брюусгаард, Джо К.; Йох, Барбара; Сартори, Роберта; Джаллуру, Натаса; Митчелл, Роберт; Коллинз-Хупер, Генри; Фостер, Кейт; Пастернак, Арья; Ритвос, Олли; Сандри, Марко; Наркар, Виханг; Суонн, Джонатан Р.; Хубер, Тобиас Б.; Патель, Кетан (5 августа 2016 г.). Коссу, Джулио (ред.). «Улучшение физических упражнений и регенеративной способности на мышиной модели, которая нарушает ограничения по размеру окислительных мышечных волокон | eLife» . электронная жизнь . 5 : е16940. doi : 10.7554/eLife.16940 . ПМЦ 4975572 . ПМИД 27494364 .

[urlNfix_Regulates_Temporal_Progression_of_Muscle_Regeneration_through_Modulation_of_Myostatin_Expression:_Cell_Reports-13] Росси, Джулиана; Антонини, Стефания; Бонфанти, Кьяра; Монтеверде, Стефания; Веццали, Кьяра; Таджбахш, Шахрагим; Коссу, Джулио; Мессина, Грациелла (8 марта 2016 г.). «Nfix регулирует временное прогрессирование регенерации мышц посредством модуляции экспрессии миостатина» . Отчеты по ячейкам . 14 (9): 2238–2249. дои : 10.1016/j.celrep.2016.02.014 . ПМЦ 4793149 . ПМИД 26923583 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]