Protein-coding gene in the species Homo sapiens
ЗЕБ1 Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB show 2E19
Идентификаторы Псевдонимы ZEB1 Внешние идентификаторы Опустить : 189909 ; МГИ : 1344313 ; Гомологен : 31779 ; Генные карты : ZEB1 ; ОМА : ZEB1 – ортологи show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog)Top expressed in Achilles tendon epithelium of colon decidua optic nerve glutes endothelial cell Skeletal muscle tissue of rectus abdominis biceps brachii tendon of biceps brachii Skeletal muscle tissue of biceps brachii
Top expressed in internal carotid artery substantia nigra motor neuron external carotid artery semi-lunar valve carotid body ascending aorta Rostral migratory stream suprachiasmatic nucleus Gonadal ridge
More reference expression data
BioGPS
Викиданные
Гомеобокс 1, связывающий E-бокс с цинковым пальцем, представляет собой белок , который у человека кодируется ZEB1 геном . [5] [6] [7]
ZEB1 (ранее известный как TCF8) кодирует «цинковый палец» и гомеодомен фактор транскрипции специфичного для Т-лимфоцитов, , который подавляет экспрессию гена IL2, путем связывания с отрицательным регуляторным доменом, состоящим из 100 нуклеотидов, 5-штрих сайта начала транскрипции IL2 . [7] [6] ZEB2 млекопитающих принадлежат к семейству Zeb в классе гомеодоменных транскрипционных факторов ZF (цинковый палец). Белок ZEB1 имеет семь цинковых пальцев и один гомеодомен. [8]
Мутации гена связаны с задней полиморфной дистрофией роговицы 3 . ZEB1 подавляет E-кадгерин и индуцирует эпителиально-мезенхимальный переход при раке молочной железы и других карциномах. [9] инвазивности рака легких и развитию метастазов. [10] [11]
^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000148516 – Ensembl , май 2017 г. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024238 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Уильямс Т.М., Монтойя Г., Ву Ю., Эдди Р.Л., Байерс М.Г., Шоу ТБ (сентябрь 1992 г.). «Ген TCF8, кодирующий белок цинковых пальцев (Nil-2-a), находится на хромосоме 10p11.2 человека». Геномика . 14 (1): 194–6. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80307-6 . ПМИД 1427828 . ^ Jump up to: а б Уильямс Т.М., Моолтен Д., Бурлейн Дж., Романо Дж., Баерман Р., Годильот А., Меллон М., Раушер Ф.Дж., Кант Дж.А. (декабрь 1991 г.). «Идентификация белка цинкового пальца, который ингибирует экспрессию гена IL-2». Наука . 254 (5039): 1791–4. Бибкод : 1991Sci...254.1791W . дои : 10.1126/science.1840704 . ПМИД 1840704 . ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: цинковый палец ZEB1, связывающий E-бокс гомеобокса 1» . ^ Бурглин Т.Р., Аффольтер М (июль 2016 г.). «Гомеодоменные белки: обновление» . Хромосома . 125 (3): 497–521. дои : 10.1007/s00412-015-0543-8 . ПМЦ 4901127 ПМИД 26464018 . ^ Эгер А., Айгнер К., Зондереггер С., Дампьер Б., Олер С., Шрайбер М., Беркс Г., Кано А., Бег Х., Фойснер Р. (март 2005 г.). «DeltaEF1 является репрессором транскрипции E-кадгерина и регулирует пластичность эпителия в клетках рака молочной железы» . Онкоген . 24 (14): 2375–85. дои : 10.1038/sj.onc.1208429 ПМИД 15674322 . ^ Лю В., Хуан Ю.Дж., Лю С., Ян Ю.Ю., Лю Х., Цуй Цз.Г., Ченг Ю., Гао Ф., Цай Дж.М., Ли Б.Л. (апрель 2014 г.). «Ингибирование TBK1 ослабляет радиационно-индуцированный эпителиально-мезенхимальный переход клеток рака легких человека A549 посредством активации GSK-3β и репрессии ZEB1» . Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии . 94 (4): 362–70. дои : 10.1038/labinvest.2013.153 ПМИД 24468793 . ^ Лу Дж, Фей Ф, Ву С, Мэй Дж, Сюй Дж, Лу П (сентябрь 2022 г.). «ZEB1: Катализатор иммунного ускользания при метастазировании опухоли» . Биомед Фармакотер . 153 : 113490. doi : 10.1016/j.biopha.2022.113490 ПМИД 36076506 . Франклин А.Дж., Джеттон Т.Л., Шелтон К.Д., Магнусон М.А. (октябрь 1994 г.). «BZP, новый белок цинковых пальцев, реагирующий на сыворотку, который ингибирует транскрипцию генов» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (10): 6773–88. дои : 10.1128/MCB.14.10.6773 . ПМК 359208 ПМИД 7935395 . Ватанабэ Ю., Каваками К., Хираяма Ю., Нагано К. (декабрь 1993 г.). «Факторы транскрипции положительно и отрицательно регулируют ген субъединицы альфа 1 Na,K-АТФазы». Журнал биохимии . 114 (6): 849–55. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124267 . ПМИД 8138542 . Икеда К., Галле Дж. П., Стельцер Г., Мейстернст М., Каваками К. (январь 1998 г.). «Участие отрицательного кофактора NC2 в активной репрессии транскрипционным фактором AREB6 с гомеодоменом цинкового пальца» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (1): 10–8. дои : 10.1128/mcb.18.1.10 . ПМЦ 121442 ПМИД 9418848 . Тернер Дж., Кроссли М. (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика mCtBP2, ко-репрессора, который связывается с основным фактором Круппеля и другими регуляторами транскрипции млекопитающих» . Журнал ЭМБО . 17 (17): 5129–40. дои : 10.1093/emboj/17.17.5129 . ПМК 1170841 ПМИД 9724649 . Постиго А.А., декан округа Колумбия (июнь 1999 г.). «ZEB подавляет транскрипцию посредством взаимодействия с корепрессором CtBP» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (12): 6683–8. Бибкод : 1999PNAS...96.6683P . дои : 10.1073/pnas.96.12.6683 ПМК 21975 ПМИД 10359772 . Хлубек Ф., Леберг С., Мейлер Дж., Юнг А., Киршнер Т., Браблец Т. (апрель 2001 г.). «Tip60 представляет собой регулятор транскрипции, специфичный для конкретного типа клеток». Журнал биохимии . 129 (4): 635–41. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002901 . ПМИД 11275565 . Локлин Р.М., Риггс Б.Л., Хикок К.К., Хортон Х.Ф., Бирн М.К., Хосла С. (декабрь 2001 г.). «Оценка регуляции генов костным морфогенетическим белком 2 в стромальных клетках костного мозга человека с использованием технологии генного массива» . Журнал исследований костей и минералов . 16 (12): 2192–204. дои : 10.1359/jbmr.2001.16.12.2192 ПМИД 11760832 . S2CID 25397480 . Шахедуззаман С., Кришнан В., Петрович А., Биттнер М., Мельцер П., Трент Дж., Венкатесан С., Зейхнер С. (2002). «Влияние Nef ВИЧ-1 на профили экспрессии клеточных генов». Журнал биомедицинской науки . 9 (1): 82–96. дои : 10.1007/BF02256581 . ПМИД 11810028 . Гуайта С., Пуиг И., Франси С., Гарридо М., Домингес Д., Батль Е., Санчо Е., Дедхар С., Де Эррерос А.Г., Баулида Дж. (октябрь 2002 г.). «Индукция улиткой эпителиально-мезенхимального перехода в опухолевых клетках сопровождается репрессией MUC1 и экспрессией ZEB1» . Журнал биологической химии . 277 (42): 39209–16. дои : 10.1074/jbc.M206400200 ПМИД 12161443 . Костантино М.Э., Стирман Р.П., Смит Г.Е., Дарлинг Д.С. (август 2002 г.). «Клеточно-специфическое фосфорилирование транскрипционного фактора Zfhep» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 296 (2): 368–73. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00880-X . ПМЦ 3682420 ПМИД 12163027 . Постиго А.А. (май 2003 г.). «Противоположные функции белков ZEB в регуляции сигнального пути TGFbeta/BMP» . Журнал ЭМБО . 22 (10): 2443–52. дои : 10.1093/emboj/cdg225 . ПМК 155983 ПМИД 12743038 . Постиго А.А., Депп Дж.Л., Тейлор Дж.Дж., Кролл К.Л. (май 2003 г.). «Регуляция передачи сигналов Smad посредством дифференциального рекрутирования коактиваторов и корепрессоров белками ZEB» . Журнал ЭМБО . 22 (10): 2453–62. дои : 10.1093/emboj/cdg226 . ПМК 155984 ПМИД 12743039 . Диллнер Н.Б., Сандерс М.М. (январь 2004 г.). «Активация транскрипции гомеодоменным белком дельта EF1 с цинковыми пальцами в каскадах передачи сигналов эстрогена». ДНК и клеточная биология . 23 (1): 25–34. дои : 10.1089/104454904322745907 . ПМИД 14965470 . Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 ПМК 514446 ПМИД 15302935 . Шимицу С., Крафчак С., Фьюз Н., Эпштейн М.П., Штайнгарт М.Т., Шугар А., Эйбшиц-Цимхони М., Даунс К.А., Розса Ф., Трагер Э.Х., Рид Д.М., Бёнке М., Морой С.Е., Ричардс Дж.Е. (ноябрь 2004 г.). «Локус задней полиморфной дистрофии роговицы (PPCD3) картируется на хромосоме 10» . Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 130А (4): 372–7. дои : 10.1002/ajmg.a.30267 . ПМЦ 1249494 ПМИД 15384081 .
показывать
show (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group CPAS Group D Group E Group F
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
show (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
show (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors
