Jump to content

ТФАП2А

ТФАП2А
Идентификаторы
Псевдонимы TFAP2A , AP-2, AP-2альфа, AP2TF, BOFS, TFAP2, фактор транскрипции AP-2 альфа
Внешние идентификаторы Опустить : 107580 ; МГИ : 104671 ; Гомологен : 2421 ; Генные карты : TFAP2A ; ОМА : TFAP2A — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001032280
НМ_001042425
НМ_003220
НМ_001372066

НМ_001122948
НМ_001301674
НМ_011547

RefSeq (белок)

НП_001027451
НП_001035890
НП_003211
НП_001358995

НП_001116420
НП_001288603
НП_035677

Местоположение (UCSC) Чр 6: 10.39 – 10.42 Мб Чр 13: 40,87 – 40,89 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Фактор транскрипции AP-2 альфа ( активирующий энхансер связывания белка 2 , который у человека альфа ), также известный как TFAP2A , представляет собой белок кодируется TFAP2A геном . [5]

Фактор транскрипции AP-2 альфа представляет собой специфичный для последовательности ДНК-связывающий белок массой 52 кДа, который усиливает транскрипцию специфических генов путем связывания с богатой GC последовательностью ДНК, впервые идентифицированной в цис-регуляторной области ДНК вируса SV40 и в цис-регуляторной области. области различных клеточных генов. [6]

Ген TFAP2-альфа был выделен и оказался индуцируемым ретиноевой кислотой в клетках тератокарциномы NT2, что указывает на потенциальную роль AP-2-альфа в клеточной дифференцировке. [7] [8] [9]

Во время эмбрионального развития AP-2 альфа экспрессируется в клетках нервного гребня, мигрирующих из краниальных нервных складок во время закрытия нервной трубки, а также экспрессируется в эктодерме, частях центральной нервной системы, зачатках конечностей и мезонефрической системе, что позволяет предположить, что AP-2 альфа экспрессируется в клетках нервного гребня, мигрирующих из краниальных нервных складок во время закрытия нервной трубки. альфа играет важную роль в детерминации и развитии этих тканей. [10] Клетки краниального нервного гребня заселяют развивающееся лицо и предоставляют о паттерне информацию для черепно-лицевого морфогенеза и генерируют большую часть костей черепа и краниальных ганглиев . [11]

AP-2-альфа, Мыши, нокаутные по умирают перинатально от краниоабдоминошизиса и тяжелого дисморфогенеза лица, черепа, органов чувств и краниальных ганглиев. [12] У гомозиготных нокаутных мышей также наблюдаются дефекты нервной трубки, за которыми следуют черепно-лицевые аномалии и аномалии стенок тела. [13] Доставка гена AP-2 альфа in vivo подавляла спонтанные кишечные полипы у мышей Apc(Min/+). [14] AP-2 альфа также действует как главный регулятор множества факторов транскрипции в печени мышей. [15]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена TFAP2A может регулироваться MITF . [16]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Мутации в гене TFAP2A вызывают бранхио-окуло-лицевой синдром, часто сопровождающийся расщелиной губы по средней линии . [17] В семье с жаберно-окуло-фациальным синдромом (БОФС) [18] была обнаружена делеция 3,2 Мб в хромосоме 6p24.3. [19] Секвенирование генов-кандидатов в этом регионе у 4 дополнительных неродственных пациентов с BOFS выявило 4 различных миссенс-мутации de novo в экзонах 4 и 5 гена TFAP2A.

Нарушение сайта связывания альфа AP-2 в энхансере IRF6 связано с заячьей губой . [20] Мутации в гене IRF6 вызывают синдром Ван дер Вуда (СВВ) [21] это редкое менделевское аутосомно-доминантное заболевание, характеризующееся ямками нижней губы у 85% больных. [22] У остальных 15% людей с синдромом Ван дер Вуда наблюдается только расщелина губы и/или волчья пасть (CL/P), и они клинически неотличимы от обычного несиндромального CL/P. NSCL/P встречается примерно у 1/700 живорождений и является одной из наиболее частых форм врожденных аномалий. Предыдущее исследование ассоциации между SNP внутри и вокруг IRF6 и NSCL/P показало значительные результаты в разных популяциях. [23] и был независимо воспроизведен. [24] [25] [26] [27]

Был проведен поиск потенциальных регуляторных элементов гена IRF6 в случаях NSCL/P с выравниванием геномных последовательностей по участку размером 500 т.п.н., охватывающему IRF6, от 17 видов позвоночных. Человеческая последовательность в качестве эталона и поиск мультивидовых консервативных последовательностей (MCS). Области, содержащиеся в 5'- и 3'-интронах, фланкирующих IRF6, были проверены путем прямого секвенирования на наличие потенциальных причинных вариантов в 184 случаях NSCL/P. Редкий аллель SNP rs642961 показал значительную связь со случаями расщелины губы. Анализ сайта связывания транскрипционных факторов показал, что аллель риска нарушает сайт связывания AP-2 альфа. [20]

Мутации в гене AP-2-альфа также вызывают жаберно-окуло-лицевой синдром. [19] который имеет перекрывающиеся черты с синдромом Ван дер Вуда, такие как орофациальные расщелины и случайные ямки на губах, что делает rs642961 хорошим кандидатом на роль этиологического варианта. Эти данные показывают, что IRF6 и AP-2 альфа находятся на одном и том же пути развития и идентифицируют вариант в регуляторной области, который вносит существенный вклад в общее сложное заболевание.

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что TFAP2A взаимодействует с:

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000137203 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021359 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Энтрез: транскрипционный фактор TFAP2A AP-2 альфа (активирующий энхансер-связывающий белок 2 альфа)» .
  6. ^ Митчелл П.Дж., Ван С., Тцзян Р. (сентябрь 1987 г.). «Положительная и отрицательная регуляция транскрипции in vitro: энхансер-связывающий белок AP-2 ингибируется Т-антигеном SV40». Клетка . 50 (6): 847–61. дои : 10.1016/0092-8674(87)90512-5 . ПМИД   3040262 . S2CID   25657738 .
  7. ^ Уильямс Т., Адмон А., Люшер Б., Тьян Р. (декабрь 1988 г.). «Клонирование и экспрессия AP-2, фактора транскрипции, специфичного для клеточного типа, который активирует индуцируемые энхансерные элементы» . Гены и развитие . 2 (12А): 1557–69. дои : 10.1101/gad.2.12a.1557 . ПМИД   3063603 .
  8. ^ Люшер Б., Митчелл П.Дж., Уильямс Т., Тьян Р. (октябрь 1989 г.). «Регуляция фактора транскрипции AP-2 с помощью морфогена ретиноевой кислоты и вторичных мессенджеров» . Генс Дев . 3 (10): 1507–17. дои : 10.1101/gad.3.10.1507 . ПМИД   2482225 .
  9. ^ Уильямс Т., Тцзян Р. (апрель 1991 г.). «Анализ ДНК-связывающих и активационных свойств фактора транскрипции человека AP-2» . Гены и развитие . 5 (4): 670–82. дои : 10.1101/gad.5.4.670 . ПМИД   2010091 .
  10. ^ Митчелл П.Дж., Тиммонс П.М., Эберт Дж.М., Ригби П.В., Тжиан Р. (январь 1991 г.). «Транскрипционный фактор AP-2 экспрессируется в линиях клеток нервного гребня во время эмбриогенеза мышей» . Генс Дев . 5 (1): 105–19. дои : 10.1101/gad.5.1.105 . ПМИД   1989904 .
  11. ^ Ле Дуарен Н.М., Циллер С., Кули Г.Ф. (сентябрь 1993 г.). «Паттерн производных нервного гребня у птичьего эмбриона: исследования in vivo и in vitro». Биология развития . 159 (1): 24–49. дои : 10.1006/dbio.1993.1219 . ПМИД   8365563 .
  12. ^ Шорле Х., Мейер П., Бухерт М., Джениш Р., Митчелл П.Дж. (май 1996 г.). «Транскрипционный фактор AP-2 необходим для закрытия черепа и черепно-лицевого развития». Природа . 381 (6579): 235–8. Бибкод : 1996Natur.381..235S . дои : 10.1038/381235a0 . ПМИД   8622765 . S2CID   581362 .
  13. ^ Чжан Дж., Хагопиан-Дональдсон С., Сербедзия Г., Элсмор Дж., Плен-Дуйович Д., МакМахон А.П., Флавелл Р.А., Уильямс Т. (май 1996 г.). «Дефекты нервной трубки, скелета и стенок тела у мышей, у которых отсутствует фактор транскрипции AP-2». Природа . 381 (6579): 238–41. Бибкод : 1996Natur.381..238Z . дои : 10.1038/381238a0 . ПМИД   8622766 . S2CID   4367622 .
  14. ^ Ли Кью, Лёр CV, Дэшвуд Р.Х. (сентябрь 2009 г.). «Белок-активатор 2альфа подавляет кишечный онкогенез у мышей Apc(min)» . Письма о раке . 283 (1): 36–42. дои : 10.1016/j.canlet.2009.03.026 . ПМЦ   2713803 . ПМИД   19376641 .
  15. ^ Ли Кью, Луо С., Лёр К.В., Дэшвуд Р.Х. (август 2011 г.). «Белок-активатор-2α действует как главный регулятор множества факторов транскрипции в печени мыши» . Гепатологические исследования . 41 (8): 776–83. дои : 10.1111/j.1872-034X.2011.00827.x . ПМК   4139281 . ПМИД   21682828 .
  16. ^ Хук К.С., Шлегель Н.К., Айххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус С., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергштейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 665–76. дои : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . ПМИД   19067971 . S2CID   24698373 .
  17. ^ Диксон М.Дж., Маразита М.Л., Бити Т.Х., Мюррей Дж.К. (2011). «Расщелина губы и неба: понимание генетических и экологических влияний». Nature Reviews Genetics (12): 167-178.
  18. ^ Интернет-менделевское наследование у человека (OMIM): 113620
  19. ^ Перейти обратно: а б Милунски Дж.М., Махер Т.А., Чжао Г., Робертс А.Е., Сталкер Х.Дж., Зори Р.Т., Берч М.Н., Клеменс М., Малликен Дж.Б., Смит Р., Лин А.Е. (май 2008 г.). «Мутации TFAP2A приводят к жаберно-окуло-лицевому синдрому» . Американский журнал генетики человека . 82 (5): 1171–7. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.03.005 . ПМЦ   2427243 . ПМИД   18423521 .
  20. ^ Перейти обратно: а б Рахимов Ф., Маразита М.Л., Висел А., Купер М.Э., Хитчлер М.Дж., Рубини М., Доманн Ф.Е., Говил М., Кристенсен К., Билле С., Мелби М., Жугессур А., Лий Р.Т., Уилкокс А.Дж., Фитцпатрик Д.Р., Грин Э.Д., Мосси П.А. , Литтл Дж., Стигерс-Теуниссен Р.П., Пеннаккио Л.А., Шютте BC, Мюррей Дж.К. (ноябрь 2008 г.). «Нарушение сайта связывания AP-2альфа в энхансере IRF6 связано с заячьей губой» . Природная генетика . 40 (11): 1341–7. дои : 10.1038/ng.242 . ПМК   2691688 . ПМИД   18836445 .
  21. ^ Интернет-менделевское наследование у человека (OMIM): 119300
  22. ^ Кондо С., Шютте БК, Ричардсон Р.Дж., Бьорк БК, Найт А.С., Ватанабе Ю., Ховард Э., де Лима Р.Л., Даак-Хирш С., Сандер А., Макдональд-Макгинн Д.М., Закай Э.Х., Ламмер Э.Дж., Эйлсворт А.С., Ардингер Х.Х., Лидраль А.С., Побер Б.Р., Морено Л., Аркос-Бургос М., Валенсия К., Удайер С., Бауау М., Моретти-Феррейра Д., Ричиери-Коста А., Диксон М.Дж., Мюррей Дж.К. (октябрь 2002 г.). «Мутации в IRF6 вызывают синдромы Ван дер Вуда и подколенного птеригиума» . Природная генетика . 32 (2): 285–9. дои : 10.1038/ng985 . ПМК   3169431 . ПМИД   12219090 .
  23. ^ Зукчеро Т.М., Купер М.Э., Махер Б.С., Даак-Хирш С., Непомучено Б., Рибейро Л., Капрау Д., Кристенсен К., Сузуки Ю., Мачида Дж., Нацуме Н., Йошиура К., Виейра А.Р., Ориоли И.М., Кастилья Э.Э., Морено Л., Аркос-Бургос М., Лидрал А.С., Филд Л.Л., Лю Й.Е., Рэй А., Гольдштейн Т.Х., Шульц Р.Э., Ши М., Джонсон М.К., Кондо С., Шутте Б.С., Маразита М.Л., Мюррей Дж.К. (август 2004 г.). «Варианты гена регуляторного фактора интерферона 6 (IRF6) и риск изолированной расщелины губы или неба» (PDF) . Медицинский журнал Новой Англии . 351 (8): 769–80. doi : 10.1056/NEJMoa032909 . ПМИД   15317890 . S2CID   3324418 .
  24. ^ Скаполи Л., Палмьери А., Мартинелли М., Пеццетти Ф., Каринчи П., Тоньон М., Каринчи Ф. (январь 2005 г.). «Убедительные доказательства неравновесия по сцеплению между полиморфизмами в локусе IRF6 и несиндромальной расщелиной губы с расщелиной неба или без нее в итальянской популяции» . Американский журнал генетики человека . 76 (1): 180–3. дои : 10.1086/427344 . ПМК   1196422 . ПМИД   15558496 .
  25. ^ Блэнтон С.Х., Кортес А., Стал С., Малликен Дж.Б., Финнелл Р.Х., Хехт Дж.Т. (сентябрь 2005 г.). «Вариации IRF6 способствуют несиндромальной расщелине губы и неба» . Американский журнал медицинской генетики, часть A. 137А (3): 259–62. doi : 10.1002/ajmg.a.30887 . ПМИД   16096995 . S2CID   25084563 .
  26. ^ Гасибе М., Байе Б., Ревенку Н., Вереллен-Дюмулен С., Жиллерот Ю., Ванвейк Р., Виккула М. (ноябрь 2005 г.). «Регуляторный фактор интерферона-6: ген, предрасполагающий к изолированной расщелине губы с расщелиной неба или без нее у бельгийской популяции» . Европейский журнал генетики человека . 13 (11): 1239–42. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201486 . ПМИД   16132054 .
  27. ^ Пак Дж.В., Макинтош И., Хетмански Дж.Б., Джабс Э.В., Вандер Колк К.А., Ву-Чоу Ю.Х., Чен ПК, Чонг С.С., Йеу В., Джи Ш.Х., Парк БАЙ, Фаллин М.Д., Ингерсолл Р., Скотт А.Ф., Бити Т.Д. (апрель 2007 г.) ). «Связь между IRF6 и несиндромальной расщелиной губы с расщелиной неба или без нее в четырех популяциях» . Генетика в медицине . 9 (4): 219–27. doi : 10.1097/GIM.0b013e3180423cca . ПМК   2846512 . ПМИД   17438386 .
  28. ^ Ли Кью, Дэшвуд Р.Х. (октябрь 2004 г.). «Белок-активатор 2альфа связывается с аденоматозным полипозом кишечной палочки/бета-катенином и ингибирует транскрипционную активность бета-катенина/Т-клеточного фактора в клетках колоректального рака» . Журнал биологической химии . 279 (44): 45669–75. дои : 10.1074/jbc.M405025200 . ПМК   2276578 . ПМИД   15331612 .
  29. ^ Перейти обратно: а б Браганса Дж., Элоранта Дж.Дж., Бэмфорт С.Д., Иббит Дж.К., Херст ХК, Бхаттачарья С. (май 2003 г.). «Физические и функциональные взаимодействия между факторами транскрипции AP-2, p300/CREB-связывающим белком и CITED2» . Журнал биологической химии . 278 (18): 16021–9. дои : 10.1074/jbc.M208144200 . ПМИД   12586840 .
  30. ^ Браганса Дж., Свинглер Т., Маркес Ф.И., Джонс Т., Элоранта Дж.Дж., Херст ХК, Шиода Т., Бхаттачарья С. (март 2002 г.). «Человеческий CREB-связывающий белок/трансактиватор, взаимодействующий с p300, с ED-богатым хвостом (CITED) 4, новый член семейства CITED, действует как коактиватор транскрипционного фактора AP-2» . Журнал биологической химии . 277 (10): 8559–65. дои : 10.1074/jbc.M110850200 . ПМИД   11744733 .
  31. ^ Кампильос М., Гарсиа М.А., Вальдивьесо Ф., Васкес Х. (март 2003 г.). «Активация транскрипции AP-2альфа модулируется онкогеном DEK» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (5): 1571–5. дои : 10.1093/нар/gkg247 . ПМК   149840 . ПМИД   12595566 .
  32. ^ Гаубац С., Имхоф А., Дош Р., Вернер О., Митчелл П., Бюттнер Р., Эйлерс М. (апрель 1995 г.). «Активация транскрипции Myc находится под отрицательным контролем фактора транскрипции AP-2» . Журнал ЭМБО . 14 (7): 1508–19. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07137.x . ПМЦ   398238 . ПМИД   7729426 .
  33. ^ Макферсон Л.А., Локтев А.В., Вейгель Р.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Опухолесупрессорная активность AP2альфа, опосредованная прямым взаимодействием с p53» . Журнал биологической химии . 277 (47): 45028–33. дои : 10.1074/jbc.M208924200 . ПМИД   12226108 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 1f1487aa94782b0fc98de5e670f266f9__1704165660
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/1f/f9/1f1487aa94782b0fc98de5e670f266f9.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
TFAP2A - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)