ДЭК (ген)

ДЕСЯТЬ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1Q1V, 2JX3
Идентификаторы
Псевдонимы	ДЭК , D6S231E, ДЭК протоонкоген
Внешние идентификаторы	Опустить : 125264 ; МГИ : 1926209 ; Гомологен : 2593 ; GeneCards : DEK ; ОМА : ДЭК - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	18,264,548 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	47,259,677 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; epithelium of nasopharynx; ; ventricular zone; ; tibia; ; ganglionic eminence; ; trabecular bone; ; amniotic fluid; ; germinal epithelium; ; skin of hip; ; jejunal mucosa;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; zygote; ; genital tubercle; ; secondary oocyte; ; primary oocyte; ; epiblast; ; bone marrow; ; ventricular zone; ; thymus; ; yolk sac;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; histone binding; chromatin binding; RNA binding;
Cellular component	nucleoplasm; contractile fiber; nucleus;
Biological process	epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; viral genome replication; regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining; transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of double-strand break repair; signal transduction; chromatin remodeling; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7913
	110052
	ENSG00000124795
	ENSMUSG00000021377
	P35659
	Q7TNV0
	НМ_001134709 ; НМ_003472
	НМ_025900
	НП_001128181 ; НП_003463
	НП_080176
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

человека DEK Ген DEK кодирует белок . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует белок с одним доменом SAP. Белок связывается с крестообразной ДНК и ДНК, свернутой в суперспираль , тем самым вызывая положительные суперспирали в замкнутой кольцевой ДНК. Он также участвует в выборе сайта сплайсинга во время процессинга мРНК . Хромосомные аберрации, затрагивающие этот участок, повышают экспрессию этого гена, а наличие антител против этого белка связано с различными заболеваниями. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

DEK взаимодействует с TFAP2A . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124795 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021377 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ фон Линдерн М., Форнерод М., ван Баал С., Джегл М., де Вит Т., Буйс А., Гросвельд Г. (апрель 1992 г.). «Транслокация (6;9), связанная со специфическим подтипом острого миелолейкоза, приводит к слиянию двух генов, dek и can, и экспрессии химерной, специфичной для лейкемии мРНК dek-can» . Мол. Клетка. Биол . 12 (4): 1687–97. дои : 10.1128/mcb.12.4.1687 . ПМЦ 369612 . ПМИД 1549122 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: DEK Онкоген DEK (связывание ДНК)» .
^ Кампильос М., Гарсия М.А., Вальдивьесо Ф., Васкес Х. (март 2003 г.). «Активация транскрипции AP-2альфа модулируется онкогеном DEK» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (5): 1571–5. дои : 10.1093/нар/gkg247 . ПМК 149840 . ПМИД 12595566 .

Дальнейшее чтение

фон Линдерн М., Форнерод М., Сукарман Н., ван Баал С., Джегл М., Хагемейер А., Бутсма Д., Гросвельд Г. (1992). «Транслокация t(6;9) при остром нелимфоцитарном лейкозе приводит к образованию слитого гена DEK-CAN». Клиническая гематология Байера . 5 (4): 857–79. дои : 10.1016/s0950-3536(11)80049-1 . ПМИД 1308167 .
Вальдманн Т., Шолтен И., Каппес Ф., Ху Х.Г., Книпперс Р. (2004). «Белок DEK - обильный и повсеместный компонент хроматина млекопитающих». Джин . 343 (1): 1–9. дои : 10.1016/j.gene.2004.08.029 . ПМИД 15563827 .
Денисенко ОН, О'Нил Б, Островски Дж, Ван Сеунинген И, Бомштык К (1996). «Zik1, репрессор транскрипции, который взаимодействует с гетерогенным белком K ядерной рибонуклеопротеиновой частицы» . Ж. Биол. Хим . 271 (44): 27701–6. дои : 10.1074/jbc.271.44.27701 . ПМИД 8910362 .
Фу ГК, Гросвельд Г, Марковиц ДМ (1997). «DEK, аутоантиген, участвующий в хромосомной транслокации при остром миелогенном лейкозе, связывается с энхансером ВИЧ-2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (5): 1811–5. Бибкод : 1997PNAS...94.1811F . дои : 10.1073/pnas.94.5.1811 . ЧВК 19999 . ПМИД 9050861 .
Мюррей К.Дж., Сзер В., Гром А.А., Доннелли П., Левинсон Дж.Э., Джаннини Э.Х., Гласс Д.Н., Сзер И.С. (1997). «Антитела к ядерному антигену DEK 45 кДа при ювенильном ревматоидном артрите с олигоартикулярным началом и иридоциклите: избирательная ассоциация с геном MHC». Дж. Ревматол . 24 (3): 560–7. ПМИД 9058666 .
Фореро Л., Цвирнер Н.В., Финк К.В., Фернандес-Винья М.А., Стастный П. (1998). «Ювенильный артрит, HLA-A2 и связывание онкоген-пептидов DEK». Хм. Иммунол . 59 (7): 443–50. дои : 10.1016/S0198-8859(98)00034-2 . ПМИД 9684994 .
Донг X, Микелис М.А., Ван Дж., Бозе Р., ДеЛанж Т., Ривз WH (1998). «Аутоантитела к онкопротеину DEK у больного системной красной волчанкой и саркоидозом». Ревмирующий артрит . 41 (8): 1505–10. doi : 10.1002/1529-0131(199808)41:8<1505::AID-ART23>3.0.CO;2-N . ПМИД 9704652 .
Вичманн И, Гарсия-Лозано-младший, Респальдиса Н, Гонсалес-Эскрибано МФ, Нуньес-Рольдан А (1999). «Аутоантитела к белкам регуляции транскрипции DEK и ALY у больного системной красной волчанкой». Хм. Иммунол . 60 (1): 57–62. дои : 10.1016/S0198-8859(98)00085-8 . ПМИД 9952027 .
Алексиадис В., Вальдманн Т., Андерсен Дж., Манн М., Книпперс Р., Грусс С. (2000). «Белок, кодируемый протоонкогеном DEK, изменяет топологию хроматина и снижает эффективность репликации ДНК хроматин-специфичным образом» . Генс Дев . 14 (11): 1308–12. дои : 10.1101/gad.14.11.1308 . ПМК 316669 . ПМИД 10837023 .
МакГарви Т., Розонина Е., Маккракен С., Ли К., Арнаут Р., Мьентжес Э., Никерсон Дж.А., Оури Д., Гринблатт Дж., Гросвельд Г., Бленкоу Б.Дж. (2000). «Белок, связанный с острым миелолейкозом, DEK, образует зависимое от сплайсинга взаимодействие с комплексами экзон-продукт» . Дж. Клеточная Биол . 150 (2): 309–20. дои : 10.1083/jcb.150.2.309 . ПМК 2180225 . ПМИД 10908574 .
Гротке С., Мантвилл К., Дитель М., Шадендорф Д., Лаге Х. (2000). «Идентификация дифференциально экспрессируемых генов в клетках меланомы человека с приобретенной устойчивостью к различным противоопухолевым препаратам». Межд. Дж. Рак . 88 (4): 535–46. doi : 10.1002/1097-0215(20001115)88:4<535::AID-IJC4>3.0.CO;2-V . ПМИД 11058868 . S2CID 24030621 .
Ле Хир Х., Изаурральде Э., Макват Л.Е., Мур М.Дж. (2000). «Сплайсосома откладывает множество белков на 20–24 нуклеотида выше экзон-экзонных соединений мРНК» . ЭМБО Дж . 19 (24): 6860–9. дои : 10.1093/emboj/19.24.6860 . ПМК 305905 . ПМИД 11118221 .
Каппес Ф., Бургер К., Баак М., Факельмайер Ф.О., Грусс К. (2001). «Субклеточная локализация протоонкогенного белка человека DEK» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 26317–23. дои : 10.1074/jbc.M100162200 . ПМИД 11333257 .
Вальдманн Т., Эккерих С., Баак М., Грусс С. (2002). «Вездесущий хроматиновый белок DEK изменяет структуру ДНК, вводя положительные суперспирали» . Ж. Биол. Хим . 277 (28): 24988–94. дои : 10.1074/jbc.M204045200 . ПМИД 11997399 .
Ларраменди М.Л., Ниини Т., Элонен Э., Надь Б., Оллила Дж., Вихинен М., Кнуутила С. (2002). «Сверхэкспрессия связанных с транслокацией слитых генов FGFRI, MYC, NPMI и DEK, но отсутствие транслокаций при остром миелолейкозе. Анализ микрочипов». Гематологическая . 87 (6): 569–77. ПМИД 12031912 .
Холленбах А.Д., Макферсон С.Дж., Мьентжес Э.Дж., Айенгар Р., Гросвельд Г. (2002). «Daxx и деацетилаза гистонов II связываются с хроматином посредством взаимодействия с коровыми гистонами и ассоциированным с хроматином белком Dek». Дж. Клеточная наука . 115 (Часть 16): 3319–30. дои : 10.1242/jcs.115.16.3319 . ПМИД 12140263 .
Критивас А., Фуджимуро М., Вайднер М., Янг Д.Б., Хейворд С.Д. (2002). «Взаимодействия белков, направленные на латентно-ассоциированный ядерный антиген герпесвируса, ассоциированного с саркомой Капоши, с клеточными хромосомами» . Дж. Вирол . 76 (22): 11596–604. doi : 10.1128/JVI.76.22.11596-11604.2002 . ПМЦ 136775 . ПМИД 12388720 .

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для белка человека DEK.

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124795 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021377 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1549122-5] фон Линдерн М., Форнерод М., ван Баал С., Джегл М., де Вит Т., Буйс А., Гросвельд Г. (апрель 1992 г.). «Транслокация (6;9), связанная со специфическим подтипом острого миелолейкоза, приводит к слиянию двух генов, dek и can, и экспрессии химерной, специфичной для лейкемии мРНК dek-can» . Мол. Клетка. Биол . 12 (4): 1687–97. дои : 10.1128/mcb.12.4.1687 . ПМЦ 369612 . ПМИД 1549122 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: DEK Онкоген DEK (связывание ДНК)» .

[pmid12595566-7] Кампильос М., Гарсия М.А., Вальдивьесо Ф., Васкес Х. (март 2003 г.). «Активация транскрипции AP-2альфа модулируется онкогеном DEK» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (5): 1571–5. дои : 10.1093/нар/gkg247 . ПМК 149840 . ПМИД 12595566 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]