КДМ3Б

КДМ3Б
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4C8D
Идентификаторы
Псевдонимы	KDM3B , 5qNCA, C5orf7, JMJD1B, NET22, лизиндеметилаза 3B, DIJOS
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 609373 ; МГИ : 1923356 ; Гомологен : 41145 ; Генные карты : KDM3B ; ОМА : KDM3B — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	138,437,028 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	34,971,713 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; glutes; ; monocyte; ; caput epididymis; ; gastric mucosa; ; mucosa of ileum; ; gastrocnemius muscle; ; tibialis anterior muscle; ; saphenous vein;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; neural layer of retina; ; genital tubercle; ; granulocyte; ; tibiofemoral joint; ; ventricular zone; ; renal corpuscle; ; right ventricle; ; thymus; ; corneal stroma;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	oxidoreductase activity; antioxidant activity; dioxygenase activity; metal ion binding; histone demethylase activity; transcription cis-regulatory region binding; chromatin DNA binding; histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity;
Cellular component	chromatin; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	cellular oxidant detoxification; response to cisplatin; transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; histone H3-K9 demethylation; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51780
	277250
	ENSG00000120733
	ENSMUSG00000038773
	Q7LBC6
	Q6ZPY7
	НМ_016604
	НМ_001081256 ; НМ_029518
	НП_057688
	НП_001074725
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Лизин-специфическая деметилаза 3B — это фермент , который у человека кодируется KDM3B геном . ^[5]^[6] KDM3B принадлежит к суперсемейству альфа-кетоглутарат-зависимых гидроксилаз .

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120733 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000038773 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Като М, Като М (июнь 2004 г.). «Идентификация и характеристика генов семейства JMJD2 in silico». Международный журнал онкологии . 24 (6): 1623–8. дои : 10.3892/ijo.25.3.759 . ПМИД 15138608 .
^ «Ген Энтрез: домен jumonji JMJD1B, содержащий 1B» .

Дальнейшее чтение

Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA». Исследование ДНК . 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923 . дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Диас Нето Э, Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста ФФ, Гольдман Г.Х., Карвальо А.Ф., Мацукума А., Бая Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонджинил К.В., О'Хара М.Дж., Соареш Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (март 2000 г.). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК 16267 . ПМИД 10737800 .
Лай Ф., Годли Л.А., Фернальд А.А., Орелли Б.Дж., Паминтуан Л., Чжао Н., Ле Бо М.М. (ноябрь 2000 г.). «Клонирование кДНК и геномная структура трех генов, локализованных в полосе хромосомы человека 5q31, кодирующей потенциальные ядерные белки». Геномика . 70 (1): 123–30. дои : 10.1006/geno.2000.6345 . ПМИД 11087669 .
Лай Ф., Годли Л.А., Джослин Дж., Фернальд А.А., Лю Дж., Эспиноза Р., Чжао Н., Паминтуан Л., Тилль Б.Г., Ларсон Р.А., Цянь З., Ле Бо М.М. (январь 2001 г.). «Карта транскрипта и сравнительный анализ часто удаляемого сегмента человеческого 5q31 размером 1,5 МБ при злокачественных миелоидных заболеваниях с del (5q)». Геномика . 71 (2): 235–45. дои : 10.1006/geno.2000.6414 . ПМИД 11161817 .
Ху З., Гомеш И., Хорриган С.К., Краварушич Дж., Мар Б., Арбиева З., Чайна Б., Фултон Н., Эдассери С., Раза А., Уэстбрук Калифорния (октябрь 2001 г.). «Новый ядерный белок 5qNCA (LOC51780) является кандидатом на роль гена-супрессора опухоли миелолейкоза в полосе q31 хромосомы 5». Онкоген . 20 (47): 6946–54. дои : 10.1038/sj.onc.1204850 . ПМИД 11687974 . S2CID 2709519 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Ямане К., Тоумазо К., Цукада Й., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Вонг Дж., Чжан Й. (май 2006 г.). «JHDM2A, JmjC-содержащая деметилаза H3K9, облегчает активацию транскрипции с помощью андрогенного рецептора» . Клетка . 125 (3): 483–95. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.027 . ПМИД 16603237 . S2CID 6643329 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Внешние ссылки

JMJD1B + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120733 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000038773 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid15138608-5] Като М, Като М (июнь 2004 г.). «Идентификация и характеристика генов семейства JMJD2 in silico». Международный журнал онкологии . 24 (6): 1623–8. дои : 10.3892/ijo.25.3.759 . ПМИД 15138608 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: домен jumonji JMJD1B, содержащий 1B» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

v т и Оксидоредуктазы : диоксигеназы , включая стероидные гидроксилазы ( EC 1.14)
1.14.11 : 2-оксоглутарат	Пролилгидроксилаза HIF-пролилгидроксилаза ЭГЛН1 ЭГЛН2 ЭГЛН3 P4HTM Лизилгидроксилаза АлкБ АЛКБХ1 ФТО
1.14.13 : НАДН или НАДФН.	Флавинсодержащая монооксигеназа ФМО1 ФМО2 ФМО3 ФМО4 ФМО5 Синтаза оксида азота НОС1 НОС2 НОС3 Холестерин 7 альфа-гидроксилаза Метанмонооксигеназа 3А4 14α-деметилаза 24-гидроксихолестерин-7α-гидроксилаза
1.14.14 : восстановленный флавин или флавопротеин	19А1 2D6 2Е1
1.14.15 : восстановленный железосерный белок	11Б1 11Б2 11А1
1.14.16 : восстановленный птеридин ( зависит от BH4 )	Фенилаланингидроксилаза Тирозингидроксилаза Триптофангидроксилаза
1.14.17 : восстановленный аскорбат	Дофамин-бета-гидроксилаза
14.1.18 - 19 : другое	Тирозиназа Стеароил-КоА-десатураза-1
14.1.99 - разное	Циклооксигеназа Гемоксигеназа ( HMOX1 ) Скваленмонооксигеназа 17А1 21А2 Экдизон-20-монооксигеназа Дезоксигипузинмонооксигеназа

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )