Гомолог Alkb 1, гистон h2a диоксигеназа

АЛКБХ1
Идентификаторы
Псевдонимы	ALKBH1 , ABH, ABH1, ALKBH, alkB, hABH, гомолог 1 alkB, гистон H2A диоксигеназа
Внешние идентификаторы	Опустить : 605345 ; МГИ : 2384034 ; Гомологен : 4393 ; Генные карты : ALKBH1 ; ОМА : ALKBH1 – ортологи
Номер ЕС	4.2.99.18
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 14 (human) Band 14q24.3 Start 77,672,404 bp End 77,708,023 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 12 (mouse) Band 12|12 D2 Start 87,472,610 bp End 87,490,787 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in oocyte secondary oocyte testicle gonad endothelial cell right ventricle cartilage tissue jejunal mucosa gastrocnemius muscle embryo Top expressed in Paneth cell primitive streak spermatocyte hand embryo tail of embryo embryo otic vesicle genital tubercle epiblast More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function methylcytosine dioxygenase activity dioxygenase activity metal ion binding catalytic activity lyase activity chemoattractant activity oxidoreductase activity ferrous iron binding tRNA binding 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity DNA-N1-methyladenine dioxygenase activity tRNA demethylase activity class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity Cellular component mitochondrion nucleus Biological process negative regulation of neuron apoptotic process cell differentiation DNA dealkylation involved in DNA repair placenta development neuron migration in utero embryonic development cellular response to DNA damage stimulus oxidative demethylation developmental growth regulation of gene expression RNA repair DNA demethylation positive chemotaxis metabolism neuron projection development DNA repair regulation of translation tRNA wobble cytosine modification regulation of translational initiation regulation of translational elongation oxidative single-stranded DNA demethylation regulation of mitochondrial translation tRNA demethylation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 8846 211064 Вместе ENSG00000100601 ENSMUSG00000079036 ЮниПрот Q13686 P0CB42 RefSeq (мРНК) НМ_001039506 НМ_006020 НМ_001102565 RefSeq (белок) НП_006011 НП_001096035 Местоположение (UCSC) Чр 14: 77,67 – 77,71 Мб Чр 12: 87,47 – 87,49 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Гомолог 1 AlkB, диоксигеназа гистона H2A представляет собой белок , который у человека кодируется геном ALKBH1 .

Функция

Этот ген кодирует гомолог продукта E. coli гена alkB . Белок alkB E. coli является частью механизма адаптивного ответа на вызванных алкилированием ДНК восстановление повреждений, . Он участвует в устранении повреждений путем окислительного деметилирования и 1-метиладенина 3 -метилцитозина . [предоставлено RefSeq, июль 2008 г.].

См. также

• МГМТ

Дальнейшее чтение

• Аас П.А., Оттерлей М., Фальнес П.О., Вогбё CB, Скорпен Ф., Акбари М., Сундхейм О., Бьорос М., Слупфауг Г., Сиберг Э., Крокан Х.Э. (февраль 2003 г.). «Человеческие и бактериальные окислительные деметилазы восстанавливают повреждения алкилирования как в РНК, так и в ДНК». Природа . 421 (6925): 859–63. Бибкод : 2003Natur.421..859A . дои : 10.1038/nature01363 . ПМИД   12594517 . S2CID   4352520 .
• Вестбай М.П., ​​Фейзи Э., Аас П.А., Вогбо CB, Талстад В.А., Кавли Б., Хаген Л., Сундхейм О., Акбари М., Лиабакк Н.Б., Слупфауг Г., Оттерлей М., Крокан Х.Э. (сентябрь 2008 г.). «Человеческий гомолог AlkB 1 представляет собой митохондриальный белок, который деметилирует 3-метилцитозин в ДНК и РНК» . Ж. Биол. Химия 283 (36): 25046–56. дои : 10.1074/jbc.M803776200 . ПМЦ   3259822 . ПМИД   18603530 .
• Мюллер Т.А., Мик К., Хаузингер Р.П. (январь 2010 г.). «Гомолог 1 AlkB человека (ABH1) проявляет ДНК-лиазную активность в абазических сайтах» . Восстановление ДНК (Амст.) . 9 (1): 58–65. дои : 10.1016/j.dnarep.2009.10.011 . ПМЦ   2818486 . ПМИД   19959401 .
• Шанкарачарья, Дас С., Видьярти А.С. (сентябрь 2011 г.). «Моделирование гомологии и прогнозирование функции hABH1, участвующей в восстановлении ДНК, поврежденной алкилированием». Междисциплинарная наука . 3 (3): 175–81. дои : 10.1007/s12539-011-0087-4 . ПМИД   21956739 . S2CID   187339 .
• Мюллер Т.А., Анджейак М.М., Хаузингер Р.П. (июнь 2013 г.). «Ковалентный аддукт белок-ДНК-5'-продукт образуется в результате активности AP-лиазы человеческого ALKBH1 (гомолог AlkB 1)» . Биохим. Дж . 452 (3): 509–18. дои : 10.1042/BJ20121908 . ПМК   4126167 . ПМИД   23577621 .
• Мюллер Т.А., Ю.К., Хаузингер Р.П., Мик К. (2013). «ALKBH1 незаменим для расщепления абазисного сайта во время эксцизионной репарации основания и рекомбинации переключения классов» . ПЛОС ОДИН . 8 (6): e67403. Бибкод : 2013PLoSO...867403M . дои : 10.1371/journal.pone.0067403 . ПМЦ   3692455 . ПМИД   23825659 .
• Феделес Б.И., Сингх В., Делани Дж.К., Ли Д., Эссигманн Дж.М. (август 2015 г.). «Семейство AlkB Fe (II) / α-кетоглутарат-зависимых диоксигеназ: устранение повреждений, вызванных алкилированием нуклеиновых кислот, и не только» . Ж. Биол. Хим . 290 (34): 20734–42. дои : 10.1074/jbc.R115.656462 . ПМЦ   4543635 . ПМИД   26152727 .
• Хааг С., Слоан К.Э., Ранжан Н., Варда А.С., Кречмер Дж., Блессинг С., Хюбнер Б., Сейковски Дж., Деннерляйн С., Релинг П., Роднина М.В., Хёбартнер С., Бонсак М.Т. (октябрь 2016 г.). «NSUN3 и ABH1 изменяют положение колебания mt-tRNAMet, чтобы расширить распознавание кодонов при митохондриальной трансляции» (PDF) . ЭМБО Дж . 35 (19): 2104–2119. дои : 10.15252/embj.201694885 . ПМК   5048346 . ПМИД   27497299 .
• Лю Ф, Кларк В, Ло Джи, Ван Х, Фу Ю, Вэй Дж, Ван Х, Хао З, Дай Ц, Чжэн Г, Ма Х, Хан Д, Эванс М, Клунгланд А, Пан Т, Хэ С (октябрь 2016 г.) ). «ALKBH1-опосредованное деметилирование тРНК регулирует трансляцию» . Клетка . 167 (3): 816–828.e16. дои : 10.1016/j.cell.2016.09.038 . ПМК   5119773 . ПМИД   27745969 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .