CUTL1
CUX1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | CUX1 , CASP, CDP, CDP/Cut, CDP1, COY1, CUTL1, CUX, Clox, Cux/CDP, GOLIM6, Nbla10317, p100, p110, p200, p75, вырезается как гомеобокс 1, GDDI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 116896 ; Гомологен : 22551 ; Генные карты : CUX1 ; OMA : CUX1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Cux1 (CUTL1, CDP, CDP/Cux) — гомеодоменный белок , который у человека кодируется CUX1 геном . [3] [4] [5] [6]
Функция
[ редактировать ]Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства гомеодоменовых ДНК-связывающих белков. Он регулирует экспрессию генов, морфогенез и дифференцировку, а также играет роль в развитии клеточного цикла, особенно в S-фазе. Описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскрипта этого гена, но полноразмерная природа некоторых из этих вариантов не определена, а изоформа p200 Cux1 подвергается протеолитическому процессингу до более мелких активных изоформ, таких как p110. [6] Связывание ДНК Cux1 стимулируется активацией рецептора, связанного с G-белком клеточной поверхности PAR2/F2RL1 , в фибробластах и эпителиальных клетках рака молочной железы для регуляции матриксной металлопротеиназы 10 , интерлейкина-1-альфа и циклооксигеназы 2 (COX2) . генов [7]
Роль в росте опухоли
[ редактировать ]Генетические данные более чем 7600 больных раком показывают, что более 1% имеют деактивированный CUX1, который связан с прогрессированием роста опухоли. Исследователи из Wellcome Trust Sanger Institute сообщили, что мутация CUX1 снижает ингибирующее действие биологического ингибитора PIK3IP1 (белок 1, взаимодействующий с фосфоинозитид-3-киназой), что приводит к повышению активности фермента , способствующего росту , фосфоинозитид-3-киназы (PI3K). ), что приводит к прогрессированию опухоли. Хотя CUX1 мутирует с меньшей скоростью по сравнению с другими известными генными мутациями, вызывающими рак, в этом исследовании обнаружено, что этот деактивированный ген при многих типах рака является основной причиной заболевания. [8] [9]
КАСП
[ редактировать ]
UX1 , впервые гена продукте , полученном альтернативным C сплайсингом О сообщалось в 1997 году. [11] [а] Ген CUX1 имеет до 33 экзонов . CASP мРНК включает экзоны с 1 по 14 и с 25 по 33. [13] Предполагается, что белок CASP человека будет содержать 678 аминокислот , из которых 400 являются общими с CUTL1. [11] Белок CASP имеет массу примерно кД 80 . [11] У него отсутствует ДНК-связывающая область CUTL1, [11] [14] но вместо этого содержит трансмембранный домен, который позволяет ему встраиваться в липидные бислои. [14] Он локализован в аппарате Гольджи . [14]
Сообщалось, что CASP является частью комплекса с Golgin 84 , который связывает COPI везикулы и важен для ретроградного транспорта в Гольджи и между Гольджи и эндоплазматическим ретикулумом . [15] Нацеливание на везикулы включает в себя привязи и SNARE . [15]
Взаимодействия
[ редактировать ]
Было показано, что Cux1 (CUTL1, CDP, CDP/Cux) взаимодействует с:
Об этих физических взаимодействиях сообщается в BioPlex 2.0.
Примечания
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000257923 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Шерер С.В., Нойфельд Э.Дж., Ливенс П.М., Оркин С.Х., Ким Дж., Цуй Л.К. (май 1993 г.). «Региональная локализация гена белка смещения CCAAT (CUTL1) в 7q22 путем анализа гибридов соматических клеток». Геномика . 15 (3): 695–6. дои : 10.1006/geno.1993.1130 . ПМИД 8468066 .
- ^ Глекнер Г., Шерер С., Шаттевой Р., Борайт А., Вебер Дж., Цуй Л.К., Розенталь А. (декабрь 1998 г.). «Крупномасштабное секвенирование двух регионов хромосомы 7q22 человека: анализ геномной последовательности размером 650 т.п.н. вокруг локусов EPO и CUTL1 выявил 17 генов» . Геном Рез . 8 (10): 1060–73. дои : 10.1101/гр.8.10.1060 . ПМК 310788 . ПМИД 9799793 .
- ^ Ока Т., Унгар Д., Хьюсон Ф.М., Кригер М. (апрель 2004 г.). «Комплексы COG и COPI взаимодействуют, чтобы контролировать количество GEAR, подмножества интегральных мембранных белков Гольджи» . Мол. Биол. Клетка . 15 (5): 2423–35. doi : 10.1091/mbc.E03-09-0699 . ПМК 404034 . ПМИД 15004235 .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтреза: CUTL1, подобный 1, белок замещения CCAAT (дрозофила)» .
- ^ Уилсон Б.Дж., Харада Р., Ледуи Л., Холленберг М.Д., Непвеу А. (январь 2009 г.). «Фактор транскрипции CUX1 является нижестоящим эффектором рецептора 2, активируемого протеиназой (PAR2)» . Ж. Биол. Хим . 284 (1): 36–45. дои : 10.1074/jbc.M803808200 . ПМИД 18952606 .
- ^ Пресс-релиз (8 декабря 2013 г.). «Ген способствует возникновению одной из ста опухолей» . Wellcome Trust Sanger Institute . Проверено 17 декабря 2013 г.
- ^ Вонг CC, Мартинкорена I, Rust AG и др. (2013). «Инактивация мутаций CUX1 способствует онкогенезу» . Природная генетика . 46 (1): 33–8. дои : 10.1038/ng.2846 . ПМЦ 3874239 . ПМИД 24316979 .
- ^ Сода М., Мисуми Ю., Ямамото А., Накамура Н., Огата С., Сакисака С., Хиросе С., Икехара Ю., Ода К. (2010). «Взаимодействие Гольгина-84 с комплексом ЦОГ опосредует ретроградный транспорт внутри Гольджи» . Трафик . 11 (12): 1552–66. дои : 10.1111/j.1600-0854.2010.01123.x . ПМИД 20874812 . S2CID 20424336 .
- ^ Jump up to: а б с д Ливенс П.М., Туфарелли С., Донади Дж.Дж., Стэгг А., Нойфельд Э.Дж. (1997). «CASP, новый, высококонсервативный продукт альтернативного сплайсинга гена CDP/cut/cux, не имеет доменов Cut-Repeat и гомео-ДНК-связывающих доменов и взаимодействует с полноразмерным CDP in vitro». Джин . 197 (1–2): 73–81. дои : 10.1016/s0378-1119(97)00243-6 . ПМИД 9332351 .
- ^ Мансур М., Ли С.Ю., Похайдак Б. (2002). «N-концевой спиральный домен семейства цитогезинов/ARNO факторов обмена гуаниновых нуклеотидов взаимодействует с каркасным белком CASP» . Журнал биологической химии . 277 (35): 32302–9. дои : 10.1074/jbc.M202898200 . ПМИД 12052827 .
- ^ Рамдзан З.М., Непвеу А (2014). «CUX1, гаплонедостаточный ген-супрессор опухоли, сверхэкспрессирующийся при поздних стадиях рака» . Обзоры природы Рак . 14 (10): 673–82. дои : 10.1038/nrc3805 . ПМИД 25190083 . S2CID 20468440 .
- ^ Jump up to: а б с Джиллингем А.К., Пфайфер AC, Манро С. (2002). «CASP, продукт альтернативного сплайсинга гена, кодирующего фактор транскрипции белка замещения CCAAT, представляет собой мембранный белок аппарата Гольджи, родственный гигантину» . Молекулярная биология клетки . 13 (11): 3761–74. doi : 10.1091/mbc.E02-06-0349 . ПМК 133590 . ПМИД 12429822 .
- ^ Jump up to: а б Мальсам Дж., Сато А., Пеллетье Л., Уоррен Дж. (2005). «Привязи Гольгина определяют субпопуляции везикул COPI». Наука . 307 (5712): 1095–8. Бибкод : 2005Sci...307.1095M . дои : 10.1126/science.1108061 . ПМИД 15718469 . S2CID 12601850 .
- ^ Ли С., Ауфиеро Б., Шильц Р.Л., Уолш М.Дж. (июнь 2000 г.). «Регуляция функции смещения / разрезания гомеодомена CCAAT белка с помощью гистон-ацетилтрансфераз p300 / фактора, связанного с CREB-связывающим белком (CBP), и CBP» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (13): 7166–71. Бибкод : 2000PNAS...97.7166L . дои : 10.1073/pnas.130028697 . ПМК 16517 . ПМИД 10852958 .
- ^ Гупта С., Луонг М.Х., Блюминг С.А., Миле А., Луонг М., Янг Д., Кнудсен Э.С., Ван Вийнен А.Дж., Штейн Дж.Л., Штейн Г.С. (сентябрь 2003 г.). «Супрессор опухоли pRB действует как ко-репрессор белка замещения CCAAT (CDP / Cut), чтобы регулировать транскрипцию гистона H4, контролируемую клеточным циклом». Дж. Селл. Физиол . 196 (3): 541–56. дои : 10.1002/jcp.10335 . ПМИД 12891711 . S2CID 2287673 .
- ^ Лю Дж., Барнетт А., Нойфельд Э.Дж., Дадли Дж.П. (июль 1999 г.). «Гомеопротеины CDP и SATB1 взаимодействуют: потенциал тканеспецифической регуляции» . Мол. Клетка. Биол . 19 (7): 4918–26. дои : 10.1128/mcb.19.7.4918 . ПМЦ 84297 . ПМИД 10373541 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Оттоленги С., Мантовани Р., Николис С., Рончи А., Джильони Б. (1990). «Последовательности ДНК, регулирующие транскрипцию гена глобина человека при неделеционной наследственной персистенции фетального гемоглобина». Гемоглобин . 13 (6): 523–41. дои : 10.3109/03630268908993104 . ПМИД 2481658 .
- Непвеу А (2001). «Роль многофункционального транскрипционного фактора гомеодомена CDP/Cut/Cux в регуляции дифференцировки, роста и развития клеток». Джин . 270 (1–2): 1–15. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00485-1 . ПМИД 11403998 .
- Нойфельд Э.Дж., Скальник Д.Г., Ливенс П.М., Оркин Ш.Х. (1993). «Человеческий белок замещения CCAAT гомологичен гомеопротеину дрозофилы, разрезанный». Нат. Жене . 1 (1): 50–5. дои : 10.1038/ng0492-50 . ПМИД 1301999 . S2CID 37107643 .
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
- Черноусов М.А., Шталь Р.К., Кэри DJ (1996). «Шванновские клетки секретируют новый коллагеноподобный адгезивный белок, который связывает N-синдекан» . Ж. Биол. Хим . 271 (23): 13844–53. дои : 10.1074/jbc.271.23.13844 . ПМИД 8662884 .
- Ливенс П.М., Туфарелли С., Донади Дж.Дж., Стэгг А., Нойфельд Э.Дж. (1997). «CASP, новый, высококонсервативный продукт альтернативного сплайсинга гена CDP/cut/cux, не имеет доменов Cut-Repeat и гомео-ДНК-связывающих доменов и взаимодействует с полноразмерным CDP in vitro». Джин . 197 (1–2): 73–81. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00243-6 . ПМИД 9332351 .
- Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
- Чаттопадхай С., Уайтхерст К.Э., Чен Дж. (1998). «Область прикрепления ядерного матрикса выше энхансера гена бета-рецептора Т-клеток связывает Cux/CDP и SATB1 и модулирует зависимую от энхансера экспрессию репортерного гена, но не экспрессию эндогенного гена» . Ж. Биол. Хим . 273 (45): 29838–46. дои : 10.1074/jbc.273.45.29838 . ПМИД 9792700 .
- Лю Дж., Барнетт А., Нойфельд Э.Дж., Дадли Дж.П. (1999). «Взаимодействие гомеопротеинов CDP и SATB1: потенциал тканеспецифической регуляции» . Мол. Клетка. Биол . 19 (7): 4918–26. дои : 10.1128/mcb.19.7.4918 . ПМЦ 84297 . ПМИД 10373541 .
- Ронг Зенг В., Суси Э., Сунг Мун Н., Мартин-Судан Н., Берубе Г., Ледюй Л., Непвеу А. (2000). «Структура экзона/интрона и альтернативные транскрипты гена CUTL1». Джин . 241 (1): 75–85. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00465-5 . ПМИД 10607901 .
- Мартин-Судан Н., Драхман Дж.Г., Каушанский К., Непвеу А. (2000). «Активность связывания ДНК CDP/Cut снижается в гранулоцитах, макрофагах и эритроцитах, но остается повышенной в дифференцирующихся мегакариоцитах». Лейкемия . 14 (5): 863–73. дои : 10.1038/sj.leu.2401764 . ПМИД 10803519 . S2CID 19998783 .
- Ли С., Ауфиеро Б., Шильц Р.Л., Уолш М.Дж. (2000). «Регуляция функции смещения / разрезания гомеодомена CCAAT белка с помощью гистон-ацетилтрансфераз p300 / фактора, связанного с CREB-связывающим белком (CBP), и CBP» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (13): 7166–71. Бибкод : 2000PNAS...97.7166L . дои : 10.1073/pnas.130028697 . ПМК 16517 . ПМИД 10852958 .
- Нироди С., Харт Дж., Дхаван П., Мун Н.С., Непвеу А., Ричмонд А. (2001). «Роль CDP в отрицательной регуляции экспрессии гена CXCL1» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 26122–31. дои : 10.1074/jbc.M102872200 . ПМЦ 2665279 . ПМИД 11371564 .
- Мун Н.С., Премдас П., Траскотт М., Ледуи Л., Берубе Г., Непвеу А. (2001). «Для активации стабильного связывания ДНК с помощью CDP/разрезанного гомеодоменного белка необходимо протеолитическое расщепление S-фазы» . Мол. Клетка. Биол . 21 (18): 6332–45. дои : 10.1128/MCB.21.18.6332-6345.2001 . ПМК 87367 . ПМИД 11509674 .
- Сантагуида М., Дин К., Берубе Дж., Траскотт М., Уайт П., Непвеу А. (2002). «Фосфорилирование белка замещения CCAAT (CDP)/фактора транскрипции Cux с помощью циклина A-Cdk1 модулирует его ДНК-связывающую активность в G (2)» . Ж. Биол. Хим . 276 (49): 45780–90. дои : 10.1074/jbc.M107978200 . ПМИД 11584018 .
- Динтильяк А., Бернюес Дж. (2002). «HMGB1 взаимодействует со многими явно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности» (PDF) . Ж. Биол. Хим . 277 (9): 7021–8. дои : 10.1074/jbc.M108417200 . ПМИД 11748221 . S2CID 39560486 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- CUTL1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- человека Местоположение генома CUX1 и страница сведений о гене CUX1 в браузере генома UCSC .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .