БиоПлекс

Сеть взаимодействия MED1 , одной из субъединиц комплекса Медиатор.

BioPlex ( биофизические - белковых взаимодействия на O RFeome основе комплексов ) — ресурс с открытым доступом для изучения белок взаимодействий. ^[1]^[2]^[3] Это результат сотрудничества Гарвардской медицинской школы и Biogen . BioPlex 1.0 сообщил о 23 744 взаимодействиях между 7 668 белками. ^[4] BioPlex 2.0 расширил эти наблюдения и обнаружил более 29 000 новых взаимодействий. ^[5]

Основная технология заключается в экспрессии белка-приманки в клетках человека. Эти белки-приманки взаимодействуют с другими белками, а затем комплексы белков-приманок и «добычи» выделяются путем аффинной очистки . Взаимодействующие белки-жертвы идентифицируются с помощью масс-спектрометрии .

Использование в исследованиях

Определение партнеров по взаимодействию плохо охарактеризованных белков может дать ключ к пониманию функции этих белков, а знание того, в каком «белковом сообществе» находится ген заболевания, может дать лучший контекст для его действия. ^[5]

См. также

Ссылки

^ анон. «БиоПлекс» . Гарвард.edu . Гарвард.edu . Проверено 24 мая 2017 г.
^ анон (18 июля 2015 г.). «Фейсбук для протеома» . Technology.org . Technology.org . Проверено 24 мая 2017 г.
^ анон. «Новое исследование отображает белковые взаимодействия четверти человеческого генома» . phys.org/ . физ.орг . Проверено 24 мая 2017 г.
^ Хаттлин Э.Л., Тинг Л., Брукнер Р.Дж., Гебреаб Ф., Гиги МП, Шпит Дж., Там С., Заррага Г., Колби Дж., Балтиер К., Донг Р., Гуарани В., Вайтес Л.П., Ордюро А., Рад Р., Эриксон Б.К., Вюр М. , Чик Дж., Чжай Б., Колиппаккам Д., Минцерис Дж., Обар Р.А., Харрис Т., Артаванис-Цаконас С., Сова М.Е., Де Камилли П., Пауло Дж.А., Харпер Дж.В., Гиги С.П. (2015). «Сеть BioPlex: систематическое исследование человеческого интерактома» . Клетка . 162 (2): 425–40. дои : 10.1016/j.cell.2015.06.043 . ПМЦ 4617211 . ПМИД 26186194 .
^ Jump up to: ^а ^б Хаттлин Э.Л., Брукнер Р.Дж., Пауло Дж.А., Кэннон Дж.Р., Тинг Л., Балтиер К., Колби Дж., Гебреаб Ф., Гиги М.П., Парзен Х., Шпит Дж., Там С., Заррага Г., Понтано-Вайтес Л., Сваруп С., Уайт А.Э., Швеппе Д.К., Рад Р., Эриксон Б.К., Обар Р.А., Гурухарша К.Г., Ли К., Артаванис-Цаконас С., Гиги С.П., Харпер Дж.В. (2017). «Архитектура интерактома человека определяет белковые сообщества и сети заболеваний» . Природа . 545 (7655): 505–509. Бибкод : 2017Natur.545..505H . дои : 10.1038/nature22366 . ПМЦ 5531611 . ПМИД 28514442 .

[1] анон. «БиоПлекс» . Гарвард.edu . Гарвард.edu . Проверено 24 мая 2017 г.

[2] анон (18 июля 2015 г.). «Фейсбук для протеома» . Technology.org . Technology.org . Проверено 24 мая 2017 г.

[3] анон. «Новое исследование отображает белковые взаимодействия четверти человеческого генома» . phys.org/ . физ.орг . Проверено 24 мая 2017 г.

[pmid26186194-4] Хаттлин Э.Л., Тинг Л., Брукнер Р.Дж., Гебреаб Ф., Гиги МП, Шпит Дж., Там С., Заррага Г., Колби Дж., Балтиер К., Донг Р., Гуарани В., Вайтес Л.П., Ордюро А., Рад Р., Эриксон Б.К., Вюр М. , Чик Дж., Чжай Б., Колиппаккам Д., Минцерис Дж., Обар Р.А., Харрис Т., Артаванис-Цаконас С., Сова М.Е., Де Камилли П., Пауло Дж.А., Харпер Дж.В., Гиги С.П. (2015). «Сеть BioPlex: систематическое исследование человеческого интерактома» . Клетка . 162 (2): 425–40. дои : 10.1016/j.cell.2015.06.043 . ПМЦ 4617211 . ПМИД 26186194 .

[pmid28514442-5] Jump up to: ^а ^б Хаттлин Э.Л., Брукнер Р.Дж., Пауло Дж.А., Кэннон Дж.Р., Тинг Л., Балтиер К., Колби Дж., Гебреаб Ф., Гиги М.П., Парзен Х., Шпит Дж., Там С., Заррага Г., Понтано-Вайтес Л., Сваруп С., Уайт А.Э., Швеппе Д.К., Рад Р., Эриксон Б.К., Обар Р.А., Гурухарша К.Г., Ли К., Артаванис-Цаконас С., Гиги С.П., Харпер Дж.В. (2017). «Архитектура интерактома человека определяет белковые сообщества и сети заболеваний» . Природа . 545 (7655): 505–509. Бибкод : 2017Natur.545..505H . дои : 10.1038/nature22366 . ПМЦ 5531611 . ПМИД 28514442 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]