ММП10

ММП10
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1Q3A, 3V96, 4ILW
Идентификаторы
Псевдонимы	MMP10 , SL-2, STMY2, матриксная металлопептидаза 10
Внешние идентификаторы	Опустить : 185260 ; МГИ : 97007 ; Гомологен : 20546 ; Генные карты : MMP10 ; ОМА : MMP10 – ортологи
Номер ЕС	3.4.24.22
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	102,780,628 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	7,510,241 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of paranasal sinus; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; palpebral conjunctiva; ; nasal epithelium; ; cartilage tissue; ; islet of Langerhans; ; epithelium of nasopharynx; ; stromal cell of endometrium; ; pancreatic epithelial cell; ; decidua;
	Top expressed in
	duodenum; ; jejunum; ; Paneth cell; ; integument; ; decidua; ; ileum; ; colon; ; ovary; ; muscle of leg; ; uterus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	zinc ion binding; peptidase activity; metalloendopeptidase activity; hydrolase activity; metallopeptidase activity; metal ion binding; serine-type endopeptidase activity;
Cellular component	extracellular region; extracellular space; extracellular matrix;
Biological process	collagen catabolic process; extracellular matrix disassembly; regulation of cell migration; proteolysis; response to hypoxia; extracellular matrix organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4319
	17384
	ENSG00000166670
	ENSMUSG00000047562
	P09238
	О55123
	НМ_002425
	НМ_019471
	НП_002416
	НП_062344
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Стромелизин-2, также известный как матриксная металлопротеиназа-10 (MMP-10) или трансин-2, представляет собой фермент , который у человека кодируется MMP10 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Белки семейства матриксных металлопротеиназ ( ММП ) участвуют в разрушении внеклеточного матрикса в нормальных физиологических процессах, таких как эмбриональное развитие, размножение и ремоделирование тканей, а также в болезненных процессах, таких как артрит и метастазирование. Большинство ММП секретируются в виде неактивных пропротеинов, которые активируются при расщеплении внеклеточными протеиназами. Фермент, кодируемый этим геном, расщепляет протеогликаны и фибронектин . Этот ген является частью кластера генов MMP, которые локализуются на хромосоме 11q22.3. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

MMP10 связана с жизнеспособностью раковых стволовых клеток и метастазированием. ^{[ 8 ]}

MMP10 является потенциальным прогностическим биомаркером рака полости рта . ^{[ 9 ]}^{[ ненадежный медицинский источник ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000166670 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000047562 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мюллер Д., Квантин Б., Геснель М.К., Миллон-Коллар Р., Абекассис Дж., Бренак Р. (июль 1988 г.). «Семейство генов коллагеназы у человека состоит как минимум из четырех членов» . Биохимический журнал . 253 (1): 187–92. дои : 10.1042/bj2530187 . ПМЦ 1149273 . ПМИД 2844164 .
^ Юнг Дж.Й., Уортер С., Румплер Ю. (1990). «Локализация гена стромелизина 2 в области q22.3-23 хромосомы 11 путем гибридизации in situ». Анналы Генетики . 33 (1): 21–3. ПМИД 2369069 .
^ «Ген Энтрез: матриксная металлопептидаза MMP10 10 (стромелизин 2)» .
^ Жюстильен В., Регала Р.П., Ценг И.С., Уолш, член парламента, Батра Дж., Радиски Э.С., Мюррей Н.Р., Филдс АП (2012). «Матричная металлопротеиназа-10 необходима для поддержания стволовых клеток рака легких, возникновения опухоли и метастатического потенциала» . ПЛОС ОДИН . 7 (4): e35040. Бибкод : 2012PLoSO...735040J . дои : 10.1371/journal.pone.0035040 . ПМЦ 3335833 . ПМИД 22545096 .
^ Упадхьяй П., Гарди Н., Десаи С., Чандрани П., Джоши А., Дхарават Б., Арора П., Бал М., Наир С., Датт А. (2017). «Геномная характеристика ВПЧ-отрицательных опухолей языка на ранних стадиях, вызванных жеванием табака/орехов, идентифицирует MMP10 как кандидата для прогнозирования метастазов» . Оральная онкология . 73 : 56–64. doi : 10.1016/j.oraloncology.2017.08.003 . ПМЦ 5628952 . ПМИД 28939077 .

Дальнейшее чтение

Чендлер С., Миллер К.М., Клементс Дж.М., Лури Дж., Коркилл Д., Энтони Д.К., Адамс С.Е., Гиринг А.Дж. (февраль 1997 г.). «Матриксные металлопротеиназы, фактор некроза опухоли и рассеянный склероз: обзор». Журнал нейроиммунологии . 72 (2): 155–61. дои : 10.1016/S0165-5728(96)00179-8 . ПМИД 9042108 . S2CID 26495949 .
Нагасе Х., Весснер Дж. Ф. (июль 1999 г.). «Матриксные металлопротеиназы» . Журнал биологической химии . 274 (31): 21491–4. дои : 10.1074/jbc.274.31.21491 . ПМИД 10419448 .
Фосанг А.Дж., Ним П.Дж., Хардингем Т.Э., Мерфи Дж., Гамильтон Дж.А. (август 1991 г.). «Расщепление хрящевого протеогликана между доменами G1 и G2 стромелизинами» . Журнал биологической химии . 266 (24): 15579–82. дои : 10.1016/S0021-9258(18)98442-5 . ПМИД 1874716 .
Сирум К.Л., Бринкерхофф CE (октябрь 1989 г.). «Клонирование генов стромелизина человека и стромелизина 2: дифференциальная экспрессия в ревматоидных синовиальных фибробластах». Биохимия . 28 (22): 8691–8. дои : 10.1021/bi00448a004 . ПМИД 2605216 .
Лихтингхаген Р., Хельмбрехт Т., Арндт Б., Бёкер К.Х. (февраль 1995 г.). «Характер экспрессии матриксных металлопротеиназ в печени человека». Европейский журнал клинической химии и клинической биохимии . 33 (2): 65–71. CiteSeerX 10.1.1.633.9185 . дои : 10.1515/cclm.1995.33.2.65 . ПМИД 7632822 . S2CID 34999090 .
Нгуен К., Мерфи Дж., Хьюз С.Э., Морт Дж.С., Раули П.Дж. (октябрь 1993 г.). «Матричные металлопротеиназы расщепляют два разных участка белка хрящевой связи человека» . Биохимический журнал . 295 (Часть 2): 595–8. дои : 10.1042/bj2950595 . ПМЦ 1134922 . ПМИД 7694569 .
Конка В., Уиллмрот Ф (июнь 1994 г.). «Т-лимфоциты человека экспрессируют члена семейства генов матриксных металлопротеиназ». Артрит и ревматизм . 37 (6): 951–6. дои : 10.1002/арт.1780370626 . ПМИД 8003069 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Гак С., Валлон Р., Шапер Дж., Рютер Ю., Анхель П. (апрель 1994 г.). «Фенотипические изменения у fos-трансгенных мышей коррелируют с изменениями в экспрессии Fos/Jun-зависимой коллагеназы типа I. Регуляция металлопротеиназ мыши канцерогенами, опухолевыми промоторами, цАМФ и онкопротеином Fos» . Журнал биологической химии . 269 (14): 10363–9. дои : 10.1016/S0021-9258(17)34069-3 . ПМИД 8144618 .
Виндзор Л.Дж., Гренетт Х., Биркедал-Хансен Б., Бодден М.К., Энглер Дж.А., Биркедал-Хансен Х. (август 1993 г.). «Тип-специфическая регуляция генов SL-1 и SL-2. Индукция гена SL-2, но не гена SL-1, кератиноцитами человека в ответ на цитокины и форболестеры» . Журнал биологической химии . 268 (23): 17341–7. дои : 10.1016/S0021-9258(19)85340-1 . ПМИД 8349617 .
Кнойпер В., Мерфи Г., Чеше Х. (январь 1996 г.). «Активация проколлагеназы нейтрофилов человека стромелизином 2». Европейский журнал биохимии . 235 (1–2): 187–91. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.00187.x . ПМИД 8631328 .
Пендас А.М., Сантамария И., Альварес М.В., Притчард М., Лопес-Отин С. (октябрь 1996 г.). «Тонкое физическое картирование генов матриксной металлопротеиназы человека, сгруппированных на хромосоме 11q22.3». Геномика . 37 (2): 266–8. дои : 10.1006/geno.1996.0557 . ПМИД 8921407 .
Сорса Т., Сало Т., Койвунен Э., Тюнеля Дж., Конттинен Ю.Т., Бергманн Ю., Тууттила А., Ниеми Э., Теронен О., Хейккиля П., Чеше Х., Лейнонен Дж., Осман С., Стенман У.Х. (август 1997 г.). «Активация проколлагеназ IV типа опухолеассоциированным трипсином-2» . Журнал биологической химии . 272 (34): 21067–74. дои : 10.1074/jbc.272.34.21067 . ПМИД 9261109 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Мадленер М., Вернер С. (ноябрь 1997 г.). «Клонирование кДНК и экспрессия гена, кодирующего мышиный стромелизин-2 (MMP-10)». Джин . 202 (1–2): 75–81. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00456-3 . ПМИД 9427548 .
Накамура Х, Фуджи Ю, Оучи Э, Ямамото Э, Окада Ю (апрель 1998 г.). «Активация предшественника человеческого стромелизина 2 и его взаимодействие с другими матриксными металлопротеиназами» . Европейский журнал биохимии . 253 (1): 67–75. дои : 10.1046/j.1432-1327.1998.2530067.x . ПМИД 9578462 .
Борд С., Хорнер А., Хембри Р.М., Компстон Дж.Э. (июль 1998 г.). «Экспрессия стромелизина-1 (MMP-3) и стромелизина-2 (MMP-10) в развитии костей человека: потенциальная роль в развитии скелета». Кость . 23 (1): 7–12. дои : 10.1016/S8756-3282(98)00064-7 . ПМИД 9662124 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS . по пептидазам и их ингибиторам: M10.006
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P09238 (Stromelysin-2) в PDBe-KB .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000166670 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000047562 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2844164-5] Мюллер Д., Квантин Б., Геснель М.К., Миллон-Коллар Р., Абекассис Дж., Бренак Р. (июль 1988 г.). «Семейство генов коллагеназы у человека состоит как минимум из четырех членов» . Биохимический журнал . 253 (1): 187–92. дои : 10.1042/bj2530187 . ПМЦ 1149273 . ПМИД 2844164 .

[pmid2369069-6] Юнг Дж.Й., Уортер С., Румплер Ю. (1990). «Локализация гена стромелизина 2 в области q22.3-23 хромосомы 11 путем гибридизации in situ». Анналы Генетики . 33 (1): 21–3. ПМИД 2369069 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: матриксная металлопептидаза MMP10 10 (стромелизин 2)» .

[pmid22545096-8] Жюстильен В., Регала Р.П., Ценг И.С., Уолш, член парламента, Батра Дж., Радиски Э.С., Мюррей Н.Р., Филдс АП (2012). «Матричная металлопротеиназа-10 необходима для поддержания стволовых клеток рака легких, возникновения опухоли и метастатического потенциала» . ПЛОС ОДИН . 7 (4): e35040. Бибкод : 2012PLoSO...735040J . дои : 10.1371/journal.pone.0035040 . ПМЦ 3335833 . ПМИД 22545096 .

[pmid28939077-9] Упадхьяй П., Гарди Н., Десаи С., Чандрани П., Джоши А., Дхарават Б., Арора П., Бал М., Наир С., Датт А. (2017). «Геномная характеристика ВПЧ-отрицательных опухолей языка на ранних стадиях, вызванных жеванием табака/орехов, идентифицирует MMP10 как кандидата для прогнозирования метастазов» . Оральная онкология . 73 : 56–64. doi : 10.1016/j.oraloncology.2017.08.003 . ПМЦ 5628952 . ПМИД 28939077 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

v т и Протеазы : металлоэндопептидазы ( EC 3.4.24 )
белки ADAM	Альфа-секретазы АДАМ9 АДАМ10 АДАМ17 АДАМ19 АДАМ2 АДАМ7 АДАМ8 АДАМ11 АДАМ12 АДАМ15 АДАМ18 АДАМ22 АДАМ23 АДАМ28 АДАМ33 АДАМЦ1 АДАМЦ2 АДАМТС3 АДАМЦ4 АДАМЦ5 АДАМТС8 АДАМЦ9 АДАМЦ10 ADAMTS12 АДАМТС13
Матриксные металлопротеиназы	Коллагеназы ММП1 ММП8 Желатиназы ММП2 ММП9 ММП3 ММП7 ММП10 ММП11 ММП12 ММП13 ММП14 ММП15 ММП16 ММП17 ММП19 ММП20 ММП21 ММП23А ММП23Б ММП24 ММП25 ММП26 ММП27 ММП28
Другой	Неприлизин Проколлагеновая пептидаза Термолизин Белок А плазмы, связанный с беременностью Костный морфогенетический белок 1 Лизостафин Фермент, расщепляющий инсулин ЗМПСТЭ24

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )