ММП28
| ММП28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | ММП28 , ЭПИЛИЗИН, ММ28, ММП-25, ММП-28, ММП25, матриксная металлопептидаза 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 608417 ; МГИ : 2153062 ; Гомологен : 41559 ; Генные карты : MMP28 ; ОМА : MMP28 – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Матриксная металлопротеиназа 28, также известная как эпилизин, представляет собой фермент , который у человека кодируется MMP28 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Функция
[ редактировать ]Матриксная металлопротеиназа 28, также известная как эпилизин, принадлежит к семейству белков, известных как матриксные металлопротеиназы, которые участвуют в тканевой регуляции. Общеизвестно, что матриксные металлопротеиназы разрушают внеклеточный матрикс, наряду с регулированием рецепторов клеточной поверхности MMP-28 высвобождает факторы роста и молекулы адгезии для модуляции воспаления. [ 8 ] MMP-28 уникален тем, что его можно найти во многих обычных тканях, что указывает на его потенциальную роль в поддержании здоровой структуры и функции большинства тканей. ММП обычно модулируют свою экспрессию через петли отрицательной и положительной обратной связи в результате высвобождения гормонов роста и реагирования на них.
ММП-28 реже обнаруживается в таких тканях, как мозг, толстая кишка, сердце и легкие. [ 9 ] Однако MMP-28 в значительной степени экспрессируется в таких органах, как семенники. Эпилизин также обнаруживается в высоких концентрациях в базальных кератиноцитах поврежденной кожи, даже на некотором расстоянии от раны, что демонстрирует его роль в восстановлении поврежденных тканей. MMP-28 также может изменять клеточную мембрану, делая ее более клейкой и не позволяя клетке мигрировать. [ 10 ]
Структура
[ редактировать ]MMP-28 представляет собой белок длиной 520 аминокислот. Предполагаемая последовательность сигнального пептида выглядит как длинный хвост случайной катушки, отходящей от белка, который помогает направить белок к экскреции с помощью последовательности PRCGVTD. [ 11 ] Каталитический сайт связывания цинка заключен в альфа-спираль в центре белка с последовательностью HEIGHTLGLTH в положениях 240–250 с гемопексиноподобным доменом. Эпилизин содержит 8 экзонов, 5 из которых являются сайтами сплайсинга, уникальными для MMP-28 и не используемыми какой-либо другой металлопротеиназой семейства MMP.
Эпилизин содержит 8 экзонов, 5 из которых являются сайтами сплайсинга, уникальными для MMP-28 и не используемыми какой-либо другой металлопротеиназой семейства MMP.
Полная аминокислотная последовательность указана на сайте uniprot. [ 12 ]
Клинические последствия
[ редактировать ]Сверхэкспрессия MMP-28 связана с метастазированием опухолей при раке. [ 13 ] Экспрессия MMP-28 может быть связана с диаметром опухоли, глубиной инвазии и стадией метастазирования. У пациентов с положительной сверхэкспрессией MMP-28 выживаемость может быть значительно менее вероятной по сравнению с отрицательной экспрессией этого белка, что делает его потенциально важным маркером для превентивного прогноза некоторых форм рака.
MMP-28 также может играть важную роль в распаде миелина . [ 14 ] важный компонент функционирования нервной системы. Демиелинизация может прервать передачу нервных сигналов или даже полностью остановить ее, что может вызвать серьезные неврологические последствия, такие как рассеянный склероз, поперечный миелит и оптиконевромиелит . [ 15 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с ENSG00000271447 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000278843, ENSG00000271447 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020682 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Лохи Дж., Уилсон С.Л., Роби Дж.Д., Паркс У.К. (март 2001 г.). «Эпилизин, новая человеческая матриксная металлопротеиназа (MMP-28), экспрессируемая в семенниках и кератиноцитах и в ответ на травму» . Журнал биологической химии . 276 (13): 10134–10144. дои : 10.1074/jbc.M001599200 . ПМИД 11121398 .
- ^ Марченко Г.Н., Стронгин А.Ю. (март 2001 г.). «MMP-28, новая человеческая матриксная металлопротеиназа с необычной последовательностью переключения цистеина, широко экспрессируется в опухолях». Джин . 265 (1–2): 87–93. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00360-2 . ПМИД 11255011 .
- ^ «Ген Энтрез: матриксная металлопептидаза 28 MMP28» .
- ^ Иллман С.А., Лохи Дж., Кески-Оя Дж. (ноябрь 2008 г.). «Эпилизин (MMP-28) - структура, экспрессия и потенциальные функции» . Экспериментальная дерматология . 17 (11): 897–907. дои : 10.1111/j.1600-0625.2008.00782.x . ПМИД 18803661 . S2CID 9952480 .
- ^ Лохи Дж., Уилсон С.Л., Роби Дж.Д., Паркс У.К. (март 2001 г.). «Эпилизин, новая человеческая матриксная металлопротеиназа (MMP-28), экспрессируемая в семенниках и кератиноцитах и в ответ на травму» . Журнал биологической химии . 276 (13): 10134–10144. дои : 10.1074/jbc.M001599200 . ПМИД 11121398 .
- ^ Роджерс У.Р., Кеворкян Л., Серридж А.К., Уотерс Дж.Г., Свинглер Т.Э., Калли К. и др. (июнь 2009 г.). «Экспрессия и функция матриксной металлопротеиназы (ММП)-28» . Матричная биология . 28 (5): 263–272. дои : 10.1016/j.matbio.2009.04.006 . ПМК 2724077 . ПМИД 19375502 .
- ^ Лохи Дж., Уилсон С.Л., Роби Дж.Д., Паркс У.К. (март 2001 г.). «Эпилизин, новая человеческая матриксная металлопротеиназа (MMP-28), экспрессируемая в семенниках и кератиноцитах и в ответ на травму» . Журнал биологической химии . 276 (13): 10134–10144. дои : 10.1074/jbc.m001599200 . ПМИД 11121398 .
- ^ «Юнипрот» . Унипрот . Проверено 9 мая 2022 г.
- ^ Чжан Дж, Пань Ц, Ян В, Ван Ю, Хэ Х, Чжао Цзи (май 2018 г.). «Сверхэкспрессия MMP21 и MMP28 связана с прогрессированием рака желудка и плохим прогнозом» . Письма об онкологии . 15 (5): 7776–7782. дои : 10.3892/ol.2018.8328 . ПМК 5920775 . ПМИД 29731903 .
- ^ Вернер С.Р., Доцлаф Дж.Э., Смит Р.С. (сентябрь 2008 г.). «ММП-28 как регулятор миелинизации» . BMC Нейронаука . 9:83 . дои : 10.1186/1471-2202-9-83 . ПМЦ 2551619 . ПМИД 18778487 .
- ^ «Узнайте больше о демилинизирующем заболевании, таком как рассеянный склероз» . Клиника Мэйо . Проверено 24 апреля 2022 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Иллман С.А., Кески-Оя Дж., Лохи Дж. (сентябрь 2001 г.). «Характеристика промотора генов эпилизина человека и мыши (MMP-28)». Джин . 275 (1): 185–194. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00664-3 . ПМИД 11574168 .
- Саариальо-Кере У, Керкеля Э, Яхкола Т, Суомела С, Кески-Оя Дж, Лохи Дж (июль 2002 г.). «Экспрессия эпилизина (MMP-28) связана с пролиферацией клеток во время восстановления эпителия» . Журнал исследовательской дерматологии . 119 (1): 14–21. дои : 10.1046/j.1523-1747.2002.01790.x . ПМИД 12164918 .
- Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Гроуз Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С. и др. (декабрь 2002 г.). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
- Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Браш Дж. и др. (октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретируемых белков (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики» . Геномные исследования . 13 (10): 2265–2270. дои : 10.1101/гр.1293003 . ПМЦ 403697 . ПМИД 12975309 .
- Бар-Ор А., Наттолл Р.К., Дадди М., Альтер А., Ким Х.Дж., Иферган И. и др. (декабрь 2003 г.). «Анализ всех членов матриксной металлопротеиназы в лейкоцитах подчеркивает, что моноциты являются основными медиаторами воспаления при рассеянном склерозе» . Мозг . 126 (Часть 12): 2738–2749. дои : 10.1093/brain/awg285 . ПМИД 14506071 .
- Кеворкян Л., Янг Д.А., Дарра С., Донелл С.Т., Шепстон Л., Портер С. и др. (январь 2004 г.). «Профиль экспрессии металлопротеиназ и их ингибиторов в хряще». Артрит и ревматизм . 50 (1): 131–141. дои : 10.1002/арт.11433 . ПМИД 14730609 .
- Бистер В.О., Салмела М.Т., Карьялайнен-Линдсберг М.Л., Урия Дж., Лохи Дж., Пуолаккайнен П. и др. (апрель 2004 г.). «Дифференциальная экспрессия трех матриксных металлопротеиназ, ММП-19, ММП-26 и ММП-28, при нормальном и воспаленном раке кишечника и толстой кишки». Пищеварительные заболевания и науки . 49 (4): 653–661. дои : 10.1023/B:DDAS.0000026314.12474.17 . ПМИД 15185874 . S2CID 34192223 .
- Момохара С., Окамото Х., Комия К., Икари К., Такеучи М., Томацу Т., Каматани Н. (декабрь 2004 г.). «Экспрессия матриксной металлопротеиназы 28/эпилизина в хряще пациентов с ревматоидным артритом и остеоартритом: комментарий к статье Кеворкяна и др.». Артрит и ревматизм . 50 (12): 4074–5, ответ автора 4075. doi : 10.1002/art.20799 . ПМИД 15593191 .
- Рено Ф, Саббатини М, Стелла М, Мальякани Г, Каннас М (2005). «Влияние механического сжатия in vitro на экспрессию эпилизина (матриксной металлопротеиназы-28) в гипертрофических рубцах». Заживление и регенерация ран . 13 (3): 255–261. дои : 10.1111/j.1067-1927.2005.130307.x . ПМИД 15953044 . S2CID 24640193 .