ММП27
| ММП27 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | ММП27 , ММП-27, матриксная металлопептидаза 27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 618101 ; МГИ : 3039232 ; Гомологен : 23345 ; Генные карты : MMP27 ; ОМА : MMP27 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Матриксная металлопептидаза 27, также известная как MMP-27, представляет собой фермент , который у человека кодируется MMP27 геном . [ 5 ]
Структура
[ редактировать ]MMP-27 была обнаружена и клонирована в 1998 году Янгом и Куркиненом. [ 6 ] Первоначально по сравнению с так называемой куриной MMP (CMMP), MMP-27 на самом деле демонстрирует очень небольшую гомологию последовательности с этой протеазой. Гомология последовательностей предсказывает, что ген MMP-27 человека кодирует канонические домены, общие для большинства MMP (аннотация основана на записи Uniprot Q9H306): (i) сигнальный пептид (остатки 1–17), (ii) пропептид ( 18–98). содержащий мотив переключения цистеина (89-96), (iii) каталитический домен (99-263), содержащий типичный HEXXHXXGXXH мотив метцинцинов (семейства M10 и M12 базы данных MEROPS[2]), (iv) богатая пролином шарнирная область (264-278) и (v) гемопексиноподобный домен (279-465), свернутый в виде четырехлопастной β-пропеллер за счет образования дисульфидной связи между двумя фланкирующими остатками Cys (Cys279 и Цис465). ММП-27 можно отнести к стромелизиновой группе ММП, поскольку ММП-27 демонстрирует 51,6% гомологию со стромелизином-2 (ММП-10) и локализуется в кластере ММП, расположенном на хромосоме 11.
Как и шесть известных МТ-ММП, человеческая ММП-27 удлиняется дополнительным С-концевым доменом (466-513). Алгоритм Spoctopus для топологического прогнозирования [ 7 ] предполагает, что это С-концевое расширение (CTE) включает потенциальный трансмембранный домен (490-510). Однако эта последовательность менее гидрофобна, чем в трансмембранных МТ-ММП (ММП-14, -15, -16 и -24), поскольку она содержит гидрофильные/заряженные остатки, в частности His492, Lys493, His504 и Lys507.
Функция
[ редактировать ]Белки семейства матриксных металлопротеиназ (ММП) участвуют в разрушении внеклеточного матрикса в нормальных физиологических процессах, таких как эмбриональное развитие, размножение и ремоделирование тканей, а также в болезненных процессах, таких как артрит и метастазирование . Большинство ММП секретируются в виде неактивных пропротеинов, которые активируются при расщеплении внеклеточными протеиназами . [ 8 ]
Коминелли А. и его коллеги продемонстрировали, что MMP-27 представляет собой необычную протеазу, которая не секретируется и эффективно удерживается в эндоплазматическом ретикулуме в трех клеточных линиях млекопитающих . [ 9 ] Делеционные мутанты и замена рекомбинантной MMP-10 демонстрируют, что уникальное С-концевое удлинение (CTE) MMP-27 необходимо и достаточно для удержания в эндоплазматическом ретикулуме, но не обеспечивает стабильного прикрепления к мембране. Несмотря на гомологию последовательности с MT-MMP, CTE не является трансмембранным доменом и не взаимодействует постоянно с мембраной. Эта уникальная особенность MMP поднимает важные вопросы о потенциальных функциях MMP-27, которые еще предстоит изучить.
Клиническое значение
[ редактировать ]Скудная информация об экспрессии MMP-27 была обнаружена в исследованиях по профилированию экспрессии генов ( микрочипы ) или при анализе характера экспрессии членов семейства MMP во время процессов развития, физиологических или патологических процессов. Транскрипт MMP-27 обнаруживается почти во всех тканях, кроме мозга, при этом наибольшая экспрессия обнаруживается в печени во время развития мышей. [ 10 ] У взрослых мРНК MMP-27 в основном присутствует в В-лимфоцитах, стимулированных анти-IgG/IgM. [ 11 ] костях и почках, но присутствует на более низких уровнях в сердце. [ 12 ]
Недавнее исследование транскриптома из различных тканевых компартментов менструального эндометрия выявило специфическую сверхэкспрессию MMP-27 в областях разрушения стромы. [ 13 ] В другом транскриптомном исследовании было обнаружено увеличение уровня MMP-27 в эндометрии человека в конце секреторной фазы, перед менструацией. [ 14 ] Более того, экспрессия MMP-27 снижается в макрофагах при совместном культивировании с клетками рака яичников. [ 15 ] но повышенная регуляция в хрящах у пациентов с остеоартритом [ 16 ] или при аневризмах брюшной аорты. [ 17 ] MMP-27 также была идентифицирована на уровне белка в MDA-MB-231. линии клеток рака молочной железы [ 18 ] и при первичном раке молочной железы человека. [ 19 ] Недавно было продемонстрировано, что MMP-27 экспрессируется CD163. + /CD206 + макрофаги в эндометрии человека и в поверхностных эндометриоидных поражениях. [ 20 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000137675 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070323 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Нагасе Х., Весснер Дж. Ф. (июль 1999 г.). «Матричные металлопротеиназы» . Ж. Биол. Хим . 274 (31): 21491–4. дои : 10.1074/jbc.274.31.21491 . ПМИД 10419448 .
- ^ Ян М., Куркинен М. (1998). «Клонирование и характеристика новой матриксной металлопротеиназы (MMP), CMMP, из фибробластов куриного эмбриона. CMMP, Xenopus XMMP и человеческая MMP19 имеют консервативный уникальный цистеин в каталитическом домене» . Ж. Биол. Хим . 273 (28): 17893–900. дои : 10.1074/jbc.273.28.17893 . ПМИД 9651395 .
- ^ Виклунд Х., Бернсель А., Скварк М., Элофссон А. (2008). «СПОКТОПУС: комбинированный предиктор сигнальных пептидов и топологии мембранных белков» . Биоинформатика . 24 (24): 2928–9. doi : 10.1093/биоинформатика/btn550 . ПМИД 18945683 .
- ^ «Энтрез Ген: ММП27» .
- ^ Коминелли А., Халбут М., Н'Кули Ф., Лемуан П., Куртой П.Дж., Марбе Э., Тайтека Д., Генриет П. (2014). «Уникальный С-концевой домен позволяет удерживать матриксную металлопротеиназу-27 в эндоплазматическом ретикулуме» . Трафик . 15 (4): 401–17. дои : 10.1111/tra.12149 . ПМИД 24548619 . S2CID 38579214 .
- ^ Наттолл Р.К., Сампиери К.Л., Пеннингтон С.Дж., Гилл С.Е., Шульц Г.А., Эдвардс Д.Р. (2004). «Анализ экспрессии всех семейств генов MMP и TIMP во время развития тканей мыши» . ФЭБС Летт . 563 (1–3): 129–34. дои : 10.1016/S0014-5793(04)00281-9 . ПМИД 15063736 . S2CID 41113107 .
- ^ Бар-Ор А., Наттолл Р.К., Дадди М., Альтер А., Ким Х.Дж., Иферган И., Пеннингтон С.Дж., Бургуэн П., Эдвардс Д.Р., Йонг Фольксваген (2003). «Анализ всех членов матриксной металлопротеиназы в лейкоцитах подчеркивает, что моноциты являются основными медиаторами воспаления при рассеянном склерозе» . Мозг . 126 (Часть 12): 2738–49. дои : 10.1093/brain/awg285 . ПМИД 14506071 .
- ^ Бернал Ф., Хартунг Х.П., Кизейер BC (2005). «Экспрессия тканевой мРНК у крыс недавно описанных матриксных металлопротеиназ» . Биол. Рез . 38 (2–3): 267–71. дои : 10.4067/S0716-97602005000200016 . ПМИД 16238105 .
- ^ Гайд Шевронне Х.П., Галант С., Лемуан П., Куртой П.Дж., Марбе Э., Генриет П. (2009). «Пространственно-временная связь фокальной деградации и реконструкции внеклеточного матрикса в менструальном эндометрии человека» . Эндокринология . 150 (11): 5094–105. дои : 10.1210/en.2009-0750 . ПМИД 19819954 .
- ^ Талби С., Гамильтон А.Е., Во К.С., Тулак С., Овергаард М.Т., Досиу С., Ле Шей Н., Нежат К.Н., Кемпсон Р., Лесси Б.А., Наяк Н.Р., Джудис Л.К. (2006). «Молекулярное фенотипирование эндометрия человека позволяет различать фазы менструального цикла и основные биологические процессы у женщин с нормоовуляцией» . Эндокринология . 147 (3): 1097–121. дои : 10.1210/en.2005-1076 . ПМИД 16306079 .
- ^ Хагеманн Т., Уилсон Дж., Берк Ф., Кульбе Х., Ли Н.Ф., Плюддеманн А., Чарльз К., Гордон С., Балквилл Ф.Р. (2006). «Клетки рака яичников поляризуют макрофаги в сторону фенотипа, связанного с опухолью» . Дж. Иммунол . 176 (8): 5023–32. дои : 10.4049/jimmunol.176.8.5023 . ПМИД 16585599 .
- ^ Кеворкян Л., Янг Д.А., Дарра С., Донелл С.Т., Шепстон Л., Портер С., Брокбанк С.М., Эдвардс Д.Р., Паркер А.Э., Кларк И.М. (2004). «Профиль экспрессии металлопротеиназ и их ингибиторов в хряще» . Ревмирующий артрит . 50 (1): 131–41. дои : 10.1002/арт.11433 . ПМИД 14730609 .
- ^ Ламблин Н., Ратайчак П., Хот Д., Дюбуа Э., Хвастиняк М., Бесеме О., Дробек Х., Лемуан Ю., Кусса М., Амуэль П., Пине Ф. (2010). «Профиль макрофагов при аневризмах брюшной аорты человека: исследование транскриптомных, протеомных белков и белков антител». J. Протеом Рез . 9 (7): 3720–9. дои : 10.1021/pr100250s . ПМИД 20513153 .
- ^ Хегедюс Л., Чо Х., Се Х., Элисейри Г.Л. (2008). «Дополнительные металлопротеиназы матрикса клеток рака молочной железы MDA-MB-231 способствуют инвазивности». Дж. Селл. Физиол . 216 (2): 480–5. дои : 10.1002/jcp.21417 . ПМИД 18286480 . S2CID 10734191 .
- ^ Кёрманн А., Каммерер У., Капп М., Дитль Дж., Анакер Дж. (2009). «Экспрессия матриксных металлопротеиназ (ММП) в первичном раке молочной железы человека и клеточных линиях рака молочной железы: новые результаты и обзор литературы» . БМК Рак . 9 :188. дои : 10.1186/1471-2407-9-188 . ПМК 2706257 . ПМИД 19531263 .
- ^ Коминелли А., Гайд Шевронне Х.П., Лемуан П., Куртой П.Дж., Марбе Э., Генриет П. (2014). «Матричная металлопротеиназа-27 экспрессируется в макрофагах CD163+/CD206+ M2 в циклическом эндометрии человека и в поверхностных эндометриоидных поражениях». Мол. Хм. Репродукция . 20 (8): 767–75. дои : 10.1093/моль/гау034 . ПМИД 24810263 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .