Бета-рецептор X печени

NR1H2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1P8D, 1PQ6, 1PQ9, 1PQC, 1UPV, 1UPW, 3KFC, 3L0E, 4DK7, 4DK8, 4RAK, 5HJP, 4NQA, 5I4V,%%s4NQA
Идентификаторы
Псевдонимы	NR1H2 , LXR-b, LXRB, NER, NER-I, RIP15, UNR, бета-рецептор X печени, подсемейство ядерных рецепторов 1, член группы H 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 600380 ; МГИ : 1352463 ; Гомологен : 21397 ; Генные карты : NR1H2 ; ОМА : NR1H2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	50,383,388 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	44,203,375 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	popliteal artery; ; tibial arteries; ; right coronary artery; ; thoracic aorta; ; left coronary artery; ; ascending aorta; ; Descending thoracic aorta; ; gastric mucosa; ; gastrocnemius muscle; ; muscle of thigh;
	Top expressed in
	granulocyte; ; neural layer of retina; ; lip; ; muscle of thigh; ; right kidney; ; superior frontal gyrus; ; duodenum; ; thymus; ; esophagus; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; ATPase binding; zinc ion binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; metal ion binding; retinoid X receptor binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; steroid hormone receptor activity; apolipoprotein A-I receptor binding; nuclear receptor activity; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; transcription cis-regulatory region binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; transcription factor binding; nuclear receptor coactivator activity; signaling receptor activity;
Cellular component	cytoplasm; nucleoplasm; nucleus; RNA polymerase II transcription regulator complex;
Biological process	positive regulation of high-density lipoprotein particle assembly; negative regulation of proteolysis; positive regulation of triglyceride biosynthetic process; positive regulation of protein metabolic process; negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway; positive regulation of cholesterol transport; regulation of transcription, DNA-templated; cellular lipid metabolic process; regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of secretion of lysosomal enzymes; positive regulation of lipid storage; positive regulation of lipoprotein lipase activity; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of fatty acid biosynthetic process; negative regulation of gene expression; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of cholesterol storage; negative regulation of pinocytosis; positive regulation of gene expression; retinoic acid receptor signaling pathway; positive regulation of cholesterol efflux; positive regulation of pancreatic juice secretion; lipid homeostasis; negative regulation of lipid transport; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; negative regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; steroid hormone mediated signaling pathway; cholesterol homeostasis; lipid metabolism; multicellular organism development; cell differentiation; cellular response to lipopolysaccharide; negative regulation of cold-induced thermogenesis; intracellular receptor signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7376
	22260
	ENSG00000131408
	ENSMUSG00000060601
	P55055
	Q60644
	НМ_007121 ; НМ_001256647
	НМ_001285517 ; НМ_001285518 ; НМ_001285519 ; НМ_009473
	НП_001243576 ; НП_009052 ; НП_009052.3
	НП_001272446 ; НП_001272447 ; НП_001272448 ; НП_033499
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Бета-рецептор X печени ( LXR-β ) является членом семейства рецепторов ядерных транскрипционных факторов . LXR-β кодируется геном NR1H2 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа H, член 2). ^[5]

Функция

Рецепторы X печени (LXR) первоначально были идентифицированы как «сиротские» члены суперсемейства ядерных рецепторов, поскольку их лиганды были неизвестны. Как и другие рецепторы этого семейства, LXR гетеродимеризуются с ретиноидным X-рецептором и связываются с элементами специфического ответа (LXRE), характеризующимися прямыми повторами, разделенными 4 нуклеотидами. Известно, что два гена, альфа ( LXRA ) и бета, кодируют белки LXR. ^[5]^[6]

Структура

Кристаллическая структура рецептора X печени человека β(LXRβ), образующего гетеродимер со своим партнером ретиноидным рецептором X α(RXRα) на его родственном элементе, прямой повтор AGGTCA с интервалом в 4 нт демонстрирует расширенное Х-образное расположение с ДНК- и лиганд- связывающие домены пересеклись. Ядро LXRβ связывается с ДНК посредством канонических контактов и вспомогательных контактов ДНК, которые повышают сродство к отвечающему элементу. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что бета-рецептор X печени взаимодействует с NCOA6. ^[8] и рецептор ретиноида X альфа . ^[9]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000131408 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060601 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: подсемейство 1 ядерного рецептора NR1H2, группа H, член 2» .
^ Сонг С., Хиипакка Р.А., Коконтис Дж.М., Ляо С. (июнь 1995 г.). «Повсеместный рецептор: структуры, иммуноцитохимическая локализация и модуляция активации генов рецепторами ретиноевых кислот и гормонов щитовидной железы». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 761 (2): 38–49. Бибкод : 1995NYASA.761...38S . дои : 10.1111/j.1749-6632.1995.tb31367.x . ПМИД 7625741 . S2CID 27208069 .
^ Лу X, Торессон Дж., Бенод С., Су Дж.Х., Филипс К.Дж., Уэбб П., Густафссон Дж.А. (март 2014 г.). «Структура гетеродимера ретиноидного рецептора X α-рецептора X печени β (RXRα-LXRβ) на ДНК». Структурная и молекулярная биология природы . 21 (3): 277–81. дои : 10.1038/nsmb.2778 . ПМИД 24561505 . S2CID 23226682 .
^ Ли С.К., Юнг С.И., Ким Ю.С., На С.И., Ли Ю.К., Ли Дж.В. (февраль 2001 г.). «Два различных домена взаимодействия с ядерными рецепторами и CREB-связывающая белок-зависимая функция трансактивации активации сигнального коинтегратора-2» . Молекулярная эндокринология . 15 (2): 241–54. дои : 10.1210/mend.15.2.0595 . ПМИД 11158331 .
^ Соль В., Чхве Х.С., Мур Д.Д. (январь 1995 г.). «Выделение белков, специфически взаимодействующих с рецептором ретиноида X: два новых рецептора-сироты» . Молекулярная эндокринология . 9 (1): 72–85. дои : 10.1210/mend.9.1.7760852 . ПМИД 7760852 .

Дальнейшее чтение

Соль В., Чхве Х.С., Мур Д.Д. (январь 1995 г.). «Выделение белков, специфически взаимодействующих с рецептором ретиноида X: два новых рецептора-сироты» . Молекулярная эндокринология . 9 (1): 72–85. дои : 10.1210/mend.9.1.7760852 . ПМИД 7760852 .
Ле Бо М.М., Сонг С., Дэвис Э.М., Хиипакка Р.А., Коконтис Дж.М., Ляо С. (март 1995 г.). «Присвоение гена повсеместного рецептора человека (UNR) 19q13.3 с использованием флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика . 26 (1): 166–8. дои : 10.1016/0888-7543(95)80100-Z . ПМИД 7782080 .
Шинар Д.М., Эндо Н., Ратледж С.Дж., Фогель Р., Родан Г.А., Шмидт А. (сентябрь 1994 г.). «NER, новый член семейства генов, кодирующий ядерный рецептор стероидного гормона человека». Джин . 147 (2): 273–6. дои : 10.1016/0378-1119(94)90080-9 . ПМИД 7926814 .
Сонг С., Коконтис Дж.М., Хиипакка Р.А., Ляо С. (ноябрь 1994 г.). «Вездесущий рецептор: рецептор, который модулирует активацию генов с помощью рецепторов ретиноевой кислоты и гормонов щитовидной железы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (23): 10809–13. Бибкод : 1994PNAS...9110809S . дои : 10.1073/pnas.91.23.10809 . ПМК 45115 . ПМИД 7971966 .
Яновский Б.А., Гроган М.Дж., Джонс С.А., Уайзли ГБ, Кливер С.А., Кори Э.Дж., Мангельсдорф DJ (январь 1999 г.). «Структурные требования к лигандам оксистериновых X-рецепторов печени LXRalpha и LXRbeta» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (1): 266–71. Бибкод : 1999PNAS...96..266J . дои : 10.1073/pnas.96.1.266 . ПМК 15128 . ПМИД 9874807 .
Фельткамп Д., Вибель Ф.Ф., Альберти С., Густафссон Дж.А. (апрель 1999 г.). «Идентификация нового сайта связывания ДНК для ядерного рецептора-сироты OR1» . Журнал биологической химии . 274 (15): 10421–9. дои : 10.1074/jbc.274.15.10421 . ПМИД 10187832 .
Ли С.К., Юнг С.И., Ким Ю.С., На С.И., Ли Ю.К., Ли Дж.В. (февраль 2001 г.). «Два различных домена взаимодействия с ядерными рецепторами и CREB-связывающая белок-зависимая функция трансактивации активации сигнального коинтегратора-2» . Молекулярная эндокринология . 15 (2): 241–54. дои : 10.1210/mend.15.2.0595 . ПМИД 11158331 .
Уитни К.Д., Уотсон М.А., Гудвин Б., Галарди С.М., Маглич Дж.М., Уилсон Дж.Г., Уилсон Т.М., Коллинз Дж.Л., Кливер С.А. (ноябрь 2001 г.). «Регуляция X-рецептора печени (LXR) гена LXRalpha в макрофагах человека» . Журнал биологической химии . 276 (47): 43509–15. дои : 10.1074/jbc.M106155200 . ПМИД 11546778 .
Уитни К.Д., Уотсон М.А., Коллинз Дж.Л., Бенсон В.Г., Стоун Т.М., Нумерик М.Дж., Типпин Т.К., Уилсон Дж.Г., Винегар Д.А., Кливер С.А. (июнь 2002 г.). «Регуляция гомеостаза холестерина Х-рецепторами печени в центральной нервной системе» . Молекулярная эндокринология . 16 (6): 1378–85. дои : 10.1210/mend.16.6.0835 . ПМИД 12040022 .
Брендель С., Шунджанс К., Ботруньо О.А., Трейтер Э., Ауверкс Дж. (сентябрь 2002 г.). «Маленький гетеродимер-партнер взаимодействует с альфа-рецептором Х печени и подавляет его транскрипционную активность» . Молекулярная эндокринология . 16 (9): 2065–76. дои : 10.1210/me.2001-0194 . ПМИД 12198243 .
Мо Дж., Фанг С.Дж., Чен В., Блоб GC (декабрь 2002 г.). «Регуляция передачи сигналов ALK-1 с помощью ядерного рецептора LXRbeta» . Журнал биологической химии . 277 (52): 50788–94. дои : 10.1074/jbc.M210376200 . ПМИД 12393874 .
Уильямс С., Бледсо Р.К., Коллинз Дж.Л., Боггс С., Ламберт М.Х., Миллер А.Б., Мур Дж., Макки Д.Д., Мур Л., Николс Дж., Паркс Д., Уотсон М., Уайзли Б., Уилсон Т.М. (июль 2003 г.). «Рентгеновская кристаллическая структура бета-лигандсвязывающего домена X-рецептора печени: регуляция с помощью переключателя гистидин-триптофан» . Журнал биологической химии . 278 (29): 27138–43. дои : 10.1074/jbc.M302260200 . ПМИД 12736258 .
Фарнегорд М., Бонн Т., Сан С., Юнггрен Дж., Ахола Х., Вильгельмссон А., Густафссон Дж.А., Карлквист М. (октябрь 2003 г.). «Трехмерная структура бета-рецептора X печени обнаруживает гибкий карман для связывания лигандов, который может вмещать принципиально разные лиганды» . Журнал биологической химии . 278 (40): 38821–8. дои : 10.1074/jbc.M304842200 . ПМИД 12819202 .
Фукучи Дж., Сонг С., Ко Ал., Ляо С. (сентябрь 2003 г.). «Транскрипционная регуляция фарнезилпирофосфатсинтазы X-рецепторами печени». Стероиды . 68 (7–8): 685–91. дои : 10.1016/S0039-128X(03)00100-4 . ПМИД 12957674 . S2CID 6023862 .
Хёрер С., Шмид А., Хекель А., Будзински Р.М., Нар Х. (декабрь 2003 г.). «Кристаллическая структура бета-лигандсвязывающего домена X-рецептора печени человека в комплексе с синтетическим агонистом». Журнал молекулярной биологии . 334 (5): 853–61. дои : 10.1016/j.jmb.2003.10.033 . ПМИД 14643652 .
Вальчак Р., Джозеф С.Б., Лаффит Б.А., Кастрилло А., Пей Л., Тонтоноз П. (март 2004 г.). «Транскрипция гена фактора роста эндотелия сосудов в макрофагах регулируется Х-рецепторами печени» . Журнал биологической химии . 279 (11): 9905–11. дои : 10.1074/jbc.M310587200 . ПМИД 14699103 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000131408 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060601 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: подсемейство 1 ядерного рецептора NR1H2, группа H, член 2» .

[pmid7625741-6] Сонг С., Хиипакка Р.А., Коконтис Дж.М., Ляо С. (июнь 1995 г.). «Повсеместный рецептор: структуры, иммуноцитохимическая локализация и модуляция активации генов рецепторами ретиноевых кислот и гормонов щитовидной железы». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 761 (2): 38–49. Бибкод : 1995NYASA.761...38S . дои : 10.1111/j.1749-6632.1995.tb31367.x . ПМИД 7625741 . S2CID 27208069 .

[pmid24561505-7] Лу X, Торессон Дж., Бенод С., Су Дж.Х., Филипс К.Дж., Уэбб П., Густафссон Дж.А. (март 2014 г.). «Структура гетеродимера ретиноидного рецептора X α-рецептора X печени β (RXRα-LXRβ) на ДНК». Структурная и молекулярная биология природы . 21 (3): 277–81. дои : 10.1038/nsmb.2778 . ПМИД 24561505 . S2CID 23226682 .

[pmid11158331-8] Ли С.К., Юнг С.И., Ким Ю.С., На С.И., Ли Ю.К., Ли Дж.В. (февраль 2001 г.). «Два различных домена взаимодействия с ядерными рецепторами и CREB-связывающая белок-зависимая функция трансактивации активации сигнального коинтегратора-2» . Молекулярная эндокринология . 15 (2): 241–54. дои : 10.1210/mend.15.2.0595 . ПМИД 11158331 .

[pmid7760852-9] Соль В., Чхве Х.С., Мур Д.Д. (январь 1995 г.). «Выделение белков, специфически взаимодействующих с рецептором ретиноида X: два новых рецептора-сироты» . Молекулярная эндокринология . 9 (1): 72–85. дои : 10.1210/mend.9.1.7760852 . ПМИД 7760852 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

v т и FXR Tooltip Фарнезоид X-рецептор и LXR Tooltip модуляторы X-рецепторов печени
FXRTooltip Farnesoid X receptor	Agonists: Bile acids Cafestol Chenodeoxycholic acid Cilofexor Fexaramine GW-4064 Ivermectin Nidufexor Obeticholic acid Tropifexor Antagonists: Guggulsterone
LXRTooltip Liver X receptor	Agonists: 22R-Hydroxycholesterol 24S-Hydroxycholesterol 27-Hydroxycholesterol Abequolixron Cholestenoic acid DMHCA GW-3965 Hypocholamide T-0901317 Antagonists: Efavirenz Larsucosterol
See also Receptor/signaling modulators