Сиротский рецептор

В биохимии орфанный рецептор — это белок, имеющий структуру, аналогичную другим идентифицированным рецепторам , но эндогенный лиганд которого еще не идентифицирован. Если позже обнаруживается лиганд сиротского рецептора, такой рецептор называют «приемным сиротой». ^[1] И наоборот, термин «сиротский лиганд» относится к биологическому лиганду, родственный рецептор которого еще не идентифицирован.

Примеры

Примеры орфанных рецепторов обнаружены в рецепторе, связанном с G-белком (GPCR). ^[2]^[3]^[4] и ядерный рецептор ^[5]^[6]^[7] семьи.

Если обнаруживается эндогенный лиганд, сиротский рецептор «усыновляется» или «деорфанизируется». ^[8] Примером является ядерный рецептор фарнезоида X (FXR) и рецептор желчных кислот, связанный с белком GPCR TGR5/GPCR19/G , оба из которых активируются желчными кислотами . ^[9] Приемные орфанные рецепторы в группе ядерных рецепторов включают FXR, X-рецептор печени (LXR) и рецептор, активирующий пролифератор пероксисом (PPAR). Другим примером сайта-сироты рецептора является сайт связывания PCP в рецепторе NMDA . ^[10] тип лиганд-управляемого ионного канала . В этом месте действует рекреационный наркотик PCP, но неизвестно, какой эндогенный лиганд связывается с этим сайтом.

Орфанным рецепторам GPCR обычно присваивается название «GPR», за которым следует номер, например GPR1 . В семействе GPCR около 100 рецептороподобных генов остаются сиротами. ^[11]

Открытие

Исторически рецепторы были обнаружены с помощью лигандов для «ловли» их рецепторов. Следовательно, по определению, эти рецепторы не были сиротами. Однако с помощью современных методов молекулярной биологии, таких как обратная фармакология , скрининг библиотек кДНК и полногеномное секвенирование , рецепторы были идентифицированы на основе сходства последовательностей с известными рецепторами, без знания их лигандов.

Ссылки

^ Нандури, Равикант; Бутани, Иша; Сомаварапу, Арун Кумар; Махаджан, Сахил; Паркеш, Раман; Гупта, Паван (01 января 2015 г.). «ONRLDB — база данных экспериментально проверенных лигандов для орфанных ядерных рецепторов, созданная вручную: взгляд на открытие новых лекарств» . База данных . 2015 : bav112. дои : 10.1093/база данных/bav112 . ПМК 4669993 . ПМИД 26637529 .
^ Левой А., Дам Дж., Аюб М.А., Гийом Дж.Л., Джокерс Р. (2006). «Обладают ли сиротские рецепторы, связанные с G-белком, лиганд-независимыми функциями? Новые данные о гетеродимерах рецепторов» . Представитель ЭМБО . 7 (11): 1094–8. дои : 10.1038/sj.embor.7400838 . ПМЦ 1679777 . ПМИД 17077864 .
^ Чивелли О, Сайто Ю, Ван З, Нотакер Х.П., Рейншайд Р.К. (2006). «Орифанные GPCR и их лиганды». Фармакол Тер . 110 (3): 525–32. doi : 10.1016/j.pharmthera.2005.10.001 . ПМИД 16289308 .
^ Уайз А., Юп СК, Рис С. (2004). «Идентификация лигандов сиротских рецепторов, связанных с G-белком». Анну Рев Фармакол Токсикол . 44 (февраль): 43–66. doi : 10.1146/annurev.pharmtox.44.101802.121419 . ПМИД 14744238 . S2CID 2618257 .
^ Жигер V (октябрь 1999 г.). «Сиротские ядерные рецепторы: от гена к функции» . Эндокр. Преподобный . 20 (5): 689–725. дои : 10.1210/edrv.20.5.0378 . ПМИД 10529899 .
^ Бенуа Дж., Куни А., Жигер В., Ингрэм Х. , Лазар М., Маскат Г., Перлманн Т., Рено Дж. П., Швабе Дж., Сладек Ф., Цай М. Дж. , Лаудет В. (2006). «Международный союз фармакологии. LXVI. Орфанные ядерные рецепторы». Фармакол Рев . 58 (4): 798–836. дои : 10.1124/пр.58.4.10 . ПМИД 17132856 . S2CID 2619263 .
^ Ши Ю (июнь 2007 г.). «Сиротские ядерные рецепторы в открытии лекарств» . Препарат Дисков. Сегодня . 12 (11–12): 440–5. дои : 10.1016/j.drudis.2007.04.006 . ПМЦ 2748783 . ПМИД 17532527 .
^ ШИ, Ю (2007). «Сиротские ядерные рецепторы в открытии лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 12 (11–12): 440–445. дои : 10.1016/j.drudis.2007.04.006 . ПМЦ 2748783 . ПМИД 17532527 .
^ Ми ЛЗ, Девараконда С., Харп Дж.М., Хан К., Пелличиари Р., Уилсон Т.М., Хорасанизаде С., Растинежад Ф (апрель 2003 г.). «Структурная основа связывания желчных кислот и активации ядерного рецептора FXR» . Мол. Клетка . 11 (4): 1093–100. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00112-6 . ПМИД 12718893 .
^ Фагг Дж.Е. (май 1987 г.). «Фенциклидин и родственные ему препараты связываются с активированным комплексом рецептор-канал N-метил-D-аспартата в мембранах головного мозга крыс». Неврология. Летт . 76 (2): 221–7. дои : 10.1016/0304-3940(87)90719-1 . ПМИД 2438606 . S2CID 23177400 .
^ Лашет, К; Дюпюи, Н.; Хэнсон, Дж (2018). «Пейзаж деорфанизации рецепторов, связанных с G-белком». Биохимическая фармакология . 153 : 62–74. дои : 10.1016/j.bcp.2018.02.016 . ПМИД 29454621 . S2CID 3566341 .

Внешние ссылки

«GPCR для сирот класса А» . Руководство IUPHAR/BPS по базе данных ФАРМАКОЛОГИИ . Эдинбургский университет/Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии.
«GPCR класса адгезии» . Руководство IUPHAR/BPS по базе данных ФАРМАКОЛОГИИ . Эдинбургский университет/Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии.
«GPCR сироты класса C» . Руководство IUPHAR/BPS по базе данных ФАРМАКОЛОГИИ . Эдинбургский университет/Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии.

[Nanduri2015-1] Нандури, Равикант; Бутани, Иша; Сомаварапу, Арун Кумар; Махаджан, Сахил; Паркеш, Раман; Гупта, Паван (01 января 2015 г.). «ONRLDB — база данных экспериментально проверенных лигандов для орфанных ядерных рецепторов, созданная вручную: взгляд на открытие новых лекарств» . База данных . 2015 : bav112. дои : 10.1093/база данных/bav112 . ПМК 4669993 . ПМИД 26637529 .

[Levoye_2006-2] Левой А., Дам Дж., Аюб М.А., Гийом Дж.Л., Джокерс Р. (2006). «Обладают ли сиротские рецепторы, связанные с G-белком, лиганд-независимыми функциями? Новые данные о гетеродимерах рецепторов» . Представитель ЭМБО . 7 (11): 1094–8. дои : 10.1038/sj.embor.7400838 . ПМЦ 1679777 . ПМИД 17077864 .

[Civelli_2006-3] Чивелли О, Сайто Ю, Ван З, Нотакер Х.П., Рейншайд Р.К. (2006). «Орифанные GPCR и их лиганды». Фармакол Тер . 110 (3): 525–32. doi : 10.1016/j.pharmthera.2005.10.001 . ПМИД 16289308 .

[Wise_2004-4] Уайз А., Юп СК, Рис С. (2004). «Идентификация лигандов сиротских рецепторов, связанных с G-белком». Анну Рев Фармакол Токсикол . 44 (февраль): 43–66. doi : 10.1146/annurev.pharmtox.44.101802.121419 . ПМИД 14744238 . S2CID 2618257 .

[pmid10529899-5] Жигер V (октябрь 1999 г.). «Сиротские ядерные рецепторы: от гена к функции» . Эндокр. Преподобный . 20 (5): 689–725. дои : 10.1210/edrv.20.5.0378 . ПМИД 10529899 .

[Benoit_2006-6] Бенуа Дж., Куни А., Жигер В., Ингрэм Х. , Лазар М., Маскат Г., Перлманн Т., Рено Дж. П., Швабе Дж., Сладек Ф., Цай М. Дж. , Лаудет В. (2006). «Международный союз фармакологии. LXVI. Орфанные ядерные рецепторы». Фармакол Рев . 58 (4): 798–836. дои : 10.1124/пр.58.4.10 . ПМИД 17132856 . S2CID 2619263 .

[pmid17532527-7] Ши Ю (июнь 2007 г.). «Сиротские ядерные рецепторы в открытии лекарств» . Препарат Дисков. Сегодня . 12 (11–12): 440–5. дои : 10.1016/j.drudis.2007.04.006 . ПМЦ 2748783 . ПМИД 17532527 .

[8] ШИ, Ю (2007). «Сиротские ядерные рецепторы в открытии лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 12 (11–12): 440–445. дои : 10.1016/j.drudis.2007.04.006 . ПМЦ 2748783 . ПМИД 17532527 .

[pmid12718893-9] Ми ЛЗ, Девараконда С., Харп Дж.М., Хан К., Пелличиари Р., Уилсон Т.М., Хорасанизаде С., Растинежад Ф (апрель 2003 г.). «Структурная основа связывания желчных кислот и активации ядерного рецептора FXR» . Мол. Клетка . 11 (4): 1093–100. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00112-6 . ПМИД 12718893 .

[pmid2438606-10] Фагг Дж.Е. (май 1987 г.). «Фенциклидин и родственные ему препараты связываются с активированным комплексом рецептор-канал N-метил-D-аспартата в мембранах головного мозга крыс». Неврология. Летт . 76 (2): 221–7. дои : 10.1016/0304-3940(87)90719-1 . ПМИД 2438606 . S2CID 23177400 .

[pmid29454621-11] Лашет, К; Дюпюи, Н.; Хэнсон, Дж (2018). «Пейзаж деорфанизации рецепторов, связанных с G-белком». Биохимическая фармакология . 153 : 62–74. дои : 10.1016/j.bcp.2018.02.016 . ПМИД 29454621 . S2CID 3566341 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]