ГПР113
| АДГРФ3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | ADGRF3 , PGR23, hGPCR37, GPR113, рецептор F3, связанный с G-белком адгезии | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | МГИ : 2685887 ; Гомологен : 17826 ; GeneCards : ADGRF3 ; OMA : ADGRF3 — ортологи | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GPR113 представляет собой ген , который кодирует рецептора 113, связанного с вероятным G-белком белок . [5] [6]
Ген
[ редактировать ]Ген GPR113 человека разумного расположен на хромосоме 2 (2p23.3). Этот ген занимает участок длиной 38,65 т.п.н. от основания 26531041 до 26569685 на отрицательной цепи. [7] Ген GPR113 имеет двух соседей с каждой стороны отрицательной цепи: предшествующий OTOF-отоферлин и следующий за ним HADHA-гидроксиацил-КоА . Прямо напротив GPR113 на положительной цепи находится ген EPT1 .Ген GPR113 также известен под псевдонимами PGR23 и HGPCR37. [8]
Гомология и эволюция
[ редактировать ]GPR113 имеет пять человеческих паралогов GPR110 , GPR115 , GPR128 , GPR111 и GPR116 . [8] GPR113 хорошо сохраняется у млекопитающих, от приматов до полуводных видов, а также у некоторых амфибий. К ним относятся обыкновенный шимпанзе, африканский кустарниковый слон, утконос и западная шпорцевая лягушка. [9] Гомологичные домены, которые хорошо консервативны во всех ортологах, сосредоточены в области 7-го трансмембранного рецептора (семейство секретина), выделенной на рисунке фиолетовым цветом. [10]
Белок
[ редактировать ]
Белковый продукт гена GPR113 представляет собой рецептор, связанный с G-белком. Белок имеет три варианта транскрипта у человека. [11] Из этих трех вариант 1 GPR113 имеет самую длинную аминокислотную последовательность и наибольшую идентичность по отношению к ортологам. Это приводит к выводу, что вариант 1 GPR113 является потомком предкового гена GPR113 человека разумного. GPR113 Var 1 содержит 1079 аминокислот и является неотъемлемой частью плазматической мембраны. [12] 7-проходной рецептор содержит 4 домена, выделенных на рисунке справа: сигнальный пептид (красный), домен рецептора гормона (синий), домен латрофилина/CL-1-подобного GPS (оранжевый) и 7-трансмембранный рецептор (фиолетовый). . Между доменом рецептора гормона и GPS находится домен неизвестной функции , который не выделен.
Функция
[ редактировать ]GPR113 представляет собой рецептор, связанный с G-белком , который участвует в сигнальном пути нейропептида. [12]
Выражение и болезнь
[ редактировать ]Было обнаружено, что GPR113 дифференциально экспрессируется при болезненных состояниях. При диабете 2 типа процентильный ранг относительно других транскриптов снижается по сравнению с нормальной функцией клеток. [13] Удаление TP63 , который опосредует широкий спектр важных процессов в организме, также приводит к снижению экспрессии GPR113. [14] В мозге мышей в мозжечке и обонятельной луковице наблюдается транскрипция гена GPR113. [15] Кроме того, исследование Национального института глухоты и других коммуникативных расстройств выявило, что экспрессия GPR113 сильно ограничена подмножеством клеток вкусовых рецепторов. [16] Выводы этой статьи в сочетании с уровнями экспрессии обонятельных луковиц могут открыть путь для будущих исследований, потенциально проливая больше информации о функции GPR113.
Взаимодействующие белки
[ редактировать ]Было показано, что GPR113 связывается с рецептором GPR123, связанным с орфанным G-белком . [17]
Факторы транскрипции
[ редактировать ]| 10 наиболее вероятных факторов транскрипции [18] |
|---|
| Сайт связывания гомеодоменов типа S8 |
| Сайт связывания гомеодоменов типа S8 |
| Сайты связывания DLX-1, -2 и -5 |
| TCF/LEF-1 (предпочтение связывания вторичной ДНК) |
| Гомеобокс, содержащий фактор транскрипции, специфичный для зародышевых клеток NOBOX |
| Spalt-подобный фактор транскрипции 1 |
| Транскрипционный репрессор CDP |
| Альтернативный сплайсинговый вариант FOXP1, активированный в ЭСК |
| Сайт связывания гомеодоменов типа S8 |
| Гомеобокс, содержащий фактор транскрипции, специфичный для зародышевых клеток NOBOX |
Клиническое значение
[ редактировать ]Клиническое значение этого белка не установлено. Однако профили экспрессии открывают интересные направления для будущих исследований гена GPR113, особенно в области изучения вкуса и запаха.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000173567 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067642 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Фредрикссон Р., Лагерстром MC, Хоглунд П.Дж., Шиот Х.Б. (ноябрь 2002 г.). «Новые человеческие рецепторы, связанные с G-белком, с длинными N-концевыми концами, содержащими домены GPS и богатые Ser/Thr области» . ФЭБС Летт . 531 (3): 407–14. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03574-3 . ПМИД 12435584 . S2CID 7449692 .
- ^ «Ген Энтреза: рецептор 113, связанный с GPR113 G-белком» .
- ^ «Хромосома 2 человека разумного, первичная сборка GRCh37.p13» . 13 августа 2013 г.
{{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется|journal=( помощь ) - ^ Jump up to: а б «Ген ADGRF3 - GeneCards | Белок AGRF3 | Антитело AGRF3» .
- ^ «BLAST: базовый инструмент поиска локального выравнивания» .
- ^ «Инструментарий биологии SDSC» .
- ^ «Рецептор F3, связанный с G-белком адгезии человека (ADGRF3), вариант 2 транскрипта, мРНК» . 24 июня 2018 г.
{{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется|journal=( помощь ) - ^ Jump up to: а б «ADGRF3 - предшественник рецептора F3, связанного с адгезионным G-белком - Homo sapiens (человек) - ген и белок ADGRF3» .
- ^ «71224040 — Профили GEO — NCBI» .
- ^ «34655140 — Профили GEO — NCBI» .
- ^ «Детали гена :: Атлас мозга Аллена: Мозг мыши» .
- ^ Лопесхименес, Северная Дакота; Сайнс, Э; Кавена, ММ; Круз-Итье, Массачусетс; Блэквуд, Калифорния; Бэтти, Дж. Ф.; Салливан, СЛ (2005). «Два новых гена, Gpr113, который кодирует рецептор семейства 2, связанный с G-белком, и Trcg1, избирательно экспрессируются в клетках вкусовых рецепторов» . Геномика . 85 (4): 472–82. дои : 10.1016/j.ygeno.2004.12.005 . ПМИД 15780750 .
- ^ «STRING: Сети функциональных белковых ассоциаций» .
- ^ «Введение в Эльдорадо» . Архивировано из оригинала 22 мая 2021 г. Проверено 12 мая 2013 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Такеда С., Кадоваки С., Хага Т. и др. (2002). «Идентификация генов рецепторов, связанных с G-белком, из последовательности генома человека» . ФЭБС Летт . 520 (1–3): 97–101. дои : 10.1016/S0014-5793(02)02775-8 . ПМИД 12044878 . S2CID 7116392 .
- Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
- Вассилатис Д.К., Хоманн Дж.Г., Цзэн Х. и др. (2003). «Репертуар рецепторов, связанных с G-белком, человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (8): 4903–8. Бибкод : 2003PNAS..100.4903V . дои : 10.1073/pnas.0230374100 . ПМК 153653 . ПМИД 12679517 .
- Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемых белков (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые человеком и трансмембранные белки: оценка биоинформатики» . Геном Рез . 13 (10): 2265–70. дои : 10.1101/гр.1293003 . ПМЦ 403697 . ПМИД 12975309 .
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
- Бьярнадоттир Т.К., Фредрикссон Р., Хёглунд П.Дж. и др. (2005). «Репертуар человека и мыши семейства адгезивных рецепторов, связанных с G-белком». Геномика . 84 (1): 23–33. дои : 10.1016/j.ygeno.2003.12.004 . ПМИД 15203201 .