НФЮБ

НФЮБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1N1J, 4AWL, 4CSR
Идентификаторы
Псевдонимы	NFYB , CBF-A, CBF-B, HAP3, NF-YB, субъединица бета ядерного транскрипционного фактора Y
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 189904 ; МГИ : 97317 ; Гомологен : 38149 ; GeneCards : NFYB ; OMA : NFYB — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	104,138,241 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	82,599,978 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; Achilles tendon; ; ventricular zone; ; endothelial cell; ; right coronary artery; ; seminal vesicula; ; left coronary artery; ; tibial arteries; ; Descending thoracic aorta; ; muscle layer of sigmoid colon;
	Top expressed in
	primitive streak; ; epiblast; ; ganglionic eminence; ; saccule; ; otic vesicle; ; embryo; ; ventricular zone; ; maxillary prominence; ; Rostral migratory stream; ; Region I of hippocampus proper;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; sequence-specific DNA binding; protein binding; protein heterodimerization activity; DNA binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; protein-containing complex binding;
Cellular component	protein-DNA complex; nucleoplasm; CCAAT-binding factor complex; nucleus; RNA polymerase II transcription regulator complex;
Biological process	positive regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of cholesterol biosynthetic process; cellular response to leukemia inhibitory factor; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	4801
	18045
	ENSG00000120837
	ENSMUSG00000020248
	P25208
	P63139
	НМ_006166
	НМ_010914
	НП_006157 ; НП_006157.1
	НП_035044
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Бета-субъединица фактора ядерной транскрипции Y представляет собой белок , который у человека кодируется NFYB геном . ^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой одну субъединицу тримерного комплекса, образующего высококонсервативный фактор транскрипции, который с высокой специфичностью связывается с мотивами CCAAT в промоторных областях различных генов. Этот генный продукт, субъединица B, образует плотный димер с субъединицей C, что является предпосылкой для ассоциации субъединицы A. Полученный тример связывается с ДНК с высокой специфичностью и сродством. Каждая из субъединиц B и C содержит гистоноподобный мотив. Наблюдение за гистоновой природой этих субъединиц подтверждается двумя типами доказательств; выравнивание последовательностей белков и эксперименты с мутантами. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что NFYB взаимодействует с:

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120837 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020248 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ли XY, Маттей М.Г., Залеска-Рутчинска З., Хофт ван Хейсдуйнен Р., Фигероа Ф., Надо Дж., Бенуа К., Матис Д. (март 1992 г.). «Одна субъединица транскрипционного фактора NF-Y отображается близко к главному комплексу гистосовместимости в хромосомах мыши и человека». Геномика . 11 (3): 630–4. дои : 10.1016/0888-7543(91)90070-У . ПМИД 1774067 .
^ Майти С.Н., де Кромбрюг Б. (июнь 1998 г.). «Роль CCAAT-связывающего белка CBF/NF-Y в транскрипции». Тенденции биохимической науки . 23 (5): 174–8. дои : 10.1016/S0968-0004(98)01201-8 . ПМИД 9612081 .
^ «Ген Энтрез: фактор ядерной транскрипции NFYB Y, бета» .
^ Имбриано К., Болоньезе Ф., Гуртнер А., Пьяджо Дж., Мантовани Р. (июль 2001 г.). «HSP-CBF является NF-Y-зависимым коактиватором боксов CCAAT промоторов теплового шока» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 26332–9. дои : 10.1074/jbc.M101553200 . HDL : 11380/303761 . ПМИД 11306579 .
^ Пайс-Мейсон Калифорния, Диттмер Дж., Клеменс К.Э., Брэди Дж.Н. (март 1997 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между белком Tax1 Т-клеточного лимфотропного вируса человека типа 1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y» . Мол. Клетка. Биол . 17 (3): 1236–43. дои : 10.1128/mcb.17.3.1236 . ПМК 231848 . ПМИД 9032250 .
^ Идзуми Х., Моландер С., Пенн Л.З., Ишисаки А., Коно К., Фуна К. (апрель 2001 г.). «Механизм репрессии транскрипции c-Myc на бета-рецепторе PDGF». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 8): 1533–44. дои : 10.1242/jcs.114.8.1533 . ПМИД 11282029 .
^ Беллорини М., Ли Д.К., Дантонель Дж.К., Земзуми К., Редер Р.Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «Взаимодействия CCAAT, связывающие NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновых складок, для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (11): 2174–81. дои : 10.1093/нар/25.11.2174 . ПМК 146709 . ПМИД 9153318 .

Дальнейшее чтение

Льоберас Дж., Солер С., Селада А. (1998). «Механизмы репрессии гена IA бета главного комплекса гистосовместимости». Иммунобиология . 198 (1–3): 249–63. дои : 10.1016/s0171-2985(97)80045-9 . ПМИД 9442396 .
Мантовани Р. (1999). «Молекулярная биология CCAAT-связывающего фактора NF-Y». Джин . 239 (1): 15–27. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00368-6 . ПМИД 10571030 .
Ли XY, Мантовани Р., Хофт ван Хейсдуйнен Р., Андре И., Бенуа С., Матис Д. (1992). «Эволюционная вариация CCAAT-связывающего фактора транскрипции NF-Y» . Нуклеиновые кислоты Рез . 20 (5): 1087–91. дои : 10.1093/нар/20.5.1087 . ПМК 312095 . ПМИД 1549471 .
Ли XY, Хофт ван Хейсдуйнен Р., Мантовани Р., Бенуа С., Матис Д. (1992). «Интрон-экзонная организация генов NF-Y. Тканеспецифический сплайсинг модифицирует домен активации» . Ж. Биол. Хим . 267 (13): 8984–90. дои : 10.1016/S0021-9258(19)50377-5 . ПМИД 1577736 .
Льоберас Дж., Маки Р.А., Селада А. (1995). «Репрессия экспрессии гена главного комплекса гистосовместимости IA бета белками dbpA и dbpB (mYB-1)» . Мол. Клетка. Биол . 15 (9): 5092–9. дои : 10.1128/mcb.15.9.5092 . ПМК 230756 . ПМИД 7651426 .
Чанг ZF, Лю CJ (1994). «ССААТ-связывающий белок тимидинкиназы человека представляет собой NF-Y, экспрессия субъединицы А которого зависит от сыворотки в диплоидных фибробластах человека IMR-90» . Ж. Биол. Хим . 269 (27): 17893–8. дои : 10.1016/S0021-9258(17)32393-1 . ПМИД 8027044 .
Мантовани Р., Ли XY, Пессара У., Хоофт ван Хуисждуйнен Р., Бенуа С., Матис Д. (1994). «Доминантно-негативные аналоги НФ-Я» . Ж. Биол. Хим . 269 (32): 20340–6. дои : 10.1016/S0021-9258(17)31997-X . ПМИД 8051128 .
Пайз-Мейсон Калифорния, Диттмер Дж, Клеменс К.Э., Брэди Дж.Н. (1997). «Физическое и функциональное взаимодействие между белком Tax1 Т-клеточного лимфотропного вируса человека типа 1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y» . Мол. Клетка. Биол . 17 (3): 1236–43. дои : 10.1128/mcb.17.3.1236 . ПМК 231848 . ПМИД 9032250 .
Беллорини М., Ли Д.К., Дантонель Дж.К., Земзуми К., Редер Р.Г., Тора Л., Мантовани Р. (1997). «Взаимодействия CCAAT, связывающие NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновых складок, для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (11): 2174–81. дои : 10.1093/нар/25.11.2174 . ПМК 146709 . ПМИД 9153318 .
Карри Р.А. (1998). «Функциональное взаимодействие между доменом тримеризации ДНК-связывающей субъединицы NF-Y и белком группы высокой подвижности HMG-I (Y)» . Ж. Биол. Хим . 272 (49): 30880–8. дои : 10.1074/jbc.272.49.30880 . ПМИД 9388234 .
Карри Р.А. (1998). «NF-Y связан с гистон-ацетилтрансферазами GCN5 и P/CAF» . Ж. Биол. Хим . 273 (3): 1430–4. дои : 10.1074/jbc.273.3.1430 . ПМИД 9430679 .
Карри Р.А. (1998). «Биохимическая характеристика комплекса транскрипционных факторов NF-Y во время развития B-лимфоцитов» . Ж. Биол. Хим . 273 (29): 18220–9. дои : 10.1074/jbc.273.29.18220 . ПМИД 9660784 .
Бемарк М., Олссон Х., Хейнегорд Д., Леандерсон Т. (1998). «Очистка и характеристика белка, связывающегося с каппа-промотором SP6. Потенциальная роль фактора-А, связывающего CArG-бокс, в каппа-транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 273 (30): 18881–90. дои : 10.1074/jbc.273.30.18881 . ПМИД 9668064 .
Фаниелло МК, Бевилаква М.А., Кондорелли Г, де Кромбрюг Б, Майти С.Н., Авведименто ВЕ, Чимино Ф, Костанцо Ф (1999). «Субъединица B СААТ-связывающего фактора NFY связывает центральный сегмент ко-активатора p300» . Ж. Биол. Хим . 274 (12): 7623–6. дои : 10.1074/jbc.274.12.7623 . ПМИД 10075648 .
Хак С.Б., Мастернак К., Каммербауэр С., Янцен С., Рейт В., Стеймле В. (2000). «Богатые лейцином повторы CIITA контролируют ядерную локализацию, рекрутирование in vivo энхансосомы главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса II и трансактивацию гена MHC класса II» . Мол. Клетка. Биол . 20 (20): 7716–25. дои : 10.1128/MCB.20.20.7716-7725.2000 . ПМЦ 86349 . ПМИД 11003667 .
Лян Ф., Шауфеле Ф., Гарднер Д.Г. (2001). «Функциональное взаимодействие NF-Y и Sp1 необходимо для транскрипции гена рецептора натрийуретического пептида типа А» . Ж. Биол. Хим . 276 (2): 1516–22. дои : 10.1074/jbc.M006350200 . ПМИД 11022037 .
Изуми Х., Моландер С., Пенн Л.З., Исисаки А., Коно К., Фуна К. (2001). «Механизм репрессии транскрипции c-Myc на бета-рецепторе PDGF». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 8): 1533–44. дои : 10.1242/jcs.114.8.1533 . ПМИД 11282029 .

Внешние ссылки

NFYB+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)
FactorBook NF-YB

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120837 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020248 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1774067-5] Ли XY, Маттей М.Г., Залеска-Рутчинска З., Хофт ван Хейсдуйнен Р., Фигероа Ф., Надо Дж., Бенуа К., Матис Д. (март 1992 г.). «Одна субъединица транскрипционного фактора NF-Y отображается близко к главному комплексу гистосовместимости в хромосомах мыши и человека». Геномика . 11 (3): 630–4. дои : 10.1016/0888-7543(91)90070-У . ПМИД 1774067 .

[pmid9612081-6] Майти С.Н., де Кромбрюг Б. (июнь 1998 г.). «Роль CCAAT-связывающего белка CBF/NF-Y в транскрипции». Тенденции биохимической науки . 23 (5): 174–8. дои : 10.1016/S0968-0004(98)01201-8 . ПМИД 9612081 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: фактор ядерной транскрипции NFYB Y, бета» .

[pmid11306579-8] Имбриано К., Болоньезе Ф., Гуртнер А., Пьяджо Дж., Мантовани Р. (июль 2001 г.). «HSP-CBF является NF-Y-зависимым коактиватором боксов CCAAT промоторов теплового шока» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 26332–9. дои : 10.1074/jbc.M101553200 . HDL : 11380/303761 . ПМИД 11306579 .

[pmid9032250-9] Пайс-Мейсон Калифорния, Диттмер Дж., Клеменс К.Э., Брэди Дж.Н. (март 1997 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между белком Tax1 Т-клеточного лимфотропного вируса человека типа 1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y» . Мол. Клетка. Биол . 17 (3): 1236–43. дои : 10.1128/mcb.17.3.1236 . ПМК 231848 . ПМИД 9032250 .

[pmid11282029-10] Идзуми Х., Моландер С., Пенн Л.З., Ишисаки А., Коно К., Фуна К. (апрель 2001 г.). «Механизм репрессии транскрипции c-Myc на бета-рецепторе PDGF». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 8): 1533–44. дои : 10.1242/jcs.114.8.1533 . ПМИД 11282029 .

[pmid9153318-11] Беллорини М., Ли Д.К., Дантонель Дж.К., Земзуми К., Редер Р.Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «Взаимодействия CCAAT, связывающие NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновых складок, для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (11): 2174–81. дои : 10.1093/нар/25.11.2174 . ПМК 146709 . ПМИД 9153318 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]