ARID3A

ARID3A
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2KK0, 4LJX
Идентификаторы
Псевдонимы	ARID3A , BRIGHT, DRIL1, DRIL3, E2FBP1, богатый AT домен взаимодействия 3A
Внешние идентификаторы	Опустить : 603265 ; МГИ : 1328360 ; Гомологен : 124247 ; Генные карты : ARID3A ; ОМА : ARID3A – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	975,939 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	79,790,852 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	monocyte; ; blood; ; placenta; ; bone marrow cells; ; left testis; ; right testis; ; stromal cell of endometrium; ; buccal mucosa cell; ; granulocyte; ; sural nerve;
	Top expressed in
	ovarian follicle; ; granulocyte; ; tibiofemoral joint; ; tail of embryo; ; yolk sac; ; germinal epithelium; ; gastrula; ; genital tubercle; ; ovarian follicle; ; placenta;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; DNA binding; protein binding; chromatin binding; DNA-binding transcription factor activity; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	membrane raft; nucleus; nucleoplasm; cytoplasm; cytosol; intracellular membrane-bounded organelle;
Biological process	positive regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1820
	13496
	ENSG00000116017
	ENSMUSG00000019564
	Q99856
	Q62431
	НМ_005224
	НМ_001288625 ; НМ_001288626 ; НМ_007880
	НП_005215
	НП_001275554 ; НП_001275555 ; НП_031906
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 3А, содержащий интерактивный домен, богатый АТ, представляет собой белок , который у человека кодируется ARID3A геном . ^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства ДНК-связывающих белков ARID (AT-богатый домен взаимодействия). Он был обнаружен по гомологии с геном мертвого звона дрозофилы, который важен для нормального эмбриогенеза. Другие члены семейства ARID играют роль в формировании эмбрионального паттерна, регуляции генов клеточного происхождения, контроле клеточного цикла, регуляции транскрипции и, возможно, в модификации структуры хроматина. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что ARID3A взаимодействует с:

БТК , ^[7] и
E2F1 ^[8]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000116017 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019564 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Корчак Р.Д., Рейманн Х., Циммер М., Эйр Х.Дж., Сэйнт Р., Дженн Д.Е. (июль 1998 г.). «Человеческий точный / яркий гомолог DRIL1: клонирование кДНК, структура гена и картирование D19S886, маркера на 19p13.3, который строго связан с синдромом Пейтца-Егерса». Геномика . 51 (2): 288–92. дои : 10.1006/geno.1998.5259 . ПМИД 9722953 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ARID3A AT богатый интерактивный домен 3A (BRIGHT-подобный)» .
^ Никсон Дж.К., Раджайя Дж.Б., Айерс Н., Эветтс С., Уэбб К.Ф. (март 2004 г.). «Фактор транскрипции Bright не экспрессируется во всех субпопуляциях В-лимфоцитов человека». Клеточная иммунология . 228 (1): 42–53. дои : 10.1016/j.cellimm.2004.03.004 . ПМИД 15203319 .
^ Сузуки М, Окуяма С, Окамото С, Ширасуна К, Накадзима Т, Хачия Т, Нодзима Х, Секия С, Ода К (август 1998 г.). «Новый E2F-связывающий белок с мотивом HLH Myc-типа стимулирует E2F-зависимую транскрипцию путем образования гетеродимера». Онкоген . 17 (7): 853–65. дои : 10.1038/sj.onc.1202163 . ПМИД 9780002 . S2CID 23588950 .

Дальнейшее чтение

Корчак Р.Д., Такер П.В., Сэйнт Р. (июнь 2000 г.). «Белки ARID приходят из пустыни». Тенденции биохимических наук . 25 (6): 294–9. дои : 10.1016/S0968-0004(00)01597-8 . ПМИД 10838570 .
Сузуки М, Окуяма С, Окамото С, Ширасуна К, Накадзима Т, Хачия Т, Нодзима Х, Секия С, Ода К (август 1998 г.). «Новый E2F-связывающий белок с мотивом HLH Myc-типа стимулирует E2F-зависимую транскрипцию путем образования гетеродимера». Онкоген . 17 (7): 853–65. дои : 10.1038/sj.onc.1202163 . ПМИД 9780002 . S2CID 23588950 .
Пипер Д.С., Шварц А., Бруммелькамп Т., Дума С., Кох Э.Ю., Дейли GQ, Бернардс Р. (февраль 2002 г.). «Функциональный скрининг идентифицирует hDRIL1 как онкоген, который спасает старение, вызванное RAS». Природная клеточная биология . 4 (2): 148–53. дои : 10.1038/ncb742 . hdl : 1874/15575 . ПМИД 11812999 . S2CID 1392204 .
Кайвен М. (июнь 2002 г.). «[Участие E2FBP1, белка-члена семейства ARID, в регуляторном пути р53]» . Кокубё Гаккай Засши. Журнал Стоматологического общества, Япония . 69 (2): 152–61. дои : 10.5357/koubyou.69.152 . ПМИД 12136662 .
Гебель П., Монтальбано А., Айерс Н., Компфнер Э., Дикинсон Л., Уэбб К.Ф., Фини А.Дж. (сентябрь 2002 г.). «Высокая частота областей прикрепления матрикса и разрезанного белка x/CCAAT-белка смещения и регулятора В-клеток сайтов связывания транскрипции IgH, фланкирующих гены области V Ig» . Журнал иммунологии . 169 (5): 2477–87. дои : 10.4049/jimmunol.169.5.2477 . ПМИД 12193717 .
Ма К., Араки К., Ичван С.Дж., Суганума Т., Тамамори-Адачи М., Икеда М.А. (апрель 2003 г.). «E2FBP1 / DRIL1, фактор транскрипции семейства доменов взаимодействия, богатый AT, регулируется p53». Молекулярные исследования рака . 1 (6): 438–44. ПМИД 12692263 .
Фукуё И., Моги К., Цунэмацу Ю., Накадзима Т. (июль 2004 г.). «E2FBP1/hDril1 модулирует рост клеток посредством подавления телец промиелоцитарного лейкоза» . Смерть клеток и дифференцировка . 11 (7): 747–59. дои : 10.1038/sj.cdd.4401412 . ПМИД 15017387 .
Никсон Дж.К., Раджайя Дж.Б., Айерс Н., Эветтс С., Уэбб К.Ф. (март 2004 г.). «Фактор транскрипции Bright не экспрессируется во всех субпопуляциях В-лимфоцитов человека». Клеточная иммунология . 228 (1): 42–53. дои : 10.1016/j.cellimm.2004.03.004 . ПМИД 15203319 .
Раджайя Дж., Никсон Дж.С., Айерс Н., Дегранж З.П., Рой А.Л., Уэбб К.Ф. (июнь 2006 г.). «Индукция транскрипции тяжелой цепи иммуноглобулина посредством транскрипционного фактора Bright требует TFII-I» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (12): 4758–68. дои : 10.1128/MCB.02009-05 . ПМЦ 1489113 . ПМИД 16738337 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 .
Лин Д., Ипполито Г.К., Зонг Р.Т., Брайант Дж., Козловский Дж., Такер П. (2007). «Bright/ARID3A способствует доступности хроматина усилителя тяжелой цепи иммуноглобулина» . Молекулярный рак . 6:23 . дои : 10.1186/1476-4598-6-23 . ПМК 1852116 . ПМИД 17386101 .
Ляо Т.Т., Сюй В.Х., Хо CH, Хван В.Л., Лан ХИ, Ло Т., Чанг CC, Тай С.К., Ян М.Х. (январь 2016 г.). «let-7 модулирует конфигурацию хроматина и репрессию целевого гена посредством регуляции комплекса ARID3B» . Отчеты по ячейкам . 14 (3): 520–33. дои : 10.1016/j.celrep.2015.12.064 . ПМИД 26776511 . ARID3A был идентифицирован как мишень let-7 . Let-7i подавлял экспрессию ARID3A путем связывания с 3'-UTR транскрипта ARID3A. В отсутствие let-7 импортин-9 облегчает ядерный импорт ARID3A, который затем образует комплекс с ARID3B .

Внешние ссылки

ARID3A+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Местоположение генома человека ARID3A и ARID3A страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000116017 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019564 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9722953-5] Корчак Р.Д., Рейманн Х., Циммер М., Эйр Х.Дж., Сэйнт Р., Дженн Д.Е. (июль 1998 г.). «Человеческий точный / яркий гомолог DRIL1: клонирование кДНК, структура гена и картирование D19S886, маркера на 19p13.3, который строго связан с синдромом Пейтца-Егерса». Геномика . 51 (2): 288–92. дои : 10.1006/geno.1998.5259 . ПМИД 9722953 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ARID3A AT богатый интерактивный домен 3A (BRIGHT-подобный)» .

[pmid15203319-7] Никсон Дж.К., Раджайя Дж.Б., Айерс Н., Эветтс С., Уэбб К.Ф. (март 2004 г.). «Фактор транскрипции Bright не экспрессируется во всех субпопуляциях В-лимфоцитов человека». Клеточная иммунология . 228 (1): 42–53. дои : 10.1016/j.cellimm.2004.03.004 . ПМИД 15203319 .

[pmid9780002-8] Сузуки М, Окуяма С, Окамото С, Ширасуна К, Накадзима Т, Хачия Т, Нодзима Х, Секия С, Ода К (август 1998 г.). «Новый E2F-связывающий белок с мотивом HLH Myc-типа стимулирует E2F-зависимую транскрипцию путем образования гетеродимера». Онкоген . 17 (7): 853–65. дои : 10.1038/sj.onc.1202163 . ПМИД 9780002 . S2CID 23588950 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]