Mammalian protein found in Homo sapiens
Фактор ответа сыворотки , также известный как SRF , представляет собой белок транскрипционного фактора . [5]
Фактор ответа сыворотки является членом MADS ( M CM1, A gamous, Deficiens и S RF). суперсемейства транскрипционных факторов [6] Этот белок связывается с элементом ответа сыворотки (SRE) в промоторной области генов-мишеней. Этот белок регулирует активность многих ранних генов , например c-fos , и тем самым участвует в клеточного цикла регуляции , апоптозе , росте клеток и дифференцировке клеток . Этот ген является последующей мишенью многих путей; например, митоген-активируемый протеинкиназный путь (MAPK), который действует через тройные комплексные факторы (TCF). [7] [8]
SRF важен во время развития эмбриона, поскольку он связан с формированием мезодермы . [9] [10] У полностью развитых млекопитающих SRF имеет решающее значение для роста скелетных мышц. [11] Взаимодействие SRF с другими белками, такими как рецепторы стероидных гормонов , может способствовать регуляции мышечного роста с помощью стероидов . [12] Взаимодействие SRF с другими белками, такими как миокардин или Elk-1, может усиливать или подавлять экспрессию генов, важных для роста гладких мышц сосудов .
Недостаток SRF кожи связан с псориазом и другими кожными заболеваниями. [13]
Было показано, что сывороточный фактор ответа взаимодействует с:
ASCC3 , [14] АТФ6 , [15] ЦЕБПБ , [16] [17] CREB-связывающий белок , [18] ЕЛК4 , [15] [19] ГАТА4 , [20] [21] ГТФ2Ф1 , [22] [23] ГТФ2И , [24] [25] Миогенин , [26] [27] НФЯ , [28] Ко-репрессор ядерных рецепторов 2 , [29] Белок промиелоцитарного лейкоза [18] и СРК , [30] и ТЕАД1 . [31]
^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000112658 – Ensembl , май 2017 г. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015605 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Норман С., Рансуик М., Поллок Р., Трейсман Р. (декабрь 1988 г.). «Выделение и свойства клонов кДНК, кодирующих SRF, фактор транскрипции, который связывается с ответным элементом сыворотки c-fos». Клетка . 55 (6): 989–1003. дои : 10.1016/0092-8674(88)90244-9 . ПМИД 3203386 . S2CID 20004673 . ^ Шор П., Шаррокс А.Д. (апрель 1995 г.). «Семейство транскрипционных факторов MADS-box». Евро. Дж. Биохим . 229 (1): 1–13. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.0001l.x . ПМИД 7744019 . ^ Далтон С., Марэ Р., Винн Дж., Трейсман Р. (июнь 1993 г.). «Выделение и характеристика дополнительных белков SRF». Филос. Пер. Р. Сок. Лонд. Б Биол. Наука . 340 (1293): 325–32. Бибкод : 1993РСТБ.340..325Д . дои : 10.1098/rstb.1993.0074 . ПМИД 8103935 . ^ «Сывороточный фактор ответа SRF» . Энтрез Джин . Национальный центр биотехнологической информации, Национальные институты здравоохранения. ^ Сепульведа Дж.Л., Влахопулос С., Айер Д., Белагули Н., Шварц Р.Дж. (июль 2002 г.). «Комбинаторная экспрессия GATA4, Nkx2-5 и фактора ответа сыворотки направляет раннюю активность сердечных генов» . Ж. Биол. Хим . 277 (28): 25775–82. дои : 10.1074/jbc.M203122200 . ПМИД 11983708 . ^ Бэррон М.Р., Белагули Н.С., Чжан С.Х., Тринь М., Айер Д., Мерло X, Лох Дж.В., Пармачек М.С., Бруно Б.Г., Шварц Р.Дж. (март 2005 г.). «Сывороточный фактор ответа, обогащенный облигатный фактор сердечной мезодермы, является нижестоящей генной мишенью для генов Tbx» . Ж. Биол. Хим . 280 (12): 11816–28. дои : 10.1074/jbc.M412408200 . ПМИД 15591049 . ^ Ли С., Зубрит М.П., Макэналли Дж., Бассель-Дюби Р., Ричардсон Дж.А., Вибель Ф.Ф., Нордхейм А., Олсон Э.Н. (январь 2005 г.). «Потребность в сывороточном факторе ответа для роста и созревания скелетных мышц, выявленная путем делеции тканеспецифического гена у мышей» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (4): 1082–7. Бибкод : 2005PNAS..102.1082L . дои : 10.1073/pnas.0409103102 . ПМК 545866 . ПМИД 15647354 . ^ Влахопулос С., Циммер В.Е., Дженстер Г., Белагули Н.С., Балк С.П., Бринкманн А.О., Ланц Р.Б., Зумпурлис В.К., Шварц Р.Дж. (март 2005 г.). «Привлечение рецептора андрогена через фактор ответа сыворотки облегчает экспрессию миогенного гена» . Ж. Биол. Хим . 280 (9): 7786–92. дои : 10.1074/jbc.M413992200 . ПМИД 15623502 . ^ Кегель Х., фон Тобель Л., Шефер М., Альберти С., Креммер Э., Маух С., Холь Д., Ван XJ, Бир Х.Д., Блох В., Нордхайм А., Вернер С. (апрель 2009 г.). «Потеря сывороточного фактора ответа в кератиноцитах приводит к гиперпролиферативному заболеванию кожи у мышей» . Дж. Клин. Инвестируйте . 119 (4): 899–910. дои : 10.1172/JCI37771 . ПМЦ 2662566 . ПМИД 19307725 . ^ Юнг DJ, Сунг Х.С., Гу Ю.В., Ли Х.М., Пак ОК, Юнг С.И., Лим Дж., Ким Х.Дж., Ли СК, Ким Т.С., Ли Дж.В., Ли Ю.К. (июль 2002 г.). «Новый комплекс коактиватора транскрипции, содержащий коинтегратор активирующего сигнала 1» . Мол. Клетка. Биол . 22 (14): 5203–11. дои : 10.1128/mcb.22.14.5203-5211.2002 . ПМК 139772 . ПМИД 12077347 . ^ Jump up to: а б Чжу С., Йохансен Ф.Е., Прайвес Р. (сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие ATF6 и сывороточного фактора ответа» . Мол. Клетка. Биол . 17 (9): 4957–66. дои : 10.1128/MCB.17.9.4957 . ПМК 232347 . ПМИД 9271374 . ^ Хэнлон М., Сили Л. (май 1999 г.). «Ras регулирует связь фактора ответа сыворотки и CCAAT/белка, связывающего энхансер бета» . Ж. Биол. Хим . 274 (20): 14224–8. дои : 10.1074/jbc.274.20.14224 . ПМИД 10318842 . ^ Сили Л., Мэлоун Д., Павлак М. (март 1997 г.). «Регуляция элемента ответа сыворотки cfos с помощью C / EBPbeta» . Мол. Клетка. Биол . 17 (3): 1744–55. дои : 10.1128/mcb.17.3.1744 . ПМК 231899 . ПМИД 9032301 . ^ Jump up to: а б Мацузаки К., Минами Т., Тодзё М., Хонда Й., Сайто Н., Нагахиро С., Сая Х., Накао М. (март 2003 г.). «ПМЛ-ядерные тельца участвуют в клеточном ответе сыворотки» . Генные клетки . 8 (3): 275–86. дои : 10.1046/j.1365-2443.2003.00632.x . ПМИД 12622724 . S2CID 9697837 . ^ Хасслер М., Ричмонд Т.Дж. (июнь 2001 г.). «В-бокс доминирует во взаимодействиях SAP-1-SRF в структуре тройного комплекса» . ЭМБО Дж . 20 (12): 3018–28. дои : 10.1093/emboj/20.12.3018 . ПМК 150215 . ПМИД 11406578 . ^ Белагули Н.С., Сепульведа Дж.Л., Нигам В., Чаррон Ф., Немер М., Шварц Р.Дж. (октябрь 2000 г.). «Сывороточный фактор ответа, обогащенный факторами сердечной ткани, и GATA-4 являются взаимными корегуляторами» . Мол. Клетка. Биол . 20 (20): 7550–8. дои : 10.1128/mcb.20.20.7550-7558.2000 . ПМК 86307 . ПМИД 11003651 . ^ Морин С., Паради П., Овен А., Немер М. (февраль 2001 г.). «Тройной комплекс сывороточного фактора ответа-GATA, необходимый для ядерной передачи сигналов рецептором, связанным с G-белком» . Мол. Клетка. Биол . 21 (4): 1036–44. дои : 10.1128/MCB.21.4.1036-1044.2001 . ПМК 99558 . ПМИД 11158291 . ^ Жолио В., Демма М., Прайвес Р. (февраль 1995 г.). «Взаимодействие с субъединицей RAP74 TFIIF необходимо для активации транскрипции фактором ответа сыворотки». Природа . 373 (6515): 632–5. Бибкод : 1995Natur.373..632J . дои : 10.1038/373632a0 . ПМИД 7854423 . S2CID 47196160 . ^ Чжу Х., Жолио В., Прайвес Р. (февраль 1994 г.). «Роль транскрипционного фактора TFIIF в транскрипции, активируемой фактором ответа сыворотки» . Ж. Биол. Хим . 269 (5): 3489–97. дои : 10.1016/S0021-9258(17)41889-8 . ПМИД 8106390 . ^ Грюнеберг Д.А., Генри Р.В., Брауэр А., Новина К.Д., Черият В., Рой А.Л., Гилман М. (октябрь 1997 г.). «Многофункциональный ДНК-связывающий белок, который способствует образованию комплексов фактора ответа сыворотки/гомеодомена: идентичность TFII-I» . Генс Дев . 11 (19): 2482–93. дои : 10.1101/gad.11.19.2482 . ПМК 316568 . ПМИД 9334314 . ^ Ким Д.В., Черият В., Рой А.Л., Кокран Б.Х. (июнь 1998 г.). «TFII-I усиливает активацию промотора c-fos посредством взаимодействия с вышестоящими элементами» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3310–20. дои : 10.1128/mcb.18.6.3310 . ПМЦ 108912 . ПМИД 9584171 . ^ Гройсман Р., Масутани Х., Лейбович М.П., Робин П., Судан И., Труш Д., Арель-Беллан А. (март 1996 г.). «Физическое взаимодействие между митоген-чувствительным фактором ответа сыворотки и миогенными белками основной спирали-петли-спирали» . Ж. Биол. Хим . 271 (9): 5258–64. дои : 10.1074/jbc.271.9.5258 . ПМИД 8617811 . ^ Биесиада Э., Хамамори Ю., Кедес Л., Сарторелли В. (апрель 1999 г.). «Миогенные основные белки спираль-петля-спираль и Sp1 взаимодействуют как компоненты мультибелкового транскрипционного комплекса, необходимого для активности промотора сердечного альфа-актина человека» . Мол. Клетка. Биол . 19 (4): 2577–84. дои : 10.1128/MCB.19.4.2577 . ПМК 84050 . ПМИД 10082523 . ^ Ямада К., Осава Х., Граннер Д.К. (октябрь 1999 г.). «Идентификация белков, взаимодействующих с NF-YA» . ФЭБС Летт . 460 (1): 41–5. дои : 10.1016/s0014-5793(99)01311-3 . ПМИД 10571058 . S2CID 28576187 . ^ Ли С.К., Ким Дж.Х., Ли Ю.К., Чеонг Дж., Ли Дж.В. (апрель 2000 г.). «Медиатор молчания рецепторов ретиноевой кислоты и гормонов щитовидной железы как новая транскрипционная корепрессорная молекула, активирующая белок-1, ядерный фактор-каппаВ и фактор ответа сыворотки» . Ж. Биол. Хим . 275 (17): 12470–4. дои : 10.1074/jbc.275.17.12470 . ПМИД 10777532 . ^ Ким Х.Дж., Ким Дж.Х., Ли Дж.В. (октябрь 1998 г.). «Коактиватор стероидных рецепторов-1 взаимодействует с фактором ответа сыворотки и коактивирует трансактивацию, опосредованную элементом ответа сыворотки» . Ж. Биол. Хим . 273 (44): 28564–7. дои : 10.1074/jbc.273.44.28564 . ПМИД 9786846 . ^ Гупта М., Когут П., Дэвис Ф.Дж., Белагули Н.С., Шварц Р.Дж., Гупта М.П. (март 2001 г.). «Физическое взаимодействие между MADS-боксом фактора ответа сыворотки и ДНК-связывающим доменом TEA/ATTS фактора-1 усилителя транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 276 (13): 10413–22. дои : 10.1074/jbc.M008625200 . ПМИД 11136726 . Эно С., Стюарт А., Гуальдрини Ф., Ист П., Хорсвелл С., Мэтьюз Н., Трейсман Р. (май 2014 г.). «Передача сигналов Rho-актина коактиваторам MRTF доминирует в немедленном транскрипционном ответе на сыворотку фибробластов» . Гены и развитие . 28 (9): 943–58. дои : 10.1101/gad.239327.114 . ПМК 4018493 . ПМИД 24732378 . Ха С., Сон HR, Чон GR, Чан Х, Со НХ, Ли Дж. Х., Ли Т. Х. (февраль 2018 г.). «Подавление оси ERK-SRF способствует перепрограммированию соматических клеток» . Экспериментальная и молекулярная медицина . 50 (2): е448. дои : 10.1038/emm.2017.279 . ПМК 5903827 . ПМИД 29472703 . Пеллегрино Р., Тавамани А., Кальвизи Д.Ф., Будчиес Дж., Нойманн А., Гефферс Р. и др. (январь 2021 г.). «Фактор ответа сыворотки (SRF) стимулирует усиление транскрипции онкогена MDM4 при ГЦК» . Раки . 13 (2): 199. doi : 10.3390/cancers13020199 . ПМЦ 7829828 . ПМИД 33429878 . Ху X, Ву Q, Чжан Дж, Ким Дж, Чен X, Хартман А.А. и др. (январь 2021 г.). «Перепрограммирующие прогрессивные клетки демонстрируют низкую активность промотора CAG» . Стволовые клетки . 39 (1): 43–54. дои : 10.1002/stem.3295 . ПМЦ 7821215 . ПМИД 33075202 . Кепсер Л.Дж., Худайбердиев С., Инохоса Л.С., Макки С., Русчика М., Марчелло Э. и др. (февраль 2021 г.). «Связанный с циклазой белок 2 (CAP2) контролирует локализацию MRTF-A и активность SRF в эмбриональных фибробластах мыши» . Научные отчеты . 11 (1): 4789. Бибкод : 2021НатСР..11.4789К . doi : 10.1038/s41598-021-84213-w . ПМЦ 7910472 . ПМИД 33637797 . В эту статью включен текст из Национальной медицинской библиотеки США ( [1] ), который находится в свободном доступе .
показывать галерея PDB
1hbx : TERNARY COMPLEX OF SAP-1 AND SRF WITH SPECIFIC SRE DNA
1k6o : Crystal Structure of a Ternary SAP-1/SRF/c-fos SRE DNA Complex
1srs : SERUM RESPONSE FACTOR (SRF) CORE COMPLEXED WITH SPECIFIC SRE DNA
показывать
show (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group C bHLH-PAS Group D Group E Group F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
show (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
hide (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors