GTF2H4

GTF2H4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5IY9, 5IVW, 5IY7, 5IY8, 5IY6
Идентификаторы
Псевдонимы	GTF2H4 , общий фактор транскрипции IIH, полипептид 4, 52 кДа, P52, TFB2, TFIIH, субъединица 4 общего фактора транскрипции IIH
Внешние идентификаторы	Опустить : 601760 ; МГИ : 1338799 ; Гомологен : 7090 ; Генные карты : GTF2H4 ; OMA : GTF2H4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	30,914,106 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	35,984,631 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of liver; ; pituitary gland; ; right hemisphere of cerebellum; ; anterior pituitary; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; body of uterus; ; tibial arteries; ; right coronary artery; ; apex of heart;
	Top expressed in
	thymus; ; otic vesicle; ; otic placode; ; spermatocyte; ; epiblast; ; saccule; ; mandibular prominence; ; abdominal wall; ; maxillary prominence; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein kinase activity; ATP-dependent activity, acting on DNA; DNA-binding transcription factor activity; DNA helicase activity; protein binding; RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity; double-stranded DNA binding; ATPase activator activity; RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Cellular component	nucleoplasm; transcription factor TFIIH holo complex; core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex; transcription factor TFIIH core complex; nucleus; transcription factor TFIID complex; nuclear speck;
Biological process	termination of RNA polymerase I transcription; regulation of transcription, DNA-templated; phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain; transcription initiation from RNA polymerase I promoter; transcription elongation from RNA polymerase II promoter; 7-methylguanosine mRNA capping; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; cellular response to DNA damage stimulus; global genome nucleotide-excision repair; transcription-coupled nucleotide-excision repair; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; nucleotide-excision repair, DNA incision; DNA repair; nucleotide-excision repair; nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization; nucleotide-excision repair, preincision complex assembly; nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion; DNA duplex unwinding; positive regulation of ATP-dependent activity; nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding; nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion; transcription elongation from RNA polymerase I promoter;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2968
	14885
	ENSG00000213780
	ENSMUSG00000001524
	Q92759
	О70422
	НМ_001517
	НМ_010364
	НП_001508
	НП_034494
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 4 общего фактора транскрипции IIH представляет собой белок , который у человека кодируется GTF2H4 геном . ^[5]^[6]

Взаимодействия

Было показано, что GTF2H4 взаимодействует с:

См. также

Транскрипционный фактор II H

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000213780 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001524 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Маринони Дж.К., Рой Р., Вермюлен В., Миниу П., Лутц Ю., Вида Г., Сероз Т., Гомес Д.М., Хоймейкерс Дж.Х., Эгли Дж.М. (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика р52, пятой субъединицы ядра фактора репарации транскрипции/ДНК TFIIH» . ЭМБО Дж . 16 (5): 1093–102. дои : 10.1093/emboj/16.5.1093 . ПМК 1169708 . ПМИД 9118947 .
^ «Ген Энтрез: общий фактор транскрипции GTF2H4 IIH, полипептид 4, 52 кДа» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вэй В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Дж.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (11): 5605–10. Бибкод : 1997PNAS...94.5605S . дои : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ПМК 20825 . ПМИД 9159119 .
^ Джилья-Мари Дж., Коин Ф., Раниш Дж.А., Хугстратен Д., Тейл А., Вигерс Н., Ясперс Н.Г., Раамс А., Аргентини М., ван дер Спек П.Дж., Ботта Е., Стефанини М., Эгли Дж.М., Эберсолд Р., Хоймейкерс Дж.Х., Вермюлен W (июль 2004 г.). «Новая, десятая субъединица TFIIH отвечает за синдром репарации ДНК трихотиодистрофии группы А» . Нат. Жене . 36 (7): 714–9. дои : 10.1038/ng1387 . ПМИД 15220921 .

Дальнейшее чтение

Жанг КТ (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». Дж. Биомед. Наука . 5 (1): 24–7. дои : 10.1007/BF02253352 . ПМИД 9570510 .
Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транкрипционный контроль: кофакторы Tat и элонгация транскрипции» . Курс. Биол . 8 (13): Р447-9. Бибкод : 1998CBio....8.R447Y . дои : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . ПМИД 9651670 . S2CID 15480646 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Блау Дж., Сяо Х., Маккракен С., О'Хара П., Гринблатт Дж., Бентли Д. (1996). «Три функциональных класса домена активации транскрипции» . Мол. Клетка. Биол . 16 (5): 2044–55. дои : 10.1128/MCB.16.5.2044 . ПМК 231191 . ПМИД 8628270 .
Драпкин Р., Ле Рой Г., Чо Х., Акуличев С., Рейнберг Д. (1996). «Человеческая циклинзависимая киназа, активирующая киназу, существует в трех различных комплексах» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (13): 6488–93. Бибкод : 1996PNAS...93.6488D . дои : 10.1073/pnas.93.13.6488 . ПМК 39050 . ПМИД 8692842 .
Чжоу Ц, Шарп, Пенсильвания (1996). «Tat-SF1: кофактор стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука . 274 (5287): 605–10. Бибкод : 1996Sci...274..605Z . дои : 10.1126/science.274.5287.605 . ПМИД 8849451 . S2CID 13266489 .
Парада Калифорния, Редер Р.Г. (1996). «Повышенная процессивность РНК-полимеразы II, запускаемая Tat-индуцированным фосфорилированием ее карбокси-концевого домена». Природа . 384 (6607): 375–8. Бибкод : 1996Natur.384..375P . дои : 10.1038/384375a0 . ПМИД 8934526 . S2CID 4278432 .
Гарсиа-Мартинес Л.Ф., Иванов Д., Гейнор Р.Б. (1997). «Ассоциация Tat с очищенными комплексами преинициации транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2» . Ж. Биол. Хим . 272 (11): 6951–8. дои : 10.1074/jbc.272.11.6951 . ПМИД 9054383 .
Кужек Т.П., Чо Х., Мальдонадо Э., Мейер Дж., Рейнберг Д., Петерлин Б.М. (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с голоферментом РНК-полимеразы II» . Мол. Клетка. Биол . 17 (4): 1817–23. дои : 10.1128/mcb.17.4.1817 . ПМК 232028 . ПМИД 9121429 .
Россиньоль М., Колб-Шейнель И., Эгли Дж.М. (1997). «Субстратная специфичность киназы, активирующей cdk (CAK), изменяется при ассоциации с TFIIH» . ЭМБО Дж . 16 (7): 1628–37. дои : 10.1093/emboj/16.7.1628 . ПМЦ 1169767 . ПМИД 9130708 .
Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вэй В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Дж.Д. (1997). «BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (11): 5605–10. Бибкод : 1997PNAS...94.5605S . дои : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ПМК 20825 . ПМИД 9159119 .
Гарсиа-Мартинес Л.Ф., Маванкал Г., Неве Х.М., Лейн В.С., Иванов Д., Гейнор Р.Б. (1997). «Очистка Tat-ассоциированной киназы обнаруживает комплекс TFIIH, который модулирует транскрипцию ВИЧ-1» . ЭМБО Дж . 16 (10): 2836–50. дои : 10.1093/emboj/16.10.2836 . ПМЦ 1169892 . ПМИД 9184228 .
Нехай С., Шукла Р.Р., Кумар А. (1997). «Первичная Tat-ассоциированная киназа вируса иммунодефицита человека типа 1, происходящая из Т-лимфоцитов человека, фосфорилирует С-концевой домен РНК-полимеразы II и индуцирует активность CAK» . Дж. Вирол . 71 (10): 7436–41. doi : 10.1128/JVI.71.10.7436-7441.1997 . ЧВК 192089 . ПМИД 9311822 .
Кужек Т.П., Окамото Х., Фудзинага К., Мейер Дж., Чемберлин Х., Морган Д.О., Петерлин Б.М. (1997). «Трансактиватор ВИЧ ТАТ связывается с киназой, активирующей CDK, и активирует фосфорилирование карбокси-концевого домена РНК-полимеразы II» . Генс Дев . 11 (20): 2645–57. дои : 10.1101/gad.11.20.2645 . ПМК 316603 . ПМИД 9334327 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Ли XY, Грин MR (1998). «Клеточный коактиватор Tat ВИЧ-1 Tat-SF1 представляет собой общий фактор элонгации транскрипции» . Генс Дев . 12 (19): 2992–6. дои : 10.1101/gad.19.12.2992 . ПМК 317190 . ПМИД 9765201 .
Пинг Ю.Х., Рана ТМ (1999). «Tat-ассоциированная киназа (P-TEFb): компонент комплексов преинициации и элонгации транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 274 (11): 7399–404. дои : 10.1074/jbc.274.11.7399 . ПМИД 10066804 .

Внешние ссылки

GTF2H4+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000213780 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001524 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9118947-5] Jump up to: ^а ^б Маринони Дж.К., Рой Р., Вермюлен В., Миниу П., Лутц Ю., Вида Г., Сероз Т., Гомес Д.М., Хоймейкерс Дж.Х., Эгли Дж.М. (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика р52, пятой субъединицы ядра фактора репарации транскрипции/ДНК TFIIH» . ЭМБО Дж . 16 (5): 1093–102. дои : 10.1093/emboj/16.5.1093 . ПМК 1169708 . ПМИД 9118947 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: общий фактор транскрипции GTF2H4 IIH, полипептид 4, 52 кДа» .

[pmid9159119-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вэй В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Дж.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (11): 5605–10. Бибкод : 1997PNAS...94.5605S . дои : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ПМК 20825 . ПМИД 9159119 .

[pmid15220921-8] Джилья-Мари Дж., Коин Ф., Раниш Дж.А., Хугстратен Д., Тейл А., Вигерс Н., Ясперс Н.Г., Раамс А., Аргентини М., ван дер Спек П.Дж., Ботта Е., Стефанини М., Эгли Дж.М., Эберсолд Р., Хоймейкерс Дж.Х., Вермюлен W (июль 2004 г.). «Новая, десятая субъединица TFIIH отвечает за синдром репарации ДНК трихотиодистрофии группы А» . Нат. Жене . 36 (7): 714–9. дои : 10.1038/ng1387 . ПМИД 15220921 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]