TFCP2

TFCP2
Идентификаторы
Псевдонимы	TFCP2 , LBP1C, LSF, LSF1D, SEF, TFCP2C, фактор транскрипции CP2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 189889 ; МГИ : 98509 ; Гомологен : 4134 ; Генные карты : TFCP2 ; OMA : TFCP2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	51,173,135 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	100,449,889 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of paranasal sinus; ; superficial temporal artery; ; ventricular zone; ; monocyte; ; ganglionic eminence; ; granulocyte; ; rectum; ; gastrocnemius muscle; ; gonad; ; islet of Langerhans;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; pineal gland; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; ventricular zone; ; perirhinal cortex; ; renal corpuscle; ; entorhinal cortex; ; right kidney; ; neural tube;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; protein C-terminus binding; protein binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; transcription factor binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	nucleoplasm; cytosol; nucleus; protein-containing complex;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; mRNA transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7024
	21422
	ENSG00000135457
	ENSMUSG00000009733
	Q12800
	Q9ERA0
	НМ_005653 ; НМ_001173452 ; НМ_001173453
	НМ_001289603 ; НМ_033476 ; НМ_001355497
	НП_001166923 ; НП_001166924 ; НП_005644
	НП_001276532 ; НП_258437 ; НП_001342426
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор транскрипции альфа-глобина CP2 представляет собой белок , который у человека кодируется TFCP2 геном . ^[5]^[6]

TFCP2 также называется фактором позднего SV40 ( LSF ) и индуцируется хорошо известным онкогеном AEG-1 . ^[7] LSF также действует как онкоген при гепатоцеллюлярной карциноме . ^[8] LSF усиливает ангиогенез путем повышающей регуляции транскрипции матриксной металлопротеиназы-9 ( MMP9 ). ^[9]

Наряду со своей основной онкогенной функцией при гепатоцеллюлярной карциноме (ГЦК), он играет многогранную роль в химиорезистентности, эпителиально-мезенхимальном переходе (ЕМТ), аллергической реакции, воспалении и болезни Альцгеймера . ^[8]^[10] Небольшая молекула FQI1 (ингибитор хинолинона фактора 1) предотвращает связывание LSF с ДНК HCC, что приводит к гибели клеток HCC. ^[8]^[10]^[11]

Взаимодействия

Было показано, что TFCP2 взаимодействует с APBB1. ^[12] и РНФ2 . ^[13]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135457 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000009733 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Свендеман С.Л., Шпильхольц С., Дженкинс Н.А., Гилберт Д.Д., Коупленд Н.Г., Шеффери М. (апрель 1994 г.). «Характеристика структуры генома, хромосомного расположения, промотора и экспрессии развития фактора транскрипции альфа-глобина CP2» . Журнал биологической химии . 269 (15): 11663–71. дои : 10.1016/S0021-9258(19)78176-9 . ПМИД 8157699 .
^ «Ген Энтрез: фактор транскрипции TFCP2 CP2» .
^ Ю БК, Гредлер Р, Вожилла Н, Су ЗЗ, Чен Д, Форсьер Т, Шах К, Саксена Ю, Хансен Ю, Фишер ПБ, Саркар Д (август 2009 г.). «Идентификация генов, обеспечивающих устойчивость к 5-фторурацилу» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (31): 12938–43. Бибкод : 2009PNAS..10612938Y . дои : 10.1073/pnas.0901451106 . ПМЦ 2722317 . ПМИД 19622726 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ю Б.К., Эмдад Л., Гредлер Р., Фуллер С., Думур С.И., Джонс К.Х., Джексон-Кук С., Су ЗЗ, Чен Д., Саксена У.Х., Хансен У., Фишер П.Б., Саркар Д. (май 2010 г.). «Фактор транскрипции Поздний фактор SV40 (LSF) действует как онкоген при гепатоцеллюлярной карциноме» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (18): 8357–62. Бибкод : 2010PNAS..107.8357Y . дои : 10.1073/pnas.1000374107 . ПМЦ 2889542 . ПМИД 20404171 .
^ Сантекадур П.К., Гредлер Р., Чен Д., Сиддик А., Шен К.Н., Дас С.К., Эмдад Л., Фишер П.Б., Саркар Д. (январь 2012 г.). «Поздний фактор SV40 (LSF) усиливает ангиогенез за счет повышающей регуляции транскрипции матриксной металлопротеиназы-9 (MMP-9)» . Журнал биологической химии . 287 (5): 3425–32. дои : 10.1074/jbc.M111.298976 . ПМК 3270996 . ПМИД 22167195 .
^ Jump up to: ^а ^б Сантекадур П.К., Раджасекаран Д., Сиддик А., Гредлер Р., Чен Д., Шаус С.К., Хансен У., Фишер П.Б., Саркар Д. (2012). «Фактор транскрипции LSF: новый онкоген гепатоцеллюлярной карциномы» (PDF) . Am J Cancer Res . 2 (3): 269–285. ПМК 3365805 . ПМИД 22679558 .
^ Грант Т.Дж., Бишоп Дж.А., Кристадор Л.М., Барот Дж., Чин Х.Г., Вудсон С., Кавурис Дж., Сиддик А., Гредлер Р., Шен XN, Шерман Дж., Михан Т., Фицджеральд К., Прадхан С., Бриггс Л.А., Эндрюс В.Х., Саркар Д. , Шаус С.Е., Хансен У (март 2012 г.). «Антипролиферативные низкомолекулярные ингибиторы транскрипционного фактора LSF выявляют зависимость онкогена от LSF при гепатоцеллюлярной карциноме» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (12): 4503–8. Бибкод : 2012PNAS..109.4503G . дои : 10.1073/pnas.1121601109 . ПМЦ 3311344 . ПМИД 22396589 .
^ Самбрано Н., Минополи Дж., де Кандиа П., Руссо Т. (август 1998 г.). «Адаптерный белок Fe65 взаимодействует через свой домен PID1 с фактором транскрипции CP2/LSF/LBP1» . Журнал биологической химии . 273 (32): 20128–33. дои : 10.1074/jbc.273.32.20128 . ПМИД 9685356 .
^ Такфилд А., Клаустон Д.Р., Вилановски Т.М., Чжао Л.Л., Каннингем Дж.М., Джейн С.М. (март 2002 г.). «Связывание полисотовых белков RING со специфическими генами-мишенями в комплексе с семейством факторов транскрипции, похожих на зернистую головку» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (6): 1936–46. дои : 10.1128/MCB.22.6.1936-1946.2002 . ПМК 135618 . ПМИД 11865070 .

Дальнейшее чтение

Лим Л.К., Свендеман С.Л., Шеффери М. (февраль 1992 г.). «Молекулярное клонирование фактора транскрипции альфа-глобина CP2» . Молекулярная и клеточная биология . 12 (2): 828–35. дои : 10.1128/mcb.12.2.828 . ПМК 364316 . ПМИД 1732747 .
Джейн С.М., Ниенхейс А.В., Каннингем Дж.М. (январь 1995 г.). «Переключение гемоглобина у человека и курицы опосредовано гетеромерным комплексом между вездесущим фактором транскрипции CP2 и специфичным для развития белком» . Журнал ЭМБО . 14 (1): 97–105. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb06979.x . ПМК 398056 . ПМИД 7828600 .
Ширра М.К., Чжу Ц, Хуан ХК, Паллас Д., Хансен У (август 1994 г.). «Один экзон человеческого гена LSF включает консервативные области, участвующие в новых мотивах связывания ДНК и димеризации» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (8): 5076–87. дои : 10.1128/mcb.14.8.5076 . ПМК 359026 . ПМИД 8035790 .
Юн Дж.Б., Ли Дж., Рёдер Р.Г. (март 1994 г.). «Характеристика семейства родственных клеточных факторов транскрипции, которые могут модулировать транскрипцию вируса иммунодефицита человека типа 1 in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (3): 1776–85. дои : 10.1128/mcb.14.3.1776 . ПМЦ 358535 . ПМИД 8114710 .
Марголис Д.М., Сомасундаран М., Грин М.Р. (февраль 1994 г.). «Человеческий фактор транскрипции YY1 подавляет транскрипцию и продукцию вирионов вируса иммунодефицита человека типа 1» . Журнал вирусологии . 68 (2): 905–10. doi : 10.1128/JVI.68.2.905-910.1994 . ПМК 236527 . ПМИД 8289393 .
Каннингем Дж. М., Ванин Э. Ф., Тран Н., Валентайн М., Джейн С. М. (ноябрь 1995 г.). «Человеческий фактор транскрипции CP2 (TFCP2), компонент человеческого белка-селектора стадии гамма-глобина, картируется в области хромосомы 12q13 и находится в пределах 250 т.п.н. от гена NF-E2». Геномика . 30 (2): 398–9. ПМИД 8586452 .
Ромерио Ф., Габриэль М.Н., Марголис Д.М. (декабрь 1997 г.). «Подавление вируса иммунодефицита человека типа 1 посредством нового взаимодействия человеческих факторов YY1 и LSF» . Журнал вирусологии . 71 (12): 9375–82. doi : 10.1128/JVI.71.12.9375-9382.1997 . ПМК 230241 . ПМИД 9371597 .
Самбрано Н., Минополи Дж., де Кандиа П., Руссо Т. (август 1998 г.). «Адаптерный белок Fe65 взаимодействует через свой домен PID1 с фактором транскрипции CP2/LSF/LBP1» . Журнал биологической химии . 273 (32): 20128–33. дои : 10.1074/jbc.273.32.20128 . ПМИД 9685356 .
Бинг З, Редди С.А., Рен Ю, Цинь Дж, Ляо В.С. (август 1999 г.). «Очистка и характеристика сывороточного фактора усиления амилоида А3» . Журнал биологической химии . 274 (35): 24649–56. дои : 10.1074/jbc.274.35.24649 . ПМИД 10455131 .
Кулл Дж., Ромерио Ф., Сан Дж. М., Волкер Дж. Л., Гэлвин К. М., Дэви Дж. Р., Ши Ю, Хансен Ю, Марголис Д. М. (август 2000 г.). «Человеческие факторы YY1 и LSF подавляют длинный концевой повтор вируса иммунодефицита человека типа 1 посредством рекрутирования гистондеацетилазы 1» . Журнал вирусологии . 74 (15): 6790–9. doi : 10.1128/JVI.74.15.6790-6799.2000 . ПМЦ 112196 . ПМИД 10888618 .
Чжоу В., Клаустон Д.Р., Ван X, Черрути Л., Каннингем Дж.М., Джейн С.М. (октябрь 2000 г.). «Индукция экспрессии гена фетального глобина человека новым эритроидным фактором NF-E4» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (20): 7662–72. дои : 10.1128/MCB.20.20.7662-7672.2000 . ПМЦ 86334 . ПМИД 11003662 .
Родда С., Шарма С., Шерер М., Чепмен Г., Ратьен П. (февраль 2001 г.). «CRTR-1, регулируемый в процессе развития репрессор транскрипции, относящийся к семейству транскрипционных факторов CP2» . Журнал биологической химии . 276 (5): 3324–32. дои : 10.1074/jbc.M008167200 . ПМИД 11073954 .
Чжэн Дж.Б., Чжоу Ю.Х., Майти Т., Ляо В.С., Сондерс Г.Ф. (октябрь 2001 г.). «Активация человеческого гена PAX6 через энхансер экзона 1 факторами транскрипции SEF и Sp1» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (19): 4070–8. дои : 10.1093/нар/29.2.e6 . ПМК 60230 . ПМИД 11574690 .
Такфилд А., Клаустон Д.Р., Вилановски Т.М., Чжао Л.Л., Каннингем Дж.М., Джейн С.М. (март 2002 г.). «Связывание полисотовых белков RING со специфическими генами-мишенями в комплексе с семейством факторов транскрипции, похожих на зернистую головку» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (6): 1936–46. дои : 10.1128/MCB.22.6.1936-1946.2002 . ПМК 135618 . ПМИД 11865070 .
Хе Г, Марголис ДМ (май 2002 г.). «Контррегуляция деацетилирования хроматина и оккупации деацетилазы гистонов на интегрированном промоторе вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) с помощью репрессора ВИЧ-1 YY1 и активатора ВИЧ-1 Tat» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (9): 2965–73. дои : 10.1128/MCB.22.9.2965-2973.2002 . ПМЦ 133763 . ПМИД 11940654 .
Питерс Л.М., Андерсон Д.В., Гриффит А.Дж., Грундфаст К.М., Сан-Агустин Т.Б., Мадео А.С., Фридман Т.Б., Морелл Р.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Мутация транскрипционного фактора TFCP2L3 вызывает прогрессирующую аутосомно-доминантную потерю слуха, DFNA28» . Молекулярная генетика человека . 11 (23): 2877–85. дои : 10.1093/hmg/11.23.2877 . ПМИД 12393799 .
Людекинг-Циммер Э., ДеКоски С.Т., Небес Р., Камбо М.И. (февраль 2003 г.). «Связь полиморфизма 3'-UTR транскрипционного фактора LBP-1c/CP2/LSF с болезнью Альцгеймера с поздним началом». Американский журнал медицинской генетики, часть B. 117Б (1): 114–7. дои : 10.1002/ajmg.b.10026 . ПМИД 12555245 . S2CID 24087609 .
Че Дж. Х., Ким К. Г. (февраль 2003 г.). «Связывание CP2 с промотором необходимо для усиления транскрипции глобиновых генов в эритроидных клетках» . Молекулы и клетки . 15 (1): 40–7. дои : 10.1016/S1016-8478(23)25235-8 . ПМИД 12661759 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135457 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000009733 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8157699-5] Свендеман С.Л., Шпильхольц С., Дженкинс Н.А., Гилберт Д.Д., Коупленд Н.Г., Шеффери М. (апрель 1994 г.). «Характеристика структуры генома, хромосомного расположения, промотора и экспрессии развития фактора транскрипции альфа-глобина CP2» . Журнал биологической химии . 269 (15): 11663–71. дои : 10.1016/S0021-9258(19)78176-9 . ПМИД 8157699 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: фактор транскрипции TFCP2 CP2» .

[pmid19622726-7] Ю БК, Гредлер Р, Вожилла Н, Су ЗЗ, Чен Д, Форсьер Т, Шах К, Саксена Ю, Хансен Ю, Фишер ПБ, Саркар Д (август 2009 г.). «Идентификация генов, обеспечивающих устойчивость к 5-фторурацилу» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (31): 12938–43. Бибкод : 2009PNAS..10612938Y . дои : 10.1073/pnas.0901451106 . ПМЦ 2722317 . ПМИД 19622726 .

[pmid20404171-8] Jump up to: ^а ^б ^с Ю Б.К., Эмдад Л., Гредлер Р., Фуллер С., Думур С.И., Джонс К.Х., Джексон-Кук С., Су ЗЗ, Чен Д., Саксена У.Х., Хансен У., Фишер П.Б., Саркар Д. (май 2010 г.). «Фактор транскрипции Поздний фактор SV40 (LSF) действует как онкоген при гепатоцеллюлярной карциноме» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (18): 8357–62. Бибкод : 2010PNAS..107.8357Y . дои : 10.1073/pnas.1000374107 . ПМЦ 2889542 . ПМИД 20404171 .

[pmid22167195-9] Сантекадур П.К., Гредлер Р., Чен Д., Сиддик А., Шен К.Н., Дас С.К., Эмдад Л., Фишер П.Б., Саркар Д. (январь 2012 г.). «Поздний фактор SV40 (LSF) усиливает ангиогенез за счет повышающей регуляции транскрипции матриксной металлопротеиназы-9 (MMP-9)» . Журнал биологической химии . 287 (5): 3425–32. дои : 10.1074/jbc.M111.298976 . ПМК 3270996 . ПМИД 22167195 .

[Santhekadur-10] Jump up to: ^а ^б Сантекадур П.К., Раджасекаран Д., Сиддик А., Гредлер Р., Чен Д., Шаус С.К., Хансен У., Фишер П.Б., Саркар Д. (2012). «Фактор транскрипции LSF: новый онкоген гепатоцеллюлярной карциномы» (PDF) . Am J Cancer Res . 2 (3): 269–285. ПМК 3365805 . ПМИД 22679558 .

[pmid22396589-11] Грант Т.Дж., Бишоп Дж.А., Кристадор Л.М., Барот Дж., Чин Х.Г., Вудсон С., Кавурис Дж., Сиддик А., Гредлер Р., Шен XN, Шерман Дж., Михан Т., Фицджеральд К., Прадхан С., Бриггс Л.А., Эндрюс В.Х., Саркар Д. , Шаус С.Е., Хансен У (март 2012 г.). «Антипролиферативные низкомолекулярные ингибиторы транскрипционного фактора LSF выявляют зависимость онкогена от LSF при гепатоцеллюлярной карциноме» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (12): 4503–8. Бибкод : 2012PNAS..109.4503G . дои : 10.1073/pnas.1121601109 . ПМЦ 3311344 . ПМИД 22396589 .

[pmid9685356-12] Самбрано Н., Минополи Дж., де Кандиа П., Руссо Т. (август 1998 г.). «Адаптерный белок Fe65 взаимодействует через свой домен PID1 с фактором транскрипции CP2/LSF/LBP1» . Журнал биологической химии . 273 (32): 20128–33. дои : 10.1074/jbc.273.32.20128 . ПМИД 9685356 .

[pmid11865070-13] Такфилд А., Клаустон Д.Р., Вилановски Т.М., Чжао Л.Л., Каннингем Дж.М., Джейн С.М. (март 2002 г.). «Связывание полисотовых белков RING со специфическими генами-мишенями в комплексе с семейством факторов транскрипции, похожих на зернистую головку» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (6): 1936–46. дои : 10.1128/MCB.22.6.1936-1946.2002 . ПМК 135618 . ПМИД 11865070 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]